Cron: Out of memory, что делать, куда копать?
Сервер работает под своим php.ini, cron запускает php в cli-режиме, в этом режиме используется другой php.ini.
Увеличьте память для скрипта где-то в районе: /etc/php5/cli/php.ini
Добавить памяти или увеличить swap (если есть) или создать.
ubuntulogy.org/docs/fs/3259