Thông liên thất nhỏ thường tạo ra tiếng thổi khác nhau, từ tiếng thổi ngắn thì tâm thu âm sắc cao, cường độ từ 1/6 đến 2/6 (do những lỗ thông nhỏ dẫn đến đóng thực sự đóng ở cuối thì tâm thu) đến tiếng thổi toàn thì tâm thu 3/5 đến 4/6 đến (có hoặc không có rung miu) nghe tại phần thấp dọc bờ trái xương ức; tiếng thổi này thường nghe được từ vài ngày đầu sau sinh (xem bảng).