Вот такой скрипт у меня лежит в директории~/.local/share/nemo/scripts:
## Код:
```
#!/bin/sh

bbGUIdir="/usr/lib/blackbox"

unset UBUNTU_MENUPROXY
unset GTK_MODULES
export LIBOVERLAY_SCROLLBAR=0

env \
  BB_PRIMARY_DIR="${bbGUIdir}" \
  BB_SECONDARY_DIR="$PWD" \
  ${bbGUIdir}/blackbox $* &
```


Запускаю Блэкбокс из контекстного меню файлового менеджера Nemo в любых директориях.

Для Windows версии, чтобы через Wine запускался там же лежит вот такой скрипт

## Код:
```
#!/bin/sh
wine '/home/dia/oberon/blackbox/BlackBox.exe' -use "`winepath -w "$PWD"`" $* &
```


Файловый менеджер Nautilus также умеет, но надо использовать его директорию с настройками скриптов
~/.local/share/nautilus/scripts
и в последних версиях Nautilus не умеет запускать скрипты из пустых папок. Приходится создать хотя бы один файл или пустой каталог, от которого запускать уже скрипты из контекстного меню.

Эти же скрипты могут лежать в директории с проектами.