Nesinonimna supstitucija
Nesinonimna supstitucija je nukleotidna mutacija koja mijenj sekvencu aminokiselina nekog proteina. Razlikuje se od sinonimnih, koje ne menjaju sekvence aminokiselina i jesu (ponekad) tihe mutacije. Kako nesinonimne supstitucije rezultiraju biološkom promjenom u organizmu, podliježu prirodnoj selekciji. Nesinonimske zamjene na određenim lokusima mogu se uporediti sa sinonimnim zamjenama na tom lokusu da bi se dobi o omjer Ka/Ks. Taj omjer koristi se za mjerenje brzine evolucije genskih sekvenci. Ako gen ima niže razine nesinonimnih nego sinonimimnih supstitucija nukleotida, onda se može zaključiti da je funkcionalan, jer omjer Ka/Ks < 1 označava sekvence koje su ograničena na kodiranje proteina. Nesinonimna supstitucija se također referira i kao zamjenska mutacija.