Как реализовать базу данных с 100 000 000 (100 млн.) записей?
1) Покажите схему таблицы
2) Покажите данные которые загружаете
Самый быстрый способ это загружать напрямую из фаила чарез LOAD DATA INFILE 'mydata.csv' INTO TABLE 'xxx';
Собственно: dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/insert-speed.html