DB для node.js
Ну если для самообразования и джаваскрипт, то попробуйте воспользоваться CouchDB. Не то, чтобы очень родная но языковая связь имеется.
В recommended листе у ноды есть github.com/felixge/node-mysql но он, вроде как, не расчитан на высокую нагрузку.
Лучше всего, имхо, подходит MongoDB, драйвер для ноды у них есть (даже парочка).