Как синхронизироваться с git на на новом компьютере?
Про выбирает тот вариант, который удобен ему и не имеет мозг окружающим.
Интеграция(плагин) с IDE конечно удобнее. 
Но если вы, как я, дома и на работе используете разные ОС и вам нужно кроссплатформенное решение, у которого вы каждый раз не будете искать, где кнопка коммита, то берете Ungit и юзаете его с любой IDE.