Trong tháng đầu tiên sau ghép, hầu hết các nhiễm trùng đều do cùng một loại vi khuẩn và nấm bệnh viện mà chúng cũng ảnh hưởng đến các bệnh nhân phẫu thuật khác (ví dụ: chủng Pseudomonas gây viêm phổi, vi khuẩn gram dương gây nhiễm trùng vết mổ).