Что такое «Внешняя скорость передачи данных» HDD?
Очень странное описание задачи или вопроса. 
Смотрите очередь на диск или время отклика и всё станет понятно, если растёт - значит он не успевает. 
SATA 6Gbit/s - скорость интерфейса. Это максимальная скорость, с которой способен работать интерфейс диска, а сам диск, с такой скоростью, сможет вам, разве что, отдать свой кеш, не более того. Даже не все SSD на такое способны (работать с такой скоростью).
Судя по формулировки вопроса вам лучше всего обратиться к специалисту.
Если кратко, скорость обычного жесткого диска в пределе 150мбайт/c, при случайном доступе может падать вплоть до нескольких мбайт в секунду. Проверить есть ли проблема с производительностью диска можно через очередь команд к диску( есть такая метрика производительности ).