Một yếu tố khác làm cho việc chống lại HIV thật khó khăn là ngay cả khi vi rút được hoàn toàn loại trừ ra khỏi cơ thể, dấu vết của nó vẫn còn nằm im trong hồ chứa HIV, chờ đợi để quay trở lại một khi điều trị chấm dứt.