Выбор системы управления проектами + tracing система?
Судя по описанию нужна система уровня управления жизненным циклом (application lifecycle managnemt), поскольку только в таких есть встроенные возможности трассировки между проектными артефактами, а также учет и планирование ресурсов.
Из доступных российских аналогов могу порекомендовать devprom.ru
работа в jira год, что могу сказать...если на проекте будут менеджеры или другие люди со слабой логикой - беда будет)))если все в теме, то ок...хотя, когда все в теме, то любая система особых вопросов не вызывает)