С чем связан поздний рендеринг Браузера?
он и раньше так задавался. ты просто не замечал этого. видимо страница прогружалась дольше и не показывалось как задается паддинг. 
в общем если транзишн там стоит не для паддинга - то меняй all - на то что тебе нужно.
Это из-за того, что страница начинает отрисовываться до того, как подгружается таблица стилей. можно попробовать разбить запись, типаelement {какие-то стили}
element {transition: 1s}