Scrapy — я сдаюсь!
Замедлить можно этими настройками

CONCURRENT_REQUESTS — макс число одновременных запросов
CONCURRENT_REQUESTS_PER_DOMAIN — макс число одновременных запросов на домен
DOWNLOAD_DELAY — задержка между запросами
Раньше тут еще был CONCURRENT_SPIDERS — макс число пауков. Видимо, убрали.

По умолчанию scrapy склеивает куки, о чем говорит параметр dont_merge_cookies 

Единственное условие — надо использовать встроенный Request
Немного оффтоп, но какие у вас объёмы запросов на вордстат? может имеет смысл воспользоваться api яндекс.директа — CreateNewWordstatReport? (на 1 акк — 1000 запросов/сутки)