The character '芸' that is used for 芸能 and 園芸 is derived from the traditional form '藝' which was simplified into 芸 as a new character form published for use as common-use kanji (then "toyo-kanji" now superseded by "joyo-kanji") after the war, resulting in integration of character form with the character 芸 that was older in existence and in use.
芸能・園芸の「芸」（ゲイ）は当用漢字公布まで用いられた旧字体では「藝」（ゲイ）という書体だったが、戦後になって当用漢字（常用漢字の前身）が公布されてからは新字体として「芸」（ゲイ）に簡略化されたため、もとからある「芸」（ウン）と同形衝突（一致）してしまったのである。