Những khó khăn được ghi nhận chung và nhiều nhất từ người chăm sóc trẻ và nhân viên y tế là: (1) sự khó khăn về kinh tế; (2) sự biến động về người chăm sóc trẻ; (3) sự hạn chế về kiến thức, thái độ và thực hành đúng về điều trị ARV ở trẻ; (4) sự thiếu hụt hỗ trợ từ các thành viên khác trong gia đình do việc giấu kín tình trạng nhiễm của trẻ; (5) sự thiếu hợp tác từ phía trẻ trong việc uống thuốc do trẻ chưa được bộc lộ tình trạng; (6) khó khăn trong dung nạp thuốc ở trẻ (trẻ bị tác dụng phụ, trẻ uống thuốc bị nôn / ói, trẻ kém ăn và suy dinh dưỡng; (7) sự bất tiện trong việc thu xếp thời gian đưa trẻ đến khám và lấy thuốc tại phòng khám.