Что съело жесткий диск?
/proc/kcore - всего лишь интерфейс к физической оперативе, размер его обычно 128ТБ. Вообще не надо ничего в /proc искать, т.к. это псевдофайловая система.
Что там в директории chroot видней тому, кто систему ставил.
А сожрать место могли какие-нибудь логи. Еще вариант - какой-то процесс что-то пишет в файл, вы этот файл удалили, но процесс так и продолжил писать. После перезагрузки системы результат должен измениться.
О, а гугл выдает много чего интересного, например вот или вот.