Какой диструбутив линукс будет лучшим выбором для веб- разработчика?
Привет, Бро. 
Чтобы тебе не геморроиться:
node.js ставь только через nvm, далее пакеты через npm
с другими языками старайся поступать так же.
Не стоит привязываться к репозитариям дистрибутивов. Так получилось, что разработчики придумали для себя более удобные репозитории с более актуальными версиями, нежели обеспечивают ментейнеры репозитариев дистров ОС. 
В остальном вообще не имеет значения, какой дистр ты выберешь. У генту сисек больше, но и борода будет пушистее.
Осмелюсь предположить - Ubuntu.
Но ИМХО для web-разработчика больше подходит MAC-OS или Windows.