.htaccess и engine.php уровнем выше, как?
Забудьте про .htaccess — проще на nginx переходить будет. В данном случае юзайте index.php
При чём тут .htaccess? Вы запросы на тот файл каким образом отправляете, если домен подключен ниже по дереву? С помощью include?