Может ли хозяин Wi-Fi точки видеть приложения, которые я использую?
Только если их можно как-то идентифицировать по портам или адресам к которым они обращаются. Иначе - никак.
MITM это типичное описание вашего сценария.
Например хозяин точки устанавливает свой dns и вводя mail.ya.ru 
вы попадаете на сайт evil.mail.ru
возможны и более интересные варианты.
Как защитится: 
в настройках соединения указывать свой dns
сразу после соединения устанавливать vpn и уже через него все делать