Как сделать alt linux сервером?
Очевидно поставить туда серверную програму. Но на линухе так просто это не сделать (нельзя сказать, что невозможно, но и нельзя сказать, что просто - знаний Вам явно не хватит)
Active directory сервер лучше оставить на windows, если ваша задача не переломать всю инфраструктуру.