Можно ли трактовать замену материнской платы как существенность недостатка?
Нет. Это не будет являться существенным недостатком. Также как это не будет являться заменой устройства. У вас в чем недостаток? Устройство не включается? После ремонта устройство включается? Недостаток устранен. А уж материнская там плата или отцовская — неважно.

Вот то что в ремонт саростоятельно отпрааили, косяк. Хотя не известно, что там ваш родственник подписывал.

Если за 40 дней с ремонтом не справятся, требуйте деньги.
В любом случае технически сложный товар сперва отправляют в сервис центр, вдрпуг вы его сами сломали.