البشير لحظه نزوله من الطائره في الخرطوم وكانت محكمه في جنوب افريقا قد امرت بمنع مغادره البشير الاراضي الجنوب افريقيه تمهيدا للفصل في دعوي قضائيه بتسليمه لمحكمه الجنايات الدوليه علي خلفيه اتهامه بارتكاب جرائم حرب في دارفور. لكن البشير غادر جنوب افريقيا عبر مطار عسكري قبل صدور الحكم. وقال المتحدث باسم الجيش في جنوب افريقيا لبي بي سي "لم تتعرض قواتنا في السودان لاي تهديد من اي نوع ويقوم جنودنا باداء مهامهم المعتاده". ونفي فرحان الحق المتحدث باسم الامم المتحده في بيان رسمي وجود اي تهديد للقوات الجنوب افريقيه المشاركه في قوات حفظ السلام في دارفور. مواضيع قد تهمك نهايه ويشارك الف واربعمائه جندي من جنوب افريقيا في قوات حفظ السلام التابعه للاتحاد الافريقي في السودان والتي تعمل بتكليف من الامم المتحده. وكانت قناه "اخبار 24" المحليه في جنوب افريقيا نقلت تصريحات عن شهود عيان في دارفور قولهم ان جنودا سودانيين حاصروا مقر الجنود المنتمين لجنوب افريقيا في قوه حفظ السلام في دارفور. طلب اعتقال البشير خلال قمه جوهانسبيرغ الافريقيه واضافت القناه ان ذلك وقع عندما اصبح يتردد ان البشير يمكن ان يتعرض للاعتقال في جنوب افريقيا اثناء مشاركته في قمه الاتحاد الافريقي. وذكرت القناه لاحقا ان الحصار انتهي بمجرد وصول البشير الي العاصمه الخرطوم. وطالبت المحكمه الجنائيه الدوليه جنوب افريقيا بالقاء القبض علي الرئيس السوداني عمر البشير اثناء حضور القمه الافريقيه. وقالت المحكمه الدوليه انه اذا تم القبض علي البشير فسوف يحال الي الجمعيه المؤلفه من الدول الاعضاء والي مجلس الامن الذي احال القضيه الي المحكمه الجنائيه الدوليه عام 2005. وكانت المحكمه قد اصدرت مذكره اعتقال عام 2009 متهمه الرئيس البشير بارتكاب جرائم حرب وجرائم ضد الانسانيه اثناء فتره الصراع في دارفور. وتتعلق الاتهامات بالصراع في دارفور الذي ادي الي مقتل نحو 300 الف شخص وتشريد نحو مليونين طبقا لارقام الامم المتحده. الدول الاعضاء وجنوب افريقيا هي احدي الدول الـ 123 الموقعه علي قانون المحكمه مما يعني ان علي شرطتها القاء القبض علي البشير طبقا لقانون المحكمه الدوليه. ومنذ صدور مذكره الاعتقال كانت معظم سفريات البشير للخارج الي دول غير اعضاء بالمحكمه الجنائيه الدوليه مثل السعوديه ومصر. لكنه سافر ايضا الي عدد من الدول الاعضاء والتي امتنعت عن اعتقاله مثل نيجيريا التي استقبلته في يوليو/تموز عام 2013. وكان الاتحاد الافريقي قد طلب من المحكمه الجنائيه الدوليه وقف اجراءاتها ضد اي رئيس اثناء فتره حكمه. وقال المتحدث باسم مفوضيه الاتحاد الافريقي ان الاتحاد لن يفرض علي اي دوله عضو القبض علي زعيم نيابه عن المحكمه.
نفت القوات المسلحه في جنوب افريقيا قيام السلطات السودانيه باعتقال عدد من الجنود التابعين لها ضمن القوات الدوليه العامله في دارفور بعد صدور امر قضائي بعدم السماح للرئيس السوداني البشر بمغادره البلاد.