Чем лучше шифровать трафик между приложениями на разных серверах?
Zabbix 3.0 умеет шифровать трафик https://habrahabr.ru/company/zabbix/blog/277739/
Что лучше знаешь или в чем быстрее разберешься - без разницы.
Может просто наткнешься на хорошую инструкцию.