Как измерить ток кулера?
А почему RC подобрать не получается? В чем проблема?
Можно вообще емкостей понавешать у кулера (электролиты+керамика/танталы/пленка) и производить измерения между источником и кулером с емкостями - это сгладит пульсации тока на участке источник - нагрузка.
Ну и для работы с сигналом было бы неплохо его видеть. Вот примеры осциллограмм с питания у кулера (от 5В без доп. емкостей) и осциллограмм с шунта 0,33 Ом.
Если не нравится усреднение конденсатором: можно взять аналоговый INA138( например), далее на АЦП с частотой дискретизации от 10кГц и программное усреднение( "стробируя" сигналом с таходатчика).
P.S. Судя по документации 219ю можно разогнать до нужной скорости, если снизить разрядность преобразования