Прокрутка tbody независимо от thead?
Вариант с JS (проверял в: Chrome 26, IE 10, FF 3.6)
jsfiddle.net/npu9r/
Как можно прокручивать то, что полностью влезает на страницу?!
Обрамите таблицу любым блоком с ограничением по высоте и все заработает: jsfiddle.net/mynBk/