Какую роль играет PHP PDO и SQLite в «боевых» проектах?
по PDO — все ORM в популярных фреймах  работают с ней, но на прямую не нужно работать как правило
другое дело — если работаете без фрейма и с БД, то лучше всего работать через него
SQLite — нет, практически не используется
Учитывая ваши предыдущие вопросы — советую разобраться раз и навсегда с подключением, это не самый сложный момент
Незачем с одной стороны. Если уже есть MySQL
С другой - а почему бы там не хранить например конфигурацию