Ubuntu snap и раздвоение docker – где мои контейнеры?
Поздравляю, теперь в системе два докера, которые претендуют на /run/docker.sock. Можно посмотреть, что вернёт docker info, там будет /var/snap/docker/common/var-lib-docker вместо /var/lib/docker

Сомневаюсь что дело в livepatch, у меня поставился без docker. Так что советую удалить snap docker и рестартнуть обычный docker.
При самовольной (?) установке snap-docker, в него автомагически переехали и все контейнеры и тома. 
При удалении они вернутся в свои исходные папки или уничтожатся или останутся, где сейчас?  Прост это продакшн серв, проект уже лайв.