Как настроить подключение к серверу  через плагин Sublime Text —  FTPSync?
Используйте winscp.net/eng/docs/lang:ru 
можно редактировать файлы на сервере, как в обычном проводнике без любых предупреждений о вснесении изменений и перезаливке файла.
Мухи к мухам, котлеты к котлетам. Не пытайтесь сделать из Sublime ftp клиент или веб-браузер, он не заточен для этого. Используйте связку Sublime Text + WinSCP и поверьте, в ближайшее время её не перебить никому.