Các nguyên nhân phổ biến nhất của vô kinh do các bất thường ở đường sinh sản bao gồm Các bất thường bộ phận sinh dục bẩm sinh gây tắc nghẽn đường chảy ra của máu kinh Những bất thường mắc phải ở đường sinh sản nữ (ví dụ: hội chứng Asherman, hẹp cổ tử cung) Bảng Tắc nghẽn bất thường gây vô kinh nguyên phát và thường đi kèm với chức năng nội tiết tố bình thường.