O grupo de trabalho das tecnologias de informação, aero-espacial, telecomunicações, robótica, astronomia, matemática, física e química, fez aliás do seu protesto o ponto 1 das suas conclusões. Nele se lê que «a comunidade científica devia ter sido ouvida na preparação do Praxis XXI e da estratégia subjacente». É curioso o facto de o relator deste grupo de trabalho ter sido Carlos Salema, um ex-presidente da Junta Nacional de Investigação Científica e Tecnológica que, durante o seu mandato, nunca organizou nenhum exercício de discussão pública sequer semelhante a esta reunião de Tróia. O secretário de Estado da Ciência e Tecnologia, Manuel Fernandes Thomaz, diria, porém, na sessão de encerramento, que a declaração de que a comunidade científica não tinha sido ouvida «não corresponde inteiramente à verdade»: «Estão aqui 250 ou 300 investigadores e tenho ouvido umas reivindicações de que devia ter ouvido 500 ou 1000, mas houve um processo institucional de consulta. Há órgãos que representam a comunidade científica e que foram ouvidos, como o Conselho Superior de Ciência e Tecnologia [CSCT], onde estão representadas todas as associações científicas, empresas, associações. O que acontece é que os mecanismos [de consulta] não são fáceis.»