Психология системы личных сообщений: каков должен быть порядок сообщений в переписке?
Если не учитывать силу привычки, сформировавшейся у пользователя из опыта использования любых  других мгновенных мессенджеров (и даже почты), то вы создадите у пользователя диссонанс, когда он увидит последние сообщения сверху. Это будет негативным опытом и поспособствует отказу пользователя от использования вашего сервиса.
А какую задачу вы решаете? Если нужно сконцентрировать внимание именно на последних сообщениях, то можно вывести последнее сообщение (или 2-3 последних сообщения в привычном порядке «сверху-вниз»), а над ними дать ссылочку «предыдущие сообщения». На Фейсбуке так реализовано и очень удобно. Похожий подход и во Вконтакте.