Что учесть разработчику стартапа, будучи наемным сотрудником в компании, чтобы не лишиться своего детища?
В трудовом договоре обязательно должно быть указано - как и на что работодатель получает исключительные права. В стандартном случае - на авторские произведения (программы), созданные работником в рабочее время, с использованием оборудования (ПК и IDE) работодателя. Обычно, если работник создаёт отдельный продукт, то от работодателя может быть задание на разработку, с описанием ПО.
В любом случае, бремя доказывания в суде, что работник что-то украл - лежит на обвиняющий стороне.
Разрабатывай его в своё свободное время и тогда никак не получится придраться.
Хотя даже в случае нжинкса негде придраться.
А по пунктам договора наверно следует уточнить, что разработчик может работать и над какими-то своими опенсорсными или не очень проектами в свободное время, и работодатель на них не претендует.