После удаления поля из ACF, неиспользуемые данные остаются в базе и надо чистить руками?
ага
Здравствуйте!
Нет, на самом деле есть готовое решение.
Redvolver ACF Cleaner 
Wordpress Plugin for delete unused modified ACF fields.
https://github.com/filippozanardo/redvolver-acfcleaner