Можно ли отформатировать или убрать тома в один на жестком диске, подключенном через SATA — переходник?
Можете.
Могу ли я сделать это через стандартную утилиту "Управление дисками"? Возможно, но не факт.
Обычно все прекрасно удаляется оттуда, но некоторые разделы могут быть недоступны для удаления.
Если что-то не удаляется - через командную строку делайте.
Утилита diskpart
Выбираете нужный накопитель и делаете ему clean - это удалит всю разметку.