Các nguyên nhân thứ phát phổ biến của rối loạn lipid máu bao gồm Đái tháo đường Bệnh thận mạn tính Lạm dụng rượu Suy giáp Xơ gan mật nguyên phát và các bệnh gan ứ mật khác Thuốc, như thiazid, chẹn beta, retinoid, các thuốc kháng retrovirus hoạt tính cao, cyclosporine, tacrolimus, estrogen và progestin và glucocorticoid Nguyên nhân thứ phát của HDL thấp là hút thuốc lá, steroid đồng hoá, nhiễm HIV và hội chứng thận hư.