Как можно сделать бонус за вход на сайт?
$query = mysql_query2015 год на дворе,  mysql_query в php7 уже не будет. 
по вопросу - обновляйте последнюю дату входа или положите в куки, чтоб базу данных не мучать. есть в куках вход - даете бонусы и т.д.
А стоит ли делать нечто наколенное?
Если у вас есть интерес, как юзеры ходят на сайт - значит, скорее всего, есть интерес к статистике и аналитике посещений. Прикручивайте ее, а уж по этим данным давать бонусы, когда захочется, или проводить иные акции будет несложно.