Chẩn đoán CFS dựa trên các triệu chứng đặc trưng ở bệnh nhân có kết quả thăm khám và xét nghiệm cơ bản bình thường; Tiêu chuẩn chẩn đoán của Viện Y học (nay là Phân môn Sức khoẻ và Y tế của Viện Khoa học, Kỹ thuật và Y khoa Quốc gia) có thể hữu ích nhưng không áp dụng chặt chẽ cho từng bệnh nhân.