Trong phương pháp tiêu huyết khối phổi bằng catheter, các động mạch phổi được tiếp cận thông qua một ống thông qua động mạch tới tim phải, thuốc tiêu huyết được chuyển trực tiếp tới các cục nghẽn lớn ở đầu gần qua đường ống thông.