Một số dị dạng thần kinh nghiêm trọng nhất (ví dụ, khuyết não bẩm sinh, thoát vị não, nứt đốt sống bẩm sinh) phát triển trong 2 tháng đầu của thai kỳ và đại diện cho các khiếm khuyết trong sự hình thành ống thần kinh (dysraphism).