Chấn thương nội mô giác mạc có thể xảy ra trong quá trình phẫu thuật nội nhãn (ví dụ, loại bỏ đục thuỷ tinh thể) hoặc sau khi đặt một bộ cấy ghép thuỷ tinh thể nội nhãn được thiết kế kém hoặc không đúng vị trí.