The Iga-Ueno Station has two platforms and three tracks, and the trains on the Iga Line of Iga Railway, converted from the Kintetsu Iga Line, arrive at and depart from this down-train platform.
伊賀上野は2面3線の構造で、下りホームから近鉄伊賀線から転換した伊賀鉄道伊賀線が発着している。