Требует ли Сколково листинг кода проекта?
А Вы сами то кто? если рядовой сотрудник  - думать не ваше, думает начальник.

Если начальник - го к юристом с этим вопросом

а че там может требовать сколково и зачем знает только сама шарашкина контора)
На сколько знаю - нет. По крайней мере не весь код и не для всех компаний.
Но патент может быть не на сам код, а на какую-то методику, которая в коде реализована.