Как изолировать папку WebDAV для безопасности сервера?
Зараженный файл сам по себе не опасен. 
Опасно запускать зараженный файл, а хранить - сколько угодно.
Если вы на сервере не запускаете файлы из шары - никаких проблем.
пор**шку... порнушку? это типа мат или какая-то нецензурщина? Для чего звездочки тут?

Во первых на критически важные сервисы не нужно ставить невесть что
Во вторых для таких вещей используют зону DMZ
В третьих исполняется файл на конечной станции, а не на сервере. Если это будет какой-то шифровальщик, то он зашифрует только те папки, к которым у пользователя есть доступ. Соответственно если так сильно хочется хард*ора то не стоит в точку монтирования добавлять каталог с базой 1С