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東方基督教
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东方教会
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历史上，东方教会是东方基督教分布最广的支系，从其核心地带——波斯统治下的美索不达米亚——一直传播到地中海沿岸、印度和中国。东方教会宣称其始于萨珊波斯帝国的教会，于424年由于接受了聂斯托里学说而独立于其他教会之外。该学说是由428-431年间担任君士坦丁堡牧首的聂斯托里创立的，被罗马帝国宣布为异端，因此，在西方这一教派以“聂斯托利教派”而闻名。在波斯时代的宗教迫害之后，东方教会在哈里发时代得以繁荣，建立了遍布亚洲的教区。_NEWLINE_在蒙古帝国的扩张式发展之后，东方教会在14世纪陷入衰败，最终被限制在在其核心地带——现在的伊拉克、叙利亚东北部、土耳其东南部、伊朗西北部和印度马拉巴尔海岸。16世纪，不同王朝之间的争斗使东方教会陷入分裂，形成了两个相互竞争的教派。两个现代的教派在分裂中逐渐形成，一个是与罗马天主教会共融而形成东仪天主教会一支的迦勒底教派，一个是东方亚述教会——这两个教派的信徒基本都是亚述人。在印度，当地的东方教会被称为圣多马教会，在葡萄牙殖民者的影响下也陷入分裂。
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东方亚述教会
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亚述教会源自历史上的东方教会。东方教会自其核心地带——美索不达米亚和叙利亚（当时为波斯帝国的一部分）广泛传播到亚洲各地，于16世纪分裂为现代的迦勒底教派和亚述教会，前者与罗马天主教完全共融，成为东仪天主教会的一支。_NEWLINE_东方教会是基于聂斯托里学说而建立的。该学说是由428-431年间担任君士坦丁堡牧首的聂斯托利创立的，强调耶稣的人性与神性的区分。聂斯托里及其学说在431年的以弗所公会议上被宣布为异端，从基督教会中分裂出去，其追随者来到波斯并在当地建立了基督教会。这一流派的神学逐渐发展，并以聂斯托里教派闻名于西方。聂斯托里教派仅仅接受前两次大公会议，即第一次尼西亚公会议和第一次君士坦丁堡公会议所确立的信条，这一点与其他东方基督教派截然不同。_NEWLINE_东方教会很快从波斯传播到亚洲各地——6世纪传播到印度和蒙古地区，7世纪传播到中国（中国称景教），在14世纪之前得以很大发展，但在蒙古帝国和帖木儿帝国的扩张中几乎被摧毁，到16世纪，教派仅被限制在伊拉克、叙利亚东北部、土耳其东南部、伊朗西北部和印度马拉巴尔海岸（喀拉拉）。15世纪时，教派分裂为迦勒底教派和亚述教会，只有前者仍然保持独立地位。东方亚述教会的分裂则一直持续到20世纪。
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东仪天主教会
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22个东仪天主教会都与梵蒂冈教廷共融，但都保留了东方基督教的神学理论和礼拜仪式。大部分东仪天主教会都和上述东方基督教的支系在民族上和礼拜仪式上有密切关系。和其他东方基督教派一样，已婚的神甫也可以晋铎，而且神甫为洗礼后婴儿行傅油礼，受洗后的孩子可以领受圣餐。在印度喀拉拉邦，部分东叙利亚礼基督徒投向了西叙利亚礼教派，成为东方教会的信徒（一些印度东方正统教会在1930年与罗马天主教会共融，成为叙利亚-玛兰卡礼天主教会）。马龙尼礼教会（常常被错误地称为“合并教派”）也宣称从未从罗马教廷分裂过。意大利-阿尔巴尼亚礼天主教会也一直和罗马教廷保持共融，但其礼拜仪式与东方正统教会相似。
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圣多马教会
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圣多马教会是分布在印度东南部的古老基督教分支，是1世纪在印度传播福音的宗徒多马建立的教会。5世纪时，圣多马教会成为东方教会的一部分，直到17世纪中期葡萄牙人抵达印度。此后，教会一直陷入分裂至今。
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天主教-正教泛基督教主义
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在过去的43年中，始于天主教罗马教宗保禄六世和正教君士坦丁堡普世牧首雅典那哥拉一世会晤所提倡的“泛基督教对话”开启了人们期盼了近千年的基督教合一。二者在耶路撒冷会晤时，撤销了最初罗马教宗和君士坦丁堡普世牧首给予对方的绝罚。最近一次天主教罗马教宗本笃十六世和正教君士坦丁堡普世牧首巴多罗买一世在会晤后发布了共同声明，宣告“我们感谢一切是好的，让我们再一次，在祈祷和对话，以表达喜悦，我们亲如兄弟的感觉，并重申我们的承诺，迈向完全共融。”
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分离运动
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在上述四个主流分支之外，还存在其他较小的教派，例如“抗议派”——其名称始于其在发源地掀起的与统治者对抗的传统，但一般为不属于信义宗——因为他们缺乏与宗教改革相关的历史传统，也与信义宗的神学理论关系甚少。这些教派大多属于正教的“旧教信仰”运动，兴起于俄罗斯正教的分裂，甚或从属于更为激进的“属灵基督教”运动——后者包括形形色色的“低教会”集团，例如主张以《圣经》为中心的Mologan教派、主张无政府主义的Doukhobor教派以及进行自残的Skoptsy教派。除了少数俄罗斯旧正教徒与俄罗斯海外正教会在礼仪上共融之外，这些教派与上述主流的东方基督教教派之间均无共融。_NEWLINE_在一些国家，分离运动体现为谋求建立其国教会——例如，从属于塞尔维亚正教会辖区的马其顿正教会和黑山正教会。马其顿的情况需要特别注意：在该国，由于建立自主的马其顿正教会的强大力量，塞尔维亚正教会的影响力很小。绝大多数马其顿正教徒认为塞尔维亚正教会在历史上是其民族历史、民族利益和民族自决方面的敌人。
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移民趋势
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20世纪，东方基督教信徒出现了由近东向西方移民的趋势。一千年前的土耳其、伊拉克、叙利亚、伊朗、黎巴嫩、约旦、巴勒斯坦、埃及，基督徒都曾在居民人口中占主体地位。直到1914年，奥斯曼帝国的居民中还有25%的基督徒。然而在21世纪初，这些地区仅有总计6-7%的居民为基督徒：在土耳其不到1%，在伊拉克为3%，在叙利亚为12%，在黎巴嫩为39% ，在约旦为6%，在以色列和巴勒斯坦为2.5%，在埃及为15–20%。造成这种大规模迁徙的主要原因是在上述地区伊斯兰教社团对基督教社团所进行的的安全攻击、肆意掠夺、宗教迫害和政治歧视。