Stralsund har altid været en betydelig søfartsby og var i mange år en del af Hanseforbundet. I Danmark er den kendt for den opsigtsvækkende fredsaftale i Stralsund i 24. maj 1370, hvor Valdemar 4. Atterdag gav Skåne i pant til Hanseforbundet og ret til kontrol over sildemarkederne i Skåne gennem en årrække. Stralsund tilhørte Sverige fra den Westfalske fred i 1648 og var 1720-1814 hjemsted for den svenske guvernør i Pommern. I 1814 blev byen afgivet til Danmark, men allerede i 1815 tilfaldt den Preussen.