Поскольку А2 штука герметичная -- заразить сложно. А стандартные программы (а-ля .exe и .coff или .elf) -- вообще не запустятся. Можно впихнуть какой-то контейнер исполнения антивируса (что-то вроде кламав).
Также из-за герметичности А2 -- можно придумать виртуальную файловую систему и пользовать как недоступное вирусякам хранилище)
Вообще, у А2 просто отличная идея и прикрутить туда что-либо очень перспективно. Да те же SCADA.