Как из загрузочной флешки сделать снова обычную?
Как сделать это правильно?Да как угодно. Можете отформатировать, можете снести раздел, можете просто сделать его неактивным. Можно ли отформатировать ее средствами самой Windows?Какими средствами вы будете форматировать не так важно.Будут ли при этом какие либо проблемы?Тут уж к астрологам лучше обратиться, они проблемы точнее предсказывают.
Зайдите в управление дисками и удалите все разделы с флэшки, потом создайте новый раздел и отформатируйте его. Никаких проблем с работой не будет, только данные с флэшки, естественно, потеряются.