Из-за чего может загореться материнская плата?
и перепутал разъем usb и 1394. 
USB рассчитан на 5В, IEEE 1394 - на 12В и распиновка у них ну вот совсем разная. Не наводит ни на какие мысли?
единственное заметил, что не подключил питание от БП 8 пин для видеокартыНу не совсем - она бы попыталась запуститься используя дорожки питания на плате, и возможно даже спалила бы их.
Но это не ваш случай - нужна нагрузка на видеокарту.и перепутал разъем usb и 1394Питание на сигнальные линии пустили и все дела. Они и сгорели. 
Не надо ничего путать, и включать нужно все что положено.