Как игнорировать .gitignore?
в .gitignore перечислены шаблоны имён файлов, которые гит будет игнорировать и не будет предлагать добавить в репозиторий, однако если файл уже есть в репозитрии и при этом также его имя соответствует одной из строчек файла .gitignore, то гит будет с ним работать как и со всеми прочими.

Ваш вопрос сформулирован очень непрозрачно. В репозитории скорее всего вообще нет файлов, которые перечислены в gitignore, но если их добавили вручную, или они попали в рпозиторий до добавления в gitignore, то вы получите их локально наравне со всеми остальными файлами в репозитории при обычном клонировани.

Так что независимо от того, что у вас написано в gitignore при клонировании вы получите абсолютно все файлы, что ииеются в репозитории, а тех, что там не имеются, вы, очевидно, не получите.
1. Удалить .gitignore
2. Сотворить все безумие
3. Вернуть .gitignore