Как при построчном чтении из PHP файла запретить include?
что то ты заливаешь))
 а еще и код из файла, который подключается через include.
При fgets код из читаемого файла не выполняется. include, соответственно, тоже.
Проблема, вероятно, в том, что в include короткий php-тег, а php-обработчик работает только с длинным.