Về mặt chẩn đoán, soi phế ống mềm cho phép Quan sát trực tiếp đường thở phía dưới, bao gồm phế quản phân thuỳ Lấy bệnh phẩm là các chất tiết và tế bào đường hô hấp bằng việc rửa, chải phế quản và rửa đường thở ngoại vi và phế nang Sinh thiết các cấu trúc nội phế quản, nhu mô và trung thất Mục đích điều trị bao gồm Hút chất tiết ứ đọng Đặt stent nội phế quản Loại bỏ dị vật Sử dụng nong bóng trong hẹp đường thở Bảng Hiện nay nội soi ống cứng chỉ được sử dụng khi cần đường vào và kênh làm việc rộng hơn để đưa dụng cụ vào, chẳng hạn như khi Thăm dò xuất huyết phổi nặng (khi ấy ống soi cứng có thể xác định tốt hơn nguồn chảy máu và, với ống hút lớn hơn, có thể hút máu tốt hơn và ngăn ngừa tắc nghẽn đường thở) Quan sát và gắp dị vật đường thở ở trẻ nhỏ Đốt laser hoặc đặt stent với những tổn thương trong lòng phế quản gây tắc nghẽn Chống chỉ định chống chỉ định tuyệt đối để nội soi phế quản bao gồm Suy hô hấp cấp tính với tăng co2 (trừ khi bệnh nhân được đặt nội khí quản và thở máy) Tắc nghẽn khí quản mức độ nặng Không có khả năng cung cấp đủ oxy cho người bệnh trong suốt quá trình làm thủ thuật Rối loạn nhịp tim không điều trị được, nguy hiểm tính mạng Chống chỉ định tương đối của nội soi phế quản bao gồm Gần đây bị nhồi máu cơ tim Bệnh nhân không hợp tác Rối loạn đông máu không được điều chỉnh Sinh thiết xuyên thành phế quản nên được thực hiện cẩn trọng ở những bệnh nhân ure máu cao, tắc nghẽn tĩnh mạch chủ trên, tăng áp mạch phổi vì tăng nguy cơ chảy máu.