Hiếm khi trẻ nhỏ có thể bị nôn nhiều lần giống bệnh trào ngược dạ dày thực quản do bệnh chuyển hoá (ví dụ: khiếm khuyết chu trình ure, bệnh galactosemia, không dung nạp fructose di truyền) hoặc bất thường về giải phẫu (như hẹp môn vị hoặc ruột quay dở dang).