Где меняется фавиконка в админке worpress?
Замените ее через function.php (файл лежит в папке темы)
Или в кодексе почитайте. 
https://codex.wordpress.org/Creating_a_Faviconfunction fav() {
echo '<link rel="Shortcut Icon" type="image/x-icon" href="http://...бла-бла-путь к картинке/favicon.ico" />';
}
add_action( 'admin_head', fav' );
Ещё проще можно указать в header.php <head>
 <link rel="shortcut icon" href="/images/favicon.ico" type="image/x-icon">
</head>