Изменения регистров сведений многих файловых баз 1С?
Пишется обработка на языке 1с делающая необходимые действия - получение информации из регистров сведений, их изменение, и.т.д.
После чего она просто запускается - вызываете из командной строки 1cv8.exe с параметрами передавая путь к этой обработке.
В результате база запускается, и выполняется обработка.
Как запустить программу на удаленном компьютере - это уже другой вопрос. Если домен, то можно использовать средства AD.
Если нет - да кучу вариантов можно придумать, в тот же планировщик задачу можно закинуть.
Так же можно опубликовать базу и открывать ее удаленно в браузере.
Так же можно опубликовать веб сервисы и делать запросы напрямую к базе.
В общем вариантов куча.
А какой выбрать это надо смотреть по задаче -как часто делать надо, с каждой базой персонально работать, или всем одинаковые настройки грузить, есть ли возможность опубликовать базу - белый адрес, и все такое.
Как альтернативу способу с запуском 1с из командной строки, можно использовать com-соединение. Данный способ удобен, если базы находятся в одной подсети. Реализуется внешняя обработка, в которую выводим шаблон настроек, перечень баз, и механизм подключения. Затем подключаемся по списку к базам и проводит необходимые действия(установка/чтение параметров и.т.д.).
Но как и в варианте с командной строкой, необходимо реализовать обработку на языке 1с. А так многое зависит от нюансов.