Настройка php-fpm
В www.conf user/group указаны?
Для них установлены права на запись?
chroot это chroot и к правам доступа отношения не имеет. Равно как и chdir (это cd в шелле).
Вас интересуют параметры user = и group = и установка соответствующих прав на папки в которые собираетесь писать.