Как решить вопрос с нумерацией без позиционирования?
.work__number вообще лишний
https://jsfiddle.net/0Lxewqj1/
Почему без позиционирования?
С позиционированием можно и от work__subtitle избавиться.
Внести такие правки:.work__item
{
width: calc(100% / 4 - 100px);
margin-right: 100px;
padding-bottom: 125px;
}

.work__number{
position: relative;
margin-top: -25px;
}