When constructed in 1898 as the chapel of Heian Jogakuin St. Agnes School, it was called "Sei-san-ichi daiseido" (literally a sacred three-one cathedral), but St Agnes Church was organized in 1923 by persons related to Heian Jogakuin St. Agnes School and now, St Agnes Church is called a cathedral.
1898年（明治31年）に平安女学院のチャペルとして建設された当時は聖三一大聖堂と呼よばれていたが、1923年に平安女学院関係者によって聖アグネス教会が組織され、現在ではこちらの名称で呼ばれている。