Как безопасно пользоваться приватными ключами id_rsa?
id_rsa отдавать никому не надо, наоборот, его надо хранить в секрете.
Отдавать надо id_rsa.pub
Располагая только id_rsa.pub крайне тяжело получить id_rsa и доступ к вашим ресурсам - это фундаментальное свойство асимметричной криптосистемы.Другое дело, что репозитории никак не шифруются, поэтому владельцы хостинга и взломщики таки смогут почитать исходники.
Нет не сможет, ведь авторизуешься ты приватным ключом