It had long been considered to be a sub-shrine of Kamo Wake Ikazuchi-jinja Shrine (Kamigamo-jinja Shrine) but some theories claim that the relocation of the main sanctuary in 1055 was the beginning of the shrine's rise to prominence.
当社は長らく賀茂別雷神社（上賀茂神社）の摂社とされてきたが、これは天喜3年の社殿再建が契起となっているとする説がある。