A myth says Nigihayahi no mikoto descended to the earth by Amenoiwafune Ship, and was associated with the god of air and aviation (Amenoiwafune is interpreted as airplane) and was chosen as the enshrined deity.
饒速日命は神話において天磐船にのって地上に降臨したとされることから、空の神・飛行機の神（天磐船：アメノイワフネ＝飛行機と解釈）として結び付けられ、飛行神社の祭神に選ばれた。