Beta barel
Beta barel je velika beta ravan koja je uvijena u namotaj tako da je u formiranoj zatvorenoj strukturi prvi prvi lanac vodonično vezan za poslednji. Beta-lanci u beta-barelima su tipično raspoređeni na antiparalelan način. Barelne strukture su često prisutne u porinima i drugim proteinima koji premoštavaju ćelijske membrane, kao i u proteinima koji vezuju hidrofobne ligande unutar barelnog centra, na primer u lipokalinima. Porinu slične barelne strukture kodira mnoštvo gena, do 2–3% gena kod gram-negativnih bakterija.

U mnogim slučajevima lanci sadrže naizmenične polarne i hidrofobne aminokiseline, pri čemu su hidrofobni ostaci orijentisani ka unutrašnjosti barela i formiraju hidrofobno jezgro, dok su polarni ostaci orijentisani ka spoljašnjoj površini barela koja je u dodiru sa rastvaračem. Porini i drugi membranski proteini koji sadrže beta barele imaju reverzni patern, tako da su hodrofobni ostaci orijentisani ka spoljašnjosti gde su u kontaktu sa okružujućim lipidima, dok su hidrofilni ostaci orijentisani kao unutrašnjosti pore.
 
Beta-bareli se mogu klasifikovati na osnovu dva celobrojna parametra: broju lanaca u beta-ravni, -{n}-, i „broja zakrivljenosti“, -{S}-, meri zanošenja lanaca u beta-ravni. Ta dva parametra (-{n}- i -{S}-) su srodna sa uglom inklanacije beta lanaca relativno na osu barela.

Reference

Literatura 
 Branden C, Tooze J. Introduction to Protein Structure Garland Publishing: New York, NY. .

Spoljašnje veze 
-{
 Explanation of all-beta topologies: "orthogonal beta-sandwiches" are beta-barrels (as defined in this article); "aligned" beta-sandwiches" correspond to beta-sandwich folds in SCOP classification.
 all-beta folds in SCOP database (folds 54 to 100 are water-soluble beta-barrels).
 General classification and images of protein structures from Jane Richardson lab
 Images and examples of transmembrane beta-barrels
 Stockholm Bioinformatics Center review of transmembrane proteins
 The Lipocalin Website
}-

Структура протеина
Протеински набори
Beta barel je velika beta ravan koja je uvijena u namotaj tako da je u formiranoj zatvorenoj strukturi prvi prvi lanac vodonično vezan za poslednji . Beta-lanci u beta-barelima su tipično raspoređeni na antiparalelan način . Barelne strukture su često prisutne u porinima i drugim proteinima koji premoštavaju ćelijske membrane , kao i u proteinima koji vezuju hidrofobne ligande unutar barelnog centra , na primer u lipokalinima . Porinu slične barelne strukture kodira mnoštvo gena , do3% gena kod gram-negativnih bakterija . U mnogim slučajevima lanci sadrže naizmenične polarne i hidrofobne aminokiseline , pri čemu su hidrofobni ostaci orijentisani ka unutrašnjosti barela i formiraju hidrofobno jezgro , dok su polarni ostaci orijentisani ka spoljašnjoj površini barela koja je u dodiru sa rastvaračem . Porini i drugi membranski proteini koji sadrže beta barele imaju reverzni patern , tako da su hodrofobni ostaci orijentisani ka spoljašnjosti gde su u kontaktu sa okružujućim lipidima , dok su hidrofilni ostaci orijentisani kao unutrašnjosti pore . Beta-bareli se mogu klasifikovati na osnovu dva celobrojna parametra : broju lanaca u beta-ravni , -{ n }- , i „ broja zakrivljenosti “ , -{ S }- , meri zanošenja lanaca u beta-ravni . Ta dva parametra ( -{ n }- i -{ S }- ) su srodna sa uglom inklanacije beta lanaca relativno na osu barela . Reference Literatura Branden C , Tooze J . Introduction to Protein Structure Garland Publishing : New York , NY . \ . Spoljašnje veze - { Explanation of all-beta topologies : " orthogonal beta-sandwiches " are beta-barrels ( as defined in this article ) ; " aligned " beta-sandwiches " correspond to beta-sandwich folds in SCOP classification. all-beta folds in SCOP database ( foldstoare water-soluble beta-barrels ) . General classification and images of protein structures from Jane Richardson lab Images and examples of transmembrane beta-barrels Stockholm Bioinformatics Center review of transmembrane proteins The Lipocalin Website }- Структура протеина Протеински набори