Сертифицирован ли CentOS для обработки ПД?
Нет, но вокруг можно построить прекрасную инфраструктура из средств защиты информации =)

Если нужен Линукс, сертифицированный ФСТЭК, может тут найти подходящее?
Нет, центос в раше вообще не сертифицируют, сертифицировались както его русские клоны да и redhat.