Yota + Torrent?
Никак не бороться. У них в правилах сказано, что у торрентов низкий приоритет, и такой трафик они пропускают не в первую очередь, дабы не ущемлять других клиентов на той же БС.
никак, забейте. 
Я долго мучал. 
Впрочем, первое время получалось нормально качать через VPN от pirate isp. Но и он потом тормозить начал.