Как вызвать окно ввода пароля администратора, во время установки программы?
Shift + ПКМ -> «Запуск от имени»?
Управление настройками осуществляется аналогичным способом - через оснастки .
Смотрите в сторону служб "Appinfo" (Сведения о приложении), "seclogon"(Вторичный вход в систему) и проверьте, включен ли UAC.
Первая должна запускаться автоматически, вторая - вручную.