Как хранить массивы в базе данных?
1. serialize/unserialize (для хранения в БД самое то)
2. JSON (если нужен обмен через AJAX без преобразований)
по строке на элемент
а вообще, вам нужно посмотреть в сторону документо-ориентированных, в частности в сторону mongo