Windows 8.1 на SSD SATA3 через сontroller PCI-Ex1?
стоит ли заморачиваться на ССД или не парится и купить обычный хдд с учетом что на новом диске должны будут хранится локальная бд от 1ски на 2 гига? 
- думаю стоит.
Сама 1с от SSD быстрее работать не будет конечно, но вот система установленная на SSD заметно ускорится и работать будет намного комфортней.
Тут принцип следующий -
если на физическом диске кроме одной базы 1с ничего нет, то прирост производительности от замены hdd на ssd будет равен нулю.
А вот если там будет несколько баз, или будут лежать еще какие то часто используемые данные, и тем более стоять система, то прирост будет приличный. 
С контроллерами типа таких, что вы указали лучше не связываться, а если все таки купили, то лучше сразу выбросьте в мусорное ведро.
И самое главное зачем вам SATA3 ? SSD прекрасно работает на SATA2, так что просто купите SSD и поставьте вместо диска.
UPD.
Не заметил такой момент-хром кеш вынести на старый хдд - ровно наоборот.
На SSD следует размещать файлы с которыми часто идет работа, и от которых зависит быстродействие, т.е - кэши браузеров, темпы, файл подкачки, документы с которыми активно работают.
На HDD выноситься статичная информация, к которой редко обращаются - архивы, редко используемые документы, файлы большого размера.
Что же вариант отпал с контролером , тк на матери PCI-Ex1 v1.1 а на контроле 2.0
Насчет загрузочный диска с контроллера- можно если будут предустановлены драйвера во время установки windows, пишут что с 7ки все ставится без проблем с дровам по дефолту.
SSD sata3 on sata2- windows 8.1 1c с бд + офис? стоит ли заморачиваться на ССД или не парится и купить обычный хдд с учетом что на новом диске должны будут хранится локальная бд от 1ски на 2 гига?