Как запустить windows с ssd?
При установке винды на новый диск желательно временно отключить другие жёсткие диски по той причине, что установщик винды может обнаружить на них старый загрузчик и использовать в качестве загрузчика именно его, вместо создания на новом диске нового загрузчика. В убунте, кстати, та же проблема.
Загрузиться с того же носителя, с которым устанавливали Windows и из командой строки поработать с загрузочными записями.