Ismail al-Azhari, lãnh đạo Đảng Liên minh Quốc gia, được bổ nhiệm làm tổng thống vào tháng 7 năm 1965, và cai trị với quyền lực hạn chế cho đến khi ông bị lật đổ vào năm 1969. Các sĩ quan quân sự chịu trách nhiệm về cuộc đảo chính thành lập Hội đồng Chỉ huy Cách mạng Quốc gia, do Gaafar Nimeiry chủ tịch. Nimeiry, lãnh đạo của Liên minh xã hội chủ nghĩa Sudan mới thành lập, đảm nhận vị trí tổng thống vào năm 1971, và sau đó thành lập một nhà nước độc đảng, tồn tại cho đến năm 1985, khi một nhóm các sĩ quan quân sự lật đổ chính phủ của ông và thành lập Hội đồng Quân sự Chuyển tiếp, do Trung tướng Abdel Rahman Swar al-Dahabani lãnh đạo. Ahmed al-Mirghani đã thành công trong vị trí tương đối bất lực của Chủ tịch Hội đồng Tối cao vào năm 1986, sau các cuộc bầu cử đa đảng được