Что надежней внешний USB 2.5 или внутренний SATA 3.5 винчестер?
Расходники.
Не имеет значения.Есть ли более точное понятие или знание, что какой то из этих дисков хранит данные на много дольше. 
Никакой. Это расходники. Все накопители - расходники. То что накопитель даёт прочитать то что ранее записали - не более чем случайность. Не будете вдруг терять данные только если примете эту мысль. Для важных данных 3 и более копий по разным накопителям - норма. В том числе географически разнесённые.
На горизонте сохранения данных в десятилетия задача решения не имеет вовсе. Да, это проблема современного мира.1й более ударнопрочный
Не бывает ударопрочных HDD. Чисто по физическому устройству этого класса накопителей.
В Samsung вроде стоит шпиндель Seagate. Принято считать диски Toshiba надежней. Самыми надежными многие называют Hitachi.