Nhuộm Warthin-Starry và nhuộm Dieterle Nhuộm bạc được sử dụng để quan sát các vi khuẩn như Xoắn khuẩn Helicobacter pylori Microsporidia Bartonella henselae (nguyên nhân gây bệnh mèo cào) Nhuộm Wright và nhuộm Giemsa Phương pháp nhuộm này được sử dụng để phát hiện những căn nguyên sau đây: Ký sinh trùng trong máu Histoplasma capsulatum trong tế bào thực bào và tế bào mô Các thể nội bào được tạo thành bởi virus và chlamydia Thể tự dưỡng của Pneumocystis jirovecii Một số vi khuẩn nội bào Nhuộm trichrome (nhuộm Gomori-Wheatley) và nhuộm sắt hematoxylin Các phương pháp nhuộm này được sử dụng để phát hiện các ký sinh trùng trong ruột.