Что за бредовая ошибка в node js — js-bson: Failed to load c++?
Failed to load c++ bson extension, using pure JS version
Вот так и понимать. Ваш модуль жалуется что у вас не установлен быстрый и удобный модуль для работы с BSON написанный на плюсах и потому оно будет использовать медленную реализацию на JS.
Забыл написать ответ:
npm install node-gyp -g
rm -rf node_modules
npm cache clean
npm install
Данные команды все исправят