Что означает эта фраза в документации?
Речь в документации идет о том что не стоит полагаться и использовать для серьезных проверок информацию из $_FILES['userfile']['type'], а стоит самому определять MIME-тип файл, например с помощью функции mime_content_type
Если на стороне PHP то можно использовать echo mime_content_type($filePath);