Căn nguyên của viêm phổi kẽ quá mẫn Hơn 300 loại kháng nguyên đã được xác định là nguyên nhân gây viêm phổi kẽ quá mẫn, mặc dù các kháng nguyên gặp phải bao gồm trồng trọt, chim chóc và ô nhiễm nước chiếm khoảng 75% số ca bệnh.