Endemic species (fish): Lake Biwa catfish (Siluridae), Biwa rock catfish (Siluridae), willow shiner (Cyprinidae), Biwa oily gudgeon (Cyprinidae), minnow (Cyprinidae)
固有種（魚）ビワコオオナマズ（ナマズ科）、イワトコナマズ（ナマズ科）、ホンモロコ（コイ科）、ビワヒガイ（コイ科）、アブラヒガイ（コイ科）