Почему такая разница между Nginx и Apache в метрике «Content Download»?
Скорее всего все зависит от того как приложения отдают http заголовки.

Когда работает через apache, TTFB ждет долго потому что пока приложение не отработает до конца, даже заголовки не будут отправлены, т.е. время, которое занимает работа приложения это TTFB+content download

Когда же работает через php fpm, за заголовки отправляются тут же, nginx не ждет когда закончится работа приложения для этого, а значит TTFB маленький (кстати 122мс это ДОЛГО что там происходит?) а уже генерация контента происходит пока идет content download
Я бы не назвал условия "равнозначными".

Просто установить вместо апача нгинкс и php-fpm недостаточно, чтобы гарантированно получить прирост производительности. Нужно смотреть, как было настроено, как настроено сейчас, крутить крыжики, профилировать...