Как настроить yii2 на хостинге(новичок)?
Как я понимаю ты выбрал виртуальный хостинг на beget.ru. Лучше спроси у техподдержки своего хостера.
Например, в jino.ru для каждого домена можно указать домашний каталог в разделе Домены.
Мне кажется у каждого хостера настраивается по своему.
положите все папки выше public_html 
а содержимое папки web  переместите в  public_html