Bên cạnh các hoạt động RNA polymerase, RNA helicase và protease phụ thuộc vào RNA, thường gặp ở virus RNA, coronavirus replicase gần đây đã được dự đoán sử dụng nhiều loại enzyme xử lý RNA không (hoặc cực kỳ hiếm) được tìm thấy trong các virus RNA khác và bao gồm endoribonuclease xác định trình tự giả định, 3 ′ - to-5 ′ exoribonuclease, 2 ′ - O-ribose methyltransferase, ADP ribose 1 ′ - phosphatase và, trong một tập hợp con coronavirus nhóm 2, hoạt động phosphodiesterase theo chu kỳ.