O resultado do exame fora de algum modo abalado pelo depoimento em Tribunal José Barrias, um dos mais reputados psiquiatras do mesmo hospital portuense, que assistira Manuel Marta meses antes dos acontecimentos de Junho e chegou mesmo a recomendar o seu internamento. Na opinião de José Barrias, Manuel Marta deveria ser enquadrado no estatuto de inimputável ou, em traços gerais, não responsável pelos seus actos. A avaliar pela sentença, o Tribunal baseou a sua decisão de condenar Manuel Marta no exame pericial. A tentativa de linchamento de que Manuel Marta fora alvo, no próprio dia do desaparecimento de António Gouveia, chegou a fazer temer a ocorrência de incidentes durante as audiências. O julgamento acabou por decorrer de forma pacífica.