Как добавить второй домен на сайт, что бы два домена ссылались на один сайт?

В A-запись второго домена прописывается адрес web-сервера
В конфигурации web-сервера прописывается второй домен
PROFIT

Технически можно сделать множеством способов
1. вы просто через порбел добавляете сервер нейм
2 или через сервер алиас, то же самое в nignx (там директивы по другому называются но так же через пробел)
ну если у вас веб панель то там как правило есть место где можно их вводить, так же через пробел.
<VirtualHost *:82>
               DocumentRoot /var/www/clients/client132/web171/web
                ServerName 3dpaneli.ru site.ru site2.ru 
                ServerAlias www.3dpaneli.ru site5.ru
                ServerAdmin webmaster@3dpaneli.ru
                ErrorLog /var/log/ispconfig/httpd/3dpaneli.ru/error.log
3. Создать 2 отдельных сайта с двумя разными доменами ведущими в 1 папку.
4.  это третий вариант но вместо одной папки  у сайта разные папки, одна из которых является симлинкой   смотри ман по баш ln -s
5. два сайта  у ведомого сайта nginx проксирует на первый через proxy_pass
6. mod_proxy  - аналог 5 для апача.
7.  На сервере всего один сайт и он лежит в папке без явно указанного домена  например  listen 80 default_server; ( такая конфигурация  у чисто установленного апача или nginx)   в таком случае любой домен сославшийся на этот айпи будет открывать один и тот же сайт.
Реально же вам должно хватить первых двух