Sachverhalt: A. Y._ richtete am 18. Juli 2006 über die Internetauktionsplattform A._ im Namen der B._ AG ein Konto ein. Im Auftrag von X._ bot er vom 21. Juli 2006 bis zum 24. Juli 2006 nicht vorhandene Mobiltelefone und Notebooks an und forderte die Gewinner der Auktion zur Vorauszahlung auf. Er veranlasste die Überweisung der Vorauszahlungen auf das Konto der B._ AG und erhielt von X._ einen Anteil am Erlös ausbezahlt. X._ lieferte die Ware nicht, weil ihm zur Beschaffung die finanziellen Mittel fehlten. Am 7. August 2006 startete er eine neue Auktion auf C._. Bei beiden Auktionen kam es nicht in allen Fällen zu Zahlungen der Auktionsgewinner. B. Das Kreisgericht VIII Bern-Laupen sprach X._ und Y._ am 21. November 2007 des mittäterschaftlich begangenen mehrfachen Betrugs und Versuchs dazu schuldig. X._ verurteilte es zu einer Freiheitsstrafe von 16 Monaten und zwei Tagen und Y._ zu einer Geldstrafe von 120 Tagessätzen zu je Fr. 90.--. Dagegen erhoben die Staatsanwaltschaft III Bern-Mittelland und die Verurteilten Appellation. Das Obergericht des Kantons Bern, 1. Strafkammer, sprach X._ und Y._ mit Urteil vom 27. November 2008 von den Anschuldigungen frei. C. Mit Beschwerde in Strafsachen beantragt die Generalprokuratur des Kantons Bern, das Urteil des Obergerichts sei aufzuheben und die Sache zu neuer Entscheidung an die Vorinstanz zurückzuweisen. D. Das Obergericht des Kantons Bern verzichtet auf Vernehmlassung. X._ und Y._ beantragen die Abweisung der Beschwerde. Zudem ersucht Y._ um amtliche Verteidigung. 