Mô hình phân đoạn nổi bật của cột sống được thiết lập trong quá trình tạo phôi khi somites được thêm theo nhịp điệu vào phía sau của phôi. Sự hình thành somite bắt đầu vào khoảng tuần thứ ba khi phôi bắt đầu tiêu hóa và tiếp tục cho đến khi khoảng 52 somites được hình thành. Somites là các hình cầu, được hình thành từ mesoderm paraxial nằm ở hai bên của ống thần kinh và chúng chứa các tiền thân của xương sống, xương sống và một phần của hộp sọ, cũng như cơ bắp, dây chằng và da. Somitogenesis và sự phân bố tiếp theo của somites được kiểm soát bởi một mô hình đồng hồ và sóng hoạt động trong các tế bào của xương sống paraxial.