Существуют ли инструменты для быстрого прототипирования GUI под Windows?
Axure — www.axure.com
Очень хороший инструмент, есть клиенты для PC и Mac
Axure — почти стандарт. Сетка есть, надо только widget libraries найти подходящий и в бой.

Ранее тут мне посоветовали Justinmind. Стоит денег, но возможностей много. Посмотрите примеры десктоп: www.justinmind.com/prototyper/widgets-desktop