Как сравнить таблицы?
как выяснилось многие вещи по 1с сложно найти в открытом доступе.Не совсем так. Материалов по 1С в открытом доступе просто море. Нет готовых решений конкретно твоих задач, которые больше никому не нужны.

Подскажи код, для загрузки 2 таблиц из xlsx для сравнения их по столбцу Договор, допустим и вывода таблицы с результатом разницы по тем полям, что есть в таблице и тем, которых вообще нету.Для загрузки таблиц из Excel в 1С предназначен объект ТабличныйДокумент. Если твои таблицы в нескольких файлах, то будет несколько ТабличныхДокументов. Если таблицы на разных листах одной книги, то это все загружается в единый ТабличныйДокумент, где каждая страница загружается в одноименную именованную область. Далее уже можно крутить циклы и получать данные из соответствующих ячеек.
В 8.3 это в менюшке есть. Ну или написать прочитать() и далее построчный поиск