Bitrix ORM: Как реализовать импорт в инфоблок нескольких тысяч элементов?
 Но ведь почему-то разработчики Битрикса решили от него отказаться?
Они не "решили отказаться", они его архитектурно еще не сделали. Элементы инфоблоков это не только запись в таблице это еще и свойства, которые могут хранится в двух вариантах, так что это вовсе не так просто.Выходит нужно использовать старый CIBlockElement::Add() без вариантов?
Если хотите атомарно и без нарушений логики - да.
По факту, если у вас простая запись, т.е. без свойств, то можно подглядеть что он делает и выполнить по аналогии. Будет в целом почти равнозначно для импорта.Есть какой-то аналог Batch Processing от Doctrine?
Аналогов нет, но и операция не такая уж частая. Есть потребность в таких объемах - обычно либо это сторонние каталоги (цены, наличие, свойства и т.п.) и тут без CIblockElement::add не обойтись, либо своя таблица (а там уже что хочешь, хоть sql)
Как обходной путь, Вы можете унаследоваться от ElementTable и переопределить в своем классе метод add, а там уже реализовать собственное добавление