Các bệnh thông thường có thể lẫn lộn với hội chứng ruột kích thích bao gồm: Không dung nạp lactose Tiêu chảy do thuốc Hội chứng sau mổ cắt túi mật Lạm dụng thuốc nhuận tràng Bệnh ký sinh trùng (ví dụ:, nhiễm giardia) Viêm dạ dày tăng bạch cầu ái toan hoặc viêm ruột Viêm đại tràng vi thể Sự phát triển quá mức của vi khuẩn đường ruột non Bệnh celiac Tiêu chảy do axit mật Giai đoạn sớm của bệnh viêm ruột Tuy nhiên, túi thừa đại tràng không viêm không gây ra triệu chứng, và sự hiện diện của chúng không nên được coi là căn nguyên.