Как установить на одном компьютере несколько независимых windows?
Если параллельность не требуется, то Вы сами ответили на свой вопрос. :-)
Установить одну веньду, зарегистрировать несколько профилей и в каждый профиль до-установить определенное программное обеспечение и/или настроить его. Это логичней, чем виртуальные машины или несколько операционных систем.
Если хочется полной независимости и одновременно не баловаться с виртуализацией или разбивкой на разделы, то можно делать так - habrahabr.ru/post/49670 или gotch.techfaq.ru/archives/91