Как отменить нумерацию определенных строк (td)?
Ах уж эти вездесущие скриптостроители:)
jsfiddle.net/gxejzg59table{
	counter-reset:test;
}
tr:nth-child(n+3):nth-last-child(n+3) td:nth-child(7n-2):before{
	counter-increment:test;
	content:counter(test);
}
Если вы и в пхп что то делаете, то что вам мешает, навесить классы на необходимые строки, а потом эти классы собственно уже и перебрать?
И в вашем коде вы делаете перебор столбцов, а не строк, так что я не понимаю, что у вас там в принципе работает...
Но если всё же хотите на яваскрипте, то можно так codepen.io/vitaliy_kirenkov/pen/LFEye