Samaras er en ivrig modstander af at ordet Makedonien indgår i den Tidligere Jugoslaviske Republik Makedoniens navn og forlod Mitsotakis' regering i 1992 på grund af indvendinger mod dens politik. Han er ligeledes en ivrig modstander af forhandlinger med (den Tidligere Jugoslaviske Republik) Makedonien.  Medlem af EU-Parlamentet Samaras var fra 2004 medlem af Europa-parlamentet for det Europæiske Folkeparti.  Kulturminister Fra 8. januar 2009 var han minister igen, denne gang kulturminister. Efter Antonis Samaras' mening, vil den Tidligere Jugoslaviske Republik Makedonien i fremtiden ikke overleve som selvstændig nation. Tillige siger han, at EU ikke vil kunne påtvinge Grækenland at anerkende dette lands forfatningsnavn: "Republikken Makedonien".  Formand for Nyt Demokrati I 2009 blev Antonis Samaras formand for partiet Nyt Demokrati. Hans forgænger på posten var Kostas Karamanlis. Han var formand indtil 2015, da han blev afløst af to midlertidige formænd: Vangelis Meimarakis og Ioannis Plakiotakis og i januar 2016 blev Kyriakos Mitsotakis valgt til ny formand.  Statsminister Efter valget i juni 2012 blev Antonis Samaras statsminister i Regeringen Antonis Samaras, der bestod af Nyt Demokrati, PASOK og Demokratiske venstre. Antonis Samaras blev indsat i embedet som statsminister, da han aflagde ed på forfatningen den 20. juli 2012. Han var statsminister indtil 26. januar 2015.