Как сделать выбор операционки при загрузке?
выставить винт с линукс первым в биос
при подключенyом втором винте,c виндой, обновить grub sudo update-grub
он увидит второй винт и создаст в меню строку для запуска винды
В линуксе по любому уже используется какой-то загрузчик (скорее всего grub), можно его сконфигурировать чтоб он еще и винду грузил.