Chẩn đoán thường là dựa trên lâm sàng nhưng các xét nghiệm RT-PCR nhạy cảm và đặc hiệu có thể phân biệt được các tuýp cúm và các tuýp phụ và do đó giúp chọn lựa liệu pháp kháng vi rút và xác định các đợt bùng phát bệnh hô hấp có phải do cúm hay không.