Верстать ли на бутстрапе?
Не в поддержке проблема, а в недостатке гибкости Бутстрапа.
Если UI более-менее сложный, лейаут (да и сами блоки) могут серьезно меняться на разных разрешениях, а не только прыгать между режимами "в ряд" и "стопкой".
Очень показательный пример, который я уже приводил неоднократно:
https://www.smashingmagazine.com/
Обратите внимание на поведение менюшек, шапки, поиска. Попробуйте сверстать это на Бутстрапе. Не, я вполне верю, что при должном упорстве это рано или поздно получится. Но в конце вы неизбежно зададите себе вопрос - а нахрена он был мне тут нужен, какой профит я с него поимел?
Не пойму в чем будет сложность поддержки )Сложность поддержки будет тогда, когда Вы столкнётесь требованием, которое в бутстрапе не предусмотрено. Например, Вам нужно будет не 3.5 разрешения, которые предоставляет бутстрап, а допустим, 8.
Если у Вас изначально такой проект, что изначальное подобные возможности не предусматриваются, то и проблем не будет соотв.
Просто подумайте, что может бутстрап. Потом подумайте, что Вам может понадобиться. Вычтите первое из второго, поймёте, с какими проблемами столкнётесь в будущем.