Klebsiella pneumoniae kháng thuốc cực kỳ nguy hiểm nhờ khả năng sinh enzyme β-lactamase phổ rộng (ESBLs) phân giải hầu hết các kháng sinh cephalosporins thế hệ 1-3 và aztreonam (monobactam), carbapenemase phân giải hầu hết các β-lactam kể cả carbapenem, là những kháng sinh quan trọng dành cho các trường hợp nhiễm khuẩn nặng, đe doạ tính mạng người bệnh.