Нужен ли уровень агрегации в сети на 100 ПК?
Этот микротик и 500 выдержит. У вас канала инета не хватает или что скорее - какой то свитч тупит. 

Уберите анидечк. Сделайте rdp или meshcentral
В сети явно не хватает уровня агрегации с настроенными vlan и qos. 
Сделайте, раз не хватает.