Nison-in Temple is said to have been constructed in the early Heian period between 834 and 847 by Ennin (Jikaku Daishi) under the order of Emperor Saga.
平安時代初期の承和(日本)年中（834年-847年）、嵯峨天皇の勅により円仁（慈覚大師）が建立したと伝える。