Đôi khi các số bổ sung được thêm vào sau dấu hai chấm để xác định các biến thể allen mã hoá các protein giống hệt nhau, và sau một dấu hai chấm khác, các số khác được thêm vào để biểu thị tính đa hình trong các intron hoặc trong các vùng không phiên mã 5 'hoặc 3' (ví dụ A * 02:1 01:01:02, DRB 1 * 03:01:01: 02).