Sachverhalt: A. Mit Urteil des Bezirksgerichtes A._ vom 20. September 1995 wurde die Ehe von Y._, geb. 1948, und X._, geb. 1946, geschieden. Y._ wurde verpflichtet, X._ nacheheliche Unterhaltsbeiträge von Fr. 2'500.-- bis zum vollendeten 16. Altersjahr des jüngsten Kindes, d.h. bis zum 30. Juli 1998, von Fr. 2'000.-- ab 1. August 1998 bis zum Eintritt von X._ ins AHV-Alter und von Fr. 1'500.-- für die Zeit danach zu bezahlen. B. B.a Y._ machte am 29. Juni 2006 beim Bezirksgericht A._ ein Verfahren auf Abänderung des Ehescheidungsurteils anhängig. Mit Verfügung des Einzelrichters vom 28. August 2006 wurde die Abänderungsklage - nachdem Y._ mit Schreiben vom 24. August 2006 die Abschreibung des Verfahrens beantragt hatte - als durch Rückzug erledigt abgeschrieben. B.b Am 31. Oktober 2006 reichte Y._ beim Bezirksgericht B._ Klage auf Abänderung des Scheidungsurteils ein und beantragte, es sei festzustellen, dass er seit dem 1. Juli 2006 keinen nachehelichen Unterhalt mehr schulde. Eventualiter verlangte er die Neufestsetzung des Unterhaltsbeitrages per 1. Juli 2006. Im Übrigen ersuchte er um Gewährung der unentgeltlichen Rechtspflege. Mit Urteil vom 15. November 2007 reduzierte das Bezirksgericht B._ den Unterhaltsbeitrag auf Fr. 1'468.60 bis zum Eintritt von X._ ins AHV-Alter und auf Fr. 1'101.45 für die Zeit danach. Y._ wurde die unentgeltliche Rechtspflege bewilligt. B.c Gegen dieses Urteil reichte Y._ Appellation ein und beantragte die Aufhebung des Urteils in allen Teilen sowie die Feststellung, dass er seit dem 1. November 2006 keinen nachehelichen Unterhalt mehr schulde. Mit Anschlussappellation verlangte auch X._ die vollumfängliche Aufhebung des Urteils. Zudem beantragte sie, dass auf die Klage nicht einzutreten sei. Mit Urteil vom 27. November 2008 hob das Obergericht des Kantons Aargau das erstinstanzliche Urteil in teilweiser Gutheissung der Appellation von Y._ auf und setzte den Unterhaltsbeitrag ab 1. November 2006 auf Fr. 400.-- fest. Y._ wurde die unentgeltliche Rechtspflege gewährt. C. Mit Beschwerde in Zivilsachen vom 2. Februar 2009 ist X._ (fortan: Beschwerdeführerin) an das Bundesgericht gelangt. Sie verlangt die Aufhebung des obergerichtlichen Urteils und das Nichteintreten auf die Abänderungsklage. Eventualiter sei das Urteil des Bezirksgerichts B._ zu bestätigen, wonach Unterhaltsbeiträge von Fr. 1'468.60 bis zu ihrem Eintritt ins AHV-Alter und von Fr. 1'101.45 für die Zeit danach zu leisten waren. Subeventualiter sei ein Unterhaltsbeitrag von Fr. 445.-- ab 1. November 2006 und von Fr. 908.-- ab Eintritt von Y._ (fortan: Beschwerdegegner) ins AHV-Alter zu bezahlen. Dies unter Kosten- und Entschädigungsfolge für alle Instanzen. Es sind keine Vernehmlassungen eingeholt worden. 