سجن عبد الفتاح اربعه اشهر علي ذمه قضيه "احداث مجلس الشوري". وكانت النيابه العامه اسندت للمتهمين تهم الاعتداء علي المقدم عماد طاحون، مفتش مباحث غرب القاهره، وسرقه جهازه اللاسلكي والتعدي عليه بالضرب، وتنظيم مظاهره بدون ترخيص امام مجلس الشوري، واثاره الشغب والتعدي علي افراد الشرطه وقطع الطريق والتجمهر واتلاف الممتلكات العامه وذلك احتجاجا علي المحاكمات العسكريه للمدنيين وقانون التظاهر. وسجن عبد الفتاح حوالي اربعه اشهر بعد اتهامه بتنظيم مظاهره بدون ترخيص لكن اخلي سبيله بكفاله قدرها عشره الاف جنيه مصري . واثار اعتقال عبد الفتاح وغيره من الناشطين انتقادات قويه من جانب منظمات مدافعه عن حقوق الانسان. وتظاهر المتهمون امام مجلس الشوري في نوفمبر/تشرين الثاني الماضي، اعتراضا علي اقرار "قانون التظاهر الجديد" الذي يحظر التجمعات والتظاهر بدون اخطار السلطات. مواضيع قد تهمك نهايه وكانت محكمه جنايات الجيزه قد حكمت علي عبدالفتاح وشقيقته، مني، وعشره نشطاء اخرين في يناير/كانون الثاني بالسجن سنه مع ايقاف التنفيذ في قضيه حرق المقر الانتخابي للمرشح الرئاسي السابق الفريق احمد شفيق. وكان عبد الفتاح من الداعين لمظاهرات يناير/كانون الثاني 2011 التي اطاحت بالرئيس السابق حسني مبارك. يذكر انه منذ عزل الجيش للرئيس المصري محمد مرسي اعتقلت السلطات عددا كبيرا من الناشطين السياسيين وانصار جماعه الاخوان المسلمين.
اصدرت محكمه جنايات القاهره حكما غيابيا بحبس علاء عبدالفتاح ونشطاء اخرين، 15 عاما، في احداث شارع قصر العيني والمعروفه اعلاميا بـ "احداث مجلس الشوري" والتي وقعت في شهر نوفمبر الماضي، بحسب شقيقه الناشط مني سيف.