С помощью чего можно реализовать 3D модель для сайта?
Не совсем понял. Вам нужно создать подобную модель или разместить ее на сайте? Если первый пункт, то ответа краткого нет. Нужно выбирать 3D редактор и учить его (в инете уроков много по всем). Если второй пункт, то threejs не советую. На threejs придется делать все "ручками" - это библиотека больше для программеров. Хороший, бесплатный плеер 3D моделей есть у Blend4Web. Там все на русском, читайте.
Как вариант, можно посмотреть sketchfab. В отличие от варианта выше, вам не нужно будет заботиться о хостинге для плеера и модели. Но там есть некоторые ограничения - читайте условия.
threejs.org
пы.сы. судя по последним коммитам JSC3D она уже заброшена давно.