Как большие компании организовывают совместную работу и контроль версий в Unreal Engine?
Git LFS?

Не исходный же код у вас 50 гигов весит, не так ли?
Как вариант, можно поднять (бесплатно без смс) gitlab на собственном сервере/виртуалке, где достаточно дискового пространства под свои объёмы.