Cytoscape
Cytoscape on avatud lähtekoodiga bioinformaatika tarkvara platvorm, mis on mõeldud molekulaarsete interaktsioonide visualiseerimiseks ja geeniekspressioonide ühendamiseks muude andmetega. Cytoscape'i lisafunktsioonid on saadaval pluginatena. Pluginad on saadaval molekulaarprofiilide analüüsimiseks, andmete esitamisviisi muutmiseks, toetatud faililaiendite lisamiseks ja andmebaasiga ühenduse loomiseks. Pluginaid on võimalik arendada kõigil huvilistel kasutades Cytoscape'i Java tarkvara arhitektuuri.