Chẩn đoán bằng cách xác định E. histolytica trong mẫu phân và được xác nhận bằng xét nghiệm miễn dịch phát hiện kháng nguyên trong phân, hoặc bằng xét nghiệm huyết thanh nếu nghi ngờ bệnh ngoài đường tiêu hoá.