Почему процессор лежит на большой плате?
У процессора очень много входов/выводов, ну или просто контактов. Они сейчас и так еле умещаются на "переходнике" - посмотрите снизу процессора. Если его уменьшить - соответственно уменьшится площадь самих контактов, что черевато тонной проблем: от повышенной вероятности механического повреждения, до ненадежности соединения.
Для решения проблем с теплом, грязью и механикой. Корпус отводит тепло и защищает от ударов, вибрации, грязи и т.п.
Внутри корпуса чипа идеальная чистота, кстати.