Компиляция PHP с расширением PCRE?
в php 5 pcre включен в сорцы, php собирается с pcre по умолчанию, никаких отдельных флагов для configure указывать не нужно.
Отвечая на более общий вопрос:
Обычно это /usr или /usr/local, в зависимости от ОС.
Для FreeBSD типичным будет /usr/local, для Debian — /usr
Т.е. это папка, относительно которой можно написать /lib для получения папки с либами, и/или /include для получения папки с хэдерами.