Как бы сделать систему хранения мелочей?

потрать один раз деньги на такое и потом сотню раз спасибо себе скажешь)
Соглашусь с Сергей 
Лучше взять органайзеров нормальных, особенно если ваши детали это какие-то мелкие smd. Для чего побольше можно в строительных магазинах посмотреть.
А коробки в ведро, ну или если под что-то крупное и не часто используемое. (небольшие движки, энкодеры, большие потенциометры и т.п., ибо в 10х10х10см даже из-за высоты коробки не особо удобно лазить будет, для рассыпухи лучше что-то низкое ИМХО)