The names 'Sanzen-in Temple' and 'Sanzen-in Monzeki Temple' only came into use after 1871, before which names including 'Kajii Monzeki Temple', 'Kajii Gosho Temple' and 'Kajii Gu Temple' were used with aliases such as 'Nashimoto Monzeki Temple' and 'Entoku-in Temple', but it appears that its formal name was 'Enyu-bo.'
「三千院」あるいは「三千院門跡」という寺名は1871年以降使われるようになったもので、それ以前は「梶井門跡」「梶井御所」「梶井宮」などと呼ばれ、「梨本門跡」「円徳院」などの別称もあり、「円融房」が正式の寺名だったようである。