С чего лучше начать карьеру сетевого инженера?
Если начальство нормальное, стоит обсудить вопрос вашего профессионального развития и с ним тоже, хотя бы на предмет оплаты экзаменов и/или курсов.
По поводу сертификатов - если вам их сдачу оплатят, то сдавайте любые, какие сможете. Если не оплатят, то я бы на вашем месте денег сэкономил.
Учить/читать - книги Дойла ("Routing TCP/IP"  в двух томах), "Interconnections" Перлман (создателя STP, чтоб она была здорова). У Juniper хорошие книги ("Junos enterprise routing/switching") и материалы для подготовки, да и экзамены дешевле, если сдавать надумаете. 
Еще можете изучить имеющуюся документацию рабочей сети (схема, конфигурации), собрать виртуальную лабу (GNS3/IOL), поэкспериментировать, выяснить ключевые моменты работы соответствующих протоколов.
filinio советуют atraining.ru для дистанционного обучения.