Помогите для PHP выбрать формат конфига с поддержкой кириллических ключей
Декодировать будет json_decode, и кириллицы она не боится.
А для json_encode просто добавьте JSON_UNESCAPED_UNICODE — и всё
Если используется PHP, то предполагается, что данные хранятся на сервере, а не на клиенте. Сервер может хранить данные (в этом случае «ключи») в удобном ему формате, а перед отображение пользователю преобразовывать.

Поэтому мой совет — использовать удобные вам ключи, а бухгалтерам показывать переведённые ключи.
Сам «конфиг» конечно же хранить в базе данных, так как то, что вы привели, не очень похоже на конфигурацию приложения.