Как эффективнее всего выдать 5V с аккумуляторов 18650?
Банки соединить параллельно, чтобы не заморачиваться с балансировкой. Для получения 5 вольт использовать step-up преобразователь, вроде такого: www.dx.com/p/usb-dc-1-5v-to-dc-5v-voltage-step-up-... Можно найти и на 2 А выходного тока, подороже.
Для зарядки тоже есть готовые модули: www.dx.com/p/tp4056-1a-li-ion-battery-charging-mod...
Наличие защиты на аккумуляторе опознается по нашлепке на одном из торцов и металлической ленте вдоль бока банки. Если защиты нет, то она тоже продается отдельно: www.dx.com/p/charge-discharge-protective-circuit-b...
Я бы предложил начать с изучения родной схемы, а когда появится четкое понимание принципов её работы, то и вопросы все отпадут.
Без этого можно будет наколхозить до самоподрыва или пожара.