Какая команда закрывает программу?
Тогда сначала научитесь пользоваться Google!
stackoverflow.com/questions/2670956/how-to-quit-a-...
2 способа для java: 
1) System.exit(status) - закрывает приложение нормально, вызывая перед этим shutdown-хуки.
2) Runtime.getRuntime().halt(status) - закрывает программу экстремальным способом не вызывая хуков.
Первый способ предпочтительнее. Если не понятно что такое shutdown-хуки, то гугл в помощь.