В чем отличия оригинальной сборки Postgresql от 1Cной Postgresql?
будет ли 1С работать с оригинальной PostgreSQL
Не будет.

чем отличается сборка Postgresql от 1С от оригинальной Postgresql
Для ответа на этот вопрос лучше всего скачать из ИТС патч для постгреса и посмотреть его. Он правит исходные код в нескольких десятках мест. Там и методы экранирования символов, и нюансы обработки строковых данных, и костыли с кодировками и ещё много чего.
С оригинальной работать не будет. 

Патч пытается превратить PostgreSQL в MsSQL, например: 
Добавляет mchar, mvarchar, операторы и функции для работы с ними (модули fulleq, fasttrun, mchar)
Добавляет 1900-01-01 в качестве дефолтного для datetime/date
Вносит изменения в механизм блокировок и совершает еще вагон телодвижений суть которых сводится к тому чтобы 1с работала какбы с mssql