Как установить прерывание на Serial?
sites.google.com/site/vanyambauseslinux/arduino/ispolzovanie-preryvanij-arduino

Гляньте тут. Ваше — номер 18 в таблице.
Если нужны прерывания, то нельзя использовать Serial, т.к. в нем обратотчик на прием уже висит. Главное не забыть в начале программы сделать инициализацию порта через регистры.