Как вы поддерживаете фикстуры актуальными?
Есть дополнение к Gii от Елисеева, 
в частности оно умеет из актуальной базы формировать файл с массивом данных для модели
https://github.com/ElisDN/yii2-gii-fixture-generator
Подробнее -- делаешь фикстуры, потом доработал БД и руками че-то наполнил... и все фикстура выдохлась
тогда еще раз через gii выкатил актуальную инфу в файл и готово :)
структура довольно активно меняется
видимо Вы пропустили этап планирования. Это плохо, когда структура активно меняется. Добавляется - норм, но тогда нет проблем, а вот меняется - это "бедулька".например чтоб привести заказ в определенное состояние - куча кода нужна
www.yiiframework.com/doc-2.0/ext-faker-index.html