Какие есть хорошие книги или гайды по Router OS?
Думаю ничего лучше официального мануала (wiki.mikrotik.com/wiki/Manual:TOC и т.д.) вы не найдете.
сходите на курсы по mikrotik , там понятно и доходчиво всё расскажут. И после них поймете что половина статей в инете бред полный:)