Стоит ли переходить на флексы?
Конечно!
Причем учите сразу с грид, это вообще не сложно, главное понять смысл.
После вникания вы будете удивляться зачем вообще этот bootstrap(на соем примере убедился), я уже молчу о том что вы писали на 3-й версии.
Бегом учить flexbox и grid.
Также почитай про валдиный код, чтоб вы сами поняли почему этот вопрос гулпый.
Вот сайты для изучения на играх - flexboxfroggy.com/#ru
https://cssgridgarden.com/#ru
Флекс уже зрелый, поддерживается нормально. Учитесь верстать без сеток (UPD: не сеток, фреймворков). По мере развития, уже будете понимать, какие инструменты вам нужны.