Как убрать загрузку ЦП на 100% (Системные прерывания ~45%)?
Подключите выделенный ноутбук проводом в локальную сеть и запустите wireshark на нем на сколько-нибудь длительный период. Возможно, в сети есть широковещательный флуд, в wireshark вы его сможете увидеть.
При 50ти внутренних клиентах целесообразно сегментировать сеть, как проводную (по этажам, офисам, отделам, etc), так и wifi (гостевой, для личных устройств, для служебного использования).
Согласен с Gansterito добавлю следующее.
Возможно у МТ особые правила ната\фаирвола и возникает проблема в виде битых пакетов или "излишних" ack.
Если включен upnp то посмотри что там прописывается в моменты тормозов, возможно злостный вася решает покачать фильмов торентиком а торент в свою очередь пробивается по upnp во внешку раздавая трафик.
Как вариант возможно вин10 начинает шарить и раздавать обновления по локалке.