Mikrobiota
Mikrobiota je raspon mikroorganizama koji mogu biti komensalni, simbiotski ili patogeni koji se nalaze u i na svim višećelijskim organizmima, uključujući biljke. Mikrobiota uključuje bakterije, arheje, protiste, gljive i viruse, i utvrđeno je da su ključni za imunsku, hormonsku i metaboličku homeostazu njihovog domaćina. Termin mikrobiom opisuje ili kolektiv mikrobnih genoma u ekološkoj niši ili unutar samih mikroba. Mikrobiom i domaćin pojavili su se tokom evolucije kao sinergijska jedinica iz epigenetičkih i genetičkih karakteristika, ponekad zajednički nazvani holobiont. Prisutnost mikrobiote u crijevima ljudi i ostalih metazoa je ključna za razumijevanje koevolucije između metazoa i bakterija. Mikrobiota ima ključnu ulogu u imunskim i metaboličkim odgovorima crijeva putem svojih proizvoda fermentacije (kratkolančana masna kiselina), acetat. bakterije|bakterija]] na ljudskoj koži Sve biljke i životinje, od jednostavnih oblika života do ljudi, žive u bliskoj vezi sa mikrobnim organizmima. Nekoliko napredaka je dovelo do percepcije mikrobioma, uključujući: sposobnost izvođenja analize genomske i genske ekspresije pojedinačnih ćelija i čitavih mikrobnih zajednica u disciplinama metagenomika i metatranskriptomika baze podataka dostupne istraživačima iz više disciplina metodi matematičke analize pogodne za složene skupove podataka Biolozi su shvatili da mikrobi čine važan dio fenotipa organizma, daleko izvan povremene simbiotske studije slučaja.