Bệnh nhân được chia thành hai nhóm: Nhóm chứng thực hiện nuôi cấy định danh vi khuẩn dịch phế quản và điều trị như thường quy; nhóm nghiên cứu thực hiện thêm kỹ thuật multiplex realtime PCR xác định 5 loại vi khuẩn gây bệnh thường gặp: Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Staphylococus aureus và điều trị ban đầu dựa trên kết quả của multiplex realtime PCR.