Как проверить состояние SSD диска в Debian?
Если рейд хардварный, то воспользуйтесь его средствами для диагностики:
https://wiki.debian.org/LinuxRaidForAdmins 
hwraid.le-vert.net
Если программный и оригинальные файлы устройств доступны - то smartctl -a /dev/sdN
Но для начала проверьте файловую систему посредством fsck из read-only, через liveCD или single-user mode
Есть программа fsck - она проверяет файловые системы на наличие проблем и устраняет их. Для устранения fs не должна быть смонтированан на запись, то есть проверить на штатно загруженном linux так корневые разделы не выйдет.  То есть надо загрузится не в эту ОС (с CD/DVD, флешки) и уже с неё смонтировать и проверить. Умеет так же искать битые блоки.
Есть программа badblocks - она проверяет именно диск на наличие сбойных блоков.
Есть программа smartmontools - она использует технологию самотестирования дисков (SMART) и показывает ее результаты.