Какие способы нумерации версий существуют?
Почитайте про семантическое версионирование SemVer как один из подходов.
Также интересно посмотреть как к версиям относятся различные пакетные менеджеры, например RPM: Naming Guidelines
На ум приходит следующее:
версия.билд.дата (как у ms office)
версия.подверсия.билд (как у ms windows)