Нужно ли опасаться за данные на пк при обновлении win xp sp2 до sp3?
Ставьте SP3. Очень странно и неправильно, что Вы до сих пор этого не сделали.
Косяков с потерей данных не будет (у меня ни разу не было), если только диски помрут. От того, что вы там нашаманите в реестре, нужных апдейтов в системе не добавится.