Tuy nhiên, nếu chủng bị đề kháng với erythromycin do thay đổi đích ribosomal, bệnh nhân có thể không đáp ứng lâm sàng với clindamycin vì một số đột biến có thể xuất hiện trong quá trình điều trị clindamycin; những đột biến này có khả năng chống lại clindamycin và erythromycin do sự thay đổi cấu thành của đích ribosomal.