Các biến chứng muộn thường gặp nhất là Hẹp ống dẫn mật trong gan hoặc tại miệng nối gây ra ứ mật và viêm đường mật Sau khi ghép gan với mô ghép từ người cho đã chết, hẹp đường mật đặc biệt phổ biến, xảy ra khoảng 1/4 đến 1/3 số người nhận.