Как добавить Apple Push Notifications для сайта на PHP?
У apple отличная документация.
https://developer.apple.com/notifications/safari-p...
и далее по ссылочкам:
как отправлять из backend 
https://developer.apple.com/library/mac/documentat...
как отправлять через js
https://developer.apple.com/library/mac/documentat...
Используйте готовое решение, например:https://onesignal.com/https://jeapie.com/ru/web/