MRI chống chỉ định nếu bệnh nhân Đã có máy tạo nhịp tim hoặc đặt các stent tim hoặc mạch cảnh < 6 tuần Có các clip kẹp phình động mạch hoặc các vật kim loại khác có thể bị tăng nhiệt quá nóng hoặc bị di chuyển trong cơ thể do từ trường cường độ cao Có thể cần phải sử dụng các chất đối quang từ đường tĩnh mạch (ví dụ như gadolinium) để phát hiện hình ảnh các tổn thương viêm, mất myelin và ung thư.