Посоветуйте бесплатную CMS для документооборота
Может docs.google.com? Бесплатно и делает, то что нужно.
Если выбирать именно среди цмс, а не полностью готовый решений, то я бы посоветовал MODx (Evolution) Крайне удобный интерфейс и структура документов безконечной вложенности.