Mortensen forblev stamspiller på førsteholdet i forårssæsonen, men bevarede derimod ikke sin topscorerplacering i foråret 2008, hvor angriberen kun formåede at lave yderligere to scoringer, hvorved han rykkede ned på en samlet fjerdeplads på topscorerlisten, seks mål efter topscoreren Jeppe Kjær fra FC Roskilde samtidig med at han blev overgået af Anders Jochumsen som klubbens topscorer.