Как понять, что жесткому диску пора на покой?
Самые критичные параметры на которые следует обратить внимание вот эти:

Raw Read Error Rate — частота ошибок при чтении данных с диска, происхождение которых обусловлено аппаратной частью диска.

Spin Up Time — время раскрутки пакета дисков из состояния покоя до рабочей скорости. При расчете нормализованного значения (Value) практическое время сравнивается с некоторой эталонной величиной, установленной на заводе. Не ухудшающееся не максимальное значение при Spin Up Retry Count Value = max (RAW_VALUE равном 0) не говорит ни о чем плохом. Отличие времени от эталонного может быть вызвано рядом причин, например просадка по вольтажу блока питания.

Spin Up Retry Count — число повторных попыток раскрутки дисков до рабочей скорости, в случае если первая попытка была неудачной. Ненулевое значение RAW_VALUE (соответственно немаксимальное VALUE) свидетельствует о проблемах в механической части накопителя.

Seek Error Rate — частота ошибок при позиционировании блока головок. Высокое значение RAW_VALUE свидетельствует о наличии проблем, которыми могут являться повреждение сервометок, чрезмерное термическое расширение дисков, механические проблемы в блоке позиционирования и др. Постоянное высокое значение VALUE говорит о том, что все хорошо.

Reallocated Sector Count — число операций переназначения секторов. SMART в современных дисках способен произвести анализ сектора на стабильность работы «на лету» и в случае признания его сбойным, произвести его переназначение. 

В Вашем случае, пока что, все даже очень хорошо
Проблема-то может быть не в жестком диске, а в сервере. Перегревается, вирусы, фрагментация файлов?

По-честному «скорость» диска надо тестировать не на операционной системе по ощущениям, а специальной программой. Время доступа тоже, и учесть что время доступа складывается еще и с временем доступа до самого сервера, операционная система что-то там себе думает и т.д. чтобы этот весь ворох причин не влиял на итоговую оценку — их надо исключить.
А при необходимости — исправить.