Зачем angular cli создает директорию при создании компонента?
Помимо самого .ts файла он создает .html и .scss. Вы хотите сбрасывать все на кучу? Бродовая идея конечно, но хазяин барин, думаю сдесь вы найдете ответ документация
Ну можешь ключ --flat использовать, тогда не будет папки.