Отладка JavaScript?
Возможно не ответ на вопрос, но посмотрите в сторону кодировки, в которой приходят ответы с сервера — у ие постоянные проблемы с этим, при работе с ajax
Так вышло, что мой текущий проект рассчитан исключительно на IE (корпоративный сегмент). У себя мы дебажим с помощью VS, при этом в IE нужно снять галки с «Отключить отладку сценариев...» — оба пункта (в закладке Дополнительно). Но дебажить можно, если вам известна проблемная область.

Если нет, используем программы, советуемые выше — Fiddler и dynaTrace. Незаменимые инструменты.