Что значит «скопировать сайт»?
Некоторым нужно просто скопировать статический сайт, например: сайт визитку или лендинг. Часто люди копируют чужие сайты для дорвеев, дропшиппинга, ЦПА сетей и т.д.. 
Например онлайн сервис вебклонер с лёгкостью копирует лендинг, но админку или любой другой динамический контент не возьмёт. Разве что JS скрипты какие.
Я обычно беру заказы на скачивание сайта
Обычно просят скачать из вебархива или скачать понравившися им сайт.
Конечно же 100% вы не скопируете.
Если нужно скачать их вебархива, то на питоне есть wayback machine downloader скачиваю html сайт, а потом уже адаптирую под себя
Если нужно скопировать сайт (лендинги и т.д.), то через wget качаю html и начинаю дорабатывать сайт.
Классический пример, скачать сайт и перенести на CMS. Я обычно переношу на ВП. Перенос контента на ВП осуществляю через HTML Import 2 (плагин) или адаптирую БД или парсером.
А на основании скачанного html создаю тему (дизайн), при надобности подключаю бутстрап, дорабатываю стили и скрипты. 
Как-то так