Что будет если на dcdc преобразователь подать немного большее напряжение, чем в спецификациях?
У вас совершенно неправильный подход. 
светодиод, который потребляет 9 вольт.Светодиод питается не напряжением, а током. Попытка питать его напряжением скорее всего приведёт к его сгоранию. Обычный современный светодиод высокой яркости (SMD или выводной) потребляет от десятых долей миллиампера до нескольких миллиампер, а какое при этом будет питающее напряжение - да хоть 1000 вольт.
Я прочитал, что могу купить dcdc преобразователь, что бы снизить напряжение. Да, есть такие преобразователи, но для питания светодиода вам нужен источник тока (их ещё называют стабилизаторами тока или LCD -драйверами). Напряжение они тоже снижают до уровня, безопасного для светодиода.
спецификациях указано входное напряжение 3-40V. Что будет, если я подключу аккумулятор на 42v?Поскольку вы при этом превысите предельно допустимое значение входного напряжения этого преобразователя, то как правильно заметил Армянское Радио, "как повезёт". Если у этого девайса есть конструктивный запас по входному напряжению (а обычно он есть, только мы не знаем, насколько), то может быть, некоторое время он проработает - до первого броска входного напряжения. Если запаса нет, сгорит сразу. Вам надо выбрать LCD-драйвер, дающий нужный вашему светодиоду ток (прямо по даташиту), а его диапазон рабочих напряжений должен включать в себя ваши 42 вольта - ну, что-то наподобие 15...60 вольт. Если требуемый для светодиода ток невелик, то в качестве такого драйвера сгодится обычный резистор, его сопротивление легко считается по закону Ома.
Может, сгорит, может - не сгорит. Как повезет.