JS include при сборке в gulp как реализовать?
вот в общем сам нашел варианта два ну и думаю этого достаточно будет. 
1. gulp-include лучшее решение если не делаете прям крупных проектов или там плагины какие то. И можно в добавок к нему попробовать gulp-sourcemaps  возможно им удастся еще и генерировать карты кому нужно. Но gulp-include можно не только js инклюдить  но и любые файлы даже html.
2. gulp-browserify для тех кто не хочет отказываться от gulp но тут есть много плющек и можно модульность организовать. Это уже для тех кто работает по крупному. 
Вот в общем может кому поможет это решение.
Если проект маленький то используй parcel. Пишешь один скрипт в консоли и все