SAN: выбор СХД, switch etc?
(так как на складе у них около 80 шт. новых sata 1-2TB, предпочтительно СХД с поддержкой SATA)
Ни один из вендоров Tier-1 не позволяет использовать пользователям их собственные диски в системе хранения. Это связано с высокими уровнями требований по надежности, требующих протестированности и валидированности дисков, а также предлагаемыми уровнями поддержки.

«Свои» диски в СХД позволяют ставить только Tier-2 вендоры, такие как AXUS, Infortrend, Xyratex, но при этом вы остаетесь без вендорской поддержки и большинства фич Tier-1 систем. Ну и, опять же, совсем не любой пользовательский дис можно поставить, а только из определенного compatibility-листом списка.

На вашем месте я бы забил на собственные винты. Куда проще их продать, пока новые. Решили строить «энтерпрайз» — стройте обеими ногами, не пытайтесь совместить «самосбор» и вендорское решение.
При отсутствии чётких требований к СХД, лучше посмотреть на систему с тирингом и недорогим расширением. Например, младшие модели 3PAR (тем более вы у них уже купили серверы).
NetApp выглядит соблазнительно благодаря дедупликации и тесной интеграции с VMware, но от ценника на полки расширения заказчик может упать в обморок. Впрочем, надо сравнивать конкретные предложения и считать.

По собственному опыту (у нас примерно такие же задачи):
1. Первым кончается место, тут помогла бы дедупликация. Без неё это решается через архивацию старых стендов.
2. Упираемся в производительность, в этом случае добавляем диски и выделяем отдельные массивы для разделения нагрузки.