Эмуляция пропусков и других БСК через NFC
1. Далеко не все пропуска работают на 13.56 МГц и подпадают под стандарты NFC. Даже хуже, подавляющее большинство сейчас — низкочастотные (125 килогерц и т.д.). ключевые слова: HID proxcard clamshell.
Да, именно БСК это 13.56 МГц и ISO-14443, но там проприетарная реализация от NXP (Mifare), и взломаны только старые поколения карт Mifare. 
Соответственно, если хотите эмулировать БСК — то Вам надо стать партнером самого Метрополитена и интегрироваться в их систему. Иначе — никак.
Есть, правда, тупые read-only Mifare Ultralight карты в Москве, в принципе, их можно эмулировать с телефона, но их все равно надо сначала купить удобным образом.

2. Про сложности с клонированием коллега выше уже сказал. Все платежные смарт-карты подразумевают что на них в защищенной памяти зашиты, грубо говоря, секретные ключи и/или секретные данные, а наружу карта отдает только то, что надежно атуентифицирует ее перед считывателем. Достать из защищенной памяти ценные данные можно, но это слишком дорого.

3. Раработчики и интеграторы об этом уже подумали. Да, смартфон с NFC может эмулировать несколько бесконтактных банковских карт, но есть одна проблема — как NFC SE SIM, так и встроенные в железо NFC SE требуют секретных ключей для установления защищенного канала с SE. В случае с NFC SE SIM — это сложная процедура, договора и геморрой с ОПСОСом, чья SIM, а в случае со встроенным NFC SE — то же самое, но уже c производителем телефона. Понятно, что MasterCard может сделать это для работы своего PayPass Wallet на популярных марках Android-смартфонов, но частное лицо или небольшая фирма — едва ли: как минимум, слишком долго и дорого.
ну а ключ от домофона например?