Ergenekon davasının ikinci iddianamesinde emekli orgeneraller Eruygur ve Tolon'un Danıştay saldırısıyla ilgili görüşmeleri de yer alıyor.
1909 sayfalık iddianamenin önemli bir bölümü telefon dinlemelerinden oluşuyor. Davanın bir numaralı sanığı Eruygur ile 2 numaralı sanığı Tolon arasında 8 Nisan 2008'de yapılan görüşme kaydında, Danıştay baskını sanığı Alparslan Aslan'ın adı geçiyor: Hurşit Tolon: "Önce Danıştay saldırısı yaşandı. Bakın şimdi Alpaslan Aslan adlı bir saldırgan Danıştay binasında ölüm saçtı sonrada yakalandı. Saldırgan türbanı yasaklayan kararları nedeniyle eline silah almıştı ya. Bu adam ben dinciyim diyor"  Şener Eruygur: "Artı o adam bir de beni öldüreceğini söylemişti"  Hurşit Tolon: "Gerçi saldırgan son zamanlarda daha çok ulusalcı çevrelerle vakit geçirmiş. Bunu da şimdi avukatlar inceliyor. Adamın biri çıktı ulusalcılar dincilerden daha tehlikelidir dedi. Öbürü de çıktı, 'Ulusalcılar teröristtir' dedi; biliyorsunuz değil mi?" Eruygur ve Tolon arasında geçen görüşmede Cumhuriyet mitinglerinin Ergenekon örgütünce gerçekleştirildiğine yönelik haberler de eleştiriliyor.  Eruygur, sivil insanların katılımcı demokrasi içinde fiklerini açıkladığını belirterek, "Çıkın falanca yerde birleşin, demişim. Keşke öyle bir düş olsa hemen parti kurarım" diyor. İkili arasında daha sonra Hrant Dink cinayetinin kendilerine mal edilmeye çalışıldığına dair bir görüşme iddianamede yer alıyor.  Şener Eruygur: "Şimdi adam bir taraftan şunu da ima etmeye çalışıyor. Hrant Dink cinayetini bile bunlar yapmışlardır demeye getiriyor."  Hurşit Tolon: "Şimdi aklınıza gelen herşey eski görev yapan insanların üstüne atılı oluyor."
[]
'Alparslan Arslan beni de öldüreceğini söylemişti'