Как применить изменения к НЕ последнему коммиту?
Есть ветка и три коммита в ней AAA-BBB-CCC...
Далее были сделаны правки, но их надо применить к коммиту BBBgit commit -a -m fixes
git rebase -i AAA
перенести fixes после BBB, заменить pick перед fixes на fix.
Всё то же самое, но автоматически:git commit -a --fixup BBB
git rebase --autosquash AAA
Сначала спрячем незакоммиченные правки. Нам нужен чистый рабочий каталог.
git stash
Запустим процесс переписывания истории
git rebase -i AAA
В текстовом редакторе заменяем перед коммитом BBB слово pick на edit
Сохраняем, выходим
Git начнёт процесс переборки ветки и остановится на коммите BBB
и покажет инструкцию
Stopped at BBB
You can amend the commit now, with

 git commit --amend 

Once you are satisfied with your changes, run

 git rebase --continue
По хорошему, в этом состоянии и надо было изначально начинать редактировать коммит. 
Но мы сейчас вытащим спрятанные правки
git stash pop
# скорее всего вылезут конфликты, которые нужно разрешить и 
git add .
Затем собственно поправить коммит BBB
git commit --amend
Далее по инструкции
git rebase --continue
Если всё хорошо, увидим
Successfully rebased and updated refs/heads/master.