Mô bệnh học hiển vi có thể gợi ý chẩn đoán một cách mạnh mẽ, đặc biệt ở những bệnh nhân bị AIDS và các bệnh nhiễm trùng sâu rộng; ở những bệnh nhân như vậy, có thể thấy nấm men nội bào trong máu ngoại vi nhuộm Wright hoặc Giemsa hoặc các mẫu bệnh phẩm có áo choàng trắng.