Почему python на vs code неправильно создает папку при помощи vs code?
настройки запуска находятся в файле .vscode/launch.json
добавьте туда параметр cwd со значением "${fileDirname}"
Все зависит от того, где именно запускается скрипт. VS просто может запустить скрипт из папки с пользователем, когда PyCharm запускает скрипт непосредственно в папке со скриптом.