Есть ли скрипт для автоматической настройки сервера с нуля?
То, что вы ищете называется ansible
Обычно, если покупаешь какой-нибуль VPS, то на нем уже установлен пакет необходимых программ, всякие nginx, php, mysql. Если у вас не так, то наверняка в сети можно найти готовые скрипты, нужно лишь немного погуглить. Но здесь же возникает много нюансов: какая ОС у вашего сервера, какой набор программ вам нужен, да и собственно какие еще настройки вы хотите сделать. Если же использовать упомянутый ansible, то например вот здесь есть куча готовых решений на все случаи жизни,
апач+остальное: https://galaxy.ansible.com/fvarovillodres/lamp
nginx: https://galaxy.ansible.com/larixsource/lemp