Что нужно сделать, чтобы после обновлений в битриксе не слетал шаблон?
Научиться пользоваться битриксом на дилетантском уровне
Для каждого компонента, в его настройках, указать шаблон из local/templates/
Можно в "режиме правки" скопировать шаблон компонентов в local/templates/ (стрелочка вниз, рядом с шестеренкой, выбираете компонент и копировать шаблон компонента)