Мне не удалось понять, о чем идет речь, поэтому пока не голосую. Если имеется в виду область для рисования графов, отображающих взаимозависимости модулей и их объединение в подсистемы, то такая область в PureBuilder уже предусмотрена. Это - так называемая "панель структуры" нарисунке.