Jmol
-{Jmol}- je program otvorenog koda, napisan u Javi, za prikazivanje hemijskih struktura u 3D, za čiji rad nisu neophodni dodaci za 3D ubrzavanje. Jmol prikazuje 3D reprezentaciju molekula koja se može koristi u nastavi i u istraživanjima, npr. u oblastima hemije i biohemije. Ovaj besplatni softver otvorenog koda napisan u Javi se može koristiti na Windows-u, Mac OS X, Linuksu i Juniks. Dostupna je i samostalna aplikacija, kao i komplet alata za razvoj, koji se mogu integrisati u druge Java programe, kao što su Bioclipse i Taverna.

Popularno svojstvo je -{applet}- koji može da bude integrisan u veb stranice radi prikazivanja molekula na razne načine. Na primer, molekuli se mogu prikazati kao modeli „lopti i štapova“, „prostorno popunjavajući“ modeli, „trakasti“ modeli, etc. Jmol podržava širok opseg molekularnih formata fajlova, uklučujući -{Protein Data Bank}- (pdb), kristalografski informacioni fajl (cif), MDL molfajl (mol), i -{Chemical Markup Language}- (CML).

Jmol aplet, pored drugih mogućnosti, se može koristiti kao alternativu Čajm pluginu, čiji je razvoj zaustavljen. Mada mnoga svojatava Jmola nisu dostupna u -{Chime}- paketu, on nije zamišljen kao sveukupna zamena -{Chime}- funkcionalnosti (pre svega, skulpturnog moda). Da bis koristio -{Chime}- neophodno je da se instalira plug-in i da se koristi Internet eksploreru 6.0 ili Fajerfoksu 2.0 na Microsoft Windowsu, ili Netskejp komunikatoru 4.8 na Makintoš OS9. Za upotrebu Jmol-a neophodana je Java instalacija, koja se može koristiti na mnoštvu različitih platformi. Na primer, Jmol je potpuno funkcionalan u Mozilinom fajerfoksu, Internet Eksploreru, Operi, Guglovom Hromu i Safariju.

Snimci ekrana

Vidi još 
 Spisak molekulskih grafičkih sistema
 Spisak softvera za molekularno mehaničko modelovanje
 -{Chemistry Development Kit}- (CDK)
 Molekulska grafika
 -{PyMOL}-
 Jmol za Medijaviki

Reference

Spoljašnje veze 

 -{Jmol official web site}-
 -{Jmol wiki where a list of Websites, Wikis, Moodles, ... using Jmol is available}-

Софтвер за хемију
Софтвер за молекулско моделовање
Софтвер за биоинформатику
Слободни софтвер за хемију
Слободни софтвер написан у Јави
-{ Jmol }- je program otvorenog koda , napisan u Javi , za prikazivanje hemijskih struktura u , za čiji rad nisu neophodni dodaci za ubrzavanje . Jmol prikazuje reprezentaciju molekula koja se može koristi u nastavi i u istraživanjima , npr. u oblastima hemije i biohemije . Ovaj besplatni softver otvorenog koda napisan u Javi se može koristiti na Windows-u , Mac OS X , Linuksu i Juniks . Dostupna je i samostalna aplikacija , kao i komplet alata za razvoj , koji se mogu integrisati u druge Java programe , kao što su Bioclipse i Taverna . Popularno svojstvo je -{ applet }- koji može da bude integrisan u veb stranice radi prikazivanja molekula na razne načine . Na primer , molekuli se mogu prikazati kao modeli „ lopti i štapova “ , „ prostorno popunjavajući “ modeli , „ trakasti “ modeli , etc . Jmol podržava širok opseg molekularnih formata fajlova , uklučujući -{ Protein Data Bank }- ( pdb ) , kristalografski informacioni fajl ( cif ) , MDL molfajl ( mol ) , i -{ Chemical Markup Language }- ( CML ) . Jmol aplet , pored drugih mogućnosti , se može koristiti kao alternativu Čajm pluginu , čiji je razvoj zaustavljen . Mada mnoga svojatava Jmola nisu dostupna u -{ Chime }- paketu , on nije zamišljen kao sveukupna zamena -{ Chime }- funkcionalnosti ( pre svega , skulpturnog moda ) . Da bis koristio -{ Chime }- neophodno je da se instalira plug-in i da se koristi Internet eksploreru0 ili Fajerfoksu0 na Microsoft Windowsu , ili Netskejp komunikatoru8 na Makintoš OS9. Za upotrebu Jmol-a neophodana je Java instalacija , koja se može koristiti na mnoštvu različitih platformi . Na primer , Jmol je potpuno funkcionalan u Mozilinom fajerfoksu , Internet Eksploreru , Operi , Guglovom Hromu i Safariju . Snimci ekrana Vidi još Spisak molekulskih grafičkih sistema Spisak softvera za molekularno mehaničko modelovanje -{ Chemistry Development Kit }- ( CDK ) Molekulska grafika -{ PyMOL }- Jmol za Medijaviki Reference Spoljašnje veze -{ Jmol official web site }- -{ Jmol wiki where a list of Websites , Wikis , Moodles , \ ... using Jmol is available }- Софтвер за хемију Софтвер за молекулско моделовање Софтвер за биоинформатику Слободни софтвер за хемију Слободни софтвер написан у Јави