Tuy nhiên, một số chuyên gia, những người thách thức quan điểm này vì bằng chứng là yếu, đã đề nghị kê đơn fluoroquinolones như là thuốc kháng sinh hàng 2 và hạn chế sử dụng cho một số tình huống cụ thể, bao gồm nhiễm P. aeruginosa ở bệnh nhân bị xơ gan dự phòng và điều trị nhiễm khuẩn ở bệnh nhân suy giảm miễn dịch, nhiễm khuẩn đa kháng đe doạ tính mạng ở trẻ sơ sinh và trẻ sơ sinh và Salmonella hoặc là Shigella Nhiễm trùng đường tiêu hoá.