Система управления проектами на PHP+MySQL
используем qdPM — для небольшой фирмы — самое то!
совсем не монстр, удобная, лёгкая к восприятию.
и очень адекватный разработчик (были вопросы по специфичной конфигурации).
рекомендуюю.
Я бы посоветовал Redmine (правда он на Ruby).