Как организовать разделы диска для Linux?
Дело вкуса.
На домашних машинах делаю так:
/ - под систему (80 gb хватает, как правило, за глаза)
/tmp - 2 gb
/home - максимальное количество пространства
swap - 2-4gb
Ну и попутно.
Если есть два диска, то ничто не мешает указать /home на второй диск, тогда как всё остальное - на первом.
Т.е. если эксперимент не удался и очень хочется переустановить систему (зачем?), то /home останется на втором диске.
А в целом, можно всё и на одном диске.
Форматируем же разделы только те, которые хотим отформатировать.
Зачем форматировать раздел /home?
В данном случае эти разделы ( / ,  /tmp , swap , /home ) и есть такие вот диски c:, d:, e:...
ext4 / ~2G
ext4 /var ~4G
ext4 /var/log ~1G
ext4 /home >=40G
ext4 /usr >=16G
* ext4 /tmp ~2G - если мало оперативы
** tmpfs /tmp - если оператива позволяет
swap ~2xRAM (примерно в 2 раза больше имеющейся памяти).
Остальное место форматим под что хотим и отдельно маунтим (пример):cat /etc/fstab

/dev/disk/by-uuid/2389db43-e74d-431c-a33e-ac57f6faaf49 /mnt/DATA auto nosuid,nodev,nofail,comment="x-gvfs-show,x-gvfs-name=DATA 0 0
Важно: mbr позволяет создать до 4 (включительно) не логических разделов.
Хотя на вкус и цвет все фломастеры разные...