Как правильно организовать архитектуру микросервисов docker?
Правильно задумались. Добавьте в ваши таблицы Userid  и храните все в одной базе. Бэкапить 100500 баз то ещё удовольствие
lxc котейнер... и под каждого юзера. сделать общий шаблон, и после разворачивание контейнера только менять внутри "необходимое" под каждого юзера
да и бэкапить удобно