Не сохраняется конфиг на Juniper EX 3300 после перезагрузки, почему?
У ex3300 врожденные проблемы с флешем.
Можно 
а) попробовать провалиться в BSD-консоль ("start shell user root") и выполнить команду "nand-mediack", которая проверит и попытается перезаписать "уставшие" ячейки.
https://kb.juniper.net/InfoCenter/index?page=conte...

б) переустановить софт "с нуля", не через "request system software add", а через loader,  с usb-флешки, с полным форматированием флеша ("install --format file:///jinstall-ex-3300-12.3R12-S12-domestic-signed.tgz")
https://kb.juniper.net/InfoCenter/index?page=conte...
https://kb.juniper.net/InfoCenter/index?page=conte...

и сделать snapshot свежеустановленной фирмвари на второй раздел ("request system snapshot media internal slice alternate"), чтоб с него загрузиться в случае проблем на основном.
https://kb.juniper.net/InfoCenter/index?page=conte...

Но, даже если это поможет, то лишь временно, через полгода-год все вернется обратно -- флеш там сыпется неотвратимо.
Привет, а никаких Alarm нет?
Скорее всего надо смореть dmesg (show system boot-messages) и понять что происходит при загрузке.
Это ненормальная ситуация когда "слетает" конфигураци, да и у Juniper нет аналогичных Cisco манипуляций с config register для восстановления пароля например.

А есть второй ex3300 что бы сравнить лог загрузки?