Trong bối cảnh hiện nay của nước ta, việc chỉ định kháng sinh khá dể dãi cho các bệnh lý không do H.pylori gây ra và cả do H.pylori gây ra đã làm gia tăng H.pylori đề kháng với kháng sinh và vì thế làm giảm hiệu quả tiệt trừ H.pylori.