Как скрыть программу из диспетчера задач?
Обычно вредоносное ПО прячут, легальные задачи такими способами не решаются.
Правильно делать политиками безопасности и правами. 
Т.к. задача носит административный характер можно отслеживать наличие программы и воздействовать на особо умного пользователя с правами админа.
Назовите ее conhost.exe и в task manager'е она так и будет видна.