MySQL или MSSQL для крупного проекта?
Я бы не стал заморачиваться с поиском лучшего решения на пустом месте, если бы лучшая бд существовала, остальные бы умерли в неизвестности. В вашем случае я бы использовал MySQL, как минимум на начальном этапе, и вот почему:
1) Это бесплатно
2) Мускуль - хороший добротный середнячек своего класса, то есть он умеет почти все и при этом сильно не проседает по производительности.
3) На него ОГРОМНОЕ количество доков и юзеркейсов, а так же туториалов и советов по оптимизации в конкретную задачу.
4) При смене бд(если таковая понадобится) вам, скорее всего, придется только поменять драйвер бд(при условии грамотной архитектуры) и аккуратно перенести дамп базы.
5) Про MSSQL -  до недавнего времени в ней не было нативной поддержки UTF-8, вместо нее была(и есть еще вроде) своя UCS, которая мультибайт, но какой-то свой(как всегда у мс), в свое время в угоду "скорости" ставили сервак с мсскулем, в итоге практически никакого прироста не получили, зато получили гемор с переводом кодировок.
6) Если проект реально нуждается в разрывном бд на пределе современных возможностей - смотрите в сторону инмемори бд, например тарантул или что-то носкюельное, типа редис и иже с ним.
Возможно, я не помогу конкретно по этому вопросу, но для крупных проектов выбирают PostgreSQL или самописную СУБД.