Почему нельзя редактировать htaccess через админку битрикс?
Мне кажется если внесете неправильную правку, вы не получите доступа к админке, так что лучше править в консоли проверяя результаты
Это, как работать удаленно с настройками сети. Можете потерять доступ. 
Работать можно, но должен быть внешний доступ на случай ахтунга.