Схема бэкапа клиент-сервер vs сервер-клиент?
Не держите в принципе бизнес-данные на пользовательских машинах - пусть держат всё в расшаренной папке на сервере. И уже эту папку архивировать на другой физический диск на сервере, или синхронизовать - как удобно. При этом доступа Юзеров к другому диску быть не должно.
А на рабочем компе пусть держат что угодно - котиков, домашние фото, музыку, порнуху, ... - админ за сохранность этого не отвечает.
Сервер должен забирать файлы для бекапа, а не наоборот.
Используйте инкрементальные бекапы с длительным временем хранения.