Как решить проблемы с правами?

sudo chmod 775 /var/www
sudo chmod -R 775 /var/www
За такие права надо бить по рукам и отрывать все что отрывается. Зачем у вас всем в группе право на запись в директорию? Зачем у вас все файлы запускаемые?
chmod 750 /srv/www
chmod -R 640 /srv/www/ 
P.S. Директория содержащая данные отдаваемые веб-сервером уже больше 13 лет не должна находится в /var, это — пережиток прошлого, для таких целей существует /srv, читайте FHS.
Apache, MySQL останавливал когда давал права на запись?