Как в Angular уйти от включения JS-файлов в index.html?
На нормальном проекте должна быть инфраструктура с галпом/вебпаком. Если вам самим лень в таком копаться, погуглите готовые генераторы yeoman с angular+webpack/gulp. Жизнь сразу станет проще и веселее.
<!-- app scripts -->
<script src="app/app.js"></script>

<!-- services -->
<script src="app/components/auth/AuthService.js"></script>

<!-- controllers -->
<script src="app/components/home/HomeController.js"></script>
<script src="app/components/auth/LoginController.js"></script>
<script src="app/components/navigation/NavigationController.js"></script>
Вот это все в один файл конкатенируется и будет счастье