يطالب التقرير الحكومه باتخاذ اجراءات محدده لتعزيز التسامح الديني وقالت المنظمه التي تتخذ من نيويورك مقرا نها ان هناك ازديادا ملحوظا في تعرض الاقليات المسيحيه والبوذيه والمسلمه لهجمات، علي ايدي مسلحين اسلاميين في كثير من الاحيان. وتقول المنظمه انها عملت علي اعداد تقريرها بين اغسطس/اب 2011 وديسمبر/كانون اول 2012، وان معدي التقرير اجروا مقابلات مع 100 شخص من ديانات مختلفه. وتضمن التقرير حالات هجوم علي اقليات، بينها هجوم لمسلحين اسلاميين علي اتباع الاقليه الاحمديه عام 2011 خلف ثلاثه قتلي. وورد في التقرير ان مسؤولين حكوميين كانوا ضالعين في بعض الهجمات اما بشكل مباشر او غير مباشر، وان المسؤولين عن الهجمات اما لم يتعرضوا لاي عقوبات او كانت عقوباتهم خفيفه. مواضيع قد تهمك نهايه وحث التقرير الرئيس سوسيلو بامبانغ يودويونو علي حمايه الاقليات، كما حث علي انشاء "قوات تدخل" وطنيه مستقله لديها صلاحيات تمكنها من الحفاظ علي التسامح الديني، والغاء القوانين المتحيزه مثل "قانون التجديف". كذلك دعا التقرير الي عدم التسامح اطلاقا مع الهجمات التي تستهدف الاقليات الدينيه. وفي رده علي التقرير قال باهرول هايات الامين العام لوزاره الشؤون الدينيه الاندونيسيه لوكاله انباء اسوشييتد برس ان استطلاعا اجرته الحكومه العام الماضي اظهر ان هناك انسجاما دينيا قويا في البلاد.
حثت منظمه هيومان رايتس ووتش اندونيسيا علي معالجه غياب التسامح الديني المتصاعد في البلاد.