Mặc dù chỉ nên dùng thuốc chống đông thông thường cho những bệnh nhân có rối loạn chức năng thất phải nhẹ (dựa trên lâm sàng, điện tâm đồ hoặc siêu âm tim), điều trị tiêu sợi huyết hoặc lấy huyết khối có thể cần thiết khi tổn thương thất phải nghiêm trọng và hoặc giảm oxy máu, thậm chí cả khi không có tụt áp, đặc biệt là khi tình trạng tồi đi có thể xảy ra do nhịp tim tăng hoặc giảm độ bão hoà oxy hoặc huyết áp.