Ubuntu на внешнем жестком диске
Я бы выбрал контроллер + внешний диск, на котором есть и esata и usb. Разница в скорости esata и usb достаточно большая, комфортнее будет конечно же на esata.
Ну исходя хотя бы из того, что ESata встречается намного реже, чем USB — я бы брал USB