Три монитора под linux (два на pcie x16 + 1 на pcie x1)
Про Linux не в курсе, но в разъём PCIe x1 можно вставить и простую видеокарту, если такая имеется. Нужно пропиливание разъёма (или выскабливание скальпелем, совсем недолго) и, возможно, небольшие поправки для управляющих сигналов — описано в "Ставим вторую видеокарту в разъём PCI-Express x1". («соединён контакт PRSNT #2 на конце разъёма PCIe x16 с таким же сигналом на разъёме PCIe x1») — и всё, любая вторая видеокарта запустится.

(Ну а по Линуксу и 3 мониторам давно и много спрашивали и решали — www.google.com/search?q=linux+2+video+cards+3+monitors&ie=utf-8&oe=utf-8 )
Проблема решена, вот мой конфиг:
10-monitor.confSection «ServerLayout»
 Identifier «Layout0»
 Screen 0 «Screen0»
 Screen 1 «Screen1» RightOf «Screen0»
 Screen 2 «Screen2» LeftOf «Screen0»
# Screen 3 «Screen3» LeftOf «Screen2»
 Option «Clone» «off»
 Option «Xinerama» «On»
EndSection

Section «Monitor»
 Identifier «DVI-1»
 ModelName «Asus First»
 HorizSync 27.0 — 81.0
 VertRefresh 50.0 — 75.0
 Option «Primary» «true»
 Option «DPMS»
 Option «PreferredMode» «1920x1080_60.00»
EndSection

Section «Monitor»
 Identifier «DVI-2»
 ModelName «Asus Second»
 HorizSync 27.0 — 81.0
 VertRefresh 50.0 — 75.0
 Option «DPMS»
 Option «PreferredMode» «1920x1080_60.00»
EndSection

Section «Monitor»
 Identifier «DVI-3»
 ModelName «Philips»
 HorizSync 27.0 — 81.0
 VertRefresh 50.0 — 75.0
 Option «DPMS»
 Option «PreferredMode» «1920x1080_60.00»
EndSection

Section «Device»
 Identifier «FirstCard0»
 BusID «PCI:1:0:0»
 Driver «nouveau»
 Option «Monitor-DVI-I-1» «DVI-1»
 Screen 0
 Option «ZaphodHeads» «DVI-I-1»
EndSection

Section «Device»
 Identifier «FirstCard1»
 BusID «PCI:1:0:0»
 Driver «nouveau»
 Option «Monitor-DVI-I-2» «DVI-2»
 Screen 1
 Option «ZaphodHeads» «DVI-I-2»
EndSection

Section «Device»
 Identifier «SecondCard0»
 Option «Monitor-DVI-I-3» «DVI-3»
 BusID «PCI:4:0:0»
 Driver «nouveau»
 Screen 0
 Option «ZaphodHeads» «DVI-I-3»
EndSection

Section «Device»
 Identifier «SecondCard1»
 Option «Monitor-VGA-1» «VGA-1»
 BusID «PCI:4:0:0»
 Driver «nouveau»
 Screen 1
 Option «ZaphodHeads» «VGA-1»
EndSection

Section «Screen»
 Identifier «Screen0»
 Device «FirstCard0»
 Monitor «DVI-1»
EndSection

Section «Screen»
 Identifier «Screen1»
 Device «FirstCard1»
 Monitor «DVI-2»
EndSection

Section «Screen»
 Identifier «Screen2»
 Device «SecondCard0»
 Monitor «DVI-3»
EndSection

#Section «Screen»
# Identifier «Screen3»
# Device «GorszaKarta1»
# Monitor «VGA-1»
#EndSection


Вот только ЗD ускорение и фулскрин видео работает только на мониторах подключенных к первой карте, на дополнительном мониторе на второй карте пока не удалось это реализовать, хотя в окнах все работает замечательно!