Как подключиться к MySQL из Zabbix?
Похоже, что база то создана, но не заполнена по схеме. Необходимо распаковать и выполнить в mysql скрипты schema.sql, images.sql и data.sql из папки /usr/share/zabbix-server-mysql# cd /usr/share/zabbix-server-mysql/
# gunzip < schema.sql.gz | mysql -uroot -p zabbix
# gunzip < images.sql.gz | mysql -uroot -p zabbix
# gunzip < data.sql.gz | mysql -uroot -p zabbix
читайте доку про установку заббикса
там подробно написано что надо залить в базу
и сделайте отдельного юзера для этой бд а не подключайтесь рутом, за такое надо бить по пальцам.