Green Day giver koncert på en scene, der er placeret ovenpå Lake Springfield, hvor de uden held forsøger at få publikum til at interessere sig for miljøspørgsmål. De dør, da det forurenede vand i søen ætser deres scene væk, så den synker. Ved begravelsen får bedstefar et syn, der viser, at en stor katastrofe er på vej, men kun Marge tager det alvorligt. Lisa og en irsk dreng Colin afholder et seminar med titlen "En irriterende sandhed" (titlen er tydeligvis inspireret af titlen på filmen En ubekvem sandhed), der får overbevist byen om, at søen skal renses. Imens får Homer lokket Bart til at stå på skateboard nøgen ned til Krusty Burger og tilbage, men politibetjent Wiggum fanger Bart og Homer nægter have noget med det at gøre. Ned Flanders trøster Bart efter ydmygelsen, mens Homer vælger at  adoptere en gris. Homer opbevarer gylle fra grisen i en tank i haven, men tanken bliver hurtig fyldt. Marge beder Homer om at køre den fyldte gylletank på en sikker affaldsplads, men Homer vælger en hurtigere løsning nemlig at smide den i Lake Springfield, hvilket gør søen mere forurenet end nogensinde. Lederen af USA's miljøbeskyttelsesvæsen EPA fortæller præsident Schwarzenegger, at Springfield er ekstremt forurenet, og at regeringen er nødt til at gøre noget. Præsidenten beordrer EPA til at sænke en stor glaskuppel over byen, så intet kan komme ind eller ud, og byen er helt isoleret fra omverdenen.  DVD udgivelse Filmen udkom på dvd den 4. december 2007. Dvd'en indeholder kommentarspor med blandt andre Matt Groening og Richard Sakai, den engelske, norske og danske version med undertekster, scenevalg, bonusmateriale og selve filmen.  Bonusmaterialet handler om den gang Simpsons var med i American Idol og The Tonight Show.  Desuden er der fraklippede scener.