Chống chỉ định đặt thông mũi dạ dày bao gồm Tắc mũi họng hoặc tắc thực quản Chấn thương hàm mặt mức độ nặng Bất thường đông máu chưa điều trị Giãn tĩnh mạch thực quản trước đó có thể cân nhắc là chống chỉ định, nhưng thiếu bằng chứng về tác dụng bất lợi.