Bakterijska transkripcija
Bakterijska transkripcija je proces u kojem se segment bakterijske DNK kopira u novosintetizirani lanac informacijske RNK (iRNK) uz korištenje enzima RNK-polimeraza. Proces se odvija u tri glavna koraka: inicijacija, elongacija i terminacija; a krajnji rezultat je lanac iRNK koji je komplementaran jednom lancu DNK. Općenito, transkribirani region obuhvata više od jednog gena. U stvari, mnogi prokariotski geni se javljaju u operonima, koji su niz gena koji rade zajedno da kodiraju isti protein ili genski proizvod i kontrolira ih jedan promotor. Bakterijska RNK-polimeraza sastoji se od četiri podjedinice i kada se spoji peta podjedinica, nazvana σ-faktor, polimeraza može prepoznati specifične vezujuće sekvence u DNK, zvane promotori. Vezivanje σ-faktora za promotor je prvi korak u inicijaciji. Jednom kada se σ-faktor oslobodi iz polimeraze, nastavlja se elongacija. Polimeraza nastavlja niz dvolančanu DNK, odmotavajući je i sintetizirajući novi lanac iRNK, sve dok ne dođe do mjesta završetka. Postoje dva mehanizma raskida koja su detaljnije razmotrena u nastavku. Završetak je potreban na određenim mjestima da bi se pojavila odgovarajuća ekspresija gena. Ekspresija gena određuje koliko genskog proizvoda, kao što je protein, proizvodi gen. Transkripciju vrši RNK-polimeraza, ali je njena specifičnost kontrolirana specifičnom sekvencom DNK-vezujućim proteinima koji se nazivaju transkripcijski faktori. Transkripcijski faktori rade na prepoznavanju specifičnih sekvenci DNK i na osnovu potreba ćelija, promovišu ili inhibiraju dodatnu transkripciju. Slično ostalim taksonima, bakterije doživljavaju nalete transkripcije. Rad Jonesovog tima u Jones et al 2014 objašnjava neke od osnovnih uzroka pucanja i druge varijabilnosti, uključujući stabilnost rezultirajuće iRNK, jačinu promocije kodirane u relevantnom promotoru i trajanje transkripcije zbog jačine TF-vezujućeg mjesta. Također su otkrili da se bakterijski TF-ovi zadržavaju prekratko za TF-ske‍ '​ karakteristike vezivanja kako bi se objasnila kontinuirana transkripcija rafala. Bakterijska transkripcija se razlikuje od eukariotske transkripcije na nekoliko načina. Kod bakterija, transkripcija i translacija se mogu odvijati istovremeno u ćelijskoj citoplazmi, dok se kod eukariota transkripcija dešava u jedru, a translacija se dešava u citoplazmi. Postoji samo jedan tip bakterijske RNK-polimeraze dok eukarioti imaju tri tipa. Bakterije imaju σ-faktor koji detektuje i vezuje se za promotorska mjesta, ali eukariotima nije potreban σ-faktor. Umjesto toga, imaju transkripcijske faktore koji omogućavaju prepoznavanje i vezivanje promotorskih mjesta. Sve u svemu, transkripcija unutar bakterija je visoko reguliran proces koji je kontroliran integracijom mnogih signala u datom trenutku. Bakterije se u velikoj mjeri oslanjaju na transkripciju i translaciju kako bi generirali proteine koji im pomažu da specifično reagiraju na okolinu.