The jurisdiction was transferred to the Commission for Protection of Cultural Properties in 1950, and to the Agency for cultural affairs in 1968, and the museum became an Independent Administrative Institution National Museum in 2001, and in 2007, became a museum to be established by an Independent Administrative Institution, National Institutes for Cultural Heritage.
所管は1950年（昭和25年）文化財保護委員会、1968年（昭和43年）文化庁に変更し、2001年（平成13年）からは独立行政法人国立博物館、2007年（平成19年）からは独立行政法人国立文化財機構の設置する博物館となっている。