Почему подвисают веб сервера на линуксе?
Возможно у вас из-за keep-alive просто исчерпывается лимит активных подключений?
Можете попробовать применить советы из этой статьи: https://stackoverflow.com/questions/410616/increas...
Может быть проблема в хосте, на котором виртуалки крутятся? Случайно это не виндовс?