Как удалить программы в ubuntu?
Для начала стоит понять что вы запускаете и как оно попало в систему.
Это может быть просто запущенный бинарник который вы закрепили в доке, может быть что то установленное из исходников make install или нормальное приложение поставленное через пакетный менеджер.

В первом случае просто открепите его из дока и удалите файлы которые запускали.
Во втором топитесь, если повезет к make install завезли make uninstall и он отработает корректно.
В третьем варианте вам нужно определить имя пакета.
Сделать это можно так:
- определить имя процесса через топ или системный монитор
- найти какой именно бинарник запускается можно так Посмотреть ps aux | grep имя_процесса, если оно будет без пути, то which имя_процесса
- определяем какому пакету принадлежит запускающийся исполняемый файл dpkg -S путь_к_файлу
Ну как удалить известный пакет я надеюсь вы уже знаете.
Там есть центр приложений можно как скачать новое так и удалить.gui-шный 
Ну или в программе должно быть раздел "О программе" и там будет написано ее имя и потом уже apt purge "имя пакета "
Apt autoremove