Sandanski sinh ra ở làng Vlahi gần Kresna ở Đế chế Ottoman vào ngày 18 tháng 5 năm 1872. [1] Cha ông Ivan tham gia như một người mang cờ trong cuộc nổi dậy Kresna-Razlog. Sau khi cuộc nổi dậy bị đè bẹp, năm 1879, gia đình ông chuyển đến Dupnitsa, Bulgaria, nơi Sandanski nhận được giáo dục tiểu học. Từ năm 1892 đến 1894, ông là một người lính trong quân đội Bulgaria. Sandanski là một người ủng hộ tích cực cánh Radoslavov của Đảng Tự do và ngay sau khi lên nắm quyền vào tháng 2 năm 1899, ông được bổ nhiệm làm người đứng đầu Nhà tù Dupnitsa.