Как вы смотрите на замену mysql на mongodb?
Судя по всему вы не до конца понимаете для чего они нужны.
Хотя после опыта с mongodb я тоже не понимаю, для чего она вообще может быть нужна.
если вы не понимаете сути документно-ориентированных баз, то трудности будут т.к. между ними много отличий. И всё зависит от конкретной задачи, если вам надо хранить много неструктурированных и вложенных данных, то лучше mongo. + mongo проще горизонтально масштабировать.