Как организовать резервное копирование Windows?
Во первых есть встроенная архивация  -  прекрасно работает, и без проблем делает снимок состояния системы из которого потом можно восстановить систему.
Во вторых - есть прекрасная утилита Руссиновича disk2vhd которая без всяких заморочек делает образ указанных дисков.
Причем имеет как GUI так и CLI, в общем можно делать по расписанию из батника образ. Еще этот образ удобен тем, что его можно моментально подключить к VM и загрузиться с него.

В обоих случаях делается теневой снимок тома (снапшот), поэтому оно делается на лету, без перезагрузки и в любое время.  Ну  и разумеется копирование не посекторное - копируется только занятое файлами место.

Например пользователю переставили систему с windows 7 на  windows 10, и через неделю обраружилось что пользователь не помнит пароль от онлайн сервиса, в старой системе он был у него сохранен в браузере и нужен криптоключ и сертификат которые хранились в реестре старой ОС - загружаем виртуальную машину с резервного диска и вытаскиваем все, что нужно.

На диске С: в Windows 10 есть файлы, жёстко привязанные к секторам, которые нельзя перемещать?Нет.

Понятно, что все копируется, но вот заработает ли этот бэкап после восстановления?Все люди деляться на три типа

Те кто не делает бэкапы.
Те кто делает бэкапы
И те кто не только делает бэкапы, но еще и проверяет их.

Veeam бекап попробуй. агент бесплатен даже. А так способов куча.