Несколько доменов, 1 сервер. Какой нужен сертификат SSL?
Есть несколько вариантов. 
Либо сертификат Wildcard, если необходима защита субдоменов типа:
payments.yourdomain.com
login.yourdomain.com
mail.yourdomain.com
Либо мультидоменный сертификат, если необходима единая защита для разных доменов типа:
www.website.com
any-domain.ru
secure.website1.co.uk
Но, зачастую, в стоимость такого сертификата включено только несколько доменов (например 3) и есть необходимость доплаты за каждый домен сверх тарифа.
Так что можно рассмотреть вариант и простого сертификат, на каждый домен. 
В зависимости от того, что будет выгоднее в данной ситуации.
Спасибо.
Резжевали :)