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天主教南京总教区
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初创
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清顺治18年（1660年），罗马教廷传信部在中国推行宗座代牧制，从澳门教区分设南京宗座代牧区（Apostolic Vicariate of Nanking），将代牧的任命权从葡萄牙手中变相收回。_NEWLINE_康熙十五年（1676年），教宗克雷芒十世任命中国籍传教士罗文藻担任宗座代牧。他是历史上第一位中国籍主教，也是1926年以前惟一的一位中国籍主教。 _NEWLINE_1690年，为安抚葡萄牙，罗马教廷决定，将北京、南京两个代牧区提升成为教区，属葡萄牙派人管理，这标志着南京教区（Diocese of Nanking）的正式成立。当时南京教区管理江苏、安徽和河南等地。
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禁教时期
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中国礼仪之争后，康熙帝、雍正帝全面禁止天主教在中国传教，天主教在城市里基本消失，但在松江府、崇明、海门、无锡以及五河县的农村，尤其是渔民中间，仍有为数不少的天主教徒。在100多年的禁教时期，南京教区的主教经常藏身在小船里，往来于江南的河网地带，夜间为教徒们秘密做弥撒。
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重心转移到上海
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第一次鸦片战争之后，清政府和法国于道光二十四年（1844年）签订中法黄埔条约，宣布重新允许天主教在中国传教，发还教产。1856年1月21日，教廷将南京教区改为江南代牧区（Apostolic Vicariate of Kiangnan），辖江苏、安徽两省，主教驻上海，委托耶稣会管理。南京成为江南代牧区之下的一个总铎区。_NEWLINE_1921年8月8日，江苏省和安徽省分别成立江苏代牧区（Apostolic Vicariate of Kiangsu）和安徽代牧区，主教座堂分别位于上海和芜湖。1922年5月1日，江苏代牧区又改名为南京代牧区（Apostolic Vicariate of Nanking）。南京代牧区的主教有姚宗李（1922年—1931年）和惠济良（1931年－1933年）。
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于斌时代
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1926年和1931年，教廷将江苏省长江以北信徒较多的2个地区划出，分别成立了海门教区和徐州教区。1936年，教廷又划出江苏省长江以南、无锡以西的地区成立南京教区，江苏省剩下的地区（上海、苏州和大半个苏北）成立上海教区。于斌出任南京教区主教。主教座堂设在首都南京的石鼓路圣母无原罪主教座堂。南京教区大部分的教友都位于无锡总铎区，无锡三里桥若瑟堂的规模也大于南京的主教座堂。虽然如此，因着南京在当时的首都地位，南京教区曾成为中国天主教的发展中心。_NEWLINE_1946年4月11日，教廷宣布在中国实行圣统制，设立137个教区，归属20个总主教区管辖。南京升格为总教区（Metropolitan Archdiocese of Nanking），于斌出任总主教，是当时仅有的三位中国籍总主教。南京总教区下辖海门教区、上海教区、徐州教区和苏州教区。_NEWLINE_1949年，于斌离开南京，后来去了台湾。
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黎培里被逐以后
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1951年，南京教区代理主教李维光等人发表宣言，要求“坚决肃清帝国主义在中国教会内的一切势力和影响”，反对罗马教廷干涉中国内政（如禁止教徒参加一些政治组织）， 要求将教廷驻华公使黎培里驱逐出境。1959年，南京教区自选自圣了李维光为主教。继任者有钱惠民（1981－1993）、刘元仁（1993—2005）、陆新平（2000至今）。_NEWLINE_江苏省长江以北的大部分地区天主教徒一直很少，长期属于上海教区管理。1949年，成立了海州监牧区和扬州监牧区，分别由法国和美国耶稣会神父管理。1950年代外国神父被驱逐后教务陷于瘫痪。后来2个教区没有恢复。因此南京教区的辖区包括了江苏省除徐州、南通、苏州以外的10个地级市：无锡、常州、南京、镇江、连云港、宿迁、扬州、泰州、盐城和淮安。南京教区有10万教徒，其中一半分布在无锡地区。盐城和淮安已经没有天主教堂。_NEWLINE_江阴青阳露德圣母堂是南京教区的主要朝圣地。