Какая настройка в PHP отвечает за регистрозависимость в именах каталогов и файлов?
Это настройка операционной системы и она не меняется.
Вот решили вы, что "Folder" и "folder" суть одна и также папка. А операционной системе как между ними выбирать?
делайте всегда с учетом