Không rõ liệu tăng tiểu cầu tiên phát có làm tăng nguy cơ huyết khối mạch lớn dẫn đến huyết khối tĩnh mạch sâu hoặc thuyên tắc phổi hay không, đặc biệt vì tiểu cầu chủ yếu tham gia vào huyết khối động mạch và không có mối tương quan giữa số lượng tiểu cầu và huyết khối mạch lớn.