The existing main hall was built in 1288 with support by the Governor of Omi Province, Yoritsuna SASAKI and may have been of considerable size.
現存する本堂は、弘安11年（1288年）、近江守護佐々木頼綱の寄進を得て建てられたもので、この頃の金剛輪寺はかなりの規模をもっていたと思われる。