Какими способами осуществляется выгрузка и поддержка большой (от 5000 позиций) БД в интернет-магазине?
У меня в тестовом больше записей)
Как хочешь, любой способ подойдет! Это мало
Если все от поставщиков то просто скприт импорта + синхронизация
ничего удивительного вроде нет 
так работает чуть ли не каждый второй магазин в интренете