Почему занимаемое место в ОЗУ на VDS постоянно растет?
Память активно используется под файловый кеш
Перезагрузки быть не должно, ну наверно стоит включить свап файл
Контролировать нагрузку через панельку ISPmanager толком не получится. Залогинься на VDS через ssh и там уже смотри список процессов через команду top. Но уже на первый взгляд, средняя загрузка демонстрирует 300-процентную нагрузку на процессор - именно из-за этого скорее всего перезагружается VDSка, а не из-за загрузки ОЗУ. Тебе нужно подумать или о переезде проекта на более мощный VDS / выделенный сервер, или всерьез заняться оптимизацией работы MySQL и PHP-скриптов. Если это движок типа Joomla, то там нужно, где только возможно, включить кэширование запросов к БД.
Также есть некая вероятность, что твой сайт подвергается DDoS атаке, смотри сколько у тебя подключений к серверу этой командой:netstat -ntu | awk '{print $5}' | grep -vE "(Address|servers|127.0.0.1)" | cut -d: -f1 | sort | uniq -c | sort -n| sed 's/^[ \t]*//'