Ramačandranov dijagram
Ramačandranov dijagram (Ramačandranov grafikon, [φ,ψ] grafikon), koji su originalno (1963) razvili G. N. Ramačandran, C. Ramakrišnan, and V. Sasisekharan, je način vizuelizacije diedralnih uglova ψ naspram φ aminokiselinskih ostataka proteinske strukture. Slika levo ilustruje definiciju φ i ψ diedralnih uglova osnove lanca (φ i φ' po Ramačandranu). Ugao ω peptidne veze je normano 180°, pošto parcijalni karakter dvostruke veze drži peptid u ravni. Slika gore desno prikazuje dozvoljene φ,ψ konformacione regione osnove lanca po Ramačandranu et al. iz 1963. i 1968, koristeći proračune trvdih sfera: pun radijus je prikazan punim linijama, redukovani radijus isprekidanim, i relaksirani tau (-{N-C}-alfa--{C}-) ugao tačkastim linijama. Pošto su vrednosti diedralnih uglova cirkularne i 0° je isto što i 360°, ivice Ramačandranovog dijagrama se „obmotavaju“, leva strana sa desnom, i dno sa vrhom. Na primer, mala traka dozvoljenih vrednosti duž donjeg levog ugla grafikona je nastavak velikog regiona gore levo.

Reference

Literatura
 , available on-line at Anatax

Spoljašnje veze
-{
DynoPlot in PyMOL wiki
Link to Ramachandran Plot Map of alpha-helix and beta-sheet locations
Link to Ramachandran plot calculated from protein structures determined by X-ray crystallography compared to the original Ramachan.
Proteopedia Ramachandran Plot
}-

Биохемијски методи
Графикони
Ramačandranov dijagram ( Ramačandranov grafikon , [ φ ,ψ ] grafikon ) , koji su originalnorazvili G. N. Ramačandran , C . Ramakrišnan , and V. Sasisekharan , je način vizuelizacije diedralnih uglova ψ naspram φ aminokiselinskih ostataka proteinske strukture . Slika levo ilustruje definiciju φ i ψ diedralnih uglova osnove lanca ( φ i φ ' po Ramačandranu ) . Ugao ω peptidne veze je normano , pošto parcijalni karakter dvostruke veze drži peptid u ravni . Slika gore desno prikazuje dozvoljene φ ,ψ konformacione regione osnove lanca po Ramačandranu et al. iz i koristeći proračune trvdih sfera : pun radijus je prikazan punim linijama , redukovani radijus isprekidanim , i relaksirani tau ( -{ N-C } -alfa--{ C }- ) ugao tačkastim linijama . Pošto su vrednosti diedralnih uglova cirkularne i je isto što i , ivice Ramačandranovog dijagrama se „ obmotavaju “ , leva strana sa desnom , i dno sa vrhom . Na primer , mala traka dozvoljenih vrednosti duž donjeg levog ugla grafikona je nastavak velikog regiona gore levo . Reference Literatura , available on-line at Anatax Spoljašnje veze - { DynoPlot in PyMOL wiki Link to Ramachandran Plot Map of alpha-helix and beta-sheet locations Link to Ramachandran plot calculated from protein structures determined by X-ray crystallography compared to the original Ramachan . Proteopedia Ramachandran Plot }- Биохемијски методи Графикони