1981 yılında Kaçakçılık Daire Başkanlığı olarak kurulan Daire Başkanlığımız, gelişen teknoloji ve ihtiyaçlar doğrultusunda, 1983 yılında Kaçakçılık İstihbarat ve Harekât Daire Başkanlığı, son olarak 1995 yılında ise Kaçakçılık ve Organize Suçlarla Mücadele (KOM) Daire Başkanlığı adı altında faaliyetlerine devam etmektedir.
Başkanlığımız 78 il biriminde KOM Şube Müdürlüğü, 44 ilçemizde KOM Grup Amirliği ile Ankara, İstanbul ve İzmir illerinde de Mali Suçlarla Mücadele Şube Müdürlüğü, Kaçakçılık Suçlarıyla Mücadele Şube Müdürlüğü ve Organize Suçlarla Mücadele Şube Müdürlükleri olarak yapılanmıştır.
Kurulduğu 1981 yılından itibaren günümüze; Daire Başkanlığımız son yıllarda suç dünyasında meydana gelen değişimleri dikkate alarak yeniden yapılanma sürecine girmiş ve ulusal güvenliğimize tehdit oluşturan terör örgütleriyle daha etkin ve verimli bir şekilde mücadele edebilmek için yeni birimler oluşturmuş ve faaliyete geçirmiştir.
Bu kapsamda, Daire Başkanlığımız bünyesinde bulunan Ulusal Güvenliğe Yönelik Suçlarla Mücadele Şube Müdürlüğü, paydaş kurumlar ile müşterek çalışmalar yürüterek başta FETÖ terör örgütü olmak üzere ulusal güvenliğimize tehdit oluşturan tüm suç örgütleri ile kararlılıkla mücadele etmektedir.
Bunun yanı sıra, sigara, alkol, tarihi eser, akaryakıt, ilaç ve emtia kaçakçılığı gibi terör örgütlerinin en önemli finans kaynağını teşkil eden her türlü kaçakçılık suçlarına karşı mücadelemiz kararlı bir şekilde dün olduğu gibi bundan sonrada etkin bir şekilde sürdürülecektir.
Doğrudan kamu otoritesini hedef alan, toplumun barış ve huzurunu bozan, ülkemizin demokratik ve sosyo-ekonomik yapısına büyük zarar veren organize suç örgütleriyle, silah ve mühimmat kaçakçılığının yanı sıra tehlikeli madde kaçakçılığı ile rüşvet, irtikap, ihaleye fesat karıştırma, görevi kötüye kullanma, ekonomik suçlar ve sahtecilik suçları ile mücadele de çok yönlü olarak soruşturulmaktadır.
Aynı zamanda, suçla mücadelenin yanında suçtan elde edilen gelirin tespiti ve engellenmesi, dolayısıyla terör örgütlerinin finans kaynaklarının kurutulması için gerekli olan tüm işlemler konusunda uzman ve kendini yetiştirmiş KOM personelinin başarılı çalışmaları aralıksız olarak devam etmektedir.