Barendorf ligger sydvest for Lüneburg ved vestenden af naturparken Elbufer-Drawehn. Landskabet er et typisk gestområde, ligesom næsten to tredjedele af området i Niedersachsen. Barendorf har ingen nævneværdige naturlige vandløb, men Elbe-Seitenkanal der siden 1976 har forbundet havnen i Hamburg med indlandet, løber lige vest for kommunen.