Как вынуть элемент из flow, так чтобы остальные элементы не сдвинулись?
Если вы всё-таки вынимаете его из потока – другие это не смогут не заметить.
Если же вам только нужно поменять положение элемента – можно воспользоваться position:relative, но тогда расчёт положения будет вестись относительно изначального положения, а не начала координат.
position: fixed|absolute как раз таки и изымает элемент из течения.