Phẫu thuật được chỉ định cho những điều sau đây: Để làm dẫn lưu mủ chèn ép tim hoặc áp xe hệ thần kinh trung ương Để đóng lỗ rò phế quản Cắt bỏ đoạn ruột nhiễm trùng Để giải phóng chèn ép tuỷ Đôi khi phẫu thuật giải áp cần thiết trong bệnh Lao cột sống để điều chỉnh các dị tật cột sống hoặc để giải ép dây nếu có sự chén ép thần kinh hoặc đau kéo dài; việc làm vững cột sống bằng ghép xương là cần thiết trong những trường hợp tiên tiến nhất.