Да, я давно использую SQLyog, комьюнити-версию. Штука отличнейшая, но инструменты моделирования - в энтерпрайз-версии, за деньги.

Ну а WorkBench бесплатный. Кстати, я его только что опробовал - очень и очень неплохо. Может в плане администрирования даже заменить SQLyog'a (хотя Йог куда удобнее).