Стоит ли в моём случае пытаться перейти из Embedded в Backend?
 Получаю копейки (около 80К после налогов).

Определённо стоит искать новое место работы. 
Джуны на джаве получают больше.
Тут, например, пишут что C норм и вакансии есть на hh. Ваш опыт уж точно лучше чем мой админский - будет легче учить второй язык чем мне, как мне кажется, а я уже в процессе и что-то даже получается. Возможностей для самообразование сейчас много, нужно дать себе время и возможность попробовать - вдруг не понравится java, потом составить план со сроками и действовать. Потом искать.  Желаю успехов.