تعلم ناجي القدسي العزف علي اله العود بنفسه لشده شغفه بالموسيقي. ويعد الموسيقار ناجي القدسي احد اهم الموسيقيين في العالم العربي، كما ان تجربته في الموسيقي السودانيه من العلامات المميزه. وقد انجز مجموعه من الالحان الخالده مثل، الساقيه، وجسمي انتحل، وحمام الوادي، وتراتيل، والعديد غيرها من الاعمال التي شكلت وجدان جيل كامل في السودان واليمن. راهبه ايطاليه ولد ناجي الهيثمي الذي اشتهر بناجي القدسي - لحبه للاحاديث القدسيه - في مدينه عطبره شمالي السودان عام 1944، لاب يمني وام سودانيه، والتحق بكتاب لحفظ القران قبل ان يلتحق بمدرسه كامبوني الكاثوليكيه الايطاليه التي تنتشر فروعها في مدن السودان. وكانت تعمل بالمدرسه راهبه ايطاليه تعزف علي اله البيانو، في صاله بعيده عن الفصول الدراسيه، مقطوعات من الموسيقي العالميه. واولع ناجي بعزفها واكتشف شغفه المصيري بالموسيقي، فكان يهرب من حصص الدراسه متسللا الي صاله الموسيقي للاستماع اليها. مواضيع قد تهمك نهايه وما لبث ان تعلم بمفرده العزف علي العود، وبدا التلحين وهو في الثانيه عشره من عمره. وبعد منتصف الخمسينيات من القرن العشرين انتقل مع اسرته الي الخرطوم، وهناك واصل السعي لتعلم الموسيقي، فالتحق بمدارس الجامعه الشعبيه حيث درس الموسيقي علي يد استاذ العود المصري عبد المنعم عرفه. وفي السادسه عشره من عمره الف ناجي مقطوعته الموسيقيه الاولي التي سجلتها اوركسترا الاذاعه السودانيه عام 1961. الساقيه ولحن ناجي كثيرا من الاغنيات العاطفيه والوطنيه لعدد من المطربين السودانيين واليمنيين، من بينها اعمال ملحميه من التراث الشعبي السوداني، واخري مسرحيه من الادب العربي، كمسرحيه ماساه الحلاج لصلاح عبدالصبور. ولكن العمل الابرز الذي اصبح ايقونه بالنسبه للشعب السوداني تمثل في اغنيه الساقيه التي الفها عمر الدوش ولحنها نهايه الستينيات في ليلتين فقط علي رمال شاطئ النيل الازرق، واداها المطرب حمد الريح لتصبح فيما بعد ذروه تجربته الثره. بيد انه اضاف الي اللحن هتافات مناوئه للرئيس السوداني السابق جعفر نميري، كانت ترددها الالات الموسيقيه. ولكن هذه الهتافات الموسيقيه، وفيما يشبه دوران الساقيه، تحولت الي هتافات كلاميه صريحه رددها المتظاهرون المناوئون لحكم نميري، ابان انقلاب اطاح فيه الحزب الشيوعي بحكم النميري لمده ثلاثه ايام في يوليو تموز عام 1971 قبل ان يعود نميري مره اخري. وسرعان ما حظر تداول الاغنيه، واعتقل بسببها ناجي القدسي. وبعدما افرج عنه بعد ثلاثه اشهر من الاعتقال، فرض عليه حصار فني واوصدت امامه جميع الابواب طوال عقد السبعينيات. وهجره حتي اصدقاؤه مما اضطره الي مغادره السودان في الثمانينيات الي اليمن. وبالرغم من انه واصل هناك عمليه التلحين لمطربين يمنيين، من بينهم ابوبكر الفقيه، وسودانيون كثيرون، فانه عاش في شبه عزله في ظروف قاسيه في غرفه متواضعه وسط العاصمه اليمنيه صنعاء، التي وافته المنيه فيها، بعد عمليه جراحيه في القلب.
رحل الفنان السوداني اليمني ناجي القدسي بعد اصابته بهبوط حاد اثر عمليه قلب مفتوح اجريت له في احد مستشفيات صنعاء.