Mặc dù có các xét nghiệm khuếch đại axit nucleic (NAATs) đối với các vi sinh vật NTM phổ biến nhất, ở Hoa Kỳ, xét nghiệm này ngày càng được thực hiện trong các phòng thí nghiệm y tế công cộng của bang sử dụng các phương pháp phân tử và các phương pháp khác.