يعتمد القطاع الفلاحي بالأقاليم الجنوبية على المنتوج الحيواني والأنشطة الزراعية السقوية بشكل رئيسي، وهي تتمركز بالأساس في كل من جهة كلميم واد نون وجهة الداخلة وادي الذهب.
انتشرت زراعة الخضراوات في البيوت البلاستيكية المنتشرة في جهة الداخلة وادي الذهب. وقد عرفت بفضل الظروف المناخية المناسبة وغياب الأمراض النباتية والحشرات الضارة تطورا هاما، ميز منتجاتها بالجودة، وخاصة منها منتوج الطماطم.
أما جهة كلميم واد نون، فقد تميزت بزراعة النخيل والتمور، وأيضا زراعة أشجار الزيتون، وهما الزراعتان الأكثر شيوعا بها. إذ تنتشر هاتين الزراعتين بكل من الواحات والمناطق الجبلية.
ويعد منتوج الكسكس الخماسي واحدا من أهم المنتجات الفلاحية الرائدة في الأقاليم الجنوبية. بحيث أنه شهد إنتاج هذا الكسكس بجهة العيون الساقية الحمراء تطورا مذهلا؛ إذ عرف ارتفاعا مهما، من 1750 طنا في سنة 2008 إلى 4200 طن في عام 2019.
بالإضافة إلى غيره من المنتوجات المحلية التي تميز أقاليم الجنوب، فإن منتوج حليب الإبل قد شكل قيمة مضافة لا يمكن إنكارها، إذ حقق معدل معاملات مهمة في اقتصاد هذه الجهات.
وكذلك الأمر بالنسبة لبقية المنتجات المحلية سواء ما تعلق منها بمشتقات لحوم الإبل (لوديك، ذروة الجمل، وتيشطار)، أوالزراعات كالتين الشوكي لآيت باعمران، وعسل شجرة الفربيون من الصحراء، و"الدغموس"، الذي ينتج بشكل خاص في جهة كلميم واد نون، فهي كلها منتجات نموذجية خاصة بالجهات الجنوبية. وهي توفر فرصا استثمارية كبيرة بسبب تزايد الطلب والإقبال عليها على الصعيد الوطني والدولي.