Một lượng nhỏ axit hữu cơ xuất phát từ những quá trình sau đây: Sự chuyển hoá không hoàn toàn glucose và axit béo thành axit lactic và ketoaxit Chuyển hoá các axit amin chứa lưu huỳnh (cysteine, methionine) thành axit sulfuric Chuyển hoá các axit amin cation (arginine, lysine) Thuỷ phân phốt phát trong chế độ ăn Axit "cố định" hoặc "trao đổi chất" không thể thải qua đường hô hấp, do đó phải được trung hoà hoặc bài tiết qua thận.