Fatti: Fatti: A. In data 27 marzo 1998, V._, nato nel 1959, al momento dei fatti alle dipendenze, quale direttore, della C._ SA e, come tale, assicurato d'obbligo contro gli infortuni presso la Suisse Assicurazioni, è rimasto vittima di un tamponamento, mentre, alla guida del proprio autoveicolo, era fermo in colonna. I medici del pronto soccorso dell'Ospedale X._, cui l'interessato si è rivolto il giorno seguente a causa dell'insorgere di dolori cervicali bilaterali irradianti verso il capo, hanno posto la diagnosi di trauma d'accelerazione al rachide cervicale ed hanno attestato una limitazione lavorativa del 100% dalla medesima data. Dopo circa una settimana, l'assicurato ha consultato il dott. M._ lamentando sensazioni vertiginose, cefalee fronto-occipitali e disturbi del sonno. Il caso è stato assunto dalla Suisse Assicurazioni, la quale ha corrisposto le prestazioni di legge. In seguito al persistere dei disturbi, l'assicurato si è sottoposto, privatamente, a un esame neuropsicologico eseguito dalla dott.ssa O._, la quale ha attestato un'incapacità lavorativa del 50-60%, poi a una perizia neurologica/neuropsicologica a cura del dott. U._, specialista in neurologia, che ha accertato un'inabilità del 75%. L'assicuratore infortuni ha dal canto suo ordinato una perizia a cura dei medici della Clinica Z._, i quali hanno concluso per una capacità lavorativa dell'interessato del 60% proponendo un soggiorno in una clinica specializzata in riabilitazione. Durante il mese di agosto 2001, l'assicurato ha quindi soggiornato presso il Centro Y._, i cui sanitari al momento della dimissione hanno attestato una capacità lavorativa del 20%. Alla luce delle risultanze dei numerosi accertamenti medici eseguiti, con decisione del 17 dicembre 2004, la Suisse Assicurazioni ha dichiarato estinto il diritto dell'assicurato a prestazioni assicurative con effetto dal 1° febbraio 2000 - data a partire dalla quale il Centro I._, in una perizia redatta per conto dell'AI, ha considerato stabilizzato lo stato di salute dell'interessato - per carenza del necessario nesso di causalità adeguata tra i problemi di salute e l'infortunio. L'assicuratore infortuni ha tuttavia rinunciato a pretendere la restituzione delle indennità versate fino al 2004. Il provvedimento è stato successivamente confermato dalla Helsana Assicurazioni SA (nel frattempo subentrata alla Suisse Assicurazioni) in data 26 settembre 2005 in seguito all'opposizione presentata dall'assicurato. Il provvedimento è stato successivamente confermato dalla Helsana Assicurazioni SA (nel frattempo subentrata alla Suisse Assicurazioni) in data 26 settembre 2005 in seguito all'opposizione presentata dall'assicurato. B. Patrocinato dall'avv. Max Sidler, V._ si è aggravato al Tribunale delle assicurazioni del Cantone Ticino, chiedendo la condanna dell'Helsana al versamento di una rendita di invalidità dell'80% come pure di un'indennità per menomazione dell'integrità del 50%. Per giudizio del 1° febbraio 2006, la Corte cantonale ha, in accoglimento del ricorso, accertato l'esistenza di un nesso causale naturale e adeguato tra l'incidente della circolazione del 27 marzo 1998 e i danni alla salute lamentati dall'assicurato e rinviato l'incarto all'Helsana affinché si pronunciasse sul diritto a prestazioni dopo il 31 gennaio 2000. Per giudizio del 1° febbraio 2006, la Corte cantonale ha, in accoglimento del ricorso, accertato l'esistenza di un nesso causale naturale e adeguato tra l'incidente della circolazione del 27 marzo 1998 e i danni alla salute lamentati dall'assicurato e rinviato l'incarto all'Helsana affinché si pronunciasse sul diritto a prestazioni dopo il 31 gennaio 2000. C. La Helsana ha interposto un ricorso di diritto amministrativo al Tribunale federale delle assicurazioni (dal 1° gennaio 2007: Tribunale federale), al quale chiede l'annullamento della pronuncia cantonale e la conferma della decisione su opposizione del 26 settembre 2005. Dei motivi si dirà, per quanto occorra, nei considerandi. Chiamato a pronunciarsi sul gravame, V._, sempre rappresentato dall'avv. Sidler, ne ha proposto la reiezione, mentre l'Ufficio federale della sanità pubblica ha rinunciato a determinarsi. 