De tal modo era despegada de bens materiais que mesmo quando seu irmão, D. João II, lhe deu o senhorio de Aveiro, ela tratou de usar esses rendimentos para «proteger órfãs, compor discórdias, evitar abusos de poderosos contra os fracos, etc.» (2) Assim foi passando os seus dias até ser acometida por uma séria doença. Nessa altura, as outras religiosas mudaram-na da sua cela minúscula -- como todas -- para um quarto mais perto da capela, de modo a que ela pudesse ouvir a missa, as orações e os cânticos. Além disso, D. Joana, devido ao seu estatuto, recebia visitas importantes, pelo que precisava de condições para o fazer. A essa decisão também não deveriam ser alheias razões que envolviam o não permitir que os visitantes entrassem muito no interior do convento, ficando, dessa maneira, mais perto da saída...