На хостинге вирус-майнер xmrig и gcc грузят CPU на 100%. Как удалить с VDS?
Ну так за что вы их убили,  не посмотрели сначала где они находятся?
Ищите теперь xmrig на сервере и убивайте. Правда раз его залили, то искать дыру надо на сайте каком-нибудь или пароль от сервере менять на нормальный. Просто удаление ничего не даст, ровно так же зальют обратно.И как вообще удалять вирусы на удаленном сервере? Выкачивать себе что ли?
шта?
У товарища одного нашел тоже это. 
добавлю еще, в крон рута добавляется 
@reboot /root/gcc -c /root/config_1.json
соответственно /root/gcc и есть тот майнер. 
других файлов правленных в тот же период нет. вероятно работают готовым софтом который только майнер заливает, и заливает еще на видное место. 
возможно у вас vestacp тоже? летом там дыра какая то была обнаружена.
https://forum.vestacp.com/viewtopic.php?t=17183