Как производится обновление готовых проектов?
надо будет опять лесть в исходники, править, пересобирать и заливать на сервер?
бинго!
После работ по проекту исходники не удаляют) при необходимости внести изменения, правят исходники и тем же gulp-ом снова компилируют все в минифицированные файлы и заливают из на сервер:)