Альтернатива для Яндекс.Диска?
Замените слово "файл" на слово "информация" - и, возможно, окажется, что вам не нужно ни хранилище, ни эксплорер, ни винды. А достаточно браузера и веб-сервиса. 
Вопрос, откуда берутся те файлы и как с ними работают.
Есть класная прога для синхронизации free file sync + ftp
Эт как вариант.
Если по умному - то конечно личное облако с ssd диском.