Скачать через прокси используя wget?
http_proxy
в конфиге ни на что не намекает?
Это во-первых.
Во-вторых, конфиг для wget можно указать явно через опцию --config. Так что можно выбрать даже два варианта для запуска: или прописать все нужные опции в нужном файле конфига или указать в явном виде в команде запуска.
# Скачать файл через proxy:
http_proxy="http://33.22.44.44:8080" wget http://www.google.com/favicon.ico
  Тоже самое, но для HTTPS
https_proxy="http://33.22.44.44:8080" wget https://www.google.com/favicon.ico
 # Использовать proxy с авторизацией
http_proxy="http://33.22.44.44:8080" wget --proxy-user=user --proxy-password=password http://www.google.com/favicon.ico
Взято  отсюда 