Структура Laravel проекта .. Как правильно создать проект?
Читайте — https://laravel.com/docs/5.5/mix . И вообще, читайте документацию, прежде чем спрашивать.
Весь js и css код, который пишите вы складываете в директорию resources/assets/js и resources/assets/css. Затем, при помощи таких инструментов как gulp или webpack, вы собираете весь js-код и стили в 2 файла public/js/app.js и public/css/app.css.