Что выбрать сервер или обычный системный блок?
По производительности серверное оборудование (за те же деньги) - существенно хуже, ниже.
Но надежнее.
Хотя для ваших целей хватит и i5, ни на какой i7 денег тратить не нужно.
Скажите, вашу организацию не смущает, что для AD и пр да еще на 100 штук нужно ПОКУПАТЬ лицензии?
На сервер и на рабочие места.
Ставьте NAS4Free - это такой специальный дистрибутив с веб-управлением.
Там и AD через Samba и файловый сервер и много много еще чего. И сервер можно взвести штатно через веб-панель.
Если вам нужны все фенечки - типа дедупликации файлов и т.п., то нужно оперативки хотя бы 4, лучше 8 Г. Но и 2 Г вполне потянет.
Процессор же можно старый древний i3 первых поколений.
Смешивать файрвол и сервер хранения данных - не стоит.
Вместо Kerio (который, кстати, тоже платный) - я бы поставил pfSense - также специализированный дистрибутив с веб-управлением.
Железа достаточно слабого, давшнишнего, на котором даже пользователям работать некомфортно - этому серверу хватит
однозначно ксенон с ядрами насколько хватит. оптимально от супермикро.