Можно ли запустить в виртуалке систему с другого винчестера?
Можно.
https://mnorin.com/ispol-zovanie-fizicheskogo-disk...
я это делал пробросом всего винта с вендой в libvirt'e  в vm
работало с глюками и тормозами (года 3-4 назад)