Как натянуть шаблон на непопулярную CMS?
Как тогда быть? 
Берете готовую тему и изучаете ее И ещё,стоит ли учитывать что-то при верстке макета,на какой движок потом буду натягивать? Т.е. верстка одного макета на 2 движка может отличаться ? 
Возможно это и может играть какую-то роль, но думаю это проблемы того, кто будет делать адаптацию для движка, а вам, как верстальщику, главное делать качественную и расширяемую верстку.
Верстайте блоками, модульно тогда без разницы на какую CMS натягивать.