Một mối quan tâm về thủ thuật này là các tế bào miễn dịch trong máu cuống rốn không có kinh nghiệm với các loại vi rút gây nhiễm trùng tiềm ẩn, dẫn đến tỷ lệ tế bào T ngây thơ cao hơn và do đó làm tăng khả năng bị kích hoạt lại của cytomegalovirus hoặc nhiễm vi rút Epstein-Barr.