Как получить возможность выбора диска для загрузки ОС при старте машины?
Вам надо правильно настроить загрузчик. Делается из под линукса.
Если у Вас UEFI системы, то efibootmgr в руки. 
Если Bios (GRUB), то средствами grub.
У меня на одном диске Windows 10 (для игор), на другом Linux Mint (для кодинга). По умолчанию выбран диск с Линуксом, если надо попасть в Windows - после включения жмякаю F8 и выбираю нужный диск. Просто, удобно. Операционки изолированы друг от друга, поломка загрузки одной из них не повлияет на другую.