Можно ли использовать стек MEAN для цифрого магазина?
Можно. 
Можно вообще использовать любой стек, ибо решают люди, а не языки и технологии.
Можно. Но, как мне кажется, нужно обратить на момент seo. Этот стек предполагает создание SPA приложений, т.е. 
когда страницы генерятся в браузере посредством javascript, что может плохо сказаться на выдаче в поиске. Также еще момент, что потребуется больше времени на разработку, так как придется все писать с нуля самому. Потому, может, стоит остановиться на wp+woocommerce.