Как по клику на определенную ссылку открыть popup-окно, в котором должен начать проигрываться mp3-файл?
В этом решении больше проблем советы:
1) ползунок сможет работать только в HTTP/1.1+. Соответственно с PHP Вы контент выдать не сможете (нормально) . Поставьте спереди nginx, и не морочте себе голову. Или стримайте инструментами для стриминга.
2) проигрывайте аудио через javascript || flash. (если уже - опишите как у Вас получилось поиметь подобные проблемы)
На первый вопрос не достаточно данных для ответа. В других местах всё работает а фаербаг никто не отменял. 
Уточните задачку. (недавно другу в похожем помогал, связанное свежо в памяти)
Попробуйте  X-Sendfile