وحذر البابا من ان البعض قد "يخطئ في تفسير البحث عن الحق، وقد يقوده هذا الي عدم العقلانيه والتطرف". ووجه البابا -الذي كان يتحدث بالاسبانيه- كلامه الي الحكومه الشيوعيه مطالبا اياها بمنح مزيد من الحقوق لكنيسه الروم الكاثوليك في كوبا، من قبيل حريه التعليم الديني في المدارس. وعقد البابا اجتماع مدته نصف ساعه مع الزعيم الثوري والرئيس السابق فيدل كاسترو. وجلس راؤول كاسترو الرئيس الحالي لكوبا، والشقيق الاصغر لفيدل كاسترو، في الصف الاول للقداس. واحتشدت الجموع في ميدان الثوره حاملين الاعلام للترحيب بالحبر الاعظم قبل ساعات من وصوله لالقاء عظته. وقال احد المحتشدين لسماع عظه البابا "جئت استمع لكلماته الحكيمه. كلمات حكيمه موجهه للشعب الكوبي. هذا يمدنا بالعون ويوحدنا". ويقول اخرون انهم لم يجيئوا طواعيه بل جاءوا لان شركاتهم ومدرسيهم ضغطوا عليهم للقدوم وغادروا قبل بدء القداس. وقال روبيرتو "جئت تنفيذا لما طلبه مدرسي. انتظرت برهه واستعد الان للمغادره". وقد كان موضوع عظه البابا هو كيف يمكن للكوبيين بناء مجتمع اكثر انفتاحا مبني علي الحق والعداله والتسامح. واثناء زياره البابا دعا بعض النشطاء الكنيسه الكاثوليكيه الي التدخل لدعم حقوق الانسان. كاسترو هو الذي طلب لقاء البابا وعندما زار البابا مدينه سانتياجو في جنوب كوبا، قال في العظه التي القاها هناك انه يصلي "للذين يعانون وللمحرومين من الحريه وللذين اضطروا للبعد عن احبابهم". وعندما اجتمع بالرئيس راؤول كاسترو، دعا البابا لمنح الكنيسه دورا اكبر. كما دعا الي ان تكون الجمعه العظيمه عطله رسميه في كوبا. وقبل زيارته كان البابا قد قال ان النموذج الماركسي الكوبي "لم يعد يتماشي مع الواقع" ودعا الي تطبيق "نماذج اخري" للحكم. وعلي الرغم من انتقادات البابا، يقول المراقبون ان العلاقات بين كوبا والكنيسه الكاثوليكيه شهدت تحسنا في الاعوام الاخيره. وقال مسؤولون كنسيون ان جدول زيارته لم تسمخ بمقابله المعارضين للحكومه.
دعا البابا بنديكت السادس عشر الكوبيين للبحث عن "الحريه الحقه" في قداس اقيم الاربعاء في ميدان الثوره في هافنا وحضره نحو ثلاثمائه الف شخص.