Что можно реализовать с использованием криптографии?
Думаю, вас все работники поблагодарят, если вы настроите на их компьютерах и в сети жёсткие правила фильтрации входящего/выходящего трафика. Также не забудьте настроить ежедневную генерацию случайных паролей на всё, куда можно поставить пароль (включая сам доступ к сети). А ещё установите на вход сканер отпечатков пальцев, чтобы он при входе выдавал новые пароли + автоматически учитывал время опоздания/прогулы/преждевременный уход. Ещё можно эдакую нейронную сеть прикрутить, которая будет следить за работниками и строить им социальный рейтинг. А также обязательно настройте автоматическую блокировку социальных сетей, почты и мессенджеров. И всё это автоматизируйте на каком-нибудь общепринятом языке, например COBOL.
p.s.
Особенно важно потом в отчёте упомянуть о повышении эффективности работников и оптимизации расходов.
Что-то не могу понять.  Если тема звучит как ""Криптoгpaфичecкиe мepы oбecпeчeния инфopмaциoннoй бeзoпacнocти...", так вы должны не "реализацией ИС для решения какой либо проблемы в процессах предприятия" заниматься, а думать над тем, КАК обеспечить криптографическую защиту  передаваемой или хранимой информации.  От криптования файлов до криптования сетевого  трафика.  
Кстати, в что такое "ВКР" ? Хоть бы сказали по какой специальности вы обучаетесь? На каком курсе.