Khả năng kết hợp chẩn đoán và điều trị trong một thủ thuật giúp nội soi có lợi thế đáng kể hơn so với những phương pháp chỉ đem lại chẩn đoán hình ảnh khác (như, chụp X-quang có thuốc cản quang, CT, MRI) và thường chi phí nội soi cao hơn và cần dùng thuốc an thần.