Как реассемблировать исполняемый .exe file?
боюсь вас разочаровать, но реассемблирование как таковое для сколь-нибудь крупных бинарников на практике не применяется.  поскольку для этого потребуется дизассемблировать полностью корректно весь файл, что было бы слишком трудоёмко.  
если у вас изменение небольшое, проще будет найти нужное место отладчиком/дизассемблером и запатчить прямо в бинарнике.
боюсь вас разочаровать, но реассемблирование как таковое для сколь-нибудь крупных бинарников на практике не применяется.  поскольку для этого потребуется дизассемблировать полностью корректно весь файл, что было бы слишком трудоёмко.  
если у вас изменение небольшое, проще будет найти нужное место отладчиком/дизассемблером и запатчить прямо в бинарнике.