Как запустить одновременно несколько веб-приложений под node.js?
Надо поднимать nginx и создавать в нем два домена, каждый будет проксировать свое приложения. Нодовские приложения придется переместить с 80 порта на что-то незанятое (каждое на свое). Примерный конфиг для одного такого приложения:upstream app1 {
    server 127.0.0.1:3003; # порт, который слушает приложения
}

server {
    listen 80;

    # черновики для разных серверов, раcкомментить нужный по необходимости
	
    # home box
    #set $apppath /home/hogart/projects/app1;
    #server_name app1.local;

    # beta
    #set $apppath /home/hogart/app1;
    #server_name app1.kitmanov.name;

    # production
    #set $apppath /home/hogart/app1;
    #server_name app1.info;


    root $apppath;

    # раздача статики
    location ~ /style|js|img/ {
        root $apppath/public/;
        gzip on;
        gzip_static on;
        gzip_types text/css application/x-javascript;
        gzip_proxied no-store no-cache private expired auth;
    }

    location / {
        proxy_pass http://app1; # из upstream (см. выше)
        proxy_http_version 1.1;
        proxy_set_header Upgrade $http_upgrade;
        proxy_set_header Connection 'upgrade';
        proxy_set_header Host $host;
        proxy_set_header X-Real-IP $remote_addr; # удалить, если приложению не нужен реальный IP юзера
        proxy_set_header X-Forwarded-For  $proxy_add_x_forwarded_for; # удалить, если приложению не нужен реальный IP юзера
        proxy_cache_bypass $http_upgrade;
    }
}
Согласен с Константин Китманов , надо ставить перед нодой nginx и запускать каждый нодовский процесс на своем порте. Снаружи будет видно только nginx на 80-м порту, а внутри нодовские процессы могут иметь хоть какой порт.