Il est considéré comme sûr d'utiliser le CLA s'il est pris tel que prescrit, certaines personnes peuvent ressentir des effets secondaires, généralement légers, notamment des maux d'estomac, de la diarrhée, des nausées, de la fatigue, des maux de tête et des maux de dos.
Ana tsammanin ba shi da haɗari don amfani da CLA idan an ƙaddara shi kamar yadda aka tsara, wasu mutane na iya fuskantar tasirin sakamako, yawanci mai laushi, har da ciwon ciki, zawo, tashin zuciya, gajiya, ciwon kai, da ciwon baya.