شغل خنفر المنصب منذ عام 2003 وقال خنفر في مذكره استقاله ارسلها بالبريد الالكتروني الي العاملين بقناه الجزيره ونشرت ايضا علي حسابه الشخصي علي موقع تويتر انه قرر الرحيل. لكنه لم يكشف عن اسباب قراره، الا ان تقارير تحدثت عن خلافات بين الموظفين حول تغطيه قناه الجزيره للانتفاضات العربيه. ويتهم بعض المعلقين القناه بالتقليل من شان احتجاجات الشيعه في البحرين لان قطر تؤيد العائله المالكه في البحرين. ويشير اخرون الي ان الاستقاله تاتي علي خلفيه اتهامات لخنفر في تسريبات ويكيليكس بانه كان يغير في الانتاج الاخباري للقناه لارضاء الولايات المتحده. كما نشر ويكيليكس في ديسمبر/كانون الاول 2010 برقيات تتهم قطر بانها تستغل الجزيره كاداه للمساومه في سياستها الخارجيه. وكان خنفر قد عين في عام 2003 مديرا لقناه الجزيره، ثم تمت ترقيته مديرا عاما لشبكه الجزيره الفضائيه. يشار الي ان الشيخ احمد بن جاسم ال ثاني يشعل منصبا قياديا العضو القيادي في شركه قطر للغاز المملوكه للدوله. وكان مدير مكتب الجزيره في بيروت غسان بن جدو قد استقال في ابريل/ نيسان الماضي، وربطت تقارير استقاله بن جدو بخلافات بشان تغطيتها للانتفاضات العربيه التي امتدت الي سوريه واليمن بعد نجاح ثورتي مصر وتونس.
استقال مدير شبكه الجزيره الفضائيه القطريه وضاح خنفر من منصبه، وحل محله احد افراد الاسره القطريه الحاكمه هو الشيخ احمد بن جاسم ال ثاني.