Почему не приходят регистрационные письма зарегистрированных пользователей на почту?
достаточно зайти в mail логи на сервере и посмотреть почему почта не доходит.
Скорее всего, проблема в хосте-отправителе.
Проверяйте, от чьего имени уходит подтверждение и соответствует ли его домен разрешённым для отправки именам хостов (SPF) вашему. Это для начала.