MYSQL на SSD оптимизация?
1073741824 bytes (1.1 GB) copied, 26.643 s, 40.3 MB/s
это приговор
железо не то, что в ваших ожиданиях или в заявленном маркетинге
query_cache_type = 1

там myisam что ли? если да, и если таблицы большие, то надо менять на иннодб. кэш этот вырубать, тормозов от него больше чем пользы, особенно когда много записи идет. потом в зависимости от размера оперативки подобрать значения иннодбшных параметров

меня вот эта статья спасла https://ruhighload.com/%D0%9E%D0%BF%D1%82%D0%B8%D0...

для 8 гб выглядит так

innodb_buffer_pool_size = 4G
innodb_log_file_size = 512M
innodb_buffer_pool_instances = 4

innodb_flush_log_at_trx_commit я поставил 0, так быстрее всего но типа ненадежно, но незнаю где там эта грань надежности и как надо базу нагрузить чтоб проломить эту грань, никаких проблем с данными больше чем за год не случилось. 
https://ruhighload.com/innodb_flush_log_at_trx_com...

думаю что всё очень индивидуально, зависит от кол-ва столбцов и их типов, но от маисама лучше уходить. он начинает конкретно тормозить на таблицах от каких-нить 100к записей. перед уходом желательно убедиться не используются ли в нем какие то фичи которые еще не появились в иннодб. начиная с 5.7 вроде ничего такого не осталось. до неё были различия в работе с переменными

майсклтюнер дал не самые лучшие советы кстати, но близкие