Как перенести часть javascipt на сервер?
Несколько раз перечитал вопрос.
И ничего не понял.
php чем не устраивает? Делайте всю логику на нем, а клиенту отдавайте только результат.
А по поводу читабельности - клиент не увидит Ваш код, а если надо скрыть от остальных (ИМХО тут уже нелогичность), то можно использовать Zend Guard.