Nhiễm nấm hệ thống như nhiễm trùng cơ hội điển hình bao gồm Nhiễm nấm Candida Aspergillosis Nhiễm Mucormycosis (zygomycosis) Fusariosis Nhiễm nấm hệ thống xảy ra trên cơ địa suy giảm miễn dịch nặng thường biểu hiện cấp tính với viêm phổi tiến triển nhanh, nhiễm nấm huyết hoặc các biểu hiện lâm sàng lan toả ngoài phổi.