S. saprophyticus kháng trung gian với các cephalosporin thế hệ II và III (cefuroxim: 30,3%, ceftriaxon: 43,2% và ceftazidim: 66,7%), sulfamethoxazole / trimethoprim (69%) và các quinolon (tỷ lệ kháng levofloxacin, ofloxacin và ciprofloxacin lần lượt là 43,5%, 59,3% và 58,1%), nhạy cảm với kháng sinh nhóm carbapenem: Imipenem (90%) và meropenem (95,7%).