Как организовать Deploy кода на несколько проектов?
1. Мастер репозиторий там лежит пресловутый скрипт, допустим в нем 2 переменные обозначьте их как {{HOST}} {{PORT}}
2. В билд скрипте для конкретного сайта добавляйте степ со скачиванием файла и перезаписью данных
Один из вариантов - использование скриптом конфигурационных (env) файлов, которые не деплоятся в рамках сборки, а живут на каждом конкретном сервере (разовая первоначальная настройка).