Веб-морда для batch скриптов?
Есть такая штука — ssh. Это как RDP, только в текстовом режиме. Среди прочих плюшек, эта система позволяет осуществлять удаленный запуск программ. Выглядит это так — ssh root@server_ip c:\bin\script.bat и Вы получите в свою консоль stdout script.bat, которая физически запускается на сервере. Можно настроить все так, чтобы не вводить каждый раз пароли. Одним словом, если Вы занимаетесь администрированием, то ssh ваш первейших друг и товарищ для автоматизации ваших рутинных действий.

Под Винду есть замечательный порт UNIX среды Cygwin при установке укажите sshd и следуйте вот этот краткой инструкции. На клиентах можно обойтись plink из набора PuTTY Но рекомендую поставить тот же Cygwin в качестве консоли, будет удобнее.
Готовых решений не знаю.
Но на том же php сделать страничку, с кнопками и exec'ом запускать скрипты — не сложно.
Конечно, если скрипты работают недолго.