Можно ли передавать команды по wi-fi/блютус на arduino?
Можно.
Команды передать несложно, но по опыту, не каждый bluetooth модуль сможет работать в связке Master-Slave. Так что лучше наверное по вайфаю, что значительно удорожит конструкцию, если использовать стандартные шилды.