Sachverhalt: A. B._, geboren 1966, erlitt am 11. Dezember 2000 einen Autounfall (Auffahrkollision). Gemäss Bericht des Dr. med. M._, den sie am nächsten Tag aufsuchte, hatte sie dabei ein Schleudertrauma erlitten (Bericht vom 12. Januar 2000). Die "La Suisse" Unfall-Versicherungs-Gesellschaft (heute: Helsana Unfall AG; nachfolgend Helsana) kam als obligatorischer Unfallversicherer für die Heilbehandlung auf und erbrachte Taggelder. Mit Verfügung vom 28. September 2004 stellte sie ihre Leistungen auf den 30. September 2004 ein und hielt daran auch auf Einsprache hin fest (Einspracheentscheid vom 13. Dezember 2005). B. Die dagegen erhobene Beschwerde hiess das Verwaltungsgericht des Kantons Luzern mit Entscheid vom 9. November 2007 in dem Sinne gut, als der Einspracheentscheid vom 13. Dezember 2005 aufgehoben und die Sache an die Helsana zurückgewiesen wurde, damit diese nach erneuter Prüfung des adäquaten Kausalzusammenhangs im Sinne der Erwägungen neu verfüge. Zur Begründung führte sie an, dass gemäss dem von der Invalidenversicherung eingeholten Gutachten der Medizinischen Abklärungsstelle (MEDAS) vom 16. September 2004 die Behandlung vor allem der unfallbedingten Kopfschmerzen noch nicht genügend ausgeschöpft sei, sodass von einer Fortsetzung der Heilbehandlung noch eine namhafte Besserung des Gesundheitszustandes erwartet werden könne. Die von der Helsana vorgenommene Adäquanzprüfung sei damit verfrüht erfolgt. Die Sache sei daher an den Unfallversicherer zurückzuweisen zum Abschluss der Heilbehandlung. C. Die Helsana führt Beschwerde in öffentlich-rechtlichen Angelegenheiten mit dem Antrag, der angefochtene Entscheid sei aufzuheben. Mit Eingabe vom 10. April 2008 nimmt sie Stellung hinsichtlich der präzisierten Schleudertrauma-Praxis. Während B._ auf Abweisung der Beschwerde schliessen lässt, verzichtet das Bundesamt für Gesundheit auf eine Vernehmlassung. 