Какой дистрибутив linux лучше всего подходит для production rails приложения?
Debian lenny, полет отличный. А что за проблемы-то возникли?
У меня тоже apache+passenger+rails3. Ставил вроде по этому мануалу:
alexwinner.blogspot.com/2010/06/ror-ruby-on-rails-apache2.html

Рельсы ставил как гем, проблем вообще не возникло.