As dívidas de agricultores e usineiros, beneficiados por dinheiro do Banco do Brasil e Caixa Econômica Federal, também serão avaliadas. A CEI já pediu aos dois bancos um mapeamento de todos os casos desta natureza. Além de investigar as irregularidades ocorridas nos últimos anos, a comissão planeja reestruturar antigos mecanismos de combate à corrupção que foram desmantelados recentemente. É o caso da Cisets (Secretarias de Controle Interno das Estatais), compostas por auditores escalados para tentar prevenir a administração contra «roubalheiras».