Efter endt uddannelse fra Københavns Universitet arbejdede Skytte Christiansen på Polyteknisk Læreanstalt og derefter på Landbohøjskolen indtil han blev leder af Botanisk Centralbibliotek i 1952. Her koncentrerede han sig om sin forskning af lav (likener) og samlede eksemplarer fra hele Danmark, en stor del af Europa samt Grønland. Han arbejdede tidligt med botaniker og likenolog Olaf Galløe og bidrog med sin samling som illustrationer til Galløes værk Natural History of the Danish Lichens. Skytte Christiansen bidrog yderligere til Natural History of the Danish Lichens ved at redigere sidste bind (nummer 10) i 1972.  Senere karriere I 1962 blev Mogens Skytte Christiansen lektor i plantesystematik og nomenklatur ved Københavns Universitet. Samme år udgav han Flora i farver – en håndbog med beskrivelser af voksested, blomstringstidspunkt, kendetegn og brug af alle almindelige vilde planter i Danmark illustreret af farveakvareller. Fra midten af 1970erne samarbejde han med F. Rose, U. Søchting, K. Ramkaer og S. Svane på at katalogisere likener i danske egne. Efter sin pension i 1988 tilbragte Skytte Christiansen en stor del af sin tid med at katalogisere sin enorme – og for dansk botanik – uvurderlige samling. Hans likenherbarium er doneret til Botanisk Museum i København.