Что делать, если SWAP почти заполнился?
Ничего не делать.

Это самое распространенное заблуждение - мол, своп подключается, когда памяти не хватает. На самом деле это совсем не так https://habr.com/ru/post/540104/
Не парьтесь.
Система сама разберётся.
Просто выгрузила в своп лишнее.