Как оптимально настроить сервер 1С?
> Кластер из 2 серваков. С подобным не сталкивался, насколько возможно с моим бюджетом собрать производительное решение?
Кластер из двух серверов это не оптимально. Должен быть кворум. (те три)
Для кластера необходимо еще и СХД и тогда точка отказа будет эта самая СХД.
Это конечно самый правильный вариант был бы делать кластер, но очень дорого.
Клиентов по своему опыту, хорошо загонять в терминальные сессии. Тут надо смотреть насколько нагружается сеть 1С и насколько все тормозит.
SSD+hdd лучше использовать в гибрид по технологии storage space, там же можно и raid сделать программный. 
Вполне работоспособная вещь.
В итоге я наверно бы сделал так, а многие тут покрутят у виска и скажут что я псих и полно потери производительности. Но с вашими 50 человек и больше это мелочи.
Взять хороший сервер. Под систему взять диски 256gb в кол-ве трех. Сделать зеркало + hot spare.
Остальное добить SSD+HDD из расчета , что примерно на 1 tb данных, лучше взять 256gb кеша SSD. (хотя бы).
Используя Microsoft StorageSpace сделать Raid+кеширование. 
SSD лучше взять из расчета на зеркало.
Создать две машины виртуализации на Hyper-V. Зачем ? 
1) Удобнее делать backup целой машины сразу
2) Если все умрет, вам проще будет развернуть эти машины где угодно, просто их перетащит куда надо.
3) Если вдруг вы упретесь в производительность, можно легко это все разнести и кластеризировать. 
У вас не те нагрузки, что бы например создавать отдельный ClusterFileSystem (там правда могут храниться только MSSQL и машины Hyper-V)
Бюджет правда не очень понятно, это на сервера с лицен ?
Для 50 пользователей 1 сервер будет быстрее. Ну и обеспечить темпы пользюка службы 1с и /srvinfo/ также на быстрых дисках.