Ngoại trừ các chất độc được tạo sẵn chịu trách nhiệm cho một số bệnh truyền qua thực phẩm (ví dụ: bệnh ngộ độc do clostridium botulinum, ngộ độc thực phẩm do staphylococcal hoặc Bacillus cereus), độc tố được tạo ra bởi các sinh vật trong quá trình nhiễm bệnh.