Aaron Eckhart voksede op i forstaden Cupertino i Californien, men boede også i England og i Sydney (Australien), da han var teenager. Hans far arbejdede med computere, hans mor var børnebogsforfatter, han har to brødre. Da han blev færdig med at gå på gymnasium, tog han fri i tre år for at surfe på Hawaii og for at missionere for Jesu Kristi Kirke af Sidste Dages Hellige i Frankrig og Schweiz. Han blev færdig på universitet i 1994. Eckhart var forlovet med skuespillerinden Emily Cline, men de to gik fra hinanden i 1998. Eckhart købte en motorcykel, efter filmen Erin Brockovich. I 2007 modtog Eckhart en Golden Globe-nominering for hans rolle i filmen Thank You for Smoking I 2008 kunne Eckhart opleves i rollen som Harvey Dent i fortsættelsen af filmen Batman Begins, The Dark Knight.