Какое приложение сделать?
Могу Вам подкинуть конкретные задания для джуна IO, Collections.ссылка так же для джунов очень рекомендую курсы епам в Рязани, как раз сейчас набор, если хотите чему то научиться то довольно не плохой вариант(это не реклама, просто в свое время мне они очень помогли)
Можно попробовать сделать распределенную систему мониторинга. Идея следующая, есть несколько машин, с которых нужно собирать данные (например количество сообщений в лог файлах) в заданный промежуток времени и отправлять по сети на центральный сервер. Чтобы было интересней, добавьте требование работы в условиях нестабильной связи. В итоге клиентская часть должна уметь сохранять данные локально и отправлять всю историю, когда центральный сервер становится доступен. 
- ввод/вывод - работа с локальными файлами и передачей данных по сети
- JSON, XML - это ваш формат передачи данных
- сериализация - это может быть локальный кэш
- ну и без коллекций здесь не обойтись