RSTP — как изменить рут порты?
Вопрос: как мне сделать так, чтобы разрыв был между "Отдел гл. энергетика" и "правое крыло" ?
Для этого необходимо, на мой взгляд, увеличить значение cost для этого линка с каждой стороны до достаточно высокого значения.
Теперь, что касается этого самого значения. Учитывая гетерогенность вашей сети, стоит убедиться, какие именно значения cost установлены для каждого из интерфейсов, участвующих в RSTP-процессе. Они могут быть как 16-, так и 32-битными, насколько мне известно. Если все значения cost установлены  в 4 для гигабитных и 19 для 100-мегабитных портов, должно хватить значения cost 300 для  соответствующего линка (с каждой стороны, на случай дальнейшего изменения корневого коммутатора).
Необходимо также убедиться, что каждый из вышеупомянутых интерфейсов работает в полнодуплексном режиме (т.е. является, с точки зрения RSTP, p2p-портом). Это необходимо для корректной обработки изменения топологии (topology change). 
Если это не поможет и возникнут дополнительные вопросы, то будьте добры, потрудитесь нарисовать нормальную читаемую схему сети с необходимой информацией (bridge id каждого коммутатора, cost для каждого интерфейса, участвующего в RSTP).
в итоге:
посидел покурил протоколы, на одном свитче стоял древний протокол, изменил на свежий. На еще одном свитче на линках был включен edge, выключил. Повключал везде, кроме магистральных линков, portfast\edge. Задал приоритет рут свитчу 12288. 
Теперь изменения топологий на всех свитчах обозначается правильно, при падении линка в течении 30-60 секунд трафик начинает бежать в обход. Проверил пока только на паре свитчей, до конца недели остальные проверю. Пока все работает - все стабильно.