Как правильно выпаивать разъёмы, чтобы не повредить переходные отверстия?
Нужно удалять припой из отверстий "припой отсосом" - потом прогреть вывод чтобы он отпаялся от стенки - отпустить его плавно убирая паяльник сокрящая полщадь контакта с жалом - чтобы темпратуры вывода не хватило для обратного припаивания к стенке отверстия. 
С USB разьемами сложно только экран отпаивать так как у него большая площадь рассеивания и не вседа получается прогреть нормально.
Можно обычный свинцовый припой капнуть, чтоб уменьшить температуру плавления. Совет универсальный.