Как можно добавить второй сайт в папку Wordpress?
Не слушайте их. Врут. Можно сделать все, если знать как)
в вашем случае надо:
в wp-config.php прописать условие
если хост == site1.ru, то меняем префикс базы на wp1_
если хост == site2.ru, то меняем префикс базы на wp_
затем нужно будет в настройках одного из сайтов вынести в другое место папку uploads.
можно так же и themes и plugins перенести туда же.
или можно вообще все что в wp-content у одного из сайтов переместить в другое место.
это все можно сделать в том же wp-config.
https://codex.wordpress.org/%D0%A0%D0%B5%D0%B4%D0%...
(смотрите про перемещение wp-content)
так получим два сайта в одной папке, которые будут использовать разные таблицы в базе данных, разный набор плагинов, разные темы и разные медиа файлы.
Добрый день. 
В одном каталоге сделать никак не получится.