Phác đồ thay thế, cũng được đưa ra trong 21 ngày, là Pentamidine 4 mg / kg IV một lần / ngày Atovaquone 750 mg đường uống 2 lần mỗi ngày Trimethoprim 5 mg / kg uống 3 lần mỗi ngày kèm theo dapsone 100 mg uống một lần mỗi ngày Clindamycin 900 mg đường tĩnh mạch 8 giờ một lần, 600 mg đường tĩnh mạch 6 giờ một lần, 600 mg uống 3 lần / ngày hoặc 450 mg uống 4 lần / ngày, cộng với primaquine base 30 mg uống 1 lần / ngày Hạn chế chính của pentamidine là tỉ lệ gặp tác dụng phụ cao, bao gồm tổn thương thận cấp, hạ huyết áp, và hạ đường huyết.