Как удалить разницу между двумя директориями?
Может, rsync поможет?rsync \
  -av \
  --delete \
  --existing \
  dir1 dir2
diff -r dir1/ dir2/  |grep Only | sed -e 's/^.*Only in //' -e 's@: @/@' | xargs rm
Upd: но ответ Сергей Соколов  конечно красивее