Veeam или Acronis?
С энтерпрайз решениями акрониса не работал. А вот Veeam - по мне, лучшее бэкапное решение, существующее на данный момент (работал с Symantek, сейчас у коллег ComVault - вроде все умеет, но сложноват). С 9.5 бэкапит и физику, все нативно просто, но возможности при этом колосссальные. На лету восстанавливает все подряд на уровне приложений. Для сиквелов реализовано гранулярное восстановление даже для физ. серверов. ИМХО - VEEAM рулит.)
PS Контроллер домена восстанавливал только из копии сделанной родным win backup - особых проблем не было, счетчик рид перевел на позднее значение, да если нужно FSMO роли забрал - будет работать, особых сложностей с этим нет.
Работал и с тем и с тем, но восстанавливать приходилось только файлы. Без состояния системы.
Лучше послушать того кто контроллер домена смог из резерва развернуть.
Как по мне, функционал одинаков, интерфейсы разные. Формат хранения разный. 
Приемущество Акрониса лично для меня, можно через их же утилиту True Image из tib копии системы в виртуалку переконвертировать. У меня пару раз была нужда.