Как узнать кодировку зашифрованного изображения и корректная ли она?
Обычное шестнадцатеричное представление файла. 
Просто байты, написанные текстом.
Вот эти FF D8 FF ... перевести в данные вам надо. (ну или это логер так их печатает, а на самом деле оно и так в нужном виде)
FF D8 это точно начало заголовка JPG.
Данный буфер можно раскодировать следующим образом:new Buffer(metadata.picture[0].data).toString('base64')
Буфер:<Buffer ff d8 ff e1 00 a1 45 78 69 66 00 00 49 00 08 00 00 4a 00 00 00 32 01 02 00 ... >
Для вставки в css:"data:image/" + picture.format + ";base64," + new Buffer(picture.data).toString('base64');
Использовался - npm musicmetadata