Можно ли запустить Windows приложение в Linux Docker container?
ну читайте же внимательнее )You can run Windows-based containers on Windows Server 2016 and Windows 10. Windows-based containers require a Windows kernel to run, in the same way that Linux-based containers require a Linux kernel to run. You can even run Windows-based containers on a Windows virtual machine running on an macOS or Linux host. Docker Machine is not necessary if you run macOS 10.10.3 Yosemite, Windows Server 2016, or Windows 10.
https://docs.docker.com/engine/faq/
Нет.
Докер - это не особо большая НАДСТРОЙКА над ядром Линукса.
Он просто удобным способом позволяет изолировать и запускать родные приложения Линукса.
Из неродных вариантов - разве только запуск Линуксовых приложений из под Докера ФриБСД или напротив запуск Фришных приложение из под Докера Линуха - так как эти операционные системы близки.
С Виндовс сие невозможно в принципе.
Тот Докер что устанавливается в Виндовс - тянет за собой полноценный Линукс. И только это делает возможным запуска Линукс приложений в Докере Виндовс.
Обратная процедура также нетривиальна.
Если вам нужен аналог Докера для запуска приложений Виндовс - обратитесь к технологии Windows Container.