Prof. Dr. Ergün Yıldırım 1992 yılında İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Sosyoloji Bölümü’nden mezun oldu. İstanbul Üniversitesi’nde 1996 yılında yüksek lisansını ve 2001 yılında doktorasını tamamladı.
2002 yılında Yardımcı Doçent, 2006 yılında Doçent ve 2012 yılında Profesör unvanını aldı. 2012 yılında Yıldız Teknik Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi İnsan ve Toplum Bilimleri Bölümü Anabilim Dalı Başkanlığı yapmıştır ve 2015 yılından itibaren Marmara Üniversitesi İletişim Fakültesi Dekanlığını yapmaktadır.
Prof. Dr. Ergün Yıldırım’ın çeşitli konularda yayınlanmış makaleleri ve “İslam Toplumu Tasavvuru”, “Hayali Modernlik” ve “Ergenekon Ötesi Türk Milliyetçiliği” adlı kitapları bulunmaktadır. Prof. Dr. Ergün Yıldırım ayrıca Ülke Tv ve Tvnet televizyonlarında program yapmış ve Yeni Şafak Gazetesi’nde yazıları yayınlanmıştır.