Quyết Định 03/2020/QĐ-KTNN ban hành quy chế tổ chức và hoạt động đoàn kiểm toán nhà nước . Kèm theo Chương I Điều 3. Nguyên tắc hoạt động của Đoàn kiểm toán
 Khoản 1. Độc lập và chỉ tuân theo pháp luật. Khoản 2. Trung thực, khách quan, công khai, minh bạch. Khoản 3. Đoàn kiểm toán hoạt động theo chế độ thủ trưởng. Khoản 4. Khi tiến hành kiểm toán, các thành viên của Đoàn kiểm toán phải tuân thủ Luật Kiểm toán nhà nước và các văn bản pháp luật có liên quan, hệ thống chuẩn mực, hệ thống hồ sơ mẫu biểu kiểm toán, quy trình và các phương pháp chuyên môn nghiệp vụ kiểm toán, các quy định của Quy chế này. Khoản 5. Khi tiến hành kiểm toán ở nước ngoài, Đoàn kiểm toán phải tuân thủ pháp luật Việt Nam và luật pháp nước sở tại; tuân thủ nguyên tắc: tiết kiệm, hiệu quả, đảm bảo an ninh quốc phòng và bí mật nhà nước theo quy định của pháp luật.