Одинаковая версия пакетов на всех Debian серверах?
Если я правильно понял суть вашей проблемы, то можете посмотреть в сторону apt-cacher (статейка в тему) или apt-cacher-ng.
В вашем случае они вероятно будут экономичнее apt-mirror по трафику и занимаемому месту.
Всё куда проще. Есть snapshot.debian.org
Выбираете нужный снэпшот, устанавливаете репу и раскатываете все сервера из неё через Expert Install.
Если машин много, смотрите в сторону chef/puppet/ansible.