Kan'eiji kien sede ta 'qawwa kbira sal-1868, meta sar il-kamp ta' battalja fl-aħħar stand tax-xogunat kontra l-armata imperjali u l-biċċa l-kbira tal-bini nqerdu.
Il-biċċa l-kbira tal-binjiet f'Kan'eiji ġew imwaqqgħin fl-aħħar tas-seklu 19.