Trên bệnh nhân mắc SLE, có một sự kết hợp của giảm chức năng miễn dịch vì bản thân bệnh gây ra và tình trạng suy giảm miễn dịch do sử dụng các thuốc ức chế miễn dịch, điều này làm cho những bệnh nhân này dễ mắc phải tình trạng nhiễm khuẩn.