Thrombin, khi gắn với thụ thể trên tế bào nội mô (thrombomodulin CD 141), có vai trò hoạt hoá protein C. Protein C hoạt hoá, kết hợp với protein S tự do và một thụ thể protein C của tế bào nội mô, phân giải protein và bất hoạt các yếu tố VIIIa và Va.