Các dị tật tim bẩm sinh, nếu không được điều trị, có thể dẫn đến hội chứng Eisenmenger bao gồm (theo thứ tự gần đúng – 1) Thông liên thất (VSD) Thông sàn nhĩ thất (AVSD) Còn ống động mạch (PDA) Cửa sổ động mạch phổi Thông liên nhĩ (ASD) thân chung động mạch Tâm thất phải hai lối ra (DORV) không có hẹp van động mạch phổi Trong bất thường tĩnh mạch không hoàn toàn, (PAPVR tĩnh mạch phổi thông với tâm nhĩ phải thay vì tâm nhĩ trái) Những bệnh nhân hiếm gặp với các biến thể tâm thất đơn lẻ hoặc chuyển vị của các động mạch lớn có ống động mạch và / hoặc thông liên thất dai dẳng có thể phát sinh hội chứng Eisenmenger nếu không được điều trị, mặc dù phần lớn những bệnh nhân này chết sớm trong giai đoạn sơ sinh nếu dị dạng này không được biết đến và điều trị.