Cis-regulatorni element
Cis-regulatorni elementi (CRE) ili Cis-regulatorni moduli (CRM) su regije nekodirajuće DNK koja regulira transkripciju susjednih gena. CRE su vitalne komponente genetičke regulatorne mreže, koje zauzvrat kontrolišu morfogenezu, razvoj anatomskih struktura i druge aspekte embrijskog razvoja, proučavane u evolucijskoj razvojnoj biologiji. CRE se nalaze u blizini gena koje regulišu. Obično regulišu transkripciju gena, vezivanjem za transkripcijske faktore. Jedan faktor transkripcije može se vezati za mnoge CRE, i stoga kontrolirati ekspresiju mnogih gena (plejotropija). Latinski prefiks „cis“ znači „na ovoj strani“, tj. na istoj molekuli DNK kao i gen(i) koji će se transkribovati. CRM su dijelovi DNK, obično dužine 100–1000 baznih parova DNK, gdje se određeni broj transkripcijskih faktora može vezati i regulisati ekspresiju obližnjih gena i regulisati njihovu brzinu transkripcije. Označeni kao cis jer se obično nalaze na istom lancu DNK kao i geni koje kontroliraju, za razliku od trans, što se odnosi na efekte na gene koji nisu locirani na istoj niti ili dalje, kao što su faktori transkripcije. Jedan cis-regulatorni element može regulisati nekoliko gena, i obrnuto, jedan gen može imati nekoliko cis-regulatornih modula. Cis-regulatorni moduli obavljaju funkciju integracijom aktivnih transkripcijskih faktora i pripadajućih kofaktora u određenom vremenu i mjestu u ćeliji gdje se ova informacija čita i eksprimira. CRE su često, ali ne uvijek uzvodno od mjesta transkripcije. CRE su u suprotnosti sa trans-regulatorrnim elementima (TRE-ovima).