Fujikirsebær er en mellemstor busk med en stiv, udspærret vækstform. Barken er først lyst gråbrun og glat. Senere bliver den mere grålig og sprækker op. Til sidst er den rødbrun med tynde, tværgående bånd af barkporer. Bladknopperne er spredte, udspærrede, ægformede og rødbrune. Blomsterknopperne sidder i bundter på rynkede dværgskud og er noget større end bladkopperne. Bladene er smalt ægformede med lang spids og groft savtakket rand. Oversiden er mørkegrøn, mens undersiden er lysegrøn. Blomstringen sker fra begyndelsen af april (samtidig med mirabelle). Blomsterne er hvide med rødt bæger og en dyb indskæring i spidsen af hvert kronblad. Høstfarven er meget forskellig: fra gul over orange til rød og brun. Derimod ses bær kun, når der er mulighed for fremmedbestøvning. Frøene modner godt i Danmark. Rodnettet er kraftigt, vidt og dybt udbredt. Højde x bredde og årlig tilvækst: 4 x 4 m (25 x 25 cm/år).