Как сделать анимацию как на этом сайте?
- Сделать как на вашем примере, т.е. через SVG
- Сделать видеоролик, вставить через тег «video»
Привязать к скролу и к ховеру.
Это Canvas
Долго и муторно наверное их было рисовать... подумайте 100 раз - надо ли Вам это...
К тому же я перешел на сайт и не сразу даже догадался, что нужно навести курсор на этих зверей и человечков для анимации ) 
В Вашем случае возможно будет проще сделать анимированные gif-ки и вставлять их на страницу при прокрутке?