Что лучше wordpress или своя CMS?
Исходя из вопроса, предположу, что WP. Т.к. тот кто пишет свою CMS не задает таких вопросов.
Легче и быстрее будет создать свою cms, или же ковыряться в коде вордпресса и подстраивать свою верстку под него?
Легче и быстрее и главное в конечном счёте безопаснее (да, я знаю, что WordPress это "дуршлаг"):  ковыряться в коде вордпресса и подстраивать свою верстку под негоА ещё легче взять чужую вёрстку и готовую и вообще не ковыряться и т.д. :)