Как увеличить колличество инодов в ФС centos?
1. Сделать бэкап файлов.
2. Пересоздать раздел, с бОльшим количеством inodes.
3. Восстановить файлы из бэкапа.
Проверил бы лучше, кто у тебя базу данных жрёт.
Очень похоже на чрезмерную нагрузку.