С чего начать поиск причины, когда не понятно откуда взялись тысячи ссылок на него?
Смотрите что за ссылки через ahrefs или linkpad. Они с разных доменов или с одного? На мой сайт пару месяцев назад тоже повились десятки тысяч ссылок, оказалось один из сайтов просто поставил сквозную ссылку.
Просмотрите внимательно обратные ссылки. Для этого можете воспользоваться любым удобным для вас сервисом. Хоть тем же ahrefs. А вот для проверки длительности заходов и прочего установите или яндекс метрику или гугл аналитикс