Các yếu tố độc lực của B. fragilis có thể tính đến sự cô lập thường xuyên của nó từ các mẫu bệnh phẩm mặc dù nó hiếm khi có liên quan đến hệ vi sinh vật bình thường so với các loài Bacteroides species khác vi khuẩn này có một lớp vỏ polysaccharide dường như kích thích sự hình thành áp xe.