Kalpain
Kalpain (, ) je protein koji pripada familiji kalcijum-zavisnih, nelizozomalnih cisteinskih proteaza (proteolitičkih enzima) svestrano izraženih kod sisara i mnogih drugih organizama. Kalpaini sačinjavaju C2 familiju proteaznog klana CA u MEROPS bazi podataka. Kalpainski proteolitički sistem obuhvata kalpain proteaze, malu regulatornu podjedinicu CAPNS1, poznatu kao CAPN4, i endogeni, za kalpain specifični inhibitor, kalpastatin.

Specifičnost presecanja 
Kalpain ne prepoznaje jedinstvenu aminokiselinsku sekivencu. Na proteinskim supstratima, elementi tercijarne strukture umesto primarnih aminokiselinskih sekvenci su verovatno odgovorni za usmeravanje presecanja na datom supstratu. Među suptratima koji su peptidi i mali molekuli, najkonzistentnija specifičnosti je za male, hidrofobne aminokiseline (e.g. leucin, valin i izoleucin) u P2 poziciji, i velike hidrofobne aminokiseline (e.g. fenilalanin i tirozin) u P1 poziciji. Verovatno trenutno najdostupniji fluorogeni supstrat kalpaina je (EDANS)-Glu-Pro-Leu-Phe=Ala-Glu-Arg-Lys-(DABCYL), koji biva presecan na Phe=Ala vezi.

Šira familija 

Projekat ljudskog genoma je pokazao da postoji više deset kalpainskih izoformi, neke od koji imaju višestruke splajsne varijante. Kao prvi kalpain čija trodimenzionalna struktura je određena, m-kalpain je prototipna proteaza C2 (kalpainske) familije u MEROPS bazi podataka.

Reference

Literatura

Spoljašnje veze 
 
CaMPDB, Calpain for Modulatory Proteolysis Database
 The Calpain Family of Proteases. (2001).  University of Arizona.
 Calpain Info with links in the Cell Migration Gateway
 Alzheimers and calpain protease, PMAP The Proteolysis Map-animation.

ЕЦ 3.4.22
Пептидазе
Протеинске фамилије
Kalpain ( , ) je protein koji pripada familiji kalcijum-zavisnih , nelizozomalnih cisteinskih proteaza ( proteolitičkih enzima ) svestrano izraženih kod sisara i mnogih drugih organizama . Kalpaini sačinjavaju C2 familiju proteaznog klana CA u MEROPS bazi podataka . Kalpainski proteolitički sistem obuhvata kalpain proteaze , malu regulatornu podjedinicu CAPNS1 , poznatu kao CAPN4 , i endogeni , za kalpain specifični inhibitor , kalpastatin . Specifičnost presecanja Kalpain ne prepoznaje jedinstvenu aminokiselinsku sekivencu . Na proteinskim supstratima , elementi tercijarne strukture umesto primarnih aminokiselinskih sekvenci su verovatno odgovorni za usmeravanje presecanja na datom supstratu . Među suptratima koji su peptidi i mali molekuli , najkonzistentnija specifičnosti je za male , hidrofobne aminokiseline ( e.g. leucin , valin i izoleucin ) u P2 poziciji , i velike hidrofobne aminokiseline ( e.g. fenilalanin i tirozin ) u P1 poziciji . Verovatno trenutno najdostupniji fluorogeni supstrat kalpaina je ( EDANS ) -Glu-Pro-Leu-Phe=Ala-Glu-Arg-Lys-( DABCYL ) , koji biva presecan na Phe=Ala vezi . Šira familija Projekat ljudskog genoma je pokazao da postoji više deset kalpainskih izoformi , neke od koji imaju višestruke splajsne varijante . Kao prvi kalpain čija trodimenzionalna struktura je određena , m-kalpain je prototipna proteaza C2 ( kalpainske ) familije u MEROPS bazi podataka . Reference Literatura Spoljašnje veze CaMPDB , Calpain for Modulatory Proteolysis Database The Calpain Family of Proteases . University of Arizona . Calpain Info with links in the Cell Migration Gateway Alzheimers and calpain protease , PMAP The Proteolysis Map-animation . ЕЦ4.22 Пептидазе Протеинске фамилије