Chống chỉ định ghép tế bào gốc tạo máu dị hợp là tương đối và bao gồm > 50 tuổi Ghép tế bào gốc tạo máu trước đó Các bệnh đi kèm đáng kể (ví dụ, suy thận) Ghép tế bào gốc tạo máu cùng loài bị hạn chế chủ yếu do thiếu người cho tương thích về mô học.