Google Analytics на флешовом сайте — проблемы с отслеживанием станиц
Можно дергать из флэша JS-функцию, которая вызывает _gaq.push. Такие штуки используются для AJAX'овых сайтов, подойдет и тут.
Страницы во FLASH не являются HTML страницами в принципе. 
При навигации внутри флеша адрес страницы не меняется — аналитика их и не показывает.
Даже поисковики эти страницы не видят, да и всё содержимое флешки не индексирует.

Вообще, не понимаю почему вам тот, кто разрабатывал сайт, не рассказал об этом.

Может быть можно выкрутиться через якорь страницы. Но о поддержке hashchange event у Google Analytics мне не известно. (А быстро нагуглить не выходит))