GAS5
Protein 5 specifičnog zastoja rasta kontrolira dugolančana nekodirajuća RNK koja je kod ljudi kodirana genom GAS5 sa hromosoma 1. GAS5 nekodirajuća RNK, koja se acumulira i ćelijama sa zastojem rasta djeluje na element hormonskog odgovora za glukokortikoidni receptor (GR) i tako blokira nadregulciju ekspresije gena aktiviranog GR. Brojne studije povezuju GAS5 sa apoptozama i može imati ulogu u napredovanju nekih tipova raka. GAS5 introni sadrže nekoliko snoRNK sekvenci, uključujući SNORD81, SNORD47, SNORD80, SNORD79, SNORD78, SNORD44, SNORD78, SNORD44, SNORD78, SNORD44, SNORD 7, SNORD76, SNORD75|SNORD75 i SNORD74. Ove intronske sekvence su konzerviranije od egzona gena domaćina, a ti tipovi gena često nazivaju se "geni iznutra prema van". Nedavno je otkriveno da nonsens posredovana degradacija može regulirati funkciju GAS5 u čelijama sisara. Sadržaj gena u genomu sisara je tema od velikog interesa. Dok su nacrt sekvence sada dostupne za genome čovjeka, miša (www.ensembl.org/Mus_musculus) i pacova (http://hgsc.bcm.tmc.edu/projects/rat Arhivirano 29. 12. 2008. na Wayback Machine), izazov ostaje da ispravno identifikuju sve kodirajuće gene. Poteškoće u dešifriranju strukture gena sisara nastaju zbog nekoliko faktora, uključujući velike količine intervenirajuće (nekodirajuće) sekvence, nesavršenost algoritama za predviđanje gena (3) i nepotpunost resursa sekvence cDNK, od kojih se mnogi sastoje od gena, promjenjive dužine i kvaliteta. Sekvence cDNK pune dužine su izuzetno korisne za određivanje genomske strukture gena, posebno kada se analiziraju u kontekstu genomske sekvence. Kako bi olakšali napore u identifikaciji gena i da bi katalizirali eksperimentalno istraživanje, Nacionalni institut za zdravlje (NIH) pokrenuo je program za prikupljanje gena sisara (MGC) (4) s ciljem pružanja slobodno dostupnih, visokokvalitetnih sekvenci za validiranu, kompletnu ORF cDNK klonovi. U ovom članku opisujemo naš napredak prema cilju identificiranja i preciznog sekvenciranja najmanje jednog potpunog klona cDNK koji sadrži ORF za svaki ljudski i mišji gen, kao i da se ovi potpuno sekvencionirani klonove učine dostupnim bez ograničenja.