JQuery vs. Сss+Костыли. На кого ставите вы?
Однозначно CSS.
Не вижу смысла перегружать сайт javascript`ом, когда задача решаема с помощью CSS.
Для конкретно этого вопроса достаточно css (и 100500 других решений, гуглимых по фразе «sticky footer»).
Чаще всего скрипт нужен, когда css-костыли слишком тормозны в ie6.