Лишает ли гарантии перепрошивка Android-девайса?
Если ты получишь кирпич в процессе — то да. Если же прошьешься без проблем, то никто не мешает сделать анрут.
К примеру HTC ответил на этот вопрос так --> «Добрый день, %%username%%! Спасибо за обращение в НТС. Да, получение root на android устройстве или смена на модифицированную прошивку приведет к потере гарантии. Пожалуйста, обратите Ваше внимание, что Вы можете связаться с нами по телефону горячей линии *********** С уважением, НТС www.htc.com/ru» 

Не думаю, что Acer ответит иначе.