Budapest Reference Connectome
A Budapest Reference Connectome (Budapesti referenciakonnektom) 96 egészséges ember agyának egyenként 1015 csúcspontjú makroskálájú kapcsolódási térképéből, avagy konnektomjából (agygráfjából) készített konszenzusgráf. A Human Connectome Project diffúziós MRI-adataiból számoltak ki egy referenciakonnektomot (vagy „agygráfot”), ami letölthető és 3D-ben megjeleníthető.

Funkciók

A Budapest Reference Connectome 1015 csúcsponttal rendelkezik, de az ugyanazon nagyobb agyi területhez tartozókat egybe rajzolja a tisztább ábrázolás érdekében. Egérrel nagyítani és forgatni lehet a képet, egy csúcspontra kattintva csak az ahhoz a csúcsponthoz tartozó összeköttetéseket mutatja meg.

A Connectom Mapping Toolkit nevű eszközzel készítették az MRI-felvételekből az agygráfokat. A legdurvább felbontás a Desikan–Killiany atlaszra épül – mindkét agyféltekét nagyjából 34 kérgi ROI-ra osztottak, de kéreg alatti régiókat (pl. törzsdúcok), a talamuszt, az amigdalát és az agytörzset is azonosítják. Ez a 83 csúcsú agygráf a legalacsonyabb felbontású, amit finomítva érhető el az 1015 csúcspontú gráf.

Háttér
A Budapest Reference Connectome 96 vizsgálati alany agygráfainak kombinációja (az első verzióban még csak 6 gráf volt). Csak azok az élek kerülnek megmutatása, amik a kiindulási gráfok egy megadott százalékában jelen vannak. A kiválasztott élek mindegyike az egyes gráfokban más-más súlyozással rendelkezik, ezeket a súlyokat kombinálják egyszerű átlagolással vagy medián választásával egyetlen súllyá. A felhasználói felület lehetővé teszi ezeknek a paramétereknek a változtatását. Össze lehet hasonlítani a férfi és női referenciakonnektomot is. A női alanyok konnektomai lényegesen több összeköttetést tartalmaznak a férfi alanyokénál, és a női alanyoknál az élek nagyobb száma fut a két agyfélteke között.

Irodalom
 Szalkai Balázs–Kerepesi Csaba–Varga Bálint–Grolmusz Vince: Élek és élet – Az agygráf. in: Természet Világa, 2015. I. különszám, 35. oldal

Fordítás

Jegyzetek 

Idegtudomány
Bioinformatika
A Budapest Reference Connectome ( Budapesti referenciakonnektom) egészséges ember agyának egyenkéntcsúcspontjú makroskálájú kapcsolódási térképéből , avagy konnektomjából ( agygráfjából ) készített konszenzusgráf . A Human Connectome Project diffúziós MRI-adataiból számoltak ki egy referenciakonnektomot ( vagy „ agygráfot” ) , ami letölthető és-ben megjeleníthető . Funkciók A Budapest Reference Connectomecsúcsponttal rendelkezik , de az ugyanazon nagyobb agyi területhez tartozókat egybe rajzolja a tisztább ábrázolás érdekében . Egérrel nagyítani és forgatni lehet a képet , egy csúcspontra kattintva csak az ahhoz a csúcsponthoz tartozó összeköttetéseket mutatja meg . A Connectom Mapping Toolkit nevű eszközzel készítették az MRI-felvételekből az agygráfokat . A legdurvább felbontás a Desikan–Killiany atlaszra épül – mindkét agyféltekét nagyjábólkérgi ROI-ra osztottak , de kéreg alatti régiókat ( pl. törzsdúcok ) , a talamuszt , az amigdalát és az agytörzset is azonosítják . Ez acsúcsú agygráf a legalacsonyabb felbontású , amit finomítva érhető el azcsúcspontú gráf . Háttér A Budapest Reference Connectomevizsgálati alany agygráfainak kombinációja ( az első verzióban még csakgráf volt ) . Csak azok az élek kerülnek megmutatása , amik a kiindulási gráfok egy megadott százalékában jelen vannak . A kiválasztott élek mindegyike az egyes gráfokban más-más súlyozással rendelkezik , ezeket a súlyokat kombinálják egyszerű átlagolással vagy medián választásával egyetlen súllyá . A felhasználói felület lehetővé teszi ezeknek a paramétereknek a változtatását . Össze lehet hasonlítani a férfi és női referenciakonnektomot is . A női alanyok konnektomai lényegesen több összeköttetést tartalmaznak a férfi alanyokénál , és a női alanyoknál az élek nagyobb száma fut a két agyfélteke között . Irodalom Szalkai Balázs–Kerepesi Csaba–Varga Bálint–Grolmusz Vince : Élek és élet – Az agygráf. in : Természet Világa , I. különszám , oldal Fordítás Jegyzetek Idegtudomány Bioinformatika