Как поднять windows, если единственное что у меня есть это бекап системного раздела?
Я бы не стал привлекать сюда виртуал, попробовал бы обойтись и реалом. 
1. Создать раздел подходящего размера на любом из подключённых дисков, имеющих разметку в MBR, и сделать его активным (загрузочным). MBR потому, что эта разметка проще, понятнее и привычнее GPT, она не требует каких-то дополнительных скрытых UEFI-разделов, бэкапа которых у вас нет.
2. На него выгрузить содержимое вашего бэкапа.
3. Если этого оказалось недостаточно для запуска ОС, восстановить на этом разделе правильный загрузчик, с помощью утилиты BootICE или чего-то подобного. Их, восстановителей загрузки, много разных - не прошло с одним, пробуем другой. Обычно они кучкуются на популярных ремонтно-восстановительных сборках LiveDVD/LiveUSB.
Я использую этот способ для того, чтобы заставить Win10  работать на MBR (штатно она его не любит и требует GPT).
Восстановить не удалось - установил винду и заново поднимали программы.