Quanto à guerra particular com o Inkatha, que vitimou a partir de 1985 e até ao final dessa década cerca de 15 mil pessoas, Mbeki disse que o seu partido tinha apenas adoptado uma postura defensiva. «Algumas unidades de auto-defesa agiram na verdade em defesa do povo... não contra o Inkatha mas contra os senhores da guerra», disse Mbeki, para quem esses senhores da guerra eram gente a soldo do governo para fomentar a violência. Mas o ANC reconheceu, pela voz de Mbeki, que tinha tentado assassinar, a dado momento, o chefe do Inkatha, Mangosuthu Buthelezi, que encarava como colaborador do regime do apartheid. «É exacto que foi decidido assassinar o dr. Buthelezi, mas finalmente foi dada uma contra-ordem», disse Mbeki.