Какая OS семейства *nix встречается на реальных серверах чаще?
Настраиваются они одинаково. Если вы умеете хорошо делать это на одном дистрибутиве, то без проблем сможете сделать на любом другом.
А на реальных серверах встречаются все популярные поддерживаемые дистрибутивы, какие именно зависит от задач.
Сейчас два основных дистриба в продакшкне это убунту и редхат с его бесплатными клонами в виде того же центоса