Моделируются фонетические изменения (с заданием контекстов и правил), а также собственно работа этимолога: реализован поиск слов по их приблизительному звучанию и значению. Под приблизительным звучанием понимается сходство первых двух согласных в сравниваемых словах. Согласные считаются похожими, если они входят в один класс — например, в класс "зубных смычных" (1, ё, {I.}, {1к}, {ёА}, {!}, {ё} и т. п.) или в класс "аффрикат" (с, {г3}, {ел}, {г3А}, {с.}, {сА.} и т. п.). Программа позволяет пользователю создавать свои классы похожих звуков — в соответствии с тем, какие звуковые изменения характерны для исследуемых им языков.
       Значения считаются похожими, если существует такой праязыковой корень, рефлексы которого в языках-потомках имеют эти значения. Список похожих значений, так же, как и список похожих звуков, хранится в отдельном файле и доступен изменениям.
       Такое широкое понимание сходства необходимо для того, чтобы при автоматическом поиске этимологий пропустить как можно меньше правдоподобных сближений. Окончательное решение о том, являются ли найденные компьютером слова родственными, в любом случае принадлежит исследователю-человеку.
       В подавляющем большинстве случаев компаративистский компонент программы ЗТАКЬШО полагается на экспертные этимологические оценки. Однако из сказанного выше