Поможет лидефрагментация дисков RAID intel rms3cc080 при снижении производительности?
Не поможет, если снижение производительности не вызвано фрагментацией. В общем маловероятно что будет заметный эффект. Хотя дерфрагментацию все же надо делать время от времени.есть подозрение, что рейд контроллер самостоятельно делает _свою_ дефрагментацию. Это как?? Дефрагментация это устранение фрагментации файлов на ФС. Контроллер откуда может знать что такое файл???Если все таки запустить виндовую дефрагментацию, не ляжет весь рейд?Конечно ляжет. Он у вас и так нехило нагружен судя по всему, а дефрагментация это нехилая нагрузка, поэтому конечно же ляжет на время дефрагментации.Имеется RAID 1  из 4 дисков. Четыре диска в зеркале?
По поводу падения скорости я бы посмотрел SMART дисков.
Поможет, но несущественно. Во время процесса будите страдать. Рэйд не развалит.
Мой совет - запланируйте maintenance и сделайте raid 10.