Если материнская плата сгорела(и пахнет сгоревшим), подлежит ли она гарантийному обслуживанию?
Если вы ее физически не поджигали открытым огнем, тогда подлежит.В гарантии отказывают, повторяют "что-то же ее сожгло".  А на что тогда распространяется гарантия? 
Все что не физическое воздействие должно подпадать под гарантию
Многое зависит от магазина и производителя: нормальные конторы меняют без проблем, всякие недобросовестные "рога и копыта" - будут отпираться и пытаться развести на деньги. Реальный случай: собирал ПК - купил все железки, после установки винды был полный фриз на этапе теста производительности. На следующий день повез обратно и как итог: замена ЦП (скорее всего неисправное одно или более ядер), материнской платы из-за проблем с USB контроллером, видеокарта на стенде приемщика пошла полосками на экране (признак отвала GPU/памяти) - и её тоже заменили (хотя изначально там были проблемы с поддержкой нужного разрешения), а так же пришлось менять еще и корпус. Другой случай - через несколько лет эксплуатации производитель материнской платы выпустил обновление БИОС, которое окирпичивало мать - и это тоже гарантийный случай. Так что лучше покупать в надежных магазинах.