Как запомнить все options, которые выводятся в man pages?
Заучивать бесполезно, да и не нужно. Знать на что способна та или иная команда - да, хорошо, но в реальной жизни используется довольно ограниченное число команд. Так что только практика. 
Заученная информация имеет свойство выветриваться
А зачем? 
Нужное запомнится само при частом использовании. Менее нужное всегда можно посмотреть. Для разработки я постоянно держу на компе tkman - программу на Tk, в которой маны читаю на функции.