Как правильно настроить шейпинг на Микротик для мелкого провайдера?
По поводу загрузки процессора:
wiki.mikrotik.com/wiki/Manual:Tools/Profiler 
(может быть проц грузят не очереди, а открытый dns ;)
По поводу очередей:
wirelessconnect.eu/articles/bandwidth%20_control
+
wiki.mikrotik.com/wiki/Manual:Queues_-_PCQ
По поводу ната - всё зависит от конретного чипа внутри 750GL, а именно поддерживает ли оно line rate nat / nat hw acceleration.
По поводу бриджа - wiki.mikrotik.com/wiki/TransparentTrafficShaper
@seventh вы хотите на спорт каре быстро ездить и перевозить мешки с цементом!!! 
Мало того что Вы используете решение для дома\малого офиса, так Вы еще и нервные клетки пользователей(бизнеса) жгете. 
Ну и не желательно использовать железку с загрузкой на 100% всегда надо закладывать пару процентов на мощности+ на будущее...