Чтобы подключить свою реализацию, надо описать своё расширение типа Files.Directory, а затем инсталлировать через Files.SetDir.

HostFiles подключает себя сам при своей инициализации (последняя строка HostFiles.Init).
Этот модуль входит в статически компонуемую часть среды (в BlackBox.exe), поэтому подключается на самом раннем этапе её загрузки.

Как подключать другие реализации - см. в качестве примера HostPackedFiles.