ciprofloxacín dosahuje vysoké koncentrácie v rôznych tkanivách ako sú pľúca (epitelová tekutina alveolárne makrofágy bioptické tkanivo) v dutinách zápalových léziách (tekutina pľuzgierov spôsobených španielskou muškou) a v urogenitálnom trakte (moč prostata endometrium) kde sa dosahujú celkové koncentrácie prekračujúce koncentrácie v plazme