Разграничение API приложения и тяжелых вычислений?
2 варианта:вычисления вынести на отдельный серверлюбым способом "затормозить" вычисления, чтобы они не мешали остальному. Если это Ваш сервер, то виртуализация поможет
Выигрыш, думаю, в отдельном сервере очевиден
запускайте их на двух разных серверах или впс