Mặc dù việc đánh giá bằng mắt thường và sinh thiết có thể không có ý nghĩa chẩn đoán, bởi vì có nhiều chồng chéo giữa các loại viêm đại tràng, viêm cấp đại cấp tính, tự khỏi, nhiễm trùng có thể được phân biệt về mô học với bệnh viêm đại tràng thể loét tự phát mạn tính hoặc viêm đại tràng Crohn.