Как подружить swiftmailer с яндекс.пдд?
Оказывается вот как надо:
protected function execute(InputInterface $input, OutputInterface $output)
{
    $mailer = $this->getContainer()->get('mailer');
    $transport = $mailer->getTransport();
    $transport->start();
    $message = \Swift_Message::newInstance(
        $input->getOption('subject'),
        $input->getOption('body'),
        $input->getOption('content-type'),
        $input->getOption('charset')
    )
        ->setFrom(['mail@nkt.me' => 'Admin'])
        ->setTo($input->getOption('to'));
    $output->writeln(sprintf('Sent %s emails', $transport->send($message)));
    $transport->stop();
}

Смысл в start-stop
Побробуйте указать From равным логину.