Как в линукс сделать снимок папки, потом через время еще один, и сравнить, что бы узнать какие файлы появились?
$ ls -lR > before
...
$ ls -lR > after
$ diff -u before after
Как-то так подойдет?
Кажется вы доросли до системы контроля версий))
Ну а если по существу, то например копия исходной папки + команда diff.
Но если в папке текстовые файлы или файлы небольшие, то однозначно погуглите "системы контроля версий".
Кроме диффа будете видеть еще и сами изменения, по типу удалили такое-то слово в такой-то строчке.