Sinh ra ở Yonkers, New York, Comey lớn lên ở Allendale, New Jersey, là con của Joan (Herald) và J. Brien Comey. Cha của ông làm việc trong công ty bất động sản và mẹ ông là một nhà tư vấn máy tính và nội trợ. Comey có gốc Ai Len. Ông học Trường trung học khu vực Northern Highlands ở Allendale. Comey tốt nghiệp từ Cao đẳng William và Mary năm 1982, chuyên về hóa học và tôn giáo. Luận án cao cấp của ông đã phân tích nhà thần học tự do Reinhold Niebuhr, Jennifer Nieweller và Jerry Falwell bảo thủ, nhấn mạnh đến niềm tin chung của họ đối với hành động công cộng. Ông đã nhận  ... Tiếp tục ở trên, sao cho nó trả lời "Comey đã nhận được loại bằng cấp nào vào năm 1985?":
bằng Juris Doctor (J.D.) từ Trường Luật Đại học Chicago năm 1985.