Chẩn đoán nhiễm CMV bẩm sinh và chu sinh Nuôi cấy virut trong nước tiểu, nước bọt, hoặc mô Xét nghiệm phản ứng chuỗi polymerase (PCR) bằng cách sử dụng nước tiểu, nước bọt, máu hoặc mô Nhiễm CMV bẩm sinh có triệu chứng phải được phân biệt với các bệnh nhiễm bẩm sinh khác, bao gồm toxoplasmosis, rubella, Viêm màng não tăng lypho bào do virus (Lyphotic choriomeningitis virus - LCMV), và giang mai.