Стоит ли избавляться от гетерогенности linux в сети?
Выбор дистрибутива вопрос сильно религиозный, не стоит тут открывать филиал ЛОРа. Но спокойно и планомерно устранять зоопарк - однозначно надо.
Переводить все на один дистрибутив. На Debian, само собой, а не на rpm-ад.