Какую файловую систему лучше выбрать для домашнего NAS?
Выбор фс зависит от контента, который собираетесь на ней хранить. Например для стопки маленьких файликов я бы посоветовал raiserfs, для хранилища скажем фильмов XFS, для системы само собой журналируемый ext4. Также стоит не забыть про LVM т.к. придет время и понадобится расширять пространство.
Пользуюсь ext4 поверх lvm под файлопомойку и торренто качалку. Хороший вариант.