Это RAID или нет?
яб так на вскидку сказал бы что его нет...
видно ATA диски 4 шт...  большинство контроллеров не позволяет ESXi видеть именно диски, давая возможность подключить только уже собранный массив.
если так, то одна датастора и должна быть слегка меньше, при равных дисках, так как на нем собственно живут разделы ESXi...  
на самой плате, насколько я вижу, нет чипа "аппаратного" рейда, а с софтовыми ESXi обычно не дружит.

остается только один вопрос, где 4-й диск?
или помер/не подключен 
или не добавили датастору.

попробуйте с последнего, проведите операцию добавления новой датасторы, если диск обнаружится - значит подключен, но забыли добавить.
Пока что видно что у вас 4 диска и 3 раздела.
Может быть два диска объединены в зеркало для одного из разделов, или один из дисков не используется.
Покликайте в сами сторы, например в datastore1 или main и посмотрите на чем они сделаны