CPB gây một số biến chứng nghiêm trọng, bao gồm Chảy máu Rối loạn chức năng nội tạng, bao gồm cả tác động tâm thần kinh Đột quỵ Nguyên nhân chảy máu do nhiều yếu tố, bao gồm pha loãng máu, sử dụng heparin, giảm chức năng tiểu cầu do tiếp xúc với máy bơm tuần hoàn, đông máu nội mạch rải rác và hạ thân nhiệt.