Bootstrap и дизайн?
когда речь идет о "дизайне под бутстрап", то в 90% случаях это всего лишь 12-колоночная сетка бутстрапа. (bootstrap grid) 
Остальные стили порой даже не подключают. а даже если подключают, то переопределяют под дизайн макета.
А вы не используйте предопределенные стили и все. SCSS-mixins вам в помощь. И лучше если начнете сразу с 4-ой альфы бутстрапа, забив на float