Почему на Windows пропадает звук в Bluetooth гарнитуре при включении микрофона?
Думаю дело в профилях, которые поддерживают ваши наушники. 
Чуть более детальнее ниже:

Что такое профиль Bluetooth?
Если между двумя устройствами Bluetooth установлено соединение, они получают данные о протоколах парного устройства. Только устройства, работающие по одинаковым протоколам, могут обмениваться данными, точно также и люди должны владеть одним и тем же языком для полноценного общения.

В то время, как Bluetooth устанавливает беспроводное соединение устройств, профиль Bluetooth определяет команды и функциональные возможности, которыми эти устройства могут обмениваться при помощи технологии Bluetooth.

Профили Bluetooth HSP (Handset Profile) и HFP (Hands free Profile) - это профили, необходимые для обычной работы моногарнитуры Bluetooth, A2DP и AVRCP используются для стереогарнитур.

Какие профили необходимы для гарнитур Bluetooth?
HSP (Handset Profile) – обеспечивает основные функциональные возможности, необходимые для взаимодействия трубки (мобильного телефона) и гарнитуры.

HFP (Hands free Profile) – расширенные по сравнению с HSP функциональные возможности, используется для управления мобильным телефоном со станции в автомобильном блоке hands free.

A2DP (Advanced Audio Distribution Profile) – обеспечивает передачу стерео аудиосигналов. (качество гораздо лучше, чем при кодировке моно, используемой для HSP и HFP).

AVRCP (Audio / Video Remote Control Profile) – используется для передачи команд (например, быстрый переход вперед, пауза, воспроизведение) с блока управления (например, стереогарнитуры) необходимому устройству (например, от ПК к проигрывателю Media).

ПРИМЕЧАНИЕ Профили Bluetooth функционируют только если они поддерживаются устройствами (мобильный телефон/MP3). Подробнее см. в руководстве пользователя устройства.

Источник
Задаюсь точно таким же вопросом...