Klubben blev grundlagt i 1920 og spillede sin første sæson i den bedste franske liga i 1937/1938-sæsonen. I 1957 vandt klubben sit første franske mesterskab, og frem til 1981 blev det til i alt 10 mesterskaber. I 1982 var klubbens præsident Roger Rocher indblandet i en korruptionssag, hvilket kom til at gå hårdt ud over klubben. Rocher blev idømt en fængselsstraf og Saint-Étienne rykkede ud af Ligue 1. I 1999 kom klubben tilbage til rækken, og fik stabiliseret sig som et midterhold, men i 2001 blev to af klubbens spillere afsløret med falske pas. Klubben fik en pointstraf på 7 point, hvilket betød endnu en nedrykning. I 2004 rykkede klubben op igen, og klarede i sin første sæson at få en 6. plads, hvilket betød første europæiske deltagelse i 20 år, da denne placering gav adgang til Toto Cuppen. Ved Europa League lodtrækningen i UEFA hovedkvarteret i Nyon i Schweiz den 9. august 2013 trak AS Saint-Étienne Esbjerg fB som modstander i play-off runden, og tabte første opgør 3-4.