Как отделить логику от взаимодействия с базой данных?
Почитайте о Doctrine, ORM,  архитектура DDD
Класс для работы с БД создай в отдельном файле заполни статическими методами. и вызывай их из предыдущего класа(обьекта)     только подключи файл с класом по БД в файле где класс который будет его юзать.    Я какраз так пишу   первый клас у меня делает запросы в youtube API,   второй DBdriver он делает все что связано с БДDB driver собственно.... <?php
/**
 * Created by PhpStorm.
 * User: pantene
 * Date: 13.02.2017
 * Time: 14:15
 */

namespace ytd;

use \PDO;

class DBdriver
{


    private static function getConnection()
    {

  // Получаем параметры подключения из файла
        $paramsPath = array(
            'host' => 'localhost',
            'dbname' => 'kamios_mbet',
            'user' => 'root',
            'password' => '',
        );

        $params = $paramsPath;

        // Устанавливаем соединение
        $dsn = "mysql:host={$params['host']};dbname={$params['dbname']}";
        $db = new PDO($dsn, $params['user'], $params['password']);

        // Задаем кодировку
        $db->exec("set names utf8");

        return $db;
    }   // get Connection with DataBase




    public static function Add_Video_To_DataBase($options)
    {



        // Соединение с БД
        $db = DBdriver::getConnection();

        // Текст запроса к БД
        $sql = 'INSERT INTO videos '
            . '(name, description, date, views, videos_id)'
            . 'VALUES '
            . '(:name, :description, :date, :views, :videos_id)';

        // Получение и возврат результатов. Используется подготовленный запрос
        $result = $db->prepare($sql);



        $result->bindParam(':name', $options['name'], PDO::PARAM_STR);
        $result->bindParam(':description', $options['description'], PDO::PARAM_STR);
        $result->bindParam(':date', $options['date'], PDO::PARAM_STR);
        $result->bindParam(':views', $options['views'], PDO::PARAM_INT);
        $result->bindParam(':videos_id', $options['id'], PDO::PARAM_STR);

        if ($result->execute()) {
            // Вертаємо ІД останнього запису
            return $db->lastInsertId();
        }
        // Вразі помилки 0
        return 0;
    }



    public static function clear_table(){

        $db = DBdriver::getConnection();

        $sql = 'TRUNCATE TABLE videos';

        $result = $db->prepare($sql);

        if ($about_result = $result->execute()) {
            // Если запрос выполенен успешно, возвращаем id добавленной записи
            return $about_result;
        }
        // Иначе возвращаем 0
        return 0;


    }


    public static function get_clicks_sum(){

        $db = DBdriver::getConnection();

        $sql = "SELECT `meta_value` FROM `wp_postmeta` WHERE `meta_key` = '_linker_count'";

        // echo $sql;  for debug

        $result = $db->query($sql);

        $assocArray = $result->fetchAll();

     //   var_dump($assocArray);    for debug

        $sum = 0;

        for ($i = 0; $i <= count($assocArray); $i++) {

           $sum = $sum + $assocArray[$i][meta_value];


        }


        return $sum;


    }


    public static function get_all_views_in_playlist($num_int = false) {


        $db = self::getConnection();

        $sql =  'SELECT `views` from `videos`';

        $result = $db->query($sql);

        $assocArray = $result->fetchAll();

        $sum = 0;

        for ($i = 0; $i <= count($assocArray); $i++) {

            $sum = $sum + $assocArray[$i][views];


        }


        if ($num_int) {

            return $sum;

        } else {

            return number_format($sum);

        } //else


    }   // get_all_views_in_playlist



    public static function get_views_in_last_30_days() {


        $db = self::getConnection();

        $sql =  'SELECT `views` from `videos` WHERE `date` > CURDATE() - INTERVAL 30 DAY AND CURDATE()';

        $result = $db->query($sql);

        $assocArray = $result->fetchAll();


        $sum = 0;

        for ($i = 0; $i <= count($assocArray); $i++) {

            $sum = $sum + $assocArray[$i][views];


        }


        return   number_format($sum);



    } // get_views_in_last_30_days


    public static function get_quantity() {

        $db = self::getConnection();

        $members=$db->query("SELECT COUNT(*) as count FROM videos")->fetchColumn();



        return $members;

    }  //  get_quantity_of_videos_in_play_list




    public static function get_average_views_per_video() {



              $average = self::get_all_views_in_playlist(true) / self::get_quantity();

              $average = round($average, 0);

              return $average;



    }



}
И сам класс который его юзает...<?php
/**
 * Created by PhpStorm.
 * User: pantene
 * Date: 13.02.2017
 * Time: 13:27
 */

namespace ytd;

use ytd\DBdriver;


class YtData
{

//свойства

public $last_number_of_array_on_the_last_pagination = 0;
public $all_items_ids = array();
public $array_of_full_information_about_video = array();
public $playlist_id = "";

//свойства





    public function add_videos_to_bd(){

            for ($i = 0; $i <= count($this->array_of_full_information_about_video); $i++) {

                DBdriver::Add_Video_To_DataBase($this->array_of_full_information_about_video[$i]);

            }


        }







        public function get_array_of_full_information_about_video(){

                   //  echo "</br></br>ITEMS_IDS</br></br>";

                     $i = 0;

                     foreach ($this->all_items_ids as $key=>$value){

                       $this->array_of_full_information_about_video[$i] = $this->get_data_about_video_by_id($value);

                       $i++;
                     } //foreach

            return $this->array_of_full_information_about_video;
        } // METHOD   get array of full information about video


        public function get_all_items($is_page_token = false)
        {


            if ($is_page_token != false) {

                $pgt = "&pageToken=" . $is_page_token;

            } else { $pgt = ""; }


            $request = "https://www.googleapis.com/youtube/v3/playlistItems?part=snippet&playlistId=PLbZV_PJvMcy8x0n6Bx3QsWdSABYTtM0ph&key=AIzaSyC6N_rx9GXbitgE1qTnMmDafv1lVa0Rtvk&maxResults=9&order=date".$pgt;

            $response = file_get_contents($request);

            $response = json_decode($response, true);


            for ($i = 0; $i < count($response[items]); $i++) {

                $this->all_items_ids[$this->last_number_of_array_on_the_last_pagination] = $response[items][$i][snippet][resourceId][videoId];

                $this->last_number_of_array_on_the_last_pagination++;

            } //FOR


            if (isset($response[nextPageToken])) {   $this->get_all_items($response[nextPageToken]);    }   else { return true; }



        }



    public function get_data_about_video_by_id($videoID){


        $response = file_get_contents('https://www.googleapis.com/youtube/v3/videos?id='.$videoID.'&key=AIzaSyC6N_rx9GXbitgE1qTnMmDafv1lVa0Rtvk%20&part=statistics,snippet');

        $response = json_decode($response, true);



        $data_about_video = array();

        $data_about_video[date] = $response[items][0][snippet][publishedAt];           // вихідний формат дати

        $data_about_video[date] = $this->date_in_right_order($data_about_video[date]); // получили дату роліка. Звернулися до метода, що зробить її в потрібному фоматі

        $data_about_video[name] = $response[items][0][snippet][title];    // получили назву роліка

        $data_about_video[views] =  $response[items][0][statistics][viewCount];

        $data_about_video[description] = $response[items][0][snippet][description];    // получили описання роліка

        $data_about_video[id] = $response[items][0][id];




        return $data_about_video;


    }  // METHOD - get video's data by ID


    private function date_in_right_order($date_in_false_order){


           $date_in_false_order = explode("T", $date_in_false_order);
           $date_in_false_order = explode("-",$date_in_false_order[0]);

           $string_data = implode("-", $date_in_false_order);

         //  $array_right_order = array();

           /*$ar = 2;
           $it = 0;
        for ($i = 1; $i <= count($date_in_false_order); $i++) {

            $array_right_order[$it] = $date_in_false_order[$ar];
            $ar--;
            $it++;

        } //for*/


     //   $string_data = implode("-", $array_right_order);

        return "$string_data";

    } //get date in right order  response date in need FORMAT

}   //class YtData;Интерессная штука....
Вот метод в класе драйвера БД  private static function getConnection()
    {

  // Получаем параметры подключения из файла
        $paramsPath = array(
            'host' => 'localhost',
            'dbname' => 'kamios_mbet',
            'user' => 'root',
            'password' => '',
        );

        $params = $paramsPath;

        // Устанавливаем соединение
        $dsn = "mysql:host={$params['host']};dbname={$params['dbname']}";
        $db = new PDO($dsn, $params['user'], $params['password']);

        // Задаем кодировку
        $db->exec("set names utf8");

        return $db;
    }   // get Connection with DataBase
Его я вызываю в других методах этого класа вот таким кодом...
$db = DBdriver::getConnection();     ----   и у меня уже в переменной БД интерфей для работы с PDO Mysql.  
Еще можно написать  self::fetConnection();  когда один метод использует другой внутри одного класса