Как сделать что бы второй HDD диск не отключался?
Это настраивается в свойствах электропитания.
Была у меня еще проблема когда по какой-то причине второй HDD отведенный под фалопомойку раз секунд в 30 подтормаживал и музыка на секунду прерывалась. И это на мощном ноуте с i7, SSD Samsung 950pro и 16 Гб оперативки. Изменения параметров электропитания в Win10 не помогали. Помогла программа CrystalDiskInfo.
Выкрутил настройки электропитания на максимальную скорость: