Nginx + php-fpm ест слишком много памяти?
А для чего Вам свободная память? Жалко что ли? Поделится если что, не волнуйтесь. У меня на 190 метрах памяти все забил, и ниче, и с мускулом делится и остальные не страдают. Волноваться стоит не когда память забита и все работает, а когда что-то не работает _потому что_ память забита.
Разобрался, в чем было дело: слишком сильно был раздут кэш при малом количестве рабочих процессов nginx и php-fpm, плюс была включена функция масштабирования нагрузки в свойствах сервера. Масштабирование отключил, количество рабочих процессов nginx и php-fpm значительно увеличил, кэш незначительно уменьшил — память освободилась до 150-200 мегабайт в зависимости от нагрузки, из них около 100 мегабайт кэша. 

Меньше — не значит лучше, %юзернейм%.