Quá liều heparin với heparin trọng lượng phân tử thấp có thể được điều trị bằng protamine 1 mg trong 20 mL dung dịch muối sinh lý thông thường, truyền trong vòng 10 đến 20 phút mặc dù liều chính xác không xác định vì protamine chỉ làm trung hoà một phần quá trình bất hoạt yếu tố Xa của heparin trọng lượng phân tử thấp.