Есть ли порядок жестких дисков в материнской плате?
Разъёмы же пронумерованы, загрузочный жёсткий диск желательно подключать к нулевому, так как по умолчанию приоритет загрузки в том же порядке.
Интересно, от чего же вы собирались чистить процессор?
Слетают настройки биос? этот не нормально!

Причина может быть как от проблем с контроллером диска, к примеру диск разово не обнаруживается и биос сбрасывает порядок на дефолтный, тот что отмечен циферками на материнской плате.

Логично решением может быть вставить ssd в разъем sata помеченный как 1.

p.s. включите загрузку uefi, ее реализуют каждый вендор по своему и вполне возможно станут вообще плевать на порядок дисков, выискивая нужный boot раздел по его метке.