CVS — неправильные версии
Ого, кто-то все еще пользуется CVS… о__О
Одно из возможных объяснений:

То, что у вас на сервере в somefolder наличествует каталог CVS, говорит о том, что это тоже checkout'нутая копия из репозитория, которая, по всей видимости, периодически обновляется по крону (например, раз в час). Сразу после коммита в самом репозитории будет новая версия (файл example.php,v), но развернутое дерево на сервере обновиться еще не успело — надо дождаться следующего «синка».

Обычно в таких случаях (если не хочется ждать, пока крон дернет скрипт обновления), его (скрипт) следует запустить вручную.