Áp xe phổi cũng có thể phát triển thứ phát do tắc nghẽn nội phế quản (ví dụ do ung thư biểu mô phế quản) hoặc do ức chế miễn dịch (ví dụ do HIV / AIDS hoặc sau khi ghép tạng và sử dụng các thuốc ức chế miễn dịch).