Ansible + хранение версий бинарников, какие инструменты есть?
Версионирование бинарником удобно делать через: rpmdebdocker
Чем вас собственно ftp не устраивает, или amazon s3 (и подобия)?
А применять для такого, GIT или ещё что-то, ну то такая затея, разве что, вы точно уверены что будите хранить это всё до скончания времён.