Godaddy доменное имя направить на сервер?
Если мы используем ns хостера, то настраиваем ns у них или наоборот, все на godaddy
Добавьте все необходимые DNS-записи для привязки домена к различным сервисам (например A-записи, указывающие на IP-адрес сервера вебхостинга, MX- для почты, и т.д.) на те DNS-серверы, с которыми делегирован домен.
Проще говоря, редактировать DNS-записи нужно на тех DNS-серверах, к которым привязан домен.