Mặc dù HDL trước đây được cho là bảo vệ chống lại chứng xơ vữa động mạch thông qua vận chuyển cholesterol ngược và bằng cách vận chuyển các enzym chống oxy hoá, nó có thể phân huỷ và trung hoà các lipid oxy hoá, bằng chứng cho thấy có vai trò ít quan trọng hơn đối với HDL trong quá trình sinh xơ vữa.