Outro inquérito sobre o uso da máquina do governo, aberto por iniciativa do Ministério Público, também está na reta final, mas são poucas as chances de julgamento antes do primeiro turno. Ainda que ganhe a eleição antes do julgamento, FHC não estará livre do processo. Em tese, mesmo depois de empossado, ele pode perder o mandato por causa dessas acusações. A hipótese é pouco provável, mas tecnicamente existe. O diploma do eleito pode ser impugnado no prazo de 15 dias, com base num processo em andamento.