Как правильно запускать приложения в терминале Ubuntu 14.10?
Надо запускать ./myprogramm
В вашем случае./project3
можно еще в ~/.bashrc в конце прописать  
PATH=~/Project3:$PATH
тогда в пути для поиска ваших "экзешников" добавится еще и нужная вам директория (папка)