Систему Knowledge Base с внятной и удобной структурой?
Лучше Wiki использовать, перерыл много, но остановился именно на ней. 
www.mediawiki.org/wiki/Download
demo.68kb.com/index.php — почему то сильно похоже на Wordpress с хорошо продуманной системой тегов и категорий ;) 

Для вордпресса есть плагины, которые автоматически превратят его в псевдо-вики — для автоматической расстановки ссылок в статьях на другие статьи на основе текста. Ну грубо говоря сказали вордпрессу, что во всех статьях слово «буббу» надо заменить на ссылку на вон ту статью — и оно заменяет. Названия, к сожалению, не помню. А так модулей Glossary для него море.