Производительность С++ и С#?
Ну т.е. то, что юнити в итоге транслирует c# в c++ вас не смущает? ;-)
По факту. При использовании движка важность языка в контексте перфоманса уже отошла с первого плана. Смотрите на поддерживаемые платформы, на рендер-пайплайн, на внутренние оптимизации.
На С++ должно работать в среднем быстрее, но стоит ли оно того, если будет выдавать на 5-10% кадров больше, а на разработку потратить в полтора раза больше усилий? 
Лучше сначала делать понятную архитектуру и писать легкий в модификации код, а уже потом при необходимости делать оптимизации (и то, скорее они будут нужны в плане структуры данных и алгоритмов).