Что сделать для ускорения логики реализованной на jQuery?
мистер, вы упороты. любая манипуляция с DOM сравнима с операциями Input\Output , что, как бы намекает, не  переборщи. а 250 зависимостей это как раз тот случай когда переборщил. джквери парсит строку запроса потом просто делает запросы getElementBy.... , тоесть тут не зарыто клада оптимизации. тормозит - убери без чего мож обойтись. не можешь обойтись-смирись.
надо сохранять ссылки на нужные елементы сразу в переменные, а потом ими пользоваться (что бы небыло постоянной переборки DOM)
ссылку дайте на пример