Как выполнит одним запросом несколько действий MYSQL?
Вот ты и подрос, наконец, чтобы узнать главное правило программирования:Преждевременная оптимизация - корень всех зол.
Никакой нагрузки тут нет, снижать нечего. Поэтому расслабьтся, забудь эти фантазии и займись чем-нибудь полезным. 
Например, открой для себя подготовленные выражения и не никогда не пихай переменные прямо в запрос. В противном случае будет очень, очень больно когда сайт будет выложен в открытый доступ.
поставить индекс на timer на vk_id
поставить индекс на score на vk_id
больше ничего не трогать
никакой нагрузки тут нет