Если домашняя папка зашифрована, данные всеравно могут украсть?
 зашифровал домашнюю папку по инструкции 
Зачем? Ну то есть от кого пытаетесь защититься? 
От жены/мужа/соседа - смысла особо не имеет, разве только в общаге живете.
От работодателя при удаленке - ну, может какой-то смысл есть...
От работодателя в офисе, от государства - смысла нет, так как никто Вашу "зашиту" ломать не будет. Ломать будут Вас.

Шифрование файловых систем никак не связано с паролем пользователя. Оно выполняется либо паролем, вводимым с клавиатуры (зачастую не хранимым нигде - если пароль забыли, данным пиз..ц), либо сертификатом, который может где-то храниться - и если знать где и его стырить - можно и расшифровать.
Когда-то Эдик Сноуден поведал всему миру, что даже зашифрованные папки на Гугл.Докс не фига не зашифрованные внутри собст. облака и нарисовал на салфетке какую-то картинку. Суть в том, что Эдик никакого отношения к шифрованию не имел, а шифрование шифрованию рознь. 
В данном случае шифруются не файлы, а сама файловая система, используются пароль и ключ. Так вот, даже если админ зайдёт и сбросит рут, он не "сбросит" кодировку файловой системы - у него просто будет что-то там нечитаемое в папке "Админ_дурак"
А для смеха предлагают шифрануть ещё и swap - это вообще песня! 
PS: ну вот только процессорный бекдор на asm и сможет выручить [sarcasm]