Куда девать неиспользуемые пины Ардуино?
Перемычками.
А так, вообще, не особо то и будут ловиться помехи если тот же serial или еще что будет видеть в воздухе или будет заглушено на встроенные подтяжки. Ну если это не контроллер микроволновки
Пины микроконтроллера Arduino не ловят помехи, потому по умолчанию пребывают в состоянии Hi-Z. А сопротивление входа примерно 1 МОм. Такой помехой может стать прямое попадание молнии, например.