Как при старте сервера запустить cron задачу только после старта Mysql?
Лучше, пожалуй, это делать не кроном, а systemd unit и timer. И прописать зависимость, чтобы только после mysql стартовал.
Можно просто добавить паузу в скрипт через sleep, которая даст загрузиться mysql