Есть ли хорошие книги на русском по программированию Java + IDE NetBeans?
Пожалуй стоит начать с "Философии JAVA". Код от среды не зависит.
Посоветовал бы не останавливаться долго на NetBeans и пристально посмотреть в сторону Eclipse.
Хотя, все сугубо "имхо".