Bốn chủng Entamoeba khó phân biệt về mặt hình thái, nhưng dựa vào kỹ thuật phân tử thấy được sự khác nhau giữa các chủng gồm: E. histolytica (gây bệnh) E. dispar (ký sinh vô hại, hay gặp hơn) E. moshkovskii (ít phổ biến hơn, khả năng gây bệnh không rõ ràng) E. bangladeshi (ít phổ biến hơn, khả năng gây bệnh không rõ ràng) Bệnh lỵ amip do E. histolytica và có xu hướng hay xảy ra ở những vùng có điều kiện kinh tế xã hội khó khăn nghèo nàn và điều kiện vệ sinh kém.