Миграция на Linux?
Скайп — работает как родной (правда версия немного подрезанная)
VLC — имеет все нужные кодыки
ГИМП — к сожалению не заменяет фотошоп, если много слоев сделанных в фотошопе. то работать будет дисскомфортно (решается ВАИН)
Notepad++ — этих аналогов как собак недорезанных :) Линкс выбирают ИТшники и блокноты для кодинга для них как воздух
Трансмисион — отличный тореннт клиент, но вот с большим количеством его не пробовал

Есть 2 аналога Иллистратора я говорю про мощные векторные редактора Инскайп и СК1, правда оба уступают иллюстратору, но тут зависит насколько вы серьезно работаете с иллюстратором (под ВАЙНом у меня запустить не вышло, правда такой целью не задавался)

С аудиоплеерами завтык, пока не нашел идеальной замены, хотя бы уровня винампа :(
Видеоплеер: UMPlayer или SMPlayer.
Аудиоплеер: Clementine
Torrent: Azureus
Notepad++: gedit (под Gnome/Unity) или Kate (под KDE)
RSS читаю встроенным в Оперу ридером (она же и вместо почтовика)

Вид папок, если так хочется, можете настроить с помощью символических ссылок. Есть также дистрибутивы, в которых оно уже так настроено.

Вместо выбора KDE vs Gnome рекомендую попробовать Unity, весьма неплохая штука получилась.