Нагрузка HDD вызывает сильные лаги
Обратите внимание на SSD.
У меня такие же симптомы при обновлении/скачивании в Steam. Valve вроде бы исправляли это в одном из патчей клиента, но сильные тормоза присутсвуют и по сей день. Вот несколько похожих тем на форумах Valve.

Поскольку HDD — узкое место в быстродействии сегодняшних компьютеров, понятно, что если Steam загружает его на 100%, то другие приложения так тормозят.

Что делать? Разрешать Steam делать свои дела, когда ПК простаивает.