Доменная почта Yandex вместо своего почтового сервера?
Я за Яндекс, это будет быстрее в настройке и удобнее для пользователей. Постоянное слежение за почтовыми сервисами на своем сервере, то еще удовольствие.. Давно перевели почту и ДНС на PDD и не жалеем.
P.S. Единственный минус, это во время регистрации ящика надо указывать данные владельца (ФИО и т.д.). Не всегда удобно, когда надо завести какие-либо сервисные ящики.. Но, мы решили это появлением сказочных персонажей, типа Платона Щукина
В pdd.yandex.ru / biz.mail.ru  предназначен для других целей, когда у вас имеются настоящие пользователи почты, которые работают с почтовым ящиком.  Для ваших целей он подойдет разве что на первый порах, т.к. там есть лимиты на отправку писем.
MTA на почтовом сервере вам потребуется в любом случае, даже при отправке через внешний сервис, т.е. pdd/biz могут заменить вам IMAP/Web интерфейсы к почте, но не отправку писем от вашего сервиса.
Лучше отправлять транзакционные письма напрямую с сервера, а получать письма для своего домена на одну из внешних служб для доменов.