Sfortunatament, il-bażilika kienet l-istruttura waħda tar-reġjun li sofriet l-aktar ħsarat waqt it-terremoti tal-1997, li l-epiċentru tagħha kien jinsab ftit barra minn Assisi.
It-terremoti tal-1997 seħħew f’San Francisco, u kkawżaw ħafna ħsara.