Как настроить сервер php + msql для сети?
Как вы будете отлаживать все на одном сервере? Ответ: никак.
Потому, у каждого свой локальный сервер, программисты постигают дзен гита, перед выкаткой все мерджится и тестится на каком-то из серверов а с него уже на продакшн.
Перешли на git контроль версий  https://bitbucket.org теперь горя не знаем + проекты в приватных репозиториях всегда под рукой