Почему GParted не видит разделы диска?
Однажды, после некоторых действий, я повредил таблицу разделов на жёстком диске

можно поинтересоваться каких?
Я бы посоветовал сделать бэкап важных файлов и отформатироваться как нужно, а то немного стремно получается.
Попробуйте Paragon Hard Disk Manager