Как пользоваться клиентом speedtest.net через Mikrotik?
И что будет? Ну покажет канал клиент-провайдер 100500 гигабит/сек, а у провайдера на мир один 100mb/s канал на всех клиентов

Разве что уличать провайдера в жульничестве прикладывая два спидтеста до него и чуть дальше...

p.s. типа "родное" в микротике - Bandwith test к BTest Server (меню Tools)
Ну тут Вам можно посоветовать только использовать тест скорости самого микрота - в тесте указать IP или домен сервера до которого надо измерить скорость.

Что то не совсем ясно почему пров принимает данные только от СпидТеста... обычного трейсроута, измерений средствами винды, или средствами микротика должно быть достаточно. там черным по белому будет написано если есть проблема... и на каком узле...