Есть ли способ во Vue неявно расширить какие-то данные вниз по дереву?
Как-то плохо гуглили.
https://ru.vuejs.org/v2/api/#provide-inject
что задача состоит в том, чтоб передать $ref на 2 компонента ниже.

ну так напишите так в нужном компоненте
// на 2 уровня вверх получить ref
this.$parent.$parent.refs.myref