Исследование морфологии сопоставляемых языков позволяет избежать сопоставления аффикса с частью корня, а также — в случае словосложения — корней, заведомо не родственных друг другу. Например, не может привести к успеху поиск для тагальского глагола дитам{а#А} 'работать' (приведена форма прош. вр.) родственных слов с корнем, фонетически сводимым с дит, поскольку -ит- в данном случае представляет собой инфикс, ср. дам{а#А} работа'. Яванское слово $г{э}{п_}{е/}{п_}{е/} солнце' (точнее, только его последний гласный -{е/}) сводится — по вполне регулярным правилам — с малайским Иаг1 и реджанг ЪИ{э}у (< *ма{К}г), но об этой связи трудно было бы догадаться, если бы не была известна древнеяванская формула ш{п_} Ыа{п_} ме 'уважаемое божество солнце' (др.-яв. ме день, солнце' < *ма{К}г) (пример принадлежит Ю.Х. Сирку).
       Соответствие аффикса (или части аффикса) в одном языке части корня в другом возможно только в случае морфологического переразложения, что необходимо специально доказывать.
       Проведение морфологического членения только в надежных случаях дает возможность избежать другой крайности: получения для сопоставления слишком маленьких (по две-три фонемы) корней с очень общим значением — сопоставление таких корней часто бывает малодоказательным (см. выше).