Et fuldvoksent alpemurmeldyr har, når det står på fire ben, en skulderhøjde på 18 cm. Det er mellem 42 og 54 cm i længden, fraregnet en 13-16 cm lang hale. Dyret vejer betydeligt mindre om foråret efter dvalen med en vægt på 2,8-3,3 kg end om efteråret, hvor de kan veje 5,5-8 kg. Der er tale om en af de største egern-arter (den nordamerikanske art Marmota caligata kan i nogle tilfælde blive tungere). Alpemurmeldyrets pels har en blanding af en lys, en rødlig og en mørkegrå farve. Det har kløer på de fleste af sine fingre, men negle på tommelfingrene.