Các hệ vi sinh vật chủ yếu là vi khuẩn và nấm và bao gồm các hệ sinh vật thường trú, thường xuyên hiện diện và nhanh chóng tự phục hồi nếu rối loạn, và hệ sinh vật thoáng qua, có thể xâm chiếm vật chủ trong nhiều giờ tới hàng tuần nhưng không tự thiết lập vĩnh viễn.