Trong chẩn đoán, xét nghiệm nước tiểu là chủ lực với khả năng chẩn đoán lên đến 94% nếu phối hợp cả 3 xét nghiệm: nhuộm Ziehl tìm trực khuẩn kháng acid-cồn (AFB), cấy nước tiểu tìm BK, phản ứng PCR nước tiểu, so với chỉ 38% nếu chỉ tìm trực khuẩn kháng acid-cồn.