Sæsonens produktion blev sat til at begynde i midten af juli, hvor optagelserne begynder 29. juli 2013. Den 18. juli 2013 blev det meddelt, at showet ville gå på en to-ugers pause, mens dens forfattere og producenter omskrev storylines og regne ud, hvordan de håndtere Monteiths død i forhold til hans figur, Finn Hudson. Den 19. juli 2013 annoncerede Glee gennem deres officielle Facebook-fanside, at sæsonens premiere vil vises den 26. september en uge efter den oprindelige dato, og optagelserne vil begynde i begyndelsen af august. Sæsonen begyndte at skyde den 5. august 2013 en uge senere end oprindeligt planlagt, selv om studieoptagelser og kostumeprøver til skuespillerne begyndte fire dage tidligere. Den 20. juli 2013 udtalte Ryan Murphy i et interview, at Monteith karakter ville dø i tredje episode af sæsonen og at episode et og to vil være hyldestepisoder til The Beatles. Lea Michele, Monteiths kæreste der også har rollen som Rachel Berry på serien, var involveret i beslutningen. Efter den tredje episode var afsluttet, var der en anden pause, mens det kreative team omarbejdet resten af sæsonen. Showet vendte tilbage efter baseballsæson var forbi, og viste fem episoder i træk uden afbrydelser.