Các xét nghiệm khuếch đại axit nucleic (NAAT) có bán trên thị trường rất nhạy cảm và đặc hiệu đối với chlamydia và cũng có thể được thực hiện trên mẫu bệnh phẩm nước tiểu hoặc mẫu bệnh phẩm âm đạo tự lấy, loại bỏ việc cần dùng tăm bông gây cảm giác khó chịu ở niệu đạo hoặc cổ tử cung để lấy mẫu xét nghiệm.