Bệnh nhân mắc viêm màng não do C. neoformans nhưng không mắc AIDS thường được điều trị với sự kết hợp của 5 - fluorocytosine và amphotericin B. Bệnh nhân viêm màng não do cryptococcus và AIDS được điều trị bằng amphotericin B phối hợp flucytosine (nếu dung nạp) sau đó điều trị bằng fluconazole.