MAT-lookus
MAT-lookus on DNA lõik pagaripärmi kolmandas kromosoomis, mis sisaldab informatsiooni pärmi paardumistüübi kohta. Pagaripärmi (Saccharomyces cerevisiae) paardumistüübi määravad kaks mittehomoloogset alleeli MATa ja MATα. MAT lookuse uurimisega on avastatud olulisi teadmisi geeniekspressiooni vaigistamise, heterokromatiini moodustamise ja doonorjärjestuste regulatsiooni ning kättesaadavuse kohta. Reaalajas MAT-lookuse vahetuse analüüs on andnud kõige täpsema kirjeldus selle kohta, mis juhtub homoloogilise rekombinatsiooni protsessis kaheahelalise katke ajal. Pärmirakkudel on märkimisväärne võime vahetada oma paardumistüüpi iga generatsiooniga. Selle mehhanismiks on sait-spetsiifiline homoloogiline rekombinatsioon. Antud vahetusprotsessis osalevad kaks vaikivat (mitteekspresseeritud) lookust HMLa ja HMRα, mis kannavad paardumistüübi vahetumiseks vajalikku informatsiooni. Need vaigistatud lookused asuvad sama kromosoomi vastasotstes, kus paikneb ka MAT-lookus ise. MAT-lookus asub kolmanda kromosoomi parema õla keskel, umbes 100 kb nii tsentromeerist kui ka telomeerist. Pagaripärmi MAT-lookuse vahetusel põhineva paardumistüübi vahetamise mehhanism sõltub järgnevatest fenomenidest: 1. Kaks vaigistatud paardumistüübi järjestuse koopiat käituvad MAT vahetuse ajal doonoritena. 2. Toimub programmeeritud sait-spetsiifiline kahe-ahelaline katke MAT-lookuses, mille tagajärjel asendatakse MAT-lookuse järjestus vastaspaardumistüübi järjestusega. 3. Doonorjärjestuse (vaigistatud vastaspaardumistüübi järjestuse) selekteerimine toimub spetsiifiliselt.