Tế bào gan cũng sản xuất các protein giúp chuẩn đoán các rối loạn cụ thể: Alpha-1 antitrypsin (không có hoặc giảm trong trường hợp thiếu hụt alpha-1 antitrypsin) Ceruloplasmin (giảm trong trường hợp bệnh Wilson) Transferrin (bão hoà với sắt trong trường hợp bệnh nhiễm sắc tố sắt mô) Ferritin (tăng nhiều trong trường hợp bệnh nhiễm sắc tố sắt mô) Những protein này thường tăng khi phản ứng lại với tổn thương (ví dụ, viêm) của nhiều loại mô khác nhau, do vậy tăng cao có thể không chứng tỏ một cách đặc hiệu rằng có rối loạn gan.