Как сделать бекап с минимум использования диска?
Сейчас вам не хватает 20 Гб на бэкап, завтра вам не хватит свободного места на хранение новых данных. И это завтра наступит раньше, чем вы думаете.
Добавляйте дисковое пространство.
Как временный вариант - делаете бэкап 1 базы, архивируете, отправляете в амазон, потом другой и т.д. Требуемое дисковое пространство сведется к объему максимальной базы * 2.
Есть большой список ПО с поддержкой дедупликации (искать по "dedup")
https://github.com/restic/others
ZBackup неплох.