Какой формат для pg_dump порекомендуете?
Чем более "непохожи" серверы, тем проще должен быть формат дампа. 

Но начинать надо в любом случае просто с проверки совместимости. Сделайте тест-БД, пара таблиц с FK, одна функция, одна процедура, один триггер... потом забэкапьте и в скриптовый, и в архивный форматы, и проверьте, как на конкретно Вашем хосте пройдёт восстановление.
Бинарный (кастомный) формат поддерживает параллельный рестор и дамп из-за сжатия занимает меньше. Если база небольшая - то эти преимущества, конечно, не являются решающими.