Что значит ошибка: nothing to commit, working tree clean?
Вы забыли произвести сохранение после внесенных изменений ctrl/s, дальнейшие команды вводите только после этого.
Это не ошибка, а лишь констатация факта, что в рабочем каталоге не появилось ничего нового после предыдущего коммита, либо проект не содержит вообще никаких файлов, если вы делаете коммит в первый раз. 
Сомневаюсь собираетесь опубликовать пустой каталог. Скорее всего, вы зачем то пытаетесь заново создать репозиторий, который вы уже инициализировали ранее.