Как отключить fsck при запуске системы?
В /etc/fstab есть 6ая колонка, если надо чтобы раздел не чекался fsck - поставте 0
То что у вас происходит это очень плохой признак, у вас скорее всего проблемы с диском которые заканчиваются потерей данных, поэтому отключать fsck стоит только для того чтобы загрузиться и слить данные.
Обязательно проверьте что у вас есть бекапы и они в порядке, также проверьте SMART вашего диска.
Тут.