Faits: A. A.a A._, plâtrier-peintre né en 1954, s'est fracturé le calcanéum droit en tombant d'une échelle le 31 juillet 1986. Le cas a été pris en charge par la Caisse nationale suisse d'assurance en cas d'accidents (CNA). Vu la persistance d'une incapacité totale de travail en dépit des soins prodigués par le docteur S._ et d'un séjour à la Clinique X._ du 25 novembre 1986 au 6 février 1987, A._ a présenté le 10 juin 1987 une demande de prestations de l'assurance-invalidité en vue d'un reclassement et d'une rente. Du 10 février au 9 mai 1988, il a bénéficié d'un stage d'observation professionnelle. Par décision du 19 avril 1989, la CNA a octroyé à A._ dès le 1er mai 1988 une rente d'invalidité pour une incapacité de gain de 20 % et une indemnité pour atteinte à l'intégrité, compte tenu d'une diminution de l'intégrité de 15 %. A partir du 24 octobre 1989, l'assuré a débuté une activité indépendante de peintre en bâtiment. L'office régional AI a mis fin aux mesures tendant à sa réadaptation professionnelle. A.b Dès février 1991, A._ a cessé toute activité pour des raisons de santé. Le 23 septembre 1991, il a présenté une demande de prestations de l'assurance-invalidité. Dans un rapport du 20 janvier 1992, le docteur P._, médecin traitant, a diagnostiqué une protrusion discale L4-L5, une discarthrose L5-S1 avec ostéophytose intra-foraminale gauche et un syndrome radiculaire algo-sensitif S1. Il indiquait que le patient était totalement incapable de travailler dans son activité de peintre, mais qu'une autre activité n'exigeant pas trop d'efforts physiques était possible. Dans un prononcé présidentiel du 16 juin 1992, la Commission cantonale genevoise de l'assurance-invalidité a conclu à une invalidité de 50 % depuis le 10 février 1992. Elle se fondait sur un rapport de l'office régional AI du 9 juin 1992, lequel, d'entente avec le docteur P._, admettait que l'assuré pouvait travailler à mi-temps. Par décision du 18 décembre 1992, la Caisse cantonale genevoise de compensation a alloué à A._ une demi-rente d'invalidité à partir du 1er février 1992 pour une invalidité de 50 %. A.c Le 20 septembre 1993, A._ a présenté une demande de révision de son droit à une rente d'invalidité tendant à l'octroi d'une rente entière, demande que la caisse de compensation a rejetée par décision du 11 mai 1994. Par jugement du 16 novembre 1994, la Commission cantonale genevoise de recours en matière d'AVS/AI a annulé cette décision, le dossier étant renvoyé à la Commission de l'assurance-invalidité pour expertise médicale. Dans un rapport du 7 avril 1995, les médecins de l'Hôpital Y._ ont posé les diagnostics de lombalgies chroniques et d'ancienne fracture du calcanéum droit avec arthrose de l'articulation sous-astragalienne et dysfonction de l'articulation de Chopard à droite. Ils indiquaient que compte tenu de l'aggravation des douleurs chroniques et de la durée de l'incapacité de travail, l'assuré présentait une incapacité de travail de 100 % dans sa profession. Par décision du 18 juillet 1995, l'Office de l'assurance-invalidité du canton de Genève a avisé A._ que le degré de son invalidité n'avait pas changé au point d'influencer son droit à la rente et qu'il continuait à bénéficier d'une demi-rente d'invalidité. Par jugement du 9 février 1996, la Commission cantonale genevoise de recours en matière d'AVS/AI a rejeté le recours formé par celui-ci contre cette décision. A.d Le 7 juillet 1997, A._ a présenté une nouvelle demande de révision de son droit à une demi-rente d'invalidité. Dans un questionnaire du 11 juillet 1997, il a fait état d'une aggravation de son état de santé depuis 1994, en indiquant qu'il avait constamment mal au dos. Dans un rapport du 19 août 1997, le docteur L._, spécialiste FMH en médecine interne et médecin traitant de l'assuré depuis le 3 juin 1997, a diagnostiqué des lombosciatalgies L5-S1, une discopathie radiologiquement confirmée et des séquelles d'une fracture du calcanéum. Il ne s'est pas prononcé sur l'évolution de l'état de santé et a admis une incapacité de travail sans la quantifier, estimant qu'elle était « à réévaluer ». Le 8 septembre 1997, A._ a subi un examen par résonance magnétique lombaire. Dans un rapport IRM daté du même jour, le docteur R._ a conclu à l'existence de discopathies L4-L5 et L5-S1 évoluées, à l'absence de hernie discale et à la présence de séquelles étagées de Scheuermann. Dans un avis SMR du 5 décembre 1997, le docteur C._, médecin-conseil de l'office AI, a nié l'existence d'une aggravation de l'état de santé de l'assuré et proposé le maintien du droit à une demi-rente. Le docteur D._, qui a soigné A._ dès le 28 août 1997, a diagnostiqué des lombalgies basses chroniques et lui a reconnu une incapacité totale de travail dans l'activité de plâtrier-peintre depuis le 12 septembre 1997. Pour ce praticien, l'état de santé de son patient était stationnaire (rapport médical du 21 avril 1998). Par décision du 8 juin 1998, l'office AI a rejeté la demande de révision. Il informait A._ que les renseignements recueillis dans le cadre de la procédure de révision de son droit à la rente ne permettait pas d'admettre une aggravation de son état de santé qui puisse justifier le droit à une rente entière d'invalidité. A.e A partir du 21 février 2005, l'office AI a procédé à la révision du droit de A._ à une demi-rente d'invalidité. Dans un questionnaire du 4 mars 2005, l'assuré a indiqué que son état de santé s'était aggravé, qu'il avait été soigné par le docteur T._ en avril 2002, qu'aucun traitement médical n'était en cours et qu'il exerçait la profession de plâtrier-peintre en qualité d'indépendant mais était toutefois sans activité depuis juin 2004. Le docteur T._, qui avait admis que la capacité de travail de A._ était de 50 % dès le 11 mars 2002 et que son incapacité de travail était totale depuis le 15 avril 2002 (certificat médical du 12 mars 2002), n'a pas répondu à la demande de renseignements médicaux de l'office AI, n'ayant plus revu son patient depuis le 18 avril 2002 (rapport du 8 avril 2005). La doctoresse N._, rhumatologue et médecin traitant depuis le 15 juin 2005, a posé les diagnostics ayant des répercussions sur la capacité de travail de lombalgies chroniques sur troubles statiques et dégénératifs du rachis et de status post-fracture du calcanéum droit avec pied plat secondaire. Elle a fixé l'incapacité de travail de A._ à 50 % depuis 1991 dans l'activité de plâtrier-peintre (rapport médical du 25 juillet 2005). Dans une lettre du 12 septembre 2005, elle a informé l'office AI qu'elle avait commis une erreur en remplissant le certificat médical du 25 juillet 2005 en ce sens qu'elle n'avait jamais « effectué d'incapacité de travail » et qu'elle avait mentionné une incapacité de travail de 50 % sur la base des déclarations de son patient qui lui avait déclaré être au bénéfice d'une rente AI pour une invalidité de 50 %. Réinterpelée sur la question de l'incapacité de travail de l'assuré, la doctoresse N._ a précisé avoir suivi le patient du 15 juin au 23 septembre 2005. Se fondant sur son dossier, elle a estimé que l'évolution était favorable malgré un très léger handicap au niveau du pied et que, de ce fait, la capacité de travail était de 100 % dans l'activité de peintre avec une éventuelle diminution de rentabilité de 10 à 20 % (rapport du 30 mars 2006). La Winterthur Vie, assureur privé de A._, a demandé une expertise pluridisciplinaire au Centre Z._, qui l'a confiée aux doctoresses G._, spécialiste FMH en rhumatologie, et B._, spécialiste FMH en psychiatrie-psychothérapie, ainsi qu'au docteur O._, spécialiste FMH en gastroentérologie. Dans leur rapport du 14 février 2006, les experts ont posé le diagnostic de spondylodiscarthrose (cervicale et lombosacrée), de séquelles modérées de la maladie de Scheuermann, d'arthrose sous-astragalienne après fracture du calcanéum et de porphyrie cutanée tardive avec manifestations hépatiques et cutanées. S'agissant des séquelles de la fracture du calcanéum, les experts ont constaté que l'expertisé s'en était accommodé, qu'il pouvait marcher normalement même en terrain accidenté et qu'il ne formulait aucune plainte spontanée en rapport avec le pied droit. Au niveau du rachis, les experts ont retenu que l'évolution radiologique avait été relativement stationnaire entre 1997 et 2005, qu'il n'existait pas de canal étroit, tout au plus un canal dans la limite inférieure de la norme, que les signes d'arthrose postérieure étaient modérés et qu'il n'y avait pas de hernie discale surajoutée. Tenant compte de l'absence de suivi médical tant pour le dos que pour la porphyrie et d'une discordance entre l'importance du handicap allégué et l'absence de suivi médical, les experts ont considéré que les lésions ne justifiaient pas une incapacité de travail importante. Ainsi, ils ont admis une capacité de travail entière dans l'activité de peintre avec une diminution de rendement de 20 % en raison des douleurs liées au port de charges et à certaines positions en porte-à-faux. Dans une activité adaptée, la capacité de travail était complète sans diminution de rendement. Sur la base de cette expertise et de l'avis de la doctoresse N._, le docteur V._, médecin au SMR, a fait siennes les conclusions de l'expertise concernant la capacité de travail et a précisé que la porphyrie cutanée tardive pouvait être traitée et était sans influence sur la capacité de travail (avis médical du 27 mars 2007). Dans un préavis du 19 avril 2007, l'office AI a avisé A._ qu'il avait recouvré une capacité de travail totale dans toute activité adaptée aux limitations fonctionnelles et qu'en conséquence les conditions d'une révision de son droit à la rente étaient données pour qu'elle soit supprimée, son invalidité étant largement inférieure à 40 %. Par décision du 15 juillet 2008, l'office AI a supprimé le droit de A._ à une rente d'invalidité dès le premier jour du deuxième mois suivant la notification de la décision. B. A._ a formé recours contre cette décision devant le Tribunal cantonal des assurances sociales de la République et canton de Genève, en concluant, sous suite de dépens, à l'annulation de celle-ci et au maintien de son droit à une demi-rente d'invalidité. A titre préalable, il invitait la juridiction cantonale à procéder à l'audition de la doctoresse N._ et du docteur D._. Interpellés par le juge instructeur, la doctoresse N._ et le docteur D._ ont répondu dans un questionnaire daté respectivement des 20 et 24 janvier 2009. Les parties ont pu présenter leurs observations. Par jugement du 31 mars 2009, le Tribunal cantonal des assurances sociales a rejeté le recours. Il a considéré que les conditions de suppression du droit à une demi-rente par voie de révision n'étaient pas remplies, attendu qu'il n'y avait eu aucune évolution, aggravation ou amélioration, de l'état de santé de l'assuré entre 1998 et 2008. Il a confirmé la décision de suppression du droit à la rente pour le motif substitué que les conditions d'une reconsidération étaient données. C. A._ interjette un recours en matière de droit public contre ce jugement, dont il demande l'annulation. Sous suite des frais et dépens, il conclut principalement au renvoi de la cause au Tribunal cantonal pour instruction complémentaire sous forme d'une expertise. A titre subsidiaire, il conclut à l'octroi d'une demi-rente d'invalidité. L'office de l'assurance-invalidité du canton de Genève conclut au rejet du recours. De son côté, l'Office fédéral des assurances sociales a renoncé à se déterminer. 