Không biết nhiều về những năm đầu đời của ông, nhưng Jacques de Molay có thể được sinh ra ở Molay, Haute-Saône, trong quận Burgundy, vào thời điểm đó là một lãnh thổ do Otto III cai trị như một phần của Đế quốc La Mã Thánh, và trong thời hiện đại ở khu vực Franche-Comté, đông bắc Pháp. Năm sinh của ông không chắc chắn, nhưng xét theo các tuyên bố được đưa ra trong các phiên tòa sau đó, có lẽ là khoảng năm 1250.