Kokusei‐ji was built around 1504 by Tadasue ANDO as the family temple of the warrior Hiyama-Ando clan, however it was abandoned when Ando clan (then called Akita clan) changed the territory to Hitachi Province.
国清寺は、1504年（永正元年）頃、安東忠季によって創建された檜山安東氏の菩提寺であったが、安東氏（当時は秋田氏）が常陸国へ転封されたため、廃された。