Какой тип ЧПУ будет предпочтительнее для русскоязычного сайта?
Если у вас аккуратные англоязычные ЧПУ/транслит - устраивать переход на кириллический вариант не считаю правильным. 
Вообще, если у вас кириллический домен - смысл использования кириллицы в урл есть, а если домен с латинскими символами, то смешивать в URL кириллицу с латиницей я бы не стал. 
Хотите выделение URL в выдаче - лучше сделайте правильный транслит в ЧПУ.
Первый вариант предпочтительнее.
При  прочих равных, у первого варианта больше шансов повлиять на фактор учитывающий вхождения запросов в URL.Я обратил внимание, что сайт у которого в заголовке и ссылке содержатся поисковые запросы отображается выше... Есть смысл переходить на кириллические ЧПУ?
Да, есть смысл :)