Попросили паспорт фото и идентификационный код для договора и NDA, стоит ли подписывать?
Нет ли в денном договоре ничего такого, противозаконного обычно?Обычно - нет. Нет ли в вашем конкретном - кто знает.

идентификационный кодЧто за код?

стоит ли подписыватьКонечно. В случае проблем, в суде скажете, что в интернете совета спрашивали (не показывая текст договора) и там разрешили.
На скан наложите ватермарк кому отправляете. Этого будет достаточно. В общем случае вы при трудоустройстве отправляете весь пакет ваших документов. Так что в общем то это нормально.