Как создать собственную базу данных на PHP или javascripte?
Вы свой велосипед придумать хотите? Если вам не подходит mSQL (или подразумевалась MySQL?), то можете посмотреть в сторону sqlite3.
www.php.net/manual/en/book.sqlite3.php
В Python есть Shelve, например, его вроде как повторили на PHP
sourceforge.net/projects/phpshelve
Можно посмотреть в сторону SQLite
Если данных не очень много можно использовать JSON, с которым удобно работать и из PHP и из JS