Как подключить приложение к БД в контейнере?
self.app_db_connect = 'mysql://myuser:password@127.0.0.1:3306/mydb'
Что ж никто доки-то не читает? Уже который вопрос с одной и той же проблемой.
Раз все в докере, то и подключаться надо через него же.
self.app_db_connect = 'mysql://myuser:password@mysql_db:3306/mydb'
Ознакомься с рабочим примером

DOCKER LAMP