Как намотать данный трансформатор и определить его выводы?
Один любой провод это отдельная обмотка (1 и 2).
Два других соединяются начало с концом. Соединение будет средней точкой обмотки (4 и 5).  Оставшиеся (3 и 6) два вывода  идут  на чип.
3 и 1 вывод с одной стороны, 2 и 6 со второй. Если правильно понял схему.
точка это начало обмотки. 3 провода вместе - зачищаете с все хвосты - один конец обмотки соединяете с началом другой - получается вторичная обмотка - ее на чип. Остается еще обмотка не соединенная с ней - первичная - ее на вход.