Thiếu vitamin B6 thứ cấp thường là kết quả từ Suy dinh dưỡng protein-năng lượng Kém hấp thu Tình trạng rối loạn do sử dụng rượu Sử dụng các thuốc không kích hoạt pyridoxine (ví dụ, thuốc chống động kinh, isoniazid, cycloserine, hydralazine, corticosteroid, penicillamine) Bị mất quá nhiều trong quá trình thẩm tách máu Hiếm khi, sự thiếu hụt thứ phát xảy ra do nhu cầu chuyển hoá tăng (ví dụ như cường giáp).