Как правильно пробуждать NAS через Wake-On-LAN по Интернету?
Нет, диски дольше не проживут если будут то останавливаться то раскручиваться. Для дисков идеальный вариант когда их запустили и они постоянно крутятся.
Насчет того что дольше сам NAS проживет - то же такое себе мифологическое)

Пробуждать надо по локалке... иначе любой заход на проброшенный порт разбудит устройство, что логично
Так что как вариант поднять ВПН на микротике и ходить через ВПН. тогда извне порт до NAS закрыт, а при подключении через ВПН будет пробуждаться)
Помнится был специальный сайт wakeonlan.ru.