Các biến chứng sau viêm màng não do phế cầu bao gồm Mất thính lực (lên tới 50% bệnh nhân) Động kinh Không có khả năng học tập Rối loạn tâm thần Liệt dây thần kinh số 3 Viêm nội tâm mạc phế cầu Viêm nội tâm mạc cấp có thể do vãng khuẩn huyết do phế cầu, ngay cả ở những bệnh nhân không bị bệnh van tim, nhưng hiếm gặp viêm nội tâm mạc do phế cầu.