Какими средствами сделать веб-интерфейс работы с БД?
Как мне кажется вы не правильно ставите задачу. По сути менеджеры и разработчики решают разные задачи. 
Поэтому для разработчиков phpmyadmin а для менеджеров как вы и сказали самописное приложение с возможность быстрого ввода карточек и несколькими отчетами.
Если подходят платные решения, посмотрите PHPRunner.  Легко и быстро сделает всязи между таблицами, фильтры, валидацию, CRUD итд. 

 А если самому, то серверную часть на питоне или чем-то другом, для фронтенда тоже фреймворков хватает.