Rối loạn hiếm gặp này thường có nguồn gốc sản khoa (do chấn thương khi sinh qua đường âm đạo hoặc biến chứng của nhiễm trùng vết mổ ở tầng sinh môn), nhưng lỗ rò đôi khi là do bệnh viêm ruột, khối u vùng chậu hoặc phẫu thuật vùng chậu (ví dụ: cắt tử cung, phẫu thuật hậu môn).