Faits: A. Le 30 octobre 2006, le Chef du Département genevois des institutions (ci-après: le département) a chargé l'avocat genevois A._ d'analyser le fonctionnement de la direction de la police judiciaire genevoise (ci-après: PJ). Me A._ a rendu son rapport le 28 février 2007, après avoir entendu plusieurs membres de la PJ ainsi que son chef, B._; il faisait état de divers manquements de ce dernier dans l'exercice de ses fonctions. L'audit a été remis à l'intéressé le 15 mars 2007 par le Chef du Département, qui lui a indiqué que, dans sa séance du 7 mars 1997, le Conseil d'Etat avait décidé de ne pas le reconduire dans ses fonctions; une conférence de presse a été tenue le même jour, et le rapport a été distribué et publié sur le site internet de l'Etat de Genève et de la police. Le 5, puis le 30 avril 2007, B._ s'est plaint auprès du Chef du Département de ce que certains journaux avaient eu accès prématurément au rapport d'audit; il demandait le retrait du rapport du site internet de l'Etat de Genève, et l'accès à tout le dossier d'audit (procès-verbaux, notes et documents). Il lui fut répondu que le rapport avait été retiré du site de l'Etat le 4 mai 2007, mais que le dossier relatif à l'établissement de ce rapport n'était pas accessible, conformément à l'art. 25 al. 4 de la loi genevoise sur l'information du public et l'accès aux documents, du 5 octobre 2001 (LIPAD). La médiation instituée par la LIPAD ayant échoué, le Chef du département a rejeté la demande d'accès par décision du 22 juin 2007: la décision de non-confirmation n'étant pas susceptible de recours, B._ ne pouvait fonder son droit d'accès sur les règles de la procédure administrative. B. B._ a saisi le Tribunal administratif genevois, en prenant les conclusions suivantes: 1. [...] Préalablement 2. Ordonner aux autorités intimées, le cas échéant à A._, de remettre au tribunal de céans l'intégralité du dossier relatif à l'établissement du rapport du 28 février 2007. 3. Ordonner aux autorités intimées de communiquer au tribunal l'heure exacte à laquelle le rapport a été publié sur les sites, de même que la personne ou l'autorité qui a décidé de le publier sur le site intranet de la police. [...] Principalement 5. Annuler la décision du département du 22 juin 2007. Sur la publication du rapport d'audit: 6. Dire que la diffusion, sur les sites de l'Etat de Genève et de la police, du rapport du 28 février 2007 a été faite en violation de la LIPAD. 7. Condamner les autorités intimées à faire diffuser l'arrêt du tribunal de céans dans divers médias. Sur la transmission du dossier relatif à l'établissement du rapport d'audit: 8. Transmettre, le cas échéant ordonner au département, au Conseil d'Etat et à Me A._ de transmettre au recourant l'intégralité du dossier relatif au rapport d'audit. Si par impossible le tribunal de céans devait considérer que les procès-verbaux ne sont pas encore approuvés au sens de l'art. 25 al. 4 LIPAD 9. Soumettre, cas échéant ordonner au département, au Conseil d'Etat et à Me A._ de soumettre aux personnes interrogées le procès-verbal les concernant pour approbation. 10. Les transmettre, cas échéant ordonner au département, au Conseil d'Etat et à Me A._, sous la menace des peines prévues à l'art. 292 CP, de les transmettre au recourant. [...] Le 4 mars 2008, le Tribunal administratif a rendu un arrêt sur partie par lequel il a notamment déclaré irrecevables les conclusions n° 3, 6 et 7 du recours cantonal. La décision attaquée portait uniquement sur le refus du département de communiquer le dossier relatif au rapport d'audit. Les conclusions tendant à l'obtention de renseignements sur la diffusion de ce rapport et à la publication du dispositif de l'arrêt relevaient de l'action en rectification au sens des art. 35 à 38 LIPAD; seuls les organes officiels énoncés à l'art. 35 al. 2 de la loi avaient qualité pour former une telle action. Le recourant avait d'ailleurs agi tardivement, soit après le délai de dix jours à compter de la diffusion litigieuse. Le Tribunal administratif a par ailleurs mis hors de cause le Conseil d'Etat, et appelé en cause Me A._ afin que ce dernier produise son dossier. C. B._ forme un recours en matière de droit public par lequel il demande l'annulation de l'arrêt du Tribunal administratif en tant qu'il déclare irrecevables les conclusions n° 3, 6 et 7 de son recours cantonal. Le Tribunal administratif persiste dans les considérants et dispositif de son arrêt. Le département conclut au rejet du recours en tant qu'il est recevable. Le recourant a répliqué. 