Взлом сайтов. Вставлен произвольный код?
это был взлом пароля на фтп, вероятно. Очень вероятно, что на компе разработчика поселился троян, который и выдал пароль злоумышленникам.
Как защититься? Переходите на Линукс на рабочих странциях :) Другой вариант: некоторые хостеры предлагают ограничить фтп-доступ определёнными айпишниками — воспользуйтесь этой возможностью.
Ну и, конечно же, поменяйте пароль на фтп после тщательной проверки на вирусы всех компов, где этот пароль мог засветиться.
У меня было один раз такое, скрипт правда другой был, но не суть. влезли тоже через фтп.
Теперь я вдирект админ раз в неделю делаю бэкапы. Удобно потом всё восстановить если что.