Как постигнуть администрирование 1С?
1) КА сама по себе на фирмах не появляется. Для ее запуска нужны подрядчики для выполнения настроек и переноса накопленной информации. Если подрядчики все еще у вас работают, то нужно ставить перед руководством вопрос ребром - или они настраивают комфортную работу 1С в вашей компании, или вы не закрываете им акты и деньги не перечисляете. Если уже лоханулись и приняли работу в таком хреновом виде, то ищите новых подрядчиков для оптимизации - у ваших явно квалификации не хватит, иначе сразу бы все сделали по человечески.
2) Если руководство выделит деньги на курсы, то сходить стоит. Расширите кругозор. Но квалификацию для решения вашей проблемы не получите. Оптимизация работы платформы - это следующая ступень просвещения 1С-ников, после того как они освоили все механизмы платформы. Изучение логов и использование профайлера не устраняют проблемы, а лишь указывают на тонкие места, которые нужно переделывать.
3) Работа вашего почтового сервера ну никак не зависит от 1С (разве что вы настроили бесконечные спам-рассылки).  А вот тормоза в работе почтового сервера, если он физически на одной машине с 1С:КА - это уже звоночек. Пофиг на загрузку проца - что там с очередью к диску? У вас может быть нехватка оперативки со свопом или просто старые медленные винты, которые давно пора заменить на SSD.
всё тормозит, при том что сервер не загружен и на половину
на нагрузку жесткого диска посмотрите, скорее всего причина в нем