Какую систему упр-я проектами для небольшой ИТ компании выбрать — bitrix24.ru или megaplan.ru?
Тоже долго выбирал и в итоге пришел к redmine, там есть все что вы описали по моему.
Есть облачный редмайн, где можно его дешего арендовать.
Сложно посоветовать точно, у каждого свои плюсы и минусы. 
Первое- сравнивайте интерфейс.
Второе- битрикс24 недавно запущен и куча мелких недочетов было, вроде уже исправили.
После маркетинговых «финтов ушами» мегаплана (повышение цен несколько раз) я мигрировал на битрикс24.