Gastroenterologi betegner det lægevidenskabelige speciale, der beskæftiger sig med fordøjelsessystemet. Specialet omfatter diagnosticering og behandling af sygdomme i mavetarmkanalen, herunder spiserør, mavesæk, tynd- og tyktarm, samt bugspytkirtel. I mange lande, inklusiv Danmark, er gastroenterologi kombineret med hepatologi, læren om leveren og dens sygdomme. Gastroenterologi deles op i medicinsk og kirurgisk gastroenterologi, hvor førstnævnte primært behandler sygdomme med lægemidler og sidstnævnte behandler sygdomme med kirurgiske indgreb.  Sygdomme Almindelige sygdomme der behandles under specialet omfatter inflammatoriske tarmsygdomme som Crohns sygdom og ulcerativ kolitis, korttarmsyndrom og kronisk diarré.