Как сделать простой скрипт на js?
Следите за кликом по .item, в клике получаете второй класс кликнутого элемента (например three), производите поиск элемента по селектору .message.three, если нашли, то находите все .message.active и удаляете у них класс active, после чего найденному элементу .message.three добавляете ему в classList класс active.
Не удобно, что именно классами вы помечаете связь item - message. Т.к. могут быть и другие классы, может возникнуть путаница, какой из них считать признаком, а который там просто для оформления. Лучше для этого задействовать data-атрибуты.
В нынешнем варианте надо по клику на .item искать в списке классов другой, не равный "item" – это идентификатор для поиска соотв. message. Про то, чтобы «гасить» другие с классом .active в вопросе нет, поэтому примерно так:snippet