Можно ли запустить php-скрипты на разных ядрах?
Да, это разные процессы.
Да, каждый процесс будет обрабатываться своим ядром.

Что значит "вместо PHP_CLI использовать PHP-FPM"?
В консоли вы можете запустить сколько угодно процессов. А PHP-FPM сам балансирует количество потоков в зависимости от настроек.
Да, это разные процессы.
Да, каждый процесс будет обрабатываться своим ядром.

Что значит "вместо PHP_CLI использовать PHP-FPM"?
В консоли вы можете запустить сколько угодно процессов. А PHP-FPM сам балансирует количество потоков в зависимости от настроек.