Các phân tử MHC lớp II thường chỉ hiện diện trên các tế bào biểu hiện kháng nguyên c (tế bào B, đại thực bào, tế bào đuôi gai, các tế bào Langerhans), biểu mô tuyến ức và tế bào T hoạt hoá (nhưng không nghỉ); hầu hết các tế bào nhân có thể được kích thích để biểu hiện các phân tử MHC lớp II bằng interferon (IFN) - gamma.