Как правильно узнать id полученной записи?
Выполнить fetch и посмотреть в полученных данных.
Выполнить код:
$result = mysqli_query($conn, "SELECT * FROM `country`  WHERE `city`='Москва'");

$row = mysqli_fetch_assoc($result);

printf('Country ID is: %s', $row['id']);

Здесь share PHP code