Хранение комментариев для разных типов материалов на сайте?
в угоду производительности выборки комментариев лучше разделить, но я бы для начала поставил вопрос о том нужно ли разделение на две разных таблицы новостей и статей, это же суть одно и тоже (заголовок, теги, тело и +- пара полей).
Я использую второй способ, не думаю что тут есть большая разница.