Các nghiên cứu về sử dụng kiểu gen chẩn đoán kiểu hình kháng thuốc cho thấy có độ nhạy và độ đặc hiệu cao trên 95%, tuy nhiên các nghiên cứu này sử dụng kỹ thuật giải trình tự toàn bộ bộ gen là kỹ thuật đắt tiền, đòi hỏi thiết bị phức tạp và chưa ứng dụng được trong thực hành lâm sàng.