Как перенести файлы в linux грамотно?
Попробуй их синхронизировать с помощью rsync:
/usr/bin/rsync -Paz - /home/* /media
или только содержимой папок  odin,dva,tri
/usr/bin/rsync -Paz - /home/{odin,dva,tri}/* /media/{odin,dva,tri}
Пустые папки без содержимого не синхронизируются.
Самое простое, если одна файловая система, то сделать mount --bind