Bölge Müdürlüğümüz, Gümrük ve Tekel Bakanlığı döneminde Ankara Gümrük Müdürlüğü iken, 28.07.1975 tarih ve 1975/121 sayılı Genelge ile Ankara Gümrükleri Başmüdürlüğü’ne yükseltilmiştir. 1984 yılından itibaren Maliye ve Gümrük Bakanlığı’na bağlı olarak faaliyetlerini yürütmüş, 1993 yılında Başbakanlığa bağlı Gümrük Müsteşarlığı bünyesinde faaliyetine devam ettirmiştir. Daha sonra Bakanlar Kurulu’nun 29.07.2003 tarih ve 25183 sayılı Resmi Gazete’ de yayımlanarak yürürlüğe giren 22.07.2003 tarihli Kararı ile Gümrük Başmüdürlükleri ile Muhafaza Başmüdürlüklerinin kaldırılarak tek çatı altında Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlükleri kurulmuştur. 08.06.2011 tarihli ve 27958 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 640 sayılı Kanun Hükmünde Kararname ile Gümrük Müsteşarlığı kaldırılarak Gümrük ve Ticaret Bakanlığı kurulmuş ve Bakanlığımızın kuruluş, görev, yetki ve sorumlulukları yeniden düzenlenmiştir. 22.12.2011 tarih ve 28150 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 2011/2474 sayılı Gümrük ve Ticaret Bakanlığının Taşra Teşkilatında Düzenleme Yapılması Hakkındaki Bakanlar Kurulu kararı ile Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlükleri kaldırılarak Bölge Müdürlükleri kurulmuştur. Son olarak, 09.07.2018 tarihli 30473 sayılı Resmi Gazetede yayımlanarak yürürlüğe giren “Anayasada Yapılan Değişikliklere Uyum Sağlanması Amacıyla Bazı Kanun ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun Hükmünde Kararname” KHK/703 ile Gümrük ve Ticaret Bakanlığı ile Ekonomi Bakanlığı, Ticaret Bakanlığı adı altında birleştirilmiştir. Bölge Müdürlüğümüz, Ticaret Bakanlığı bünyesinde Orta Anadolu Gümrük ve Ticaret Bölge Müdürlüğü adıyla faaliyetine devam etmektedir.
Bölge Müdürlüğümüz, bağlantı idareleri ile bir bütün halinde Gümrük Mevzuatı, Dış Ticaret Mevzuatı ve Kambiyo Mevzuatı başta olmak üzere ilgili diğer mevzuat hükümleri doğrultusunda bölgemizdeki ithalat, ihracat, transit, antrepo vb. gümrük işlerini yürütmektedir.
Bölge Müdürlüğümüz, Ticaret Bakanlığı şemasına göre bir taşra birimi olup bünyesinde 14 Şube Müdürlüğü, 1 Hukuk Grup Başkanlığı, 9 Gümrük Müdürlüğü, 2 Gümrük Muhafaza Kaçakçılık ve İstihbarat Müdürlüğü ile 1 Personel Müdürlüğü, 1 Laboratuvar Müdürlüğü, 2 Tasfiye İşletme Müdürlüğü olmak üzere toplam 16 bağlantı idaresi ile 10 ilde (7 ilde aktif olarak) faaliyet göstermektedir. Bölge Müdürlüğümüz; Ankara, Konya, Karaman, Aksaray, Nevşehir, Kırşehir ve Kayseri illerinde aktif olarak faaliyet göstermektedir. Kırıkkale, Yozgat ve Çankırı illerinde de faaliyetimiz bulunmaktadır.
Ankara Personel Müdürlüğü, Ergazi Tasfiye İşletme Müdürlüğü, Merkez Tasfiye İşletme Müdürlüğü, Ankara Laboratuvar Müdürlüğü, Ankara Gümrük Müdürlüğü, Ankara Gar Gümrük Müdürlüğü, Esenboğa Gümrük Müdürlüğü ve Ankara Gümrük Muhafaza Kaçakçılık ve İstihbarat Müdürlüğü il içi bağlantı Müdürlükleri iken; Aksaray Gümrük Müdürlüğü, Kayseri Gümrük Müdürlüğü, Karaman Gümrük Müdürlüğü, Konya Gümrük Müdürlüğü, Ürgüp Gümrük Müdürlüğü, Kırşehir Gümrük Müdürlüğü, Kayseri Gümrük Muhafaza Kaçakçılık ve İstihbarat Müdürlüğü ise il dışı bağlantı Müdürlüklerimiz olup; gümrük hizmetlerini yürütmektedir.
Bölge Müdürlüğümüz faaliyet alanına giren gümrük idarelerimizde Ankara Esenboğa Havalimanı, Ankara Etimesgut Askeri Havalimanı, Kayseri Erkilet Havalimanı, Konya Havalimanı ve Nevşehir Kapadokya (Tuzköy) Havalimanı bulunmaktadır.
Ayrıca, Kayseri Gümrük Müdürlüğümüz bünyesinde Serbest Bölge bulunmaktadır.
Bölge Müdürlüğümüz bünyesinde bulunan laboratuvarımızda; Bölge Müdürlüğümüz bağlantı idarelerinden gelen beyannamelere ait numunelerin tahliline müteakip sonuçların ilgili idareye teslim edilmesi işlemleri yürütülmektedir.