Кто знает аналог NppFTP Linux?
sublime -  уже давно популярней notepad ++
phpstorm - для  сложного кода  
Теперь про FTP  я бы на вашем месте задумался зачем вам вообще хоть какая-то утилита для редактирования
Ведь linux может с легкостью монтировать FTP как локальное устройство
А монтировать умеет любой местный навигатор , есть ли смысл при этом использовать плагины и тд ересь? когда вы можите просто работать локально. При том все это уже в дружелюбном GUI
Sublime рулит, даже за лицензию денег не жалео