Работа по удаленке прикладному программисту C# реально?
Сейчас практически все проекты масштабом от среднего и выше выполняются отдельными командами backend и frontend разработки, так что не вижу проблем, просто ищите вакансии как backend специалист, а не как fullstack.
Работы такого рода огромное количество, просто она уровнем выше лежит, чем индусские объявления вида "I need a copy of website...".
Если у вас проблемы с поиском бекенд работы на фрилансе, что странно, то попробуйте либо устроиться в компанию на удаленке, либо поработать несколько месяцев в офисе, а потом попроситься на удаленку, в нормальных компаниях никогда бекенд специалиста не заставят в css ковыряться.
Если же вы вообще не любите веб, даже с серверной стороны, то все печально, desktop направление на фрилансе практически мертво.
Двое знакомых работают удаленно как раз прикладными и мобильными разработчиками .Net. 
На прошлой неделе получают интересное предложение об удаленной работе BackEnd разработчиком.  
Так что проблем с работой нет. Сходите на несколько конференций, зарегистрируйтесь в LinkedIn и работа сама будет искать вас.