В чем разница webpack и vue-cli?
Webpack - сборщик, Vue-Cli - инструментарий поверх Webpack, для работы с Vue.
> vue init webpack 'name' 
Нет там такого. Это просто синтаксис команд от vue-cli 2.x, последнее обновление которой было 2 года назад. Сейчас есть только vue create.

В целом же: webpack - универсальная система сборки приложения, vue-cli(-<some>) - набор тулз для работы конкретно c vue, внутри использующий в том числе webpack со множеством преднастроек и плагинов.