bioinformatics | ISCB RSG Turkey
Öğrenci sempozyumumuz 25-27 Ekim tarihleri arasında gerçekleşen HIBIT 2018’in 3.gününde Falez Uygulama Oteli’nde harika bir katılımla gerçekleşti. Öğrenci sempozyumu düzenlerken başlıca hedeflerimiz yüksek lisans ve doktora öğrencileri ile akademisyenleri bir araya getirmek, kariyer tercihlerimiz hakkında konuşmak, öğrenmek ve bildiklerimizi aktarmak ve biraz da motive olmak. Bu amaçlarımızı bu sempozyumda yerine getirmeye çalışırken aynı zamanda aramıza katılan yeni arkadaşlarla her geçen gün öğrenip, daha iyisini yapmak için yeni fikirlerle dolduğumuz bir sempozyumu geride bıraktık.
İlk olarak HIBIT 2018’in ilk saatlerinden itibaren HBIT komitesinin bize sağladığı masamızda yerimizi aldık. Hem yeni arkadaşlarla tanışıp, neler yapıyoruz/neleri amaçlıyoruz bundan bahsettik hem de ilk günden itibaren herkesin kaynaşacağı bir ortam yaratmak amacı ile bir oyun başlattık. Bu oyunda bir kağıda yazılı tanımlayıcı özelliklerin kime ait olduğunu bulmak için birileriyle tanışıp sorular sorulması ve o kişinin adının kağıda yazılması gerekiyordu. En çok kişiyle tanışan ise oyunu kazanıyor. Kazanan arkadaşımıza RSG-Turkey yazılı bir kupa hediye ettik. HIBIT boyunca, öğrenci sempozyumumuza daha önceden kayıt yaptırmayan arkadaşlarımızdan da oldukça iyi sayıda bir kayıt almayı başardık 🙂
Ve 3.gün, öğrenci sempozyumumuz: Bu sene keynote konuşmacılarımız Orta Doğu Teknik Üniversitesi’nden Prof. Dr. Tolga Can ve İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’nden Dr. Ezgi Karaca idi. Bu konuşmalarda bir yandan iki hocamızın çalışmaları hakkında bilgi sahibi olup öğrenirken bir yandan da fazlasıyla motive olduk. Daha sonra ise HIBIT bilimsel komitesi tarafından seçilen farklı üniversitelerden 3 öğrenci (Samet Tenekeci, Heval Ataş ve Umut Gerlevik) sempozyumumuzda 10-15 dakika aralığında sunum yaptılar. Bu sayede de farklı alanlarda yapılan çalışmalar hakkında bilgi sahibi olmuş olduk.
Ve heyecanlı bölümlerden bir diğeri: Poster Ödülleri! Bu sene posterleri değerlendirmesini 10 hocamızdan rica ettik: Kemal Yelekçi, Serap Erkek, Tunca Doğan, Ogün Adebali, Yavuz Oktay, Nurcan Tunçbağ, Aybar Can Acar, Yeşim Aydın Son, Ebru Bilge Güven ve Cihangir Yandım posterleri değerlendirdi. Ve ilk 3 poster ödülü ISCB Student Council’ın sağladığı finansal destek sayesinde sahiplerini buldu.
Bu ödüller şu şekilde:
1.lik ödülü: Gülden Olgun: miRCoop: Identifying Cooperating Pairwise miRNAs via Kernel Based Interaction Test
2.lik ödülü: Gökçe Senger:Biological Data Integration and Protein Function Prediction with Matrix Factorization
3.lük ödülü: Esra Sinoplu:Utilization of computational systems biology methods and in vitro validation strategies to identify unknown off-target effects of drugs in hepatocellular carcinoma
Tekrardan bütün arkadaşlarımızı tebrik ediyoruz!
Aynı zamanda HIBIT 2019’u düzenleyecek olan komite ile konuşup 4.lük ödülü verilmesini sağladık. Bu ödül ise HIBIT 2019’a ücretsiz katılım!! Bu ödülün sahibi ise Cansu Dinçer (Structural Modeling of the Patient-Specific Signaling Networks in Glioblastoma) oldu.
Ayrıca sempozyumumuzun en heyecanlı ve en etkileşimli kısımlarından birisi de “kariyer oturumu” idi. Kariyer Oturumu için 4 farklı üniversiteden Hocamız (Ezgi Karaca, Serap Erkek, Tunca Doğan, Ogün Adebali) öğrenciler ile sohbet havasında geçecek gruplar oluşturdu. Bu oturumda istediğimiz hocanın yanına gidip kendi danışmak istediklerimiz ve gelecek planlarımız hakkında sorular sorup onların deneyimleri ve tavsiyelerini dinledik. Yaklaşık 2 saat süren bu oturuma katılım oldukça fazla olmakla beraber, böyle sohbetlere daha çok ihtiyacımız olduğunu da anlamış olduk 🙂
Bu sempozyum sonunda 15 yeni üyeyi aramıza kattık! Grubumuzun Türkiye Hesaplamalı Biyoloji Camiasında HIBIT gibi organizasyonlar ile desteklenerek yer edinmesi bizim için oldukça önemli. Çünkü bu sayede daha çok öğrenci arkadaşımıza ulaşmakla beraber, her geçen gün büyüyeceğimize, yeni fikirleri aramıza katacağımıza ve daha güzel işler yapacağımıza inancımız artıyor.
Organizasyon süresince destekleri için HIBIT’18 organizasyon komitesine,
Basta Melike Dönertaş, Tülay Karakulak, Yasin Kaya, Deniz Doğan, Sevilay Güleşen, Melike Çağlayan, Ece Çağlayan ve Beste Turanlı olmak üzere, tüm RSG-Turkey aktif üyelerine,
Öğrenci sempozyumu hazırlığı süresince bize yol gösteren ve sempozyumun daha iyi olmasını sağlayan Dr. Ezgi Karaca’ya,
Sağladığı destek sayesinde poster ödülü vermemizi sağlayan ISCB Student Council’a
Posterleri değerlendiren bütün Hocalarımıza,
4.lük Poster ödülü sağlayarak HIBIT 2019’a ücretsiz katılımı desteklediği için HIBIT 2019 komitesine,
Sempozyumumuza katılım sağlayarak harika geçmesini sağlayan bütün öğrenci arkadaşlarımıza ve hocalarımıza,
Posted in Events and tagged bioinformatics, HIBIT2018, ISCB RSG Turkey, Symposium on 10/11/2018 by tulaykarakulak. Leave a comment
2018’İN İLK WEBİNARI – Integrative Modeling of Biomolecular Complexes
Webinar serimizi yeniden canlandırdığımız için çok heyecanlıyız! Bu senenin ilk webinarını 31 Ocak’ta İzmir Biyotıp ve Genom Enstitüsü (İBG-İZMİR) ’nden Dr. Ezgi Karaca ile gerçekleştirdik.
Kendisi Yapısal Biyoloji’de ki temel tekniklerden, data tiplerinden ve deneysel yapısal biyoloji datalarının biyomolekül simülasyonları ile nasıl birleştirildiğinden bahsetti. Özellikle, kendisinin de geliştiricisi olduğu bir “docking” programı olan HADDOCK ve Nature Methods’ta “integrative modeling” üzerine yayınlanan çalışmasında bahsederek hesaplamalı yapısal biyolojiye olan merakımızı daha da arttırdı! Webinarımıza yaklaşık olarak 100 kişi kaydoldu ve planımız bu sayıyı oldukça arttırmak ve kısa zamanda daha çok kişiye ulaşmak!
Bu geniş kapsamlı bilgilendirici seminer için ve webinar projemize destek verdiği için kendisine çok teşekkür ederiz 🙂 Eğer siz de hesaplamalı yapısal biyolojiyi merak ediyorsanız, bu webinarımıza şu linkten ulaşabilirsiniz:
Bir sonraki webinarlarımızı iple çekiyoruz!
Posted in Uncategorized and tagged Bioinfonet Project, bioinformatics, structural biology on 20/04/2018 by tulaykarakulak. 1 Comment
The First Webinar of 2018- Integrative Modeling of Biomolecular Complexes
Turkce icin tiklayin!
We are very excited to revive our webinar series again! The first webinar of this year was given by Assoc. Prof. Ezgi Karaca from Izmir Biomedicine and Genome Center on January 31st. She mentioned about the main techniques in structural biology, data types and how integrate the experimental structural biology data into biomolecular simulations. In particular, she raised our curiosity in computational structural biology by mentioning about “docking” program HADDOCK, and her latest work on “integrative modeling” which was published on Nature Methods. Around 100 people registered our webinar. Our aim is to increase this number and reach more people in soon!
We would like to thank Dr. Ezgi Karaca for this extensive informative seminar and supporting our webinar series! If you also interested in computational structural biology, you can follow this link: https://www.bigmarker.com/bioinfonet/EzgiKaraca
We are looking forward our next webinar!
Posted in Webinars and tagged Bioinfonet Project, bioinformatics, structural biology on 11/02/2018 by tulaykarakulak. 1 Comment