Распространение торрентов бесплатных и платных программ. Запрещено ли?
Протокол торрент как таковой абсолютно легален, и никак не запрещен законом.
Хотя некоторые провайдеры могут блокировать его чтобы не создавать нагрузки на сеть, это их право.
Поэтому - вы можете свободно пользоваться торрентом для распространения программ.Легальность распространения конкретной программы зависит исключительно от ее лицензионного соглашения - если по лицензионному соглашению вы имеете такое право - можете спокойно и легально ее распространять.
Если не имеете такого права - не можете.
Поэтому смотрите лицензионное соглашение нужных вам программ.От платности или бесплатности программ это не зависит.
К ответу товарища Артема (@Jump:) следует дополнить пару вещей: 
Во-первых, в прогрессивных юрисдикциях никакого такого «права» блокировать те или иные протоколы у провайдеров связи нет — это называется принципом сетевого нейтралитета.  Но бывшие союзные республики к таким юрисдикциям, к сожалению, пока не относятся.
А во-вторых, т. Артем отвечает вам про распространение программ, тогда как вы, строго говоря, спросили про распространение торрентов, а «торрентом» все-таки называется файл с метаданными, а не само распространяемое произведение, и если вы спросили именно и только про них, то ответ будет совсем не такой однозначный, и уж точно никак не будет зависеть от того, на что этот торрент ссылается — на программу ли, или на иное произведение.
Ну и пробегусь по вашим примерам. Linux® — программа по большей части свободная, а свободную программу по определению можно распространять (и не обязательно бесплатно); несвободные ее части (это прошивки многочисленных устройств) также распространять можно, иначе бы их в Линукс не включили.  Skype, PhpStorm, 3DS MAX, Photoshop, Windows — не можете, это прямо запрещено. SourceTree — сходу не нахожу на него какой-либо лицензии вовсе, и хотя скорее всего она где-то таки есть, в целом надо понимать, что отсутствие прямого разрешения на распространение об’екта АП — это, разумеется, запрет.