Почему конструктор запросов Yii1 работает быстрее чем на Yii2?
Я чего-то не понял, у вас в ваших же тестах написано что yii2 быстрее ) 
Yii1 (0.97 сек):
Yii2 (0.56 сек):
Ну второй сделал быстрее что вам ещё надо то