Как настроить маршрут на яндекс карте?
При нажатии на pin?
Тогда там всё тоже самое, что и с обычным Placemark. песочница
Внутри конструкции .then(function (route) { ... })
получим нужную точку (например вторую) и отредактируем Placemark:route.getWayPoints().get(1).properties.set({
                'balloonContent':'Кастомный текст',
                 //а здесь в футере оставим информацию о маршруте, например
                'balloonContentFooter':route.getHumanLength()+' за '+route.getHumanTime()

});