Как удалить домен в яндекс.коннект?
https://yandex.ru/support/connect/troubleshooting....
Теперь в нашем сервисе есть возможность самостоятельно удалить домен, даже если он единственный в Вашей организации. 
Если Вы хотите удалить свой домен из Яндекс.Коннект, пожалуйста, сделайте следующее: 
1. Перейдите в раздел Профиль организации
2. Нажмите значок ... (три точки в правом верхнем углу профиля Вашей организации ) 
3. Выберите пункт "Удалить организацию". 
Это получится сделать, если: 
1. Делать это из внешнего аккаунта администратора вида login@yandex.ru 
2. На домене нет ящиков пользователей (общий ящик организации вида all@domain.com удалится автоматически при удалении организации)
3. На домене никогда не были подключены платные сервисы в Яндекс.Коннект (Трекер или Расширенный тариф)
Было такое, тех. поддержка отвяжет домен в этом случае, нужно просто подождать.