Các hội chứng đau đầu nguyên phát một bên khác với các triệu chứng thần kinh thực vật, đôi khi được nhóm cùng với đau đầu chùm như chứng đau dây thần kinh sinh ba kèm triệu chứng thực vật, cần được loại trừ: SUNCT (cơn đau đầu ngắn dạng thần kinh, một bên, có xung huyết kết mạc và chảy nước mắt) và cơn đau đầu ngắn dạng thần kinh, một bên (SUNA): Các cơn đau rất ngắn (5 đến 250 giây) và xảy ra ở tần số cao (lên đến 200 lần / ngày).