Sachverhalt: Sachverhalt: A. Mit Verfügung vom 24. März 1998 lehnte die IV-Stelle des Kantons Thurgau das im April 1996 eingereichte Gesuch um Leistungen der Invalidenversicherung der 1962 geborenen C._ ab. Die dagegen erhobene Beschwerde wies die AHV/IV-Rekurskommission des Kantons Thurgau mit Entscheid vom 14. Dezember 1998 ab. Am 12. November 2001 meldete sich die Versicherte erneut zum Bezug von Leistungen an. Gestützt auf die im Administrativverfahren getroffenen Abklärungen, insbesondere auf das Gutachten des Instituts X._ vom 18. März 2005, lehnte die IV-Stelle mit Verfügung vom 23. März 2005 den Anspruch auf eine Invalidenrente infolge eines Invaliditätsgrades von 16 % erneut ab. Dies bestätigte sie mit Einspracheentscheid vom 29. Juli 2005. Am 12. November 2001 meldete sich die Versicherte erneut zum Bezug von Leistungen an. Gestützt auf die im Administrativverfahren getroffenen Abklärungen, insbesondere auf das Gutachten des Instituts X._ vom 18. März 2005, lehnte die IV-Stelle mit Verfügung vom 23. März 2005 den Anspruch auf eine Invalidenrente infolge eines Invaliditätsgrades von 16 % erneut ab. Dies bestätigte sie mit Einspracheentscheid vom 29. Juli 2005. B. Mit Entscheid vom 10. April 2006 wies die kantonale Rekurskommission die dagegen erhobene Beschwerde ab. B. Mit Entscheid vom 10. April 2006 wies die kantonale Rekurskommission die dagegen erhobene Beschwerde ab. C. C._ lässt Verwaltungsgerichtsbeschwerde führen und beantragen, es sei ihr mit Wirkung ab August 2001 eine halbe Invalidenrente zuzusprechen; eventualiter sei die Streitsache nach Aufhebung des kantonalen Entscheides zur neuen Beurteilung an die Vorinstanz zurückzuweisen. Ferner wird die unentgeltliche Verbeiständung beantragt. Die IV-Stelle schliesst auf Abweisung der Verwaltungsgerichtsbeschwerde, während das Bundesamt für Sozialversicherungen auf eine Vernehmlassung verzichtet. 