Архитектура базы данных для комментариев
Однозначно одна таблица.
А вы не смущайтесь и попробуйте. 
Одна таблица вполне нормальный вариант. Миллионы записей не представляют проблемы для простой выборки. Главное не убить дурацкими запросами, поскольку комментарий будет скорее всего text, а они при выборке в MEMORY не создаются. Посему нельзя что бы в запросе temporary на таблицу с ними создавалось.