Interakcija domaćin-patogen
Interakcija domaćin-patogen definira se kao način na koji se mikrobi ili virusi održavaju unutar organizama domaćina na molekulskom, ćelijskom, organizamskom ili populacijjskom nivou. Ovaj termin se najčešće koristi za označavanje mikroorganizme koi uzrokuju bolesti, iako ne mogu uzrokovati bolest kod svih domaćina. Zbog toga je definicija proširena na to koliko poznati patogeni opstaju unutar svog domaćina, bez obzira da li uzrokuju bolest ili ne. Na molekulskom i ćelijskom nivou, mikrobi mogu zaraziti domaćina i brzo se podijeliti, uzrokujući bolest time što su tamo i uzrokujući homeostatsku neravnotežu u tijelu, ili izlučujući toksine koji uzrokuju pojavu simptoma. Virusi takođe mogu inficirati domaćina virulentnom DNK, što može uticati na normalne ćelijske procese (transkripcije, translacije, itd.), savijanja proteina, ili izbjegavanje imunskog odgovora.