해서 1848년에 아버지의 바람으로 해군 사관학교에 지원하였으나 낙방하였다. 같은 해 10월 프랑스의 해군 사관학교는 6개월간 견습항해시 항해 참가원끼리의 경쟁으로 생도를 뽑는 제도를 마련한다. 이에 마네는 리우데자네이루로 항해하는 배에 올라 항해를 하기도 하였다. 실패를 거듭하자 아버지는 마네가 하고 싶어 하는 미술을 교육받는 것을 허락하였다. 마네는 1850년에서 1856년까지 아카데미 파로서 커다란 역사화를 여럿 그린 화가 토마스 쿠튀르르 문하에서 공부하면서 남는 시간에 루브르 박물관에 전시된 걸작들을 따라 그리며 공부했다.
마네의 아버지는 마네가 화가가 되는 것을 반대하였다.