Возможно ли отменить действие стороннего скрипта при клике?
Если по какой-то причине пересоздать дом будет крайне проблемно (нужны другие эвенты на нём), то на нужный дом добавляешь:
.addEventListener(type, (event) => {
  event.stopPropagation();

  // code
}, true);
Пересоздай элементы DOM, удалив старые, но уже без настроек событий