Как вы работаете с phpstorm?
Ну почему же только в одну, в обе стороны вполне, 
 если файл есть локально, но не появился в phpstorm, то правой кнопкой по папке и выбирайте пункт synchronize 'projectname'
если нету  и все настроено -  то Sync with ---hostname---
Ну почему же только в одну, в обе стороны вполне, 
 если файл есть локально, но не появился в phpstorm, то правой кнопкой по папке и выбирайте пункт synchronize 'projectname'
если нету  и все настроено -  то Sync with ---hostname---