Выбор БД: MySQL vs MongoDB?
Если MySQL справляется, то зачем что-то менять? Настроенная MySQL будет работать лучше, чем MongoDB с настройками по-умолчанию.
Если не HighLoad, то остановите свой выбор на классическом MySQL. А из плюсов MongoDB отмечу, что она поддерживает горизонтальное масштабирование (шардинг) и балансировку нагрузки на уровне базы.
Переезжать на MondoDB есть смысл, если у Вас уже как минимум отдельный сервер под базу. Она намного прожорливее MySQL.