Как сделать такое всплывающее окно?
Стоит учитывать, что всплывающие сами по себе окна жутко раздражают посетителей.
Если на каком-либо сайте всплыло окно один раз - я уже напрягаюсь и хочу побыстрее закончить со своими делами на этом ресурсе, а если второй раз, то я скорее всего закрою сайт
1. Поставте куку и отлавливайте, если нету то окно
2. Не очень понятно провел одну секунду или 2 минуты... а тут копать в сторону settimeout или setinterval