[wget] Как полностью скачать сайт?
Возможно, что никак. Нынешние сайты - это не просто десяток страниц с html и пара файлов CSS :)
Для wget ключи --recursive --level=3 --referer=http//:Your.Target.Index  --save-headers пробовали?
Есть специализированные приблуды кроме wget - гуглить 'web crawler', 'web spider', много их.
Как верно подмечено в комментарии к вопросу, спарсить современный, обфусцированный сайт - целая наука.))