Как можно сделать оплату заказа по его ID в Bitrix?
вывести обработчик оплаты на страницу можно таким образом $orderObj = Sale\Order::load($order['ORDER']['ID']);
												$paymentCollection = $orderObj->getPaymentCollection();
												$payment = $paymentCollection[0];
												$service = Sale\PaySystem\Manager::getObjectById($payment->getPaymentSystemId());
												$context = \Bitrix\Main\Application::getInstance()->getContext();
												$service->initiatePay($payment, $context->getRequest());
Можно вывести компонентом<?$APPLICATION->IncludeComponent(
    "bitrix:sale.order.payment",
    "",
    Array(
    )
);?>
Но судя по коду компонента он выполняет примерно тоже, что код выше
Если хотите вывести с шаблоном сайта, то можно так сделать через буферизацию <?
require($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/modules/main/include/prolog_before.php");
$APPLICATION->SetTitle("Оплата заказа");
ob_start();
?>
<?$APPLICATION->IncludeComponent(
    "bitrix:sale.order.payment",
    "",
    Array(
    )
);?>
<?
$formPay = ob_get_contents();
ob_end_clean();
require($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/modules/main/include/prolog_after.php");
$APPLICATION->SetTitle("Оплата заказа");
?>
<div class="formPayment">
<?
echo $formPay;
?>
</div>
<?require($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"]."/bitrix/footer.php");?>
Сделать можно всё (практически). Вы уже хоть как-то сами пробовали? У нового магазина есть более-менее апи. Со старым всё хуже.