يذكر ان الرئيس الاسبق يخضع اصلا للاقامه الجبريه بتهم اخري، ولكن الكفاله التي حصل عليها من المحكمه بالامس اعطت انطباعا بانه سيستعيد حريته قريبا. ويصر مشرف علي ان جميع التهم الموجهه اليه تخفي دوافع سياسيه. ويخضع مشرف للمحاكمه بتهمتي قتل رئيسه الحكومه السابقه بينظير بوتو واحد شيوخ القبائل البلوش. كما يواجه تهمه محاوله اقاله كبار القضاه الباكستانيين عام 2007، بينما قالت الحكومه الحاليه انها تنوي مقاضاته بتهمه الخيانه. مواضيع قد تهمك نهايه ويعتقد ان اعتقال مشرف الخميس له علاقه بمقتل رجل الدين المتشدد عبدالرشيد غازي الذي قتل عندما اقتحمت قوات الجيش الباكستاني المسجد الاحمر بالعاصمه اسلام اباد بعد مواجهه مع متشددين اسلاميين كانوا يتمترسون داخله. وكان مشرف قد استولي علي الحكم عام 1999 اثر انقلاب قاده ضد رئيس الوزراء الحالي نواز شريف. وكان مشرف قد غادر باكستان الي المنفي في دبي ولندن بعد خسارته انتخابات عام 2008 امام حزب بوتو.
بعد يوم واحد من اطلاق سراحه بكفاله في قضيه اخري، القت السلطات الباكستانيه القبض علي الرئيس الاسبق برفيز مشرف لدوره في عمليه اقتحام المسجد الاحمر في اسلام اباد عام 2007 التي راح ضحيتها اكثر من 100 شخص منهم رجل دين بارز.