Phẫu thuật cắt bỏ là phương pháp điều trị được lựa chọn cho những bệnh nhân có khối u nhầy nhú-niêm mạc nội ống bị loạn sản cấp độ cao đã tiến triển thành ung thư biểu mô xâm lấn hoặc những người có các đặc điểm cho thấy có nguy cơ cao bị ung thư.