Как игнорировать файлы из git репозитория?
невозможно игнорировать то, что уже под контролем. 
можно локально убрать файл из контроля, добавить его в игнор, и у всех, кто после этого склонирует он будет в игноре.
Настрой пути сохранения сгенерированных css файлов на вне git репозитария, например второй, создав его специально для production ready файлов. Т.е. именно он и должен использоваться для переноса итоговых файлов в продакшн. либо заведи специальный подкаталог внутри git, добавив его в .gitignore, а саму инсталляцию в продакшн проводи другими способами.

sass style.scss:../prod/style.css