Как конвертировать pdf в html и обратно?
Алгоритм работы построен неверно, ибо исходит из ошибочной предпосылки возможности 100% корректной конвертации PDF в HTML.
Лучше бы вам вернуться к ТЗ и изложить его. 
Есть, например, возможность использовать PDF как подложку для нового PDF.
Кроме того, формат PDF предусматривает поля для заполнения (формы в PDF обычно делаются именно с их использованием).
А ваша идея - это колхоз на костылях, нормального результата она не даст, только время потратите.
из PDF в HTML https://packagist.org/packages/gufy/pdftohtml-php
из HTML в PDF https://packagist.org/packages/tecnickcom/tcpdf2. Заменяются необходимые участки файла на выбранные пользователем, также дата, ФИО и тд заполняется автоматом.
вот с этим, я уверен, возникнут большие проблемы учитывая что исходные данные предоставляются в PDF.