Ngoài ra, siêu âm nội soi can thiệp như: Siêu âm nội soi chọc hút bằng kim nhỏ, siêu âm nội soi dẫn lưu, siêu âm nội soi phong bế hoặc phá huỷ đám rối tạng trong điều trị giảm đau đã cho thấy độ chính xác trong chẩn đoán, theo dõi và hiệu quả điều trị caotrong các bệnh lý tiêu hoá và mật tuỵ.