No início, foi peremptório em afirmar que no tal dia 7 tinha ido com o seu patrão à morgue do HDB, e que este levava um envelope e se encontrou com Jorge Simões, o então director do hospital. Seriam estes três factos que, essencialmente, confirmariam a história de Francisco Nunes. Mas bastaram duas ou três perguntas dos membros da comissão para Amélio Baião começar a confundir o que aconteceu. Em declarações à Inspecção-geral de Saúde, Baião declarou que estava a trabalhar na morgue, juntamente com João Duarte, quando Francisco Nunes chegou, sozinho, numa carrinha comercial. Ontem disse que tinha vindo com o seu patrão de Évora até Beja e chegou com ele à morgue onde estava João Duarte. Os três teriam estado ali «um bocado a ver televisão» e depois Jorge Simões apareceu, «fez um sinal» a Francisco Nunes e este foi «ao carro buscar o envelope e escondeu-o debaixo do casaco». Depois desapareceram os dois.