Nguyên nhân thứ cấp của hội chứng rát miệng bao gồm Thiếu dinh dưỡng (vitamin B12, vitamin B9 [folate]) Thiếu máu Đái tháo đường Nhiễm trùng Candida (bệnh nấm candida) Dị ứng (thực phẩm, sản phẩm nha khoa) Các bệnh ở niêm mạc miệng (ví dụ, viêm miệng, liken phẳng, dạng pemphigoid, pemphigus thông thường, u tân sinh) Khô miệng Chất ức chế men chuyển angiotensin Thói quan cận chức năng của miệng (ví dụ: tưa lưỡi, nghiến chặt, nghiến răng lúc ngủ) Hội chứng bỏng rát miệng có thể gây bỏng rát, đau nhói hoặc tê lưỡi, vòm họng, môi hoặc các bề mặt niêm mạc khác của miệng, thường xảy ra ở hai bên và đôi khi thành nhiều ổ.