Как победить сеть?
Вдумчиво начать рисовать сеть по фактическому раскладу.
Возможно там обнаружится петля и коммутатор, умеющий гасить штормы и отключающий порт/порты при шторме на сколько-то минут.
И да, петли могут возникать и хитрым образом от расшарившего свое подключение юзера (типа имеет wifi и медь)
Я бы предположил или петлю( но поскольку по mak доступен, то это не она ) или конфликт адресов.
Попробуйте следующее:
1. Повесить еще один адрес в другой сети на тот же интерфейс и проверить доступность по данному адресу в тот момент когда возникают проблемы.
2. Повесить еще один адрес в другой сети на другой интерфейс  и проверить доступность по данному адресу в тот момент когда возникают проблемы.
3. В момент возникновения проблем снять дамп на mikrotik и на рабочей станции. Вообще в любых непонятных ситуациях с сеть снимай дамп, там можно много чего интересного найти.