Как сделать сервер на Линукс для телеграм бота?
Телеграмм-бот не что иное как некие скрипты, обрабатывающие определенные запросы.
Если написано на Python, то разбирайтесь со скриптом. если на другом языке, разбирайтесь с другим языком. 
Если вы ставите какое-то готовое решение, то что именно не работает?
Вообще вопрос возникает у каждого читающего: А что не работает?
Создайте под каждого отдельный конфиг
Запустите скрипт с указанием нужного конфига