سمرقند کا محاصرہ (1501)
سمرقند کا محاصرہ دونوں جنگجوؤں کی طرف سے شہر کے خلاف تیسری اور آخری مہم تھی بابر کی افواج کے ہاتھوں اس کے دوبارہ قبضے کے چار سال بعد ایک بغاوت ہوئی جس نے فرغانہ کے بادشاہ کو اس کی سلطنت اور اس کی راجدھانی کھو دی  میں بابر اور اس کی فوج نے دوبارہ شہر کا محاصرہ کرنے کے لیے تیار محسوس کیا تاہم اس کی حملے کی کوشش کو ایک ازبک قبائلی سردار شیبانی نے شکست دی جس کی فتوحات پورے وسطی ایشیا میں مشہور تھیں اس سے پہلے مئی  میں بابر اور سلطان علی کی دو فوجوں نے کامیابی سے سمرقند شہر کا محاصرہ کیا اور اس پر قبضہ کر لیا