O e posteriormente o tinha um Administrador delegado, a quem competia os poderes executivos da gestão corrente cláusula 12 do acordo, uma Comissão Executiva que auxiliava e apoiava o administrador delegado que era comum ao Hospital E e ao Instituto E1 e um Conselho de Administração, composto pelos administradores executivos Comissão executiva e administrador e os administradores não executivos.