Инструмент для создания linux пакетов из исходников?
build.opensuse.org/

The openSUSE Build Service is the the public instance of the Open Build Service (OBS) used for development of the openSUSE distribution and to offer packages from same source for Fedora, Debian, Ubuntu, SUSE Linux Enterprise and other distributions.
Заводите свой проект, скармливаете исходники и конфиги и просто ждёте, когда соберётся. Потом можно будет просто добавить свой репозиторий в менеджер пакетов и устанавливать/обновлять пакеты штатными средствами.
В каждом конкретном случае — есть свой инструмент 
У редхатоидов пакеты собираются утилитой rpmbuild используя spec файл как сценарий сборки
У ArchLinux — makepkg, используя в качестве сценария PKGBUILD файл
У Gentoo — emerge, использует в качестве сценария ebuild 

Есть и якобы «универсальные» инструменты — что то типа checkinstall или сизифа из Alt Linux = но их универсальность спотыкается на создании более-менее сложных пакетов(особенно начиненных инсталляционными скриптами) — поэтому лучше использовать стандартные для дистрибутива средства сборки.