Как лучше организовать базу и обновление данных товаров MySQL?
загружаем во временную(-ые) таблицу(-ы), затем лочим базу, удаляем существующую(-ие) таблицу(-ы) и переименовываем временные
Нужно больше информации, как организовано удаление и создание новых записей?
Может вы в цикле по одной записи удаляете и также добавляете)))
Думаю, такие операции не должны сильно перегружать сервер, если использовать множественный insert