팬 유전체학이란 무엇인가요?
팬 게놈은 테텔린과 메디니가 2005년에 도입한 개념으로, 생물정보학에 뿌리를 내렸습니다. 팬 게놈은 특정 분류군의 전체 유전자 레퍼토리로, 처음에는 한 종의 밀접하게 관련된 균주에 적용되었지만 속, 문 등과 같은 더 큰 맥락에 적용될 수 있습니다. 핵심 게놈: 연구 중인 모든 게놈에 공통적으로 존재하는 유전자 집합(생존에 필수적인 유지 유전자인 경우가 많음)과 불용/유연 게놈: 연구 중인 하나 또는 일부 게놈을 제외한 모든 게놈에 존재하지 않는 유전자 집합으로 나뉩니다. 생물정보학 도구인 BPGA를 사용하여 박테리아 종의 팬 게놈을 특성화할 수 있습니다.
What is pan genomics?
Pan genomics is a concept introduced in 2005 by Tettelin and Medini which eventually took root in bioinformatics. Pan genome is the complete gene repertoire of a particular taxonomic group: although initially applied to closely related strains of a species, it can be applied to a larger context like genus, phylum, etc. It is divided in two parts- The Core genome: Set of genes common to all the genomes under study (These are often housekeeping genes vital for survival) and The Dispensable/Flexible Genome: Set of genes not present in all but one or some genomes under study. A bioinformatics tool BPGA can be used to characterize the Pan Genome of bacterial species.