Политика iOS по поводу Cookies
Если такая настройка сделана в браузере, она сделана с вполне определенной целью (хотя, конечно, как способ сохранения приватности весьма нелогичный). Вместо того. чтобы пытаться ее обойти, храните свои данные например в localStorage.
Сталкивались с таким при работе с мамбой, когда надо было приложения внутрь фрейма засовывать. Там же и описал отсутствие решения:

Готовьтесь к проблемам с сафари на iOS и iPad. По умолчанию в нем внутри фрейма не сохраняются cookie. На самом деле это политика приватности, и обойти ее никак нельзя. Единственный выход — определять то, что кука не выставилась и редиректить пользователя на специальную страничку где объяснять как поменять политику безопасности. Данный вопрос касается только того случая, если вам нужны сессии в вашем приложении.
Это действительно не обойти, вообще никак. Только просить человека самого включить или передавать сессию через урл.