Faits: A. Le 22 novembre 2006, le Conseil d'Etat de la République et canton de Genève a adopté le plan localisé de quartier n° 29'468 couvrant un secteur situé à l'angle des rues Maurice-Braillard et de Moillebeau, au Petit-Saconnex. Ce plan prévoit notamment la construction de trois immeubles sur les parcelles n°s 1775, 2247, 2248 et 3056, dont sont propriétaires C._ et la société D._. L'hoirie X._, propriétaire de la parcelle n° 2249, contiguë aux parcelles n°s 2247 et 2248, a vainement contesté ce plan devant le Tribunal administratif de la République et canton de Genève, puis devant le Tribunal fédéral (arrêt 1C_248/2008 du 25 septembre 2008). Le 31 juillet 2009, la société E._ a déposé une demande d'autorisation de construire sur les parcelles n°s 1775, 2247, 2248 et 3056 trois immeubles de logements et commerces et des garages souterrains et d'installer des sondes géothermiques. Elle a en outre requis les autorisations de démolir les bâtiments et les garages existants et d'abattre des arbres sur ces parcelles. Le 17 novembre 2010, le Conseil d'Etat a promulgué la loi n° 10'646 du 24 septembre 2010 déclarant d'utilité publique la réalisation du plan localisé de quartier n° 29'468 et des bâtiments prévus par ce plan. Le 27 avril 2011, le Département des constructions et des technologies de l'information a autorisé l'application des normes de la 3ème zone de développement aux bâtiments à construire sur les parcelles n°s 1775, 2247, 2248 et 3056, selon le dossier présenté. Le 25 mai 2011, le Conseil d'Etat a décrété l'expropriation de la servitude de restriction de bâtir grevant la parcelle n° 1775 au profit de la parcelle n° 2249, en vue de la construction des bâtiments de logements prévus dans le plan localisé de quartier n° 29'468. L'hoirie X._ a recouru contre cette décision auprès de la Chambre administrative de la Cour de justice de la République et canton de Genève. La procédure est toujours pendante à ce jour. Par décisions du 3 juin 2011, le Département des constructions et des technologies de l'information a délivré à E._ l'autorisation de construire requise, portant sur cinq immeubles de logements et commerces, et l'autorisation de démolir les bâtiments et les garages existants. Par décision du même jour, le Département de l'intérieur et de la mobilité a délivré l'autorisation d'abattage d'arbres. Par jugement du 11 septembre 2012, le Tribunal administratif de première instance de la République et canton de Genève a rejeté, en tant qu'il était recevable, le recours formé par l'hoirie X._ contre ces trois autorisations. L'hoirie X._ a recouru le 15 octobre 2012 contre ce jugement auprès de la Chambre administrative de la Cour de justice de la République et canton de Genève et a sollicité la restitution de l'effet suspensif. Cette juridiction a refusé de faire droit à cette requête au terme d'une décision rendue le 19 novembre 2012. B. Agissant par la voie du recours en matière de droit public, Roger et B._, pour l'hoirie X._, demandent au Tribunal fédéral de réformer cette décision en ordonnant la restitution de l'effet suspensif à leur recours cantonal. Ils concluent subsidiairement à l'annulation de la décision attaquée et au renvoi de la cause à la Cour de justice pour nouvelle décision dans le sens des considérants. Ils se plaignent d'une violation de leur droit d'être entendus et d'arbitraire dans l'établissement des faits, dans l'appréciation des preuves et dans l'application du droit cantonal. La Cour de justice a renoncé à se déterminer. Le Département de l'urbanisme, qui a succédé au Département des constructions et des technologies de l'information, et le Département de l'intérieur, de la mobilité et de l'environnement concluent au rejet du recours dans la mesure où il est recevable. Les intimées proposent de déclarer le recours irrecevable, subsidiairement de le rejeter, et de confirmer la décision sur effet suspensif. Les recourants ont répliqué. 