Trẻ sơ sinh có nguy cơ cao hơn được điều trị HIV theo kinh nghiệm (xem bảng Xử trí bằng thuốc kháng vi rút cho trẻ sơ sinh theo nguy cơ lây nhiễm HIV), với phác đồ hai thuốc ZDV trong 6 tuần và nevirapine cho 3 liều, hoặc với phác đồ độ ba thuốc. Một số chuyên gia chọn phác đồ dự phòng hai thuốc nếu tải lượng vi rút HIV trong huyết tương của mẹ < 200 đến 400 bản sao / mL.