Разметка диска. Как правильно?
не занимайтесь ерундой, доверьтесь установщику. В 99% случаев конфигурации /boot + lvm root + swap более чем достаточно
Лучше всего использовать lvm.
/boot - ext3 вне lvm, просто раздел
а корень, swap и /var на LVM.
Есть есть PHP сессии в /tmp - сделайте его tmpfs-ом