Radeon HD 6990 — работает только одно ядро (из двух)?
а вы уверены, что так не задумано производителем? второе ядро может включаться не сразу (ну или да — софт некоррестно собирает инфу). Попробуйте запустить какой-нибудь 3dmark и сравнить производительность с «эталонным». Если не будет большой разницы — то похоже, никакой проблемы и нет.
90% что глюки софта, надо еще в чем-то потестировать