JavaScript library в J2EE
Возможно, вам необходим Rhino?
Rhino is an open-source implementation of JavaScript written entirely in Java. It is typically embedded into Java applications to provide scripting to end users.
Вряд ли. В случае с веб-приложениями Java используется на стороне сервера, а Javascript — на стороне клиента. Однако вы можете написать биндинги к Javascript-движкам (типа Google V8), либо использовать тот же Node.JS (через файлы или пайпы).