Как вылечить Ubuntu 14.04?
- переустановка системы помогает лишь в случае если разбомбить /home раздел в щепки. Если смонтировать старый home в новой системе - результат остается прежним.
Это сразу говорит, что проблема ваша (которую вы сами и создали!) в конфигурационных файлах (каталогах) вида $(HOME)/.* . Спрячьте их куда-то, а потом восстанавливайте по одному.
1. Посмотрите какие настройки делаете. 
2. Можно переместить на время каталоги из $(HOME)/ начинающиеся с точки (скрытые)  и посмотреть результат.
3. Посмотрите - не влияют ли те программы на отображение внешнего вида окна.