Почему mysql-server на ubuntu занимает больше ОЗУ чем на debian?
Сравните конфиги мускуля с обоих систем, возможно мейнтейнеры убунтовского пакета по умолчанию выделили больше памяти на всякие буферы/кеши/итд. Ну и как правильно заметил Дмитрий в убунте используется mariadb в пакете mysql-server, хотите мускуль - вам сюда https://dev.mysql.com/downloads/repo/apt/ .
Причина в том, что Ubuntu — это уже давно не совсем Debian; имеет собственные репозитории, и список установленных пакетов может сильно отличаться.