Куда уходит место на жестком диске в Linux Ubuntu?
В Линукс место просто так никуда обычно не уходит.
В твоем случае, я бы первым делом проверил что в /var/log - скорее всего ротейт логов недонастроен, и что-то накапливается.
Ну, разучите вторую команду: 
sudo du -hd 1 /
Вместо последнего подставляете тот путь, по которому предыдущая команда показала максимум.
Если оно внутри /home/{user}, то можно без sudo.