Как переехать со старого сайта на новый?
Разворачиваете на поддомене (или в папке) новый сайт, закрываете его в роботсе, доводите до ума, допиливаете что нужно.
По окончанию работ открываете роботс, направляете апач на новую версию как основную (если хостинг, то у них часто тоже есть простые средства для перенаправления).
То, что вы называете "сео детали" - это все текущие (на старом сайте) урлы, которые есть в индексе ПС. Если вы измените урл - это будет новая страница, не имеющая того "веса", а "всё что нажито..." будет отдавать 404.
Поэтому, если нет возможности использовать старые урлы (до символа!), придется сделать для каждого урла 301 редирект на новый урл. Это для разрабов не сильно сложно должно быть (чаще всего).
В любом случае, новый сайт как-то, да повлияет на позицию в выдаче не обязательно вверх, но очень хочется надеяться)) Т.к. хоть вы и сохраните все и всех, структура дерева, положение контента и его элементов изменится... Что-то уберется/добавится, повлияв на плотность вхождения ключей относительно всей страницы и т.д. Короче много чего учесть нужно, чтобы переезд был максимально комфортным.
А вы говорите "папочку я тут создам отдельную"...