Tầm quan trọng của việc phân lập Acinetobacter mẫu bệnh phẩm, ví dụ như các chất bài tiết hô hấp từ các bệnh nhân đặt nội khí quản hoặc mẫu bệnh phẩm từ các vết thương hở, rất khó xác định vì chúng có thể là bội nhiễm từ môi trường.