В каких средах создать приложение либо веб интерфейс для работы с данными магазина?
На том, что лично ты (или специалист которого ты наймешь) лучше всего знаешь.
А вообще - товарный учет - типовая задача для 1С. Уже не говоря о том, что полно готовых решений под нее. Веб-интерфейс она умеет.
Веб магазин только ленивый не написал еще. Тот же 1С / Bitrix все давно умеет.