Molnupiravir có thể có ảnh hưởng đến khả năng xuất hiện các biến thể SARS-CoV -2 mới dựa trên mối lo ngại về mặt lý thuyết; tuy nhiên, nguy cơ được cho là thấp dựa trên dữ liệu về độc tính trên di truyền sẵn có và liệu trình điều trị 5 ngày hạn chế.