Системный администратор с нуля?
но бесплатных книг по active directory не нашел.
На торрентах всё бесплатное, о чём вы?
Вообще, админству учатся практикой, лучше б вам поменять работу.
А так - руководство к CCNA, Куроуз, книги по администрированию Windows (они так и называются).
Читайте про Астериск, Samba, Hyper-V, AD, корпоративные антивирусы.
но бесплатных книг по active directory не нашел. 
Чо?
Самый первый навык, который необходимо освоить админу - умение искать и находить ответы. Бесплатных книг полно. Они не обязательно будут на сайтах магазинов или библиотек, они часто бывают на сайтах университетов, на сайтах студентов с учебными материалами, на малозаметных архивах. Да, там они скорее всего будут не последнего издания - но и AD штука очень даже не новая, ей лет двадцать уже...
Опять же торренты :)