Как решить проблему с «в вашей конфигурации PHP отсутствует расширение MySQL»?
Вот ответ sudo apt-get install php7.0-mysqli
Я тоже столкнулся с данной проблемой
Вообще Обычный mysql начиная с php 5.5 помечен устаревшим (с php7.0 вообще выпилен), пора переходить на Mysqli.
А так, скорее-всего в php.ini отключился при обновлении.
попробуйте сделать вывод  и найти там mysql (не mysqli)