One theory claims that the three deities Amatsuhikone no mikoto, Amenohinatori no mikoto and Mihotsuhime no mikoto are enshrined at Izumo Daijingu Shrine, whereas an alternative theory claims that originally only Mihotsuhime no mikoto was enshrined.
当社の祭神については、天津彦根命・天夷鳥命・三穂津姫命の三柱とする説や、元々は三穂津姫尊一柱のみであるという説もある。