Vắc xin JYNNEOS có thể có một vai trò đặc biệt trong việc tiêm vắc xin cho những người mà ACAM2000 có thể bị chống chỉ định, chẳng hạn như những người bị suy giảm miễn dịch hoặc viêm da cơ địa (xem danh sách ở trên).