Python3+uwsgi на Ubuntu 16.04. No module named 'encodings' — как узнать в чем дело?
Заведи пользователя
Заведи ему директорию в /home
Положи все там
В uwsgi укажи от какого пользователя нужно запускать
Чтоб использовать plugins=python3 нужно поставить  uwsgi-plugin-python3
а где убрал строчку 
home=/root/.virtualenvs/vek/bin/python