Как в безопасном режиме Windows с поддержкой командной строки провернуть экран?
Безопасный режим на то и безопасный, что в нём загружается минимально возможный набор только стандартных драйверов обеспечивающих работу ОС с целью восстановления.  Драйвер видеокарты загружается только базовый, без всяких свистоперделок, он не умеет поворачивать экран. Так что никак.
Попробуйте запустить desk.cpl

Или можно скачать Display
и тогда display /rotate:90

Также в некоторых драйверах видеокарты можно настроить такие хоткеи.