В чем проблема высокой загрузки процессора при включении ssl?
Без использования кипалайва каждый коннект проходит все стадии SSL-хэндшейка - скорее всего нагрузка именно из-за этого. Попробуйте включить кипалайв и сравнить результаты.
Для начала:
1. Включить кэш сессий https://nginx.org/ru/docs/http/ngx_http_ssl_module...
2. Включить http2 https://nginx.org/ru/docs/http/ngx_http_v2_module.html

А нагружает процессор что: nginx или uwsgi? SSL на стороне uwsgi включён (бывает и такое :)?