Чему сейчас отдать больший приоритет?
На PHP/mysql - больше работы на данный момент.
На JS - больше перспектив в будущем.
Выбирайте.
Вам то что больше нравится? Данные технологии тесно связаны и понимать как всё работает необходимо в любом случае и  следить нужно за развитием технологий на обоих ветвях. Ну и останавливаться на них тоже не стоит, можно посмотреть на nodeJs, попробовать noSQL базы данных, может даже другой серверный язык ( ruby, java, ...etc). Только попробовав большое число технологий вы сможете понять, что нравится именно вам. Главное - не ориентироваться только на деньги в этом вопросе: если вы будете следить за новыми технологиями и активно знакомиться с ними, а ещё лучше - принимать участие в их разработке в виде контрибьютора/альфа-юзера - проблемы с работой и, как следствие деньгами, у вас не будет.