Mikkel Rygaard spillede i årene fra 2015 til 2018 i Lyngby BK. Onsdag d. 7. februar 2018 kunne klubben meddele at Mikkel Rygaard har opsagt sin kontrakt med klubben efter han ikke havde fået sin løn udbetalt i 7 dage.  FC Nordsjælland Mikkel Rygaard skrev d. 12. februar 2018 kontrakt med FC Nordsjælland.