Почему пропадают пакеты в сети?
Кроме возможных конфликтов IP адресов (наиболее вероятно), проверьте нагрузку на свитч. Не то, чтоб это было сильно вероятно, просто легче проверить. Если и тут ничего, посмотрите, не занимается ли какой-нибудь мыслитель ARP-спуфингом. Был такой случай - один чудак на букву М терроризировал всю сетку, пока не поймали :)
Если я вас правильно понял, у вас есть 3 компьютера, "пинги" от которых до сервера вас не устраивают.есть идеи? Основная идея - узнать, чем отличаются эти три проблемных компьютера от остальных. Практические приложения этой идеи таковы:
1) Проблемые клиенты находятся в том же L2-домене (влане), что и обычные? 
2) Как вообще устроена сеть? Один L2-домен или присутствует маршрутизация? Если L2-домен один, на нем используется один ip-префикс ("подсеть") или несколько?
3) Сравните arp-таблицы (командами вроде arp или ip neighrbor, ваш вариант может отличаться) на проблемном и на обычном клиенте, особое внимание обратите на разрешение IP-адресов сервера (если он находится в то же L2-домене) и шлюза по умолчанию.
4) Сравните выводы команды ethtool (ethtool eth0, подставьте ваш интерфейс) на проблемном и нормальном клиентах.
5) Далее, выделите два клиента, проблемный и обычный, подключите проблемный клиент в порт коммутатора, куда был подключен обычный и наоборот. Что изменилось? 
Получив ваши ответы на вопросы по пунктам (вывод команд тоже пригодится), можно будет строить более конкретные предположения.