Как расшифровать нагрузку на процессор на сервере (скриншот прилагаю)?
ништяк, браток
100% * число ядер 
правильно шаришь
все верно, 100% - одно ядро занято на 100%
Не каждое приложение умеет работать в несколько потоков, поэтому есть такие, которые занимают только одно ядро%Cpu(s): 11.2 us,  1.9 sy,  0.0 ni, 86.6 id,  0.2 wa,  0.0 hi,  0.1 si,  0.1 st
Из этого самое главное -
us - то, что занято пользовательскими приложениями
sy - то, что занято системой (ядро, драйвера)
id - (idle) - простой системы, не занято
Тут можно понять, сколько процентов свободно, и чем занято - драйвера тупят или пользовательские приложения нагрузили.
htop - такое же приложение как top, но более эргономичное. В изначальную поставку не входит, нужно отдельно установить (от рута выполнить yum install htop или apt-get install htop, в зависимости от дистрибутива Линукса).