Как правильно настроить и обслуживать связку Microsoft SQL Server и 1С?
Самое первое загляннуть в коробку из любого продукта 1С и найти там книгу Клиент-серверный вариант. Руководство администратора

Ну очень занимательно чтиво, остальное опыт.
Если вы располагаете сервер приложения 1С-Предприятия и  MS SQL сервер на одном физическом компьютере, то последнему нужно настроить ограничение использования ОЗУ по формуле, которую можно найти в сети.