However, because the Hosokawa clan used the Shugo system, a county-by-county ruling system, as the governing system for its territory, it is uncertain whether the Naito clan ruled the whole of Tanba.
但し、細川氏は領国支配政策として分郡守護代制を布いていることから、内藤氏が丹波一国を支配していたかどうかは不明である。