Счетчик цифр с интервалом в 5 секунд на JQUERY?
setInterval и localStorage вам в помощь.
Сначала проверяете есть ли в storage циферки, если есть, то их увеличиваем (и естественно не забываем сохранять в storage), иначе с 1000 увеличиваем.
используйте localstorage, например.
При запуске скрипта проверяйте наличие вашего элемента в localstorage, на каждом шаге перезаписывайте элемент.