Cinco anos depois, o corpo foi trasladado, tendo as cerimónias solenes ocorrido no primeiro domingo de Setembro de 1803, com uma procissão que transportou Santa Clara até à sua nova morada e durante a qual consta que uma senhora cega recobrou miraculosamente a vista. Com este novo culto, a anterior devoção ao Senhor do Bonfim acabou por ser relegada, e há mais de um século que não se fazem celebrações em sua honra. Colocados em altar, os restos mortais de Santa Clara encontram-se dentro de uma imagem deitada -- elaborada em cera e fechada numa urna --, e deles apenas se vislumbram os ossos de uma mão e os dentes. Diariamente visitada por muitos devotos, por ela têm especial predilecção as mães sofridas com dores de parto ou as que se afligem com a debilidade dos filhos. Uma das graças mais imploradas à santa prende-se com a fala tardia das crianças, e ainda hoje algumas mulheres oferecem galinhas e pombas brancas a Santa Clara, rogando para que as crianças despertem do seu mutismo.