Что за абсурд с этим жестким диском?
HDD был загрузочным, а система стоит на другом диске.
Теперь вам нужно восстановить загрузчик и разместить его на тот диск, на котором система.
В общем загружайте компьютер с установочного диска и восстанавливайте загрузчик.
Системный и загрузочный диск - это не совсем одно и то же. Если речь про Windows - то надо восстановить загрузку  с установочного диска, инструкций хватает. Сталкивался с таким, тоже сразу не мог понять - почему система не грузится.