Есть ли у нас аналог DARPA?
Если кратко, то нет. 
Если подробнее, то (… много мата...) нет. 
Вообще у истории забавные казусы. 
В СССР была очень грамотная система планирования R&D вообще — государство заказывало не просто отдельные изыскания и проекты, но систему целиком (то есть страна покупала не просто новый самолёт, а завод по производству этих самолётов вместе со всеми патентами, смежными производственными линиями, ремонтными базами и так далее). Американцы очень кусали локти по этому поводу, так как экономия для государства получалась колоссальной. 
С другой стороны, результаты отдельных исследований и патенты, хотя и принадлежали формально государству, охранялись намного строже, чем в странах дикого капитализма — и не из-за режима секретности, а чтобы о них не пронюхали парни из соседнего НИИ. В итоге страна владела кучей изобретений, которые не покидали родной завод.
Кстати, в нашей стране, в советское время, разработкой цифро-аналоговой связи (и оборудования, и протоколов и прочего) на дальние расстояния занималось МПС для нужд советской железной дороги. Вполне себе аналог DARPAnet, со временем могло бы вырасти в советский аналог интернета.