Восстановление файлов БД MySQL на Debian GNU/Linux 6.0
В залитом дампе БД удалялась перед заливанием (стандартный DROP DATABASE IF EXISTS), значит удалялся и файл, в котором хранилась БД, а затем был создан заново при создании БД дампом.
«БД» в MySQL это папка где хранятся файлы форм(структура таблиц)/индексов/данных. Если таблицы InnoDB то индексы/данные хранятся в другом месте — все в одном файле, и этот файл не удаляется при DROP DATABASE — просто место помечается как свободное. При DROP DATABASE удаляется папка с формами.
Если InnoDB настроено как innodb_file_per_table, тогда в папке лежат *.ibd файлы с данными а в ibdata1 хранится только метаданные.

При наличии бекапов некоторых файлов есть несколько вариантов восстановления: Из .frm и ibdata1/ib_logfile{0,1}, при наличии схемы и *.ibd файлов

В вашем же случае, имхо, проще восстановится с бекапа предыдущего дня…
>Причины того, почему бэкап оказался коцнутым, здесь обсуждать не имеет смысла
Хоть намекните дабы другие не напоролись на подобное