The origins of Chion-in Temple lie in a thatched hut built by Pure Land sect founder Honenbo Genku (Honen) in the Yoshimizu area of Higashiyama in vicinity of where the temple's Seishi Hall now stands.
知恩院は、浄土宗の宗祖・法然房源空（法然）が東山吉水（よしみず）、現在の知恩院勢至堂付近に営んだ草庵をその起源とする。