Những trẻ sơ sinh nhập viện sau khi đã được điều trị kháng sinh kéo dài trước đó (cho nhiễm khuẩn sơ sinh sớm) có nguy cơ của việc kháng kháng sinh, nhiễm nấm và thêm nguy cơ nhiễm khuẩn bệnh viện do quá trình nằm viện trước đó.