Парсинг PHP на PHP и генерация кода
Есть кстроенный токинайзер php.net/manual/ru/book.tokenizer.php
Есть генератор и рефлекшин в Zend Framework

Но есть и готовый фиксер стиля github.com/fabpot/PHP-CS-Fixer
github.com/schmittjoh/php-manipulator — недавно зарелизилась либа, подаёт большие надежды.