Можно ли хранить HDD вплотную друг к другу?
Можно вполне. Укладывайте только диски аккуратно, чтобы не повредить платы электроники. 
Также у 2.5" дисков крышки могут быть весьма тонкими, с такими дисками надо обращаться аккуратно, избегая давления на крышку.
Если под рукой есть контейнеры, наподобие SeaShell (прозрачные "ракушки"), то их использование будет нелишним.
можно
как в магазине