Gemlik Devlet Hastanesi ilk olarak Ekim 1989 tarihinde Yalova yolu üzerindeki binasında hizmetine başlamıştır. 17 Ağustos 1999 depreminde binanın 8 ana kolonunun hasar görmesi nedeniyle 21 Eylül 1999 tarihinde bina tahliye edilerek hizmeti çadırda sunmak zorunda kalmış, daha sonra kış mevsimi gelince poliklinik hizmeti olarak barakalarda devam etmiştir.
Hayır sever iş adamı Sn.Muammer Ağım tarafından 10 Ekim 1988’de temeli atılan modern hastane binamız 18 Eylül 2000 tarihinde tamamlanarak hastalarımızın hizmetine sunulmuştur. Muammer Ağım Gemlik Devlet Hastanesi’nin toplam arazisi 9500 m2 olup; hastane binası insaat tekniği bakımından çelik konstrüksiyon ile yapilmış Türkiye’nin ilk hastanesidir. 5 kat yükseklikte toplam 4500 m2 kullanım alanı bulunan hastanenin taban alanıysa 768 m2 dir.
2004 yili itibariyle Hastane arsamiz üzerinde Ek Hizmet Binasi yaptirilmasina karar verilmistir. 800 m2 lik bir taban alanına baslangıçta Hemodiyaliz Ünitesi ve Acil Servis olarak planlanan bu proje daha sonra poliklinikler ve idari birimlerin de yer aldığı toplam 3 katlı (Zemin ile birlikte) bir bina olarak tamamlanmıştır. 04.07.2006 tarihinde hizmet sunmaya baslamistir.Gemlik SSK hastanesi, 2006 yılından itibaren hastanemizin Sahil Binası olarak hizmet vermeye başlamıştır.
2006 Yılında ''Bebek Dostu Hastane'' unvanını alan hastanemiz anne ve bebek sağlığı, emzirmenin önemi konusunda bilgilendirici ve destekleyici faaliyetlerde bulunmaktadır. 2012 yılında Hisar mahallesinde ''Toplum ve Ruh Sağlığı Merkezi'' hizmete girmiştir. 2014 Eylül ayı itibariyle Hastanemiz bünyesinde MR hizmetimiz başlamıştır..