Как правильно обновлять vps?
Апдейти безопасности ОС сами установятся, но не перезагрузят систему
На всякий случай стоит проверить, включена ли фича с автоапдейтами у тебя
spin.atomicobject.com/2014/08/04/debian-ubuntu-sec...
https://help.ubuntu.com/community/AutomaticSecurit...less /etc/apt/apt.conf.d/50unattended-upgrades// Automatically upgrade packages from these (origin:archive) pairs
Unattended-Upgrade::Allowed-Origins {
        "${distro_id}:${distro_codename}-security";  // данная строчка раскоментированна
//      "${distro_id}:${distro_codename}-updates";
//      "${distro_id}:${distro_codename}-proposed";
//      "${distro_id}:${distro_codename}-backports";
};
Апдейти всего остального ручками
Ребутать лучше под своим контролем
Тем более пока впс не много
Если данную VPS вы арендуете, то не советовал бы настраивать автоматическое обновление, лучше руками обновлять нужные вам пакеты. Не дай бог вы зацепите что-либо, что требуется для работы самой VPS