Освоение Debian для новичков?
Извините, но это не по Хуану сомбреро будет :) Такая задача даже для человека с солидным опытом работы с линухом - непростая, несмотртя на то, что он представляет, как это все будет работать. А Вы просто сломаете все и ничего собрать не сможете.
Япония - не Европа (когда я начал перевод Princess Evangile - я это несколько раз написал), Линух - НЕ винда. Тут все по-другому, тут идеология другая. Да, все можно сделать, особенно если у вас обычная продаванская контора, где нет забубенного инженерно-конструкторского софта (как у нас). Но для этого требуются твердые, четкие знания - как это работает.
НЕ делайте этого! Сначала изучите, освойте, наработайте практику - потом ломайте то, что работает, если останется желание. Поставьте на виртуалке или на отдельном сервере где-нибудь сбоку, поднимите тот же заббикс, файлопомойку какую-нибудь и т.д. 

Используется линукс в основном на серверах. На десктопах - не очень. Централизованную авторизацию можно сделать, централизованное управление - тоже. На удобства как в АД не рассчитывайте. В целом я не вижу причин переводить упомянутую инфраструктуру на линукс, хотя место паре-тройке линуксовых серверов там найдется.