Việc phù hợp càng nhiều kháng nguyên HLA càng tốt giúp cải thiện đáng kể khả năng sống sót về chức năng của các mảnh ghép từ những người hiến tặng tế bào gốc tạo máu và thận có liên quan đến cơ thể sống; Sự phù hợp HLA của các mảnh ghép từ những người hiến tặng không liên quan cũng cải thiện khả năng sống sót, mặc dù ít hơn nhiều do có nhiều sự khác biệt về độ tương thích mô không được phát hiện.