Предпочтительные единицы измерения для отступов?
.отступ в пикселях. Но тогда не будет адаптивности.
Откройте для себя чудесный мир media queries. Потом используйте хоть пиксели, хоть emы, хоть милиметры.
Нет единого ответа на этот вопрос, по разному бывает - от ситуации.
Субъективно у меня чаще используются px и em, реже vw/vh, еще реже rem и %.
Но используется всё.