لا تزال العلاقات متوتره بين شمال السودان وجنوبه وشجب ابراهيم غمباري الاشتباكات الاخيره بين الجيش السوداني واثنتين من حركات التمرد في دارفور. واتهم بعض المحللين الحكومه بمحاوله التخلص من المتمردين بغرض التفرغ للاستفتاء. وقال غمباري ان المواجهات اعقبت رفض الحركتين –وهما حركه العدل والمساواه وجيش تحرير السودان فصيل عبد الواحد– خوض المفاوضات. وقال غمباري: "منذ ان انسحبتا وبعد ان توقفت الامطار، استؤنفت المواجهات في جنوب دارفور وفي شماله كذلك، خاصه في جبل مره." ويري المحللون ان الجنوب قد يجنح الي الانفصال مما سيكون له عظيم الاثر علي توازن القوي في البلد. واذا ما انفصل الجنوب بالفعل فان خطر متمردي دارفور النسبي قد يتعاظم في بلد اصغر حجما. كما ان عوده الصراع بين الجنوب والشمال امر وارد لذا تسعي الخرطوم الي تجنب خوض المعارك علي جبهتين.
حذر قائد قوات حفظ السلام في اقليم دارفور غربي السودان من تصاعد اعمال العنف خلال الاسابيع القليله المقبله السابقه لاستفتاء يناير لتحديد مصير الجنوب السوداني.