At present, the following three regions are designated as 'The Historic site, Gango-ji Temple': (1) 'Gango-ji Temple Gokuraku-bo' in Chuin-cho, Nara City, (2) 'Gango-ji Temple (remains of pagoda)' in Shibanoshinya-cho, Nara City, (3) 'Remains of Shoto-in Temple of Gango-ji Temple' in Nishinoshinya-cho, Nara-City.
現在、「史跡元興寺」として指定されている地域は（1）奈良市中院町の「元興寺極楽坊」、（2）同市芝新屋町の「元興寺（塔跡）」（3）同市西新屋町の「元興寺小塔院跡」の3か所である。