Как правильно установить Let's enycript на NGINX?
Правильно будет поставить certbot котырый настроит nginx или apache для нужных доменов и будет сам продлевать сертификат.
а 80 порт открыт на сервере?, плюс в Явебмастере, насколько я помню, нужно явно указать https://.
А ругаться он может потому что в кеше сайт без серта. попробуйте открыть в режиме инкогнито