Как разделить маршруты на 2 ISP в Mikrotik?
Маркируй трафик в mangle и отправляй в по нужному маршруту.

Мультиван и маршрутизация на Mikrotik RouterOS
В правилах таблицы файрволла "mangle",  на вкладке "action" есть опция "route". При её использовании трафик по указанным условиям отправится на указанный Вами там маршрутизатор.

p.s. Маркировать трафик при этом, совсем не обязательно!