Linux. Backup всего системного HDD раз в сутки. Какие способы?
вариант 1 - "классика" tar-архив раздела с системой.
есть минусы с бекапом открытых на запись файлов (к примеру логи и т.д.)
вариант1а - дифференциальный или дополняющий бекап.  с опцией --listed-incremental особо удобен для системы ибо системные файлы меняются редко.
вариант 1б - архиватор dar - руки не дойдут пробовать. 
вариант 2 - снапшоты файловой системы. поддержка есть на btrfs и zfs. снапшот решает проблемы с открытми на запись файлами, делая мгновенный снимок системы. удобнее, функциональнее.
сам снапшот может использоваться как быстрый "горячий" бекап.
вариант3: оффлайн-копирование всего раздела. перезагружаешь комп - грузишься с сидюка или что подобное, и делаешь копию раздела через dd или другие програмки. минус: требуется временное выведение системы из работы.
разделы или каталоги с базой данных лучше архивить отдельно, ибо файловые архиваторы не умеют правильно бекапить бд, да и рабочиее файлы могут потребовать доп.параметры бекапа. но бекап чтука усложняется.
Зависит от данных.
Их типа (просто документы, которые взял и скопировал, или например база данных + приложение, которое требует установку софта)
Размер данных (стоимость и время на бэкап)
Их важность для компании (то есть какой бюджет).
Решений много. Рейд это не бэкап, но отказоустойчивость. А так - просто rsync директорий или dd всего раздела - вполне даже.