Как работает BGP в этом случае?
Да. Инженеры правы. так работает BGP.
От части они правы, но если сделать длинный AS Prepend, то думаю что эти 5-10% уменьшаться до 0.
P.S. Не видел провайдеров срезающих AS prepend, хотя всё может быть.