Ở một số trẻ sơ sinh có HLHS, đặc biệt là những trẻ bị rối loạn chức năng van ba lá hoặc tâm thất nặng, ghép tim được lựa chọn; tuy nhiên, PGE1 phải tiếp tục truyền cùng với theo dõi cẩn thận sức cản của phổi và mạch máu toàn thân cho đến khi có tim phù hợp.