নিউক্লিয়য়েড
নিউক্লিয়য়েড প্রকৃতকোষের মধ্যে একটি অনিয়মিত আকৃতির অঞ্চল যাতে সমস্ত বা বেশিরভাগ জিনগত উপাদান সঞ্চিত থাকে। একটি সাধারণ প্রকৃতকোষীর ক্রোমোজোম বৃত্তাকার হয় এবং কোষের মাত্রার তুলনায় এর দৈর্ঘ্য অনেক বড়, তাই এটিকে আঁটানোর জন্য সংকুচিত করা প্রয়োজন। আদিকোষের নিউক্লিয়াসের বিপরীতে, এটি একটি পারমাণবিক ঝিল্লি দ্বারা বেষ্টিত নয়। পরিবর্তে, ক্রোমোসোমাল আর্কিটেকচারাল প্রোটিন এবং আরএনএ অণুর পাশাপাশি ডিএনএ সুপারকয়েলিংয়ের সাহায্যে ঘনীভবন এবং কার্যকরী বিন্যাসের মাধ্যমে নিউক্লিয়য়েড গঠন করে। একটি জিনোমের দৈর্ঘ্য ব্যাপকভাবে পরিবর্তিত হয় (সাধারণত অন্তত কয়েক মিলিয়ন বেস জোড়া) এবং একটি কোষে এর একাধিক প্রতিরূপ থাকতে পারে।ব্যাকটেরিয়া নিউক্লিওয়েডের পরিচিত উচ্চ-রেজ্যুলিউশনের কাঠামো এখনও নেই, তবে মূল বৈশিষ্ট্যগুলি একটি মডেল জীব হিসাবে Escherichia coli তে গবেষণা করা হয়েছে। Escherichia coli তে, ক্রোমোসোমাল ডিএনএ গড়ে ঋণাত্মকভাবে সুপারকোয়েল করা হয় এবং প্লেটোনমিক লুপগুলিতে ভাঁজ করা হয়, যা বিভিন্ন ভৌত অঞ্চলে সীমাবদ্ধ থাকে এবং খুব কমই একে অপরের মধ্যে ছড়িয়ে পড়ে। এই লুপগুলি স্থানিকভাবে মেগাবেস-আকারের অঞ্চলে সংগঠিত হয় যাকে ম্যাক্রোডোমেন বলা হয়, যার মধ্যে ডিএনএ সাইটগুলি প্রায়শই পরস্পরের উপর ক্রিয়া করে, কিন্তু যেগুলোর মধ্যে মিথস্ক্রিয়া বিরল। ঘনীভূত এবং স্থানিকভাবে সংগঠিত ডিএনএ একটি হেলিকাল উপবৃত্তাকার গঠন করে যা কোষে র‌্যাডিয়লি সীমাবদ্ধ থাকে। নিউক্লিয়য়েডের ডিএনএর ত্রিমাত্রিক অবস্থার উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত বলে মনে হয় এবং এটি জিনের প্রকাশের সাথে যুক্ত যাতে নিউক্লিওয়েড আর্কিটেকচার এবং জিন ট্রান্সক্রিপশন শক্তভাবে পরস্পর নির্ভরশীল হয়, একে অপরকে পারস্পরিকভাবে প্রভাবিত করে।