Điều trị CGD Kháng sinh dự phòng và thường là thuốc chống nấm Thông thường dùng interferon gamma Đối với nhiễm trùng nặng, truyền máu Ghép tế bào gốc tạo máu Điều trị bệnh u hạt mạn tính là dùng kháng sinh dự phòng liên tục, đặc biệt là sulfamethoxazole / trimethoprim 800/160 mg uống 2 lần / ngày.