Конфигурация вебсервера?
Прикрепить можно что угодно.
Подсказка: домены к протоколам не имеют никакого отношения. Домен привязывается к айпи через нейм сервер, Веб-сервер настраивается в конфигурации веб-сервера. SSL настраивается как опция в конфигурации веб-сервера.
Вываливать свои файлы, чтобы их тебе переписал посторонний дядя не надо.
Если проект рабочий, а ты боишься поломать - найми специалиста. Например попросить того, кто "прикреплял" домен с поддержкой SSL.
Не надо думать, что прохожий ламер с интернета, которому твои сервера и проекты вообще до фени, сделает лучше.
Во-первых, нужно отказаться от использования апача, во-вторых, прочитать документацию для начинающих на nginx.org. В-третьих, вернуться сюда, когда будут конкретные вопросы.