Как на CentOs обновить PhpMyAdmin или установить его заново, но не из репозитория?
Оператор сервиса "Погугли чужими руками" приветствует Вас!
Вот Вам ссылка на описание процесса установки PhpMyAdmin из официальной документации.
phpMyAdmin 4.0.9 лежит в репозитории remi