Что-то генерирует файлы в корне системы?
Если хотите скандалы, интриги, расслеования - снимите образ, потом отформатируйте и накатите бекап.

Не хотите - просто разверните бекап.

Нет бекапа - ССЗБ.
1. файлы созданы от рута, поэтому найти будет немного сложнее, создавать их может любой рутовый процесс.
2. Не похоже, что это крон - он не умеет в пол-минуты, минимальный интервал минута, поэтому скорее всего это какой-то уже запущенных процесс. Но для очистки совести можно и кроны просмотреть.
А что собственно в файлах?