Как можно отмониторить нагрузку на сервер через php?
Не мучайтесь такими глупостями, поставьте munin monitoring он построит сам вам все графики 
ставиться в одну строку во всех дистрибах
что то вроде 
apt-get install munin munin-node -y
или 
yum install munin munin-node -y
и как можно получить логи когда лежали сервисы и сам сервер?