Các loại thuốc khác đã được sử dụng kết hợp để điều trị viêm não do Acanthamoeba bao gồm pentamidine, sulfadiazine hoặc trimethopri m/s ulfamethoxazole, flucytosine, azole (fluconazole, itraconazole, hoặc voriconazole), rifampin và amphotericin B. Với viêm não do B. mandrillaris, miltefosine kết hợp với các thuốc khác như flucytosine, pentamidine, fluconazole và / hoặc sulfadiazine cộng với azithromycin hoặc clarithromycin cùng với phẫu thuật cắt bỏ đã được sử dụng.