Какое значение переменной будет?
Нет-нет. Это присваивание значения. 
Чтобы присвоить ссылку, нужно писать $y = &$x;
В пхп переменные простого типа передаются по значению, для передачи ссылки на переменную используется префикс &, начиная с пхп5 по ссылке передаются объекты, до этого объекты тоже передавались по значению(клонировались), теперь для клонирования объекта есть отдельная функция clone();