Как скрыть программу в windows?
1. Секрет нет - да, следит.
2. Дамеваря смотреть скрытно рабочий стол - да запросто.
3. Безы и админы - боги в домене, а вы юзеры. Скрывать от богов что-либо практически невозможно.
В этой ситуации только один вариант, да и то, если не запретили - веб-обходы. Поставить дома консоль с веб-доступом, купить (попросить у кого-нить) домен (ну, пусть будет) третьего уровня. и ходить (не часто) к себе домой по-вебу.
С доменом, теоретически, могу помочь. И настроить всю кухню. Теоретически - ибо я не знаю, что за организация и какие бумаги при трудоустройстве подписывали. Ну и опять же, реальная необходимость? С веб-доступом можно и с телефона домой лазать...
Как-то так.
П.С. А ГПРС-глушилок-то нету надеюсь?
teamviewer - это по сути VPN с сервером в интернете. Соответственно со стороны сервера вы уязвимы, т.е. если нужно то они получат любую информацию с любого компа подключенного к VPN, а так же с любого, который находится в одной сети с подключенным  к VPN.
Выход - любой альтернативный вариант VPN. Советую OpenVPN.
К тому же OpenVPN можно не устанавливать в винду, а использовать "портабельную" версию - это поможет скрыться от безопасников (тут зависит больше от политики безопасности, если у вас в конторе совсем параноики - то не поможет и вообще - ничего тогда не поможет, но т.к. вы пользуетесь тимвьевером, то видимо не совсем параноики и шансы есть).
Для работы VPN без сервера в интернете, хорошо бы дома купить у оператора статический IP адрес, но можно обойтись и настройкой DDNS.