الكثير من مسلحي طالبان لم يعرفوا قائدا غير الملا عمر. وظهرت الخلافات بعد تولي الملا منصور. واعقب ذلك الاعلان اسابيع من الجهود الدؤوبه لتوحيد الحركه لدعم القائد الجديد، الذي يخلف الملا عمر. وبعد اعلان وفاه الملا عمر في يوليو /تموز الماضي، نصب الملا منصور بشكل عاجل "اميرا للمؤمنين" وسط رفض من اتباع الملا عمر. وكانت ابرز التحديات التي واجهت الامير الجديد هو ان شقيق الملا عمر، وابنه الاكبر، وهما غير معروفين حتي الان، شككا في طريقه تعيينه. لكنهما اعلنا الولاء اخيرا للملا منصور. مواضيع قد تهمك نهايه وقال المتحدث باسم طالبان، ذبيح الله مجاهد، لـ بي بي سي: "الملا يعقوب، والملا منان، نجل وشقيق الملا عمر، اقسما بالولاء للامير الجديد في حفل مهيب. وستستكمل الحكومه عملها الان بشكل موحد". وفي الاسابيع الاخيره، سافر المئات من قاده ومسلحي وشيوخ طالبان الي داخل وخارج باكستان، في محاوله للتغلب علي الانقسامات. اعلنت طالبان عن وفاه الملا عمر في يوليو/تموز الماضي، وخلفه نائبه الملا محمد منصور . واوردت تقارير من مدينه كويتا، قرب الحدود الافغانيه، ان المشاورات تطلبت استضافه المئات من اعضاء طالبان في المساجد، والمدارس، والمنازل، وتوفير المواصلات والامدادات. ويبدو ان مهمه توحيد الحركه لم تكتمل بعض، اذ يهدد بعض كبار القاده بعدم طاعه الملا منصور، واداره فرقهم والقيام بهجماتهم الخاصه. دافع للوحده والجهد الذي بذل في التغلب علي حاله التحدي لقياده منصور، يظهر مدي اهميه الحفاظ علي الوحده بالنسبه للحركه. وقال وحيد موزهدا، احد الخبراء المقيمين في العاصمه الافغانيه كابول، ان الحركه ادركت اهميه الوحده لاستمرارها. واضاف موزهدا الذي عمل في وزاره الخارجيه التابعه لطالبان، قبل خروج الحركه من السلطه عام 2001 "الاعداء اقوي من قبل، لذا تعلم الحركه ان الخلافات قد تقضي عليها". وقال بارنيت روبن، احد كبار الخبراء الامريكيين في الشان الافغاني ان طالبان حركه متماسكه بفضل فكرها الذي منع حدوث اي انشقاقات. وتابع روبن: "اسست طالبان علي اساس وضع حد للتفرقه، وهناك موقف قوي ضدها. الكل يتبع اوامر الامير. وطرد البعض او غادروا الحركه، لكنهم خسروا كل نفوذهم بمجرد رحيلهم". ترتيب القياده وياتي الملا منصور علي راس الحركه كونه الامير، وله نائبان. احد النائبين هو سراج الدين حقاني، قائد شبكه حقاني التي اتهمت بتنفيذ اعنف الهجمات داخل افغانستان. وحقاني مطلوب للقبض عليه في الولايات المتحده، التي رصدت مكافاه قدرها خمسه ملايين دولار في مقابل القبض عليه. وياتي في المرتبه التاليه 18 من اعضاء مجلس القياده "شوري طالبان". وبحسب الكاتب الباكستاني، رحيم الله يوسفزاي، فان عدد اعضاء شوري طالبان زاد ليصبح 21 عضوا، وان القياده كلها تقريبا في يد مجموعه باشتون العرقيه الافغانيه. ويتابع المجلس عمل اكثر من عشر هيئات، والمعروفه بوزارات طالبان. ويقول برهان عثمان، من شبكه المحللين الافغانيين، ان الهيئه العسكريه هي الاهم، والتي تنفذ الهجمات، "فقائد الهيئه العسكريه يعادل وزير الدفاع في اي بلد". وتابع عثمان ان العمليات العسكريه تدار من خلال مجموعه من القاده المحليين، ومجموعه من حكام الظل في مقاطعات افغانستان. وهناك ايضا هيئه سياسيه لطالبان، لها مكتب في قطر، اسس كنقطه للاتصال الدولي لتسهيل محادثات السلام الاوليه. القياده العسكريه تعتبر اهم القيادات، اذ تتولي تنفيذ الهجمات المختلفه.
اعلنت حركه طالبان في افغانستان انها نحت خلافاتها جانبا، والتفت حول زعيمها الجديد، الملا اخطر محمد منصور.