Где в Linux поднастроить, чтобы виртуальное окружение Python работало правильно?
Виртуальные окружения не переносимы, нужно было создать новое, а не копировать.
Лучше таким не заниматься, а иметь файлик requirements.txt и хранить там зависимости, которые при необходимости можно будет установить в новое окружение