Какую версию Python изучать?
Смотря сколько собираетесь учить. 

Если пару-тройку лет, то третью — потому-что вероятно большАя(если не бОльшая) часть библиотек и решений, перейдет на неё, за это время. Если за месяц-два планируете освоить, то 2.6\2.7 — потому-что сейчас большинство на них пишут и соответственно большинство библиотек и решений именно на нем. :)

А почему вообще питон? 
Есть куча других замечательных языков — не холивара ради, но что вы на нем собираетесь делать? 
От направления деятельности нужно выбирать язык, 
и его версию, соответственно.

Ну и до кучи — изучив любой из питонов, вы будете легко воспринимать, код на любых других версиях 
 — правда, немного почитав про отличия (их не так много, к слову). 
Однако, без большого количества правильных примеров вам будет сложно прочувствовать 
все прелести новых конструкций, которые появились в 3.*, по отношению к 2.6\2.7.
Если задача «развитие и самообучение» — то конечно третью версию, если задача «найти работу и зарабатывать» — то вторую (но с оглядкой на третью), т.к. в реальных проектах вы будете опираться на сторонние библиотеки, большинство из которых не имеет версии под третий питон.