Как настроить hotspot в уже имеющейся среде?
Да, реально. Сценарий годный, не самый оптимальный, но годный. 
Проблемы будут с теми девайсами которые должны получать инет просто так (без всякой левой хотспотовской авторизации), камеры принтеры и тыды. 
В общем случае всё будет работать так:
1. Для всех устройст микротик становится шлюзом по умолчанию
2. Всю сеть l2 замыкаете на него и пускаете трафик именно через микротик, если у вас все роутеры связаны медью - то микротик в тот же свич, если часть из них репитеры \ ретрансляторы, то тик подключаете к основному, остальные без изменений. 
3. На тике настраиваем Хотспот, тюним его и тыды. 
4. Выделяем группу устройств - даём им интернет. Если Asus поддерживает VLAN и несколько SSID - то лучше для организовать вторую сеть - закрытую с блекджеком и шлю усиленной авторизацией но без hotspot.
1) Да
2) Все точки в режим АР перевести, чтоб они были не роутерами.
3) Да, поднять хотспот на любом существующем сервере либо перепрошить роутеры на прошивку с хотспотом.