Phần lớn viêm phổi tổ chức hoá không đặc hiệu và có thể xảy ra thứ phát ở nhiều bệnh lý khác nhau, bao gồm nhiễm trùng, viêm mạch, lymphoma và các bệnh phổi kẽ khác như xơ phổi tự phát, viêm phổi kẽ không đặc hiệu, bệnh phổi kẽ liên quan đến bệnh mô liên kết, bệnh phổi do thuốc gây ra, viêm phổi kẽ quá mẫn và viêm phổi tăng bạch cầu ái toan mạn tính.