Почему могут слетать стили с bootstrap меню(nav)?
В хроме нажимайте F12 или Ctrl+Shift+i и перед Вами откроется сказочный мир, в котором всегда "весна"! А весной, как говорится в поговорке, сразу видно "кто где сралъ":)
Проверьте, действительно ли подключаются таблицы стилей (сами файлы). F12 -> Sources -> дерево подключенных файлов Sources