Bên cạnh hiệu quả và độ an toàn của thuốc, việc lựa chọn phác đồ điều trị còn phụ thuộc vào tính chi phí – hiệu quả của can thiệp. Trong phương pháp phân tích chi phí – hiệu quả, xây dựng mô hình được xem là một trong những khâu rất quan trọng.