Cтоит ли использовать jQuery если знаешь JavaScript?
JQuery в основном используется как обертка над DOM и событиями. Логика в любом случае пишется как обычно.
Либо совсем без jQ (что работает шустрее в разы)
Либо только на jQ - иначе рискуете вызвать утечки памяти в самой jQ
Лично мой выбор - подрубить polyfill.io (чтоб не париться совместимостью со старыми браузерами) и использовать нативный DOM-api