Что нужно указать в настройках что бы код компилировался не в ES5 а в ES6?
Дак babel как раз нужен чтобы компилировать код только в es5, т.е. вы пишете на es6 -> получаете код работающий везде. По поводу если вы хотите видеть код для отладки тогда используйте source-map. В webpack конфиге укажите:devtool: 'source-map',
используйcat *.js