Việc lựa chọn kháng sinh đặc hiệu phải dựa vào kết quả nuôi cấy vi khuẩn và kháng sinh đồ như người lớn vì loại vi khuẩn lây nhiễm ở sơ sinh cũng có độ nhậy cảm kháng sinh giống như ở người lớn chứ không riêng biệt cho trẻ sơ sinh.