Почему неверный пароль root пользователя после установки пароля?
Вы предупреждение читали? Особое внимание обратите на последнее предложение.
При этом, если сперва авторизоваться под пользователем отличающимся от root, но с правами root, и выполнить su - root и ввести пароль, то я буду под пользователем root
Вот этим и пользуйся, зачем напрямую root'ом логинится? sudo -i и всё, вот тебе шелл рутовый.