Чем пользоваться на mac os el capitan для веб разработки?
Попробуйте  Vagrant. И система чище, и нативный воркфлов
Извините но на маке извращение ставить вагрант.. ну если только не что то специфическое...
ставте brew и через него поставте все что нужно.. мне лично хватает  
nginx - php-fmp - mysql - redis
но на всякий пожарный держу VirtualBox