Возможны ли два разных libstdc++.so.6 в одной системе?
Ставил пакетом или вручную? Если пакетом, конфликт неизбежен - ведь yum полагается на то, что libstdc++ - в системе единственная. Скорее всего придется ставить вручную и при этом очень внимательно разносить их по папкам - чтобы инсталлер случайно не грохнул более новую.
И для работы с ней возможно придется дополнительные параметры указывать, а то и configure подпиливать.
Не понятно, что за ОС у Вас. Однако для генты разные версии одного ПО это не проблема