Можно ли подключить кулер к флешке?
Не совсем понятно, что вы хотите получить в итоге. Если считаете, что флешка перегревается, и ее нужно охлаждать, и вас не пугает то, что габариты кулера в разы превосходят габариты флешки, то пожалуйста! 
1) Убедитесь, что поверхность чипа — самый выступающий элемент на плате (мне, например, кажется, конденсаторы С5 и С2 выступают сильнее)
2) Установите радиатор, не забыв про термопроводящую пасту/клей. Как вы его будете крепить — ума не приложу :) Убедитесь, что радиатор не замыкает ничего.
3) Прикрутите сверху вентилятор. Питание на него можно подать прямо от USB, ничего сгореть не должно.

Если это моддинг-проект, и нужно просто установить вентилятор, чтобы он красиво крутился — только пункт 3.
Только вот зачем это всё автору, он так и не сказал.