The temple site was formerly Kujo-tei, one of the estates of the Fujiwara clan, and temple originates from the Kujo-do Hall (or Kujo-in) that was operated by FUJIWARA no Michinaga's grandson FUJIWARA no Nobunaga.
寺地は藤原氏の邸宅の一つ九条邸があったところで、ここに藤原道長の孫藤原信長がいとなんだ九条堂（または九条院）を起源とする。