Как заменить Регулярное выражение — регулярным выражением?
re должно быть строкой. И зачем в регулярке (\n) я не понял.
В общем, я бы сделал так:function chistka() {
  var s = document.getElementById('k2').value;
  var ri = />\s+</gmi;
  var re = ">\n<";

  var result = s.replace(ri, re);
  document.getElementById('k2').value = result;
}
Переменная должна быть строкой:function chistka() {
  var s = document.getElementById('k1');
  var result = s.value.replace(/(>)\s(<)/gmi, '$1\n$2');
  s.value = result;
}
Спасибо ВСЕМ!