Proteinlaboratoriet blev oprettet som et forskningslaboratorium i Institut for Almen Patologi ved Københavns Universitets Sundhedsvidenskabelige Fakultet i 1949 med dr. Niels M. G. Harboe som leder. Senere blev Proteinlaboratoriet en del af Institut for Neurovidenskab og Farmakologi. Proteinlaboratoriets forskningsområde omfattede fraktionering og analyse af proteiner med speciel reference til medicinske problemstillinger. Proteinlaboratoriets forskere blev specielt kendt for at udvikle og anvende de analytiske protein-kemiske metoder kendt som "krydset immunelektroforese" eller "kvantitativ immunelektroforese". Dr. Harboes motto var "at gøre nytte", og lige fra starten blev disse metoder udbredt både nationalt og internationalt igennem kurser for læger og forskere. Der var fra 1970'erne og ind i 1990'erne en meget stor post-graduat undervisning som dog gradvist blev overtaget af undervisning i humanbiologi. I en periode indtil Proteinlaboratoriets administrative lukning har Elisabeth Bock været leder af Proteinlaboratoriet. Forskere fra Proteinlaboratoriet har haft nær tilknytning til erhvervslivet. De har varetaget ledende funktioner inden for firmaerne Chr. Hansen, ALK-Abello, Lundbæk og Novo Nordisk og har personligt oprettet firmaer som Dako og Dako-Cytomation (først Dakopats), Kem-En-Tec, Upfront Chromatography, Schafer-N, ENKAM Pharmaceuticals, Henning Løwenstein ApS og ImmunoSigns,