Как правильно организовать независимые куски приложения в GIT?
Кроме отдельных веток, возможно вам подойдут submodules.
Если Вы не можете создать репозиторий, тогда какой ещё выход, кроме ветки, у Вас остаётся? Когда будет возможность создайте себе репозиторий для демонов и всяческих утилит, которые не зависемы на одном проекте, тоесть можно использовать на разных проектах.