Имеет ли git юридическую силу?
Лезешь в Консультант плюс.Ищещь там слово git.Профит.
У вас же уже все перечислено в акте. 
Какие еще доказательства нужны? 
Подписывая акт, заказчик согласился в т.ч. и с этим перечнем. 
Технически заказчик может самостоятельно для себя выяснить этот вопрос - проанализировав коммиты полученные от исполнителя.