Как объединить два больших react приложения из разных реп?
ну, варианта два: 
- иметь два реакт-приложения на странице, инициализируя их в разных  контейнерах
- приводить к одной архитектуре и структуре для начала. 

второй подразумевает что надо переделать так чтобы сборка была одна на всех и использовались те же версии библиотек, как минимум реакта и всех "глобальных" вещей, типа роутинга, gql если есть и тп. все что имеет глобальный стейт или использует контекст реакта.
подключайте как исходный код - будет проще изменить то что нужно изменить, отдельный модуль вам не нужен

Естественно если вы хотите объединить приложения на уровне исходного кода то с большой вероятностью этот код и сборку придется переделывать либо в первом либо во втором.
moleculer мб? обьеденяет разные приложения. даже если они на разных машинах.