Импорт csv (800 мегабайт) в sqlite?
В Navicat есть отличный Import Wizard. Выбираем там Text File, в field delimiter ставим запятую (для csv) и все. Если потребуется, он даже сам создаст структуру таблицы для импортируемых данных.
P.S. У Навиката есть бесплатная версия, но я не уверен, что там есть этот визард.
Используйте mysqlimport, очень быстро загоняет CSV в MySQL, а оттуда уже в SQLite запросом, думаю, справитесь.