Как сделать резервную копию большой папки с сохранением владельцев и прав (Windows)?
Из штатного — ROBOCOPY.EXE %SRC% %DST% /COPYALL
Инструкция: Перенос файлового хранилища с сохранением структуры директорий, структурой прав NTFS и системных параметров общего доступа на другой жесткий диск

Файловая система
NTFS
Задача: Перенос файлового хранилища с сохранением структуры директорий, структурой прав NTFS и системных параметров общего доступа на другой жесткий диск
ОС: w2k3
Условия: Файловое хранилище находится на одном системном разделе
Выполните полную резервную копию раздела или диска, который собираетесь переносить.
Вы уже имеете полную резервную копию?
Алгоритм:
0.Устанавливаем Acronis Disc Director (перезагружаемся, если нужно)
1.Блокируем в Брандмауэре Windows порты для общего доступа к файлам и принтерам (мера предосторожности против возможных попыток работы с файлами из сети)
2.Управление дисками\исходный диск\исходный раздел\запомнить букву раздела\удалить букву раздела
3.Управление дисками\целевой диск\удалить все разделы( все не обязательно). Перенос осуществлялся на свободный диск, возможен вариант «подселения» целевого раздела на свободное пространство целевого диска, который уже имеет разделы.
4. Acronis Disc Director\Исходный диск(ориентируемся по номеру диска и по его объему)\контекстное меню(правой кнопкой мыши)\Копировать\выбираем целевой диск или свободное пространство на целевом диске\Применить
5.Назначаем Управление дисками\целевой диск\целевой раздел\букву диска, которую запомнили в п.2 (всё подхватится после назначения буквы, если нет — перезагрузка)

Результат: файловая структура, структура разрешений NTFS, правила общего доступа перенесены на новый диск или в раздел нового диска без изменений
Успешно переносятся хранилища с длиной имен файлов более 260 символов

Моя статейка, она же лежит тут: vk.com/feed#/topic-66609_26017359 Тема смежная, для разового переноса данных подойдёт и описание инструментов есть. Что косается синхронизации, я бы посмотрел в сторону cwrsync, но у меня за 30 мин не получилось сделать так чтобы разрешения переехали, списки пользователей переезжают, а разрешения нет, тестировал при синхронизации локальных папок.