Где в WP подключается родной jquery?
Читам документацию по функции wp_register_script
Выключаем родной JQuery примерно так wp_dequeue_script( 'jquery' ) или wp_deregister_script( 'jquery' );
Первоисточник - сделайте поиск ключевого слова 'jqeury' по содержимому файлов в папке wp-includes.
Вам поможет wp-kama.ru/function/wp_enqueue_script