Переход с linux на Windows, подводные камни?
Платный софт, неконтролируемые обновления, вирусы, трудноотлавливаемые глюки (в винду нормального логирования не завезли). А так жить можно.
Если вы сидите на Линукс и по какой-то причине мигрируете на Майкрософт, думаю у вас проблем не возникнет, посколку windows при всех его минусах, куда проще ( в плане освоения) линукс, и если вам не доставляет труда юзать линукс, то освоить windows вам будет соль же трудно как пересесть с gnome  на kde