Ssh ключи и пароли. Где хранить?
Отставить авторизацию по паролям - настроить обязательно по ключам.
Для хранения ключей использовать Keepass, его файлы базы данных хранить в зашифрованом виде в облаке, к которому есть доступ со всех устройств, я использую Dropbox. Локальные клиенты для Keepass есть под все основные платформы, в том числе и мобильные, с них же можно и настроить доступ к локальным базам данных.
для хранения паролей KeePass вполне устраивает