Các hội chứng bẩm sinh hiếm gặp (ví dụ: hội chứng giảm sản sụn-tóc, hội chứng Chédiak-Higashi, loạn sản sừng bẩm sinh, bệnh dự trữ glycogen típ Ib, hội chứng Shwachman-Diamond, mụn cóc, hạ gamma globulin huyết, nhiễm trùng, hội chứng myelokathexis [WHIM]) có thể liên quan đến suy tuỷ xương gây ra giảm bạch cầu trung tính.