Как поднять 2 сайта на сервере Apache?
Создать виртуальные хосты, в зависимости от дистрибутива процесс создания может различаться. Лучше все делать руками через конфиги, не рекомендую пользоваться графическими установщиками.
По тому что надо создавать виртуальный хост. Апач не настроен.
Жаль что Webmin лет 10 назад использовал )))почему-то когда я захожу на на тот или иной сайт он открывает папку с сайтами У тебя запущен Apache только с defaul хостом, поэтому любой запрос скорее всего идет /var/www/html/ и там включен просмотр папок ( папки и файлы отображаются как в проводнике). 
Нужно создать виртуальный хост с именем sait.by (тут тонкость - как правильно сказать?) и корневой папкой /var/www/html/sait.by/. Повторить с mail.sait.by.