Отдельные CSS стили для каждого браузера
Если вариант с несколькими CSS для Вас будет самым простым - его и делайте. Различия по браузерам можно разрешить на уровне веб-сервера. И nginx, и apache умеют парсить HTTP-заголовки, а значит, смогут определить user-agent, который в них передается, и отдать нужный css-файл. Это практически не повлияет на серверную нагрузку (ничуть не более mod_rewrite) и не повлияет на объем загружаемых пользователем данных, поскольку отдаваться будет всегда только нужный файл.
а ты не пробовал использовать префиксы?@-webkit-keyframes blinkpulse { }
@-moz-keyframes blinkpulse { }
@keyframes blinkpulse { }

-webkit-animation: ... ;
-moz-animation: ... ;
animation: ... ;
тогда вся анимация у тебя будет кроссбраузерная