Массово редактировать страницы Wordpress (чистка после вируса)?
Сливаешь таблицу, реплейсом удаляешь скрипт, заливаешь обратно replace into
Писать SQL или попробовать 
https://uk.wordpress.org/plugins/better-search-replace/
Предварительно сделав бекап всего хозяйства