Quyết Định 391/QĐ-TTg ban hành quy chế tổ chức và hoạt động của trường đại học việt nhật . Kèm theo Chương II Điều 9. Các phòng chức năng
 Khoản 1. Các phòng chức năng trực thuộc Trường là các đơn vị tham mưu, giúp việc cho Ban giám hiệu, do Hiệu trưởng quyết định thành lập, sáp nhập, chia, tách, giải thể sau khi có ý kiến của Hội đồng trường và theo quy định của Đại học Quốc gia Hà Nội. Khoản 2. Cơ cấu tổ chức, nhiệm vụ và quyền hạn của các phòng chức năng do Hiệu trưởng quy định.