Стоить ли углубится в изучение HTML, CSS и Java или выучить так что бы было понятно?
Java и JavaScript разные языки. 
В случае веба, это JavaScript.
Не совсем понятно, зачем Вам еще и Python ? 
Везде не получится стать хорошим специалистом. 
Выберите, что Вам больше нравится, и на этом сконцентрируйтесь.
Если везде форсят Питона, то это не повод его изучать. 
У Вас получится достичь успехов только в том, что Вам искренне нравится. 
Мода проходит и просто зря время потеряете.
На счет Java ничего не могу сказать, как по мне это удел разработки сервисов, но поправьте меня знатоки, если это не так.
Python — отличный язык для разработки как простых сайтов, так и полноценных приложений. При всем при том, что подавляющее большинство сайтов разработано либо на голом html, либо на php.
Если цель — стать крутым спецом в разработке, вперед и с песней осваивать питона или пыху, если хочется упростить себе жизнь — посмотри на общие сведения языка, обзорная экскурсия занимает пару часов (у кого-то, может, быстрее, у кого-то это дни), и углубляйся в какой-нибудь фреймворк, там копированием из гайдов с разбором подтянешь и сам язык (наверное).
Для этих языков хватит общего понимания html+css, если ты хочешь стать человеком-оркестром, но лучше выбрать направление фронт или бэк уже сейчас.
Если это все же была опечатка и ты не отличаешь Java от Javascript, то рекомендую сперва разобраться в теме.