Что означают буквы A и B на платах DAOR53MB6E0 и DAOR53MB6E1?
Номер ревизии. Это как версия ПО, только версия платы.
Может означать всё что угодно, какая-то прмоежуточная ревизия или код завода или номера станка печатающего плату. С практической точки зрения это ничего не значит. 
Если партнамбер совпадает то платы взаимозаменяемы, если партнамбер разный - на свой страх и риск.