Con đường không cổ điển sự kích hoạt xảy ra khi các thành phần của bề mặt tế bào vi khuẩn (ví dụ, các thành nấm men, lipopolysaccharide của tế bào vi khuẩn [endotoxin]) hoặc immunoglobulin (ví dụ như yếu tố thận, IgA lắng đọng) phân cắt một số lượng nhỏ C 3.