Hiếm khi, phiền muộn giới có liên quan đến tình trạng mơ hồ về bộ phận sinh dục (tình trạng lưỡng tính [rối loạn phát triển giới tính]) hoặc bất thường về di truyền (ví dụ, hội chứng Turner, hội chứng Klinefelter).