Из-за чего микротик иногда уходит в режим моста?
У вас какой то неправильный микротик. Может его кто нить перестраивает? ;)
Поменять пароли, перекрыть доступ извне, отключить mac telnet server c wan интерфейсов.
Убедиться в нормальном питании. 
Не поможет - попробуйте поменять железку.
Ну да, обновиться до последней стабильной прошивки...
Вообщем стандартные действия, господа.
Попробуйте разобрать bridge и использовать аппаратную коммутацию, для этого для портов eth3-eth5 выбрать master port eth2.