Логирование в разные файлы в Python3?
Добавьте название для логгеров 
log_left = logging.getLogger('left')
log_right = logging.getLogger('right')
Если не передавать название, то будет приходить root - логгер, который один
Для этого необходимо более явно указывать название логгера при получении. Например:
log_left = logging.getLogger("left_logger")
log_right = logging.getLogger("right_logger")