Nếu nghi ngờ một trong hai loại virut này hoặc nếu nghi ngờ có bệnh viêm não do herpes simplex, hầu hết các bác sĩ lâm sàng bắt đầu điều trị theo kinh nghiệm với acyclovir và nếu PCR âm tính đối với những vi-rút này thì dừng thuốc.