واختلف شيخ الازهر مع رؤيه الخشت فيما يتعلق بـ "تجديد التراث الاسلامي"؛ اذ يري الخشت، الذي كان استاذا للفلسلفه في جامعه القاهره قبل تولي رئاستها، ضروره تجديد التراث الديني بما يتناسب مع مقتضيات العصر الحديث، وهذا لا يتضمن "ترميم بناء قديم" بل "تاسيس بناء جديد بمفاهيم حديثه" للوصول الي "عصر ديني جديد". وردا علي ذلك، اكد شيخ الازهر علي اهميه التراث الذي "خلق امه كامله" وسمح للمسلمين "بالوصول الي الاندلس والصين"، منبها الي ان "الفتنه الحاليه سياسيه وليست تراثيه". "ضروره الاجتهاد" يري عماد الدين اديب في الوطن المصريه ان "الجدل الذي دار بين فضيله الامام الاكبر شيخ الازهر، والدكتور محمد الخشت، رئيس جامعه القاهره في ندوه تجديد الفكر الديني هو مساله تستحق ان نتوقف امامها طويلا بالتامل والتحليل". يقول اديب: "ما اريد مناقشته اليوم ليس في المحتوي او المضمون، ولكن في ضروره الاجتهاد وحدوده في التجديد والمعاصره. انها فريضه الاجتهاد، او الاجتهاد في التفكير، حتي لا يتعطل العقل البشري عن التكيف او المواءمه مع تحديات العصر ويصبح عقلا راكدا مثل المستنقع الاسن الذي ياتي بالتطرف." مواضيع قد تهمك نهايه ويضيف اديب: "نحن امام نوعين من التطرف: تطرف الجمود الناشئ عن تقديس الماضي واعطاء العصمه لكل من سبقنا؛ وتطرف الوقوع في اهدار المقدس القطعي الثبوت تحت دعوي التجديد والمعاصره والحداثه ... والوسطيه ليست التوفيق او التلفيق او المجامله الفكريه بين مواقف متناقضه لكنها الجمع بين احترام ما هو سماوي باليقين واطلاق ملكات التفكير العلمي والاجتهاد في كل ما هو من صنع البشر". ويختتم الكاتب قائلا: "بدلا من ان يري البعض ان ما حدث هو صراع فكري او انقسام داخل المجتمع، علينا ان نسعد بمثل هذا الجدل ونشجعه ونطوره، لانه حوار بين علماء افاضل يجمعون بين الغيره علي الدين والتمكن من المعارف الانسانيه واصول الدين الحنيف". وفي رد علي تعليق شيخ الازهر بان التراث سمح للمسلمين "بالوصول الي الاندلس والصين"، يقول الكاتب خالد منتصر في صحيفه الوطن: "الحقيقه انني لا اريد للمسلم المصري ان تكون قدمه اليمني في الصين ولا اليسري في الاندلس، اريد ان تكون قدمه ويكون عقله وقلبه موجودا ومتجذرا في وطنه مصر، واقول لشيخ الازهر ان قوه التراث لم تكن سببا فيما تسميه فضيلتك فتحا، بل كان السبب هو قوه السيف والحروب العسكريه". ويضيف الكاتب: "ومثلما قلت فضيلتك ان الصليبيين كانوا يرفعون الانجيل بيد، وفي اليد الاخري السيف، فاننا ايضا فعلنا نفس الشيء، لكن الفرق بيننا وبينهم هو انهم قد اعتذروا عن هذا التاريخ الاسود، ونحن لم نعتذر بعد، وما زلنا نصف ما فعلناه من غزو واستعمار فتحا مباركا". "ابرز علماء المرحله الراهنه" بينما يقول خالد النجار في الاخبار المصريه ان "المحبه والقبول انعكاس لما داخل النفوس من صدق ونقاء. فصفاء النفس وشفافيتها والقبول الذي يحظي به فضيله الامام احمد الطيب شيخ الازهر نتاج ما يحمله قلبه. نحن في حاجه الي استنساخ امثال الشيخ الطيب الذي يتعامل بكياسه فطريه بعيدا عن التجمل. فخبرته في اقامه الصلح بين العائلات الصعيديه في ساحه الطيب بالاقصر جعلت من الازهر ساحه انفتاح علي العالم. فالشيخ الطيب من ابرز علماء المرحله الراهنه لتماشي اسلوبه مع دعم حوار الحضارات وهو يتمتع بثقافه متشعبه واطلاع واع علي العالم فهو حاصل علي الدكتوراه من جامعه السوربون وهو احد ابرز المتصوفه من علماء الازهر النابهين". ردود "حاده وخشنه" تقول اليوم السابع المصريه ان "مواجهه مباشره بين مفكر اكاديمي وراس المؤسسه الدينيه الاهم في العالم السني، ربما تمثل الحاله الاولي التي تحدث فيها تلك المقابله بين العقل والنقل". ووصفت الصحيفه ردود شيخ الازهر "بالحاده والخشنه"، بينما وصفت الخشت بانه "عالم شجاع، يقتحم مجاهيل الواقع ويفكك الافكار المركبه". وابرزت اليوم السابع تصريحات الخشت التي قال فيها: "تجديد الخطاب الديني ليس حكرا علي مؤسسه بعينها. نعيش جمودا فقهيا وفكريا منذ سبعه قرون وعلينا تفكيك العقل التقليدي والتمييز بين المقدس والبشري حتي نتجاوز لاهوت العصور الوسطي ... علينا انقاذ الدين وتخليصه من الموروث الاجتماعي وقاع التراث".
ابرزت صحف مصريه النقاش الذي دار بين شيخ الازهر احمد الطيب، ورئيس جامعه القاهره محمد عثمان الخشت في مؤتمر الازهر العالمي للتجديد في الفكر الاسلامي.