Hầu hết (95%) ung thư âm đạo nguyên phát là ung thư biểu mô tế bào vảy; các loại khác bao gồm ung thư biểu mô tuyến nguyên phát và thứ phát, ung thư biểu mô tế bào vảy thứ phát (ở phụ nữ lớn tuổi), ung thư biểu mô tế bào sáng (ở phụ nữ trẻ) và u sắc tố ác tính.