Quyết Định 04/2021/QĐ-TTg ban hành điều lệ tổ chức và hoạt động của quỹ đổi mới công nghệ quốc gia . Kèm theo Chương II Điều 6. Cơ cấu tổ chức
Cơ cấu tổ chức của Quỹ bao gồm: Khoản 1. Hội đồng Quản lý Quỹ. Khoản 2. Kiểm soát viên. Khoản 3. Giám đốc Quỹ và bộ máy giúp việc.