Сканирование директорий и файлов сайта
Конечно, есть. Из того, что можно самому своими руками запустить: dirb, DirBuster, Sublist3r, dirsearch. Разницы между ними не так много, главное какой словарь для перебора использовать. 
Из онлайн вариантов могу посоветовать URL Fuzzer или METASCAN, у них словари уже встроенные.
В пределах ссылок на этом сайте можно получить хорошую копию с помощью программы Телепорт или подобных.