Стоит ли переходить на Percona server с MariaDB/MySQL?
Вопрос не тривиальный и переход должен делать специалист.
Выбор всего движа должен происходить в том числе из реалий вашего бизнеса/проекта, команды специалистов и прочего.
Таким образом, если сейчас всё работает и устраивает и вы сами лично не видите плюсов/минусов, и даже не сильно разбираетесь в настройках, то я бы рекомендовал сосредоточится на улучшении, развитии других частей проекта, в которых вы в теме. 
А для переезда, масштабирования БД выделить бюджет на специалиста, когда бюджет появится. А так, работает не трогай, тк переезд это всегда подводные камни, время, нервы и возможные простои. Оно вам надо? Я думаю нет. 
Поэтому не спешите.
И в первую очередь составьте список, лёгкое ТЗ, проблем и задач администрирования БД в вашем случае. Затем его можно наложить на ваш текущий движ, и может быть всё не так уж и плохо. И скорее всего, есть много инструментов облегчающих, автоматизирующих работу и в MariaDB.
А может вам вообще в самом sql функций не хватает, может вам нужен PostgreSQL? 
Нет, так дела не делаются, вопрос побольшому счёт вообще бессмысленный, разве что в комменты вы ждете любителей холиваров ради холиваров.
Для начала можно обновить до новой версии 10.4
Версия 5.5 уже давно выпущена была.
Если хочется оптимизировать, то это надо делать на запросах, при помощи проверки Slow Queries, EXPLAIN и мониторинга.