Как верстать древо скиллов как на картинке?
Да не заморачивайтесь вы с этими бутстрапами. Они нужны для сетки, а тут сетка - три колонки.
Верстайте эти вот элементики. С ними фреймворк не поможет
Позиционированием, вот к примеру https://valkyrie-wow.org/armory/tool/talentCalcula...
А что бы адаптивно было используешь @media и от ширины устройства играешься в css