Polymeras
Polymeras är ett enzym (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) som syntetiserar långa kedjor av polymerer eller nukleinsyror. DNA-polymeras och RNA-polymeras används för att sätta ihop DNA-respektive RNA-molekyler genom att kopiera en DNA-mallsträng med basparande interaktioner eller RNA genom halvstegsreplikation.

Ett DNA-polymeras från den termofila bakterien, Thermus aquaticus ( Taq ) (PDB 1BGX , EC 2.7.7.7) används i polymeraskedjereaktionen, en viktig teknik inom molekylärbiologin.

Ett polymeras kan vara mallberoende eller malloberoende. Poly-A-polymeras är ett exempel på malloberoende polymeras. Terminalt deoxinukleotidyltransferas är också känt för att ha både malloberoende och mallberoende aktiviteter.

Typer

Efter funktion

DNA polymerase (DNA-riktat DNA-polymeras, DdDP)
Familj A: DNA polymeras I; Pol γ, θ, ν
Family B: DNA polymeras II; Pol α, δ, ε, ζ
Familj C: DNA polymeras III holoenzym
Familj X: Pol β, λ, μ
Terminal deoxynucleotidyl transferase (TDT), som ger mångfald åt antikroppars tunga kedjor.
Familj Y: DNA polymeras IV (DinB) och DNA-polymeras V (UmuD'2C) - SOS reperationspolymeraser; Pol η, ι, κ
Omvänt transkriptas (RT; RNA-riktat DNA polymeras, RdDP)
 Telomeras
DNA-riktat RNA-polymeras (DdRP, RNAP)
Multiunderenhet (msDdRP): RNA-polymeras I, RNA-polymeras II, RNA-polymeras III
Enkelunderenhet (ssDdRP): T7 RNA polymeras, POLRMT
Primase, PrimPol
RNA-replikas (RNA-riktat RNA-polymeras, RdRP)
Viral (enkelunderenhet)
Eukaryot cellulär (cRdRP, dubbelunderenhet)
Mallfri RNA-förlängning
 Polyadenylering: PAP, PNPas

Efter struktur
Polymeraser är i allmänhet uppdelade i två superfamiljer, "högerhands" veckade (InterPro :  IPR043502) och "dubbel psi beta barrel" (ofta helt enkelt "double-barrel") veckade. Den förra ses i nästan alla DNA-polymeraser och nästan alla virala enkelunderenhetspolymeraser. De är markerade med en bevarad "palm"-domän. Det senare ses i alla RNA-polymeraser med flera underenheter, i cRdRP, och i "familj D"-DNA-polymeraser som finns i archaea. "X"-familjen som representeras av DNA-polymeras beta har bara en vag "handflata"-form och anses ibland vara en annan superfamilj (InterPro : IPR043519 ).

Primaser faller i allmänhet inte in i någon av kategorierna. Bakteriella primaser har vanligtvis Toprim-domänen, och är relaterade till topoisomeraser och mitokondriell helicase -glitter. Archae- och eukaryotaprimaser bildar en obesläktad AEP-familj, möjligen besläktad med polymeraspalmen. Båda familjerna är ändå bundna till samma uppsättning helikaser.

Se även 
 Centrala dogmen
 Exonukleas
 Ligas
 Nukleas
 PCR
 RT-PCR

Referenser

Noter

Externa länkar 

Enzymer
Polymeras är ett enzym ( EC7.7.6/7/19/48/49 ) som syntetiserar långa kedjor av polymerer eller nukleinsyror . DNA-polymeras och RNA-polymeras används för att sätta ihop DNA-respektive RNA-molekyler genom att kopiera en DNA-mallsträng med basparande interaktioner eller RNA genom halvstegsreplikation . Ett DNA-polymeras från den termofila bakterien , Thermus aquaticus ( Taq ) ( PDBGX , EC7.7.7) används i polymeraskedjereaktionen , en viktig teknik inom molekylärbiologin . Ett polymeras kan vara mallberoende eller malloberoende . Poly-A-polymeras är ett exempel på malloberoende polymeras . Terminalt deoxinukleotidyltransferas är också känt för att ha både malloberoende och mallberoende aktiviteter . Typer Efter funktion DNA polymerase ( DNA-riktat DNA-polymeras , DdDP ) Familj A : DNA polymeras I ; Pol γ , θ , ν Family B : DNA polymeras II ; Pol α , δ , ε , ζ Familj C : DNA polymeras III holoenzym Familj X : Pol β , λ , μ Terminal deoxynucleotidyl transferase ( TDT ) , som ger mångfald åt antikroppars tunga kedjor . Familj Y : DNA polymeras IV ( DinB ) och DNA-polymeras V ( UmuD' 2C ) - SOS reperationspolymeraser ; Pol η , ι , κ Omvänt transkriptas ( RT ; RNA-riktat DNA polymeras , RdDP ) Telomeras DNA-riktat RNA-polymeras ( DdRP , RNAP ) Multiunderenhet ( msDdRP ) : RNA-polymeras I , RNA-polymeras II , RNA-polymeras III Enkelunderenhet ( ssDdRP ) : T7 RNA polymeras , POLRMT Primase , PrimPol RNA-replikas ( RNA-riktat RNA-polymeras , RdRP ) Viral ( enkelunderenhet ) Eukaryot cellulär ( cRdRP , dubbelunderenhet ) Mallfri RNA-förlängning Polyadenylering : PAP , PNPas Efter struktur Polymeraser är i allmänhet uppdelade i två superfamiljer , "högerhands" veckade ( InterPro \ : IPR043502 ) och "dubbel psi beta barrel " ( ofta helt enkelt "double-barrel" ) veckade . Den förra ses i nästan alla DNA-polymeraser och nästan alla virala enkelunderenhetspolymeraser . De är markerade med en bevarad "palm"-domän . Det senare ses i alla RNA-polymeraser med flera underenheter , i cRdRP , och i "familj D"-DNA-polymeraser som finns i archaea . " X"-familjen som representeras av DNA-polymeras beta har bara en vag "handflata"-form och anses ibland vara en annan superfamilj ( InterPro \ : IPR043519 ) . Primaser faller i allmänhet inte in i någon av kategorierna . Bakteriella primaser har vanligtvis Toprim-domänen , och är relaterade till topoisomeraser och mitokondriell helicase -glitter . Archae- och eukaryotaprimaser bildar en obesläktad AEP-familj , möjligen besläktad med polymeraspalmen . Båda familjerna är ändå bundna till samma uppsättning helikaser . Se även Centrala dogmen Exonukleas Ligas Nukleas PCR RT-PCR Referenser Noter Externa länkar Enzymer