В связи с чем флешки ведут себя очень странно?
Также появилась проблема, похожая на печально известный баг #12309 - при передачи файлов на флешку начинает дичайше тормозить компьютер, курсор перемещается отрывисто, и т.п.
Вот, например, сегодня, совершив 3-4 попытки, файлы все таки удалились. Начал скидывать на флешку файл в 1.5 гига, начал тормозить компьютер, в итоге все скинулось. Есть еще несколько странностей при передаче данных. Скидывая, к примеру, 5 файлов в 575 МБ, прогресс в статус-баре быстро доходит до 570 МБ, зависает на некоторое время, отвисает, затем опять быстро доходит до 1140 МБ (как будто, загрузив уже два файла), зависает, и т.д. 
Это долбанутость системы ввода/вывода Linux. Когда программа пишет какие-либо данные на диск, на самом деле они пишутся в память, а непосредственная запись происходит при достижении этим буфером размера, заданного параметром sysctl vm.dirty_ratio, который задаётся в процентах от объёма доступной ( MemFree + Cached) оперативной памяти(на самом деле может быть раньше, но об этом ниже). На современных системах порой получается дохрена (в вашем случае ≈ 570 Мб) и в момент записи устройство начинает офигивать от внезапно свалившегося потока данных на запись ( сколько там скорость записи у вашей флешки? 15-30 Мб/с в лучшем случае? ), а вообще все процессы, использующие какой-либо диск, наглухо блокируются до освобождения буфера. Если таких процессов много, то все ядра процессора повисают в iowait и система начинает заметно лагать.
Чтобы как-то жить с этой фигнёй, надо настроить размеры буферов таким образом, чтобы процесс сброса не вызывал блокировку на длительное время. Например:
sysctl vm.dirty_bytes=10485760
sysctl vm.dirty_background_bytes=2621440
vm.dirty_bytes - аналогично vm.dirty_ratio, но в байтах, а не процентах от сферического коня в вакууме. Если задано vm.dirty_bytes, то vm.dirty_ratio обнуляется и не учитывается.
vm.dirty_background_bytes - тоже самое, но для фонового процесса сброса данных (pdflush), который периодически просыпается и смотрит, не надо ли скинуть что-то на диск ( он может начать сброс раньше, чем заполнится буфер, а может и не начать, если не успеет проснуться (= ).
Это слишком низкие значения, но вашу проблему должны решить полностью. Поиграйте с циферками, чтобы подобрать значения, при которых данные не будут писаться слишком часто и система не будет подвисать при копировании на медленные устройства. Сохранить их между перезагрузками можно через /etc/sysctl.conf.Затем, извлек и вставил обратно флешку, и она перестала читаться, ссылается на Input/Output error. 
Если флешка с индикатором записи, то не вытаскивайте ей пока он мигает, даже если ваш файловый менеджер говорит, что уже можно (он, скотина, врёт!). Если индикатора нет, то просто пойдите заварить себе чайку после нажатия кнопки отмонтировать/извлечь или как там её.
PS Указанные параметры достаточно подробно описаны в документации
PPS мог что-то напутать в деталях, так как время уже позднее, но параметры точно те.
На арче, с ядром 4.10 или 4.11 тоже были проблемы с флешками, но другие. При включении флешки с 3.0 файлы скидывались очень медленно, и более того, не было гарантии, что они все таки сбросятся.