Удалит ли команда rm -rf / содержимое внешних жестких дисков?
Удалит если они примонтированы, т.е. если данные находятся где то по адресу /что-то-там то естественно удалит. 
Если конечно у вас хватит на это прав.
Удалит... Помнится на Радио-Т слушал поучительную историю как один пров таким образом затер данные клиентов вместе с бекапами, поскольку во время выполнения команды тома с бекапами тоже были примонтированы к системе.
Вот кстати эта поучительная история