Почему внешний жесткий диск не читается с порта usb 3.0, но читается с usb hub под usb 2.0?
Если раньше диск при подключении к тому же порту работал, а сейчас - не виден, попробуйте подключить диск другим кабелем. 
Звучит бредово, но мы сталкивались с ситуацией, когда диск с фирменным самсунговским кабелем внезапно перестал быть виден, а с хорошим (недешёвым) кабелем из китайского магазина нормально появлялся в системе.
ну если диск сам работает на других устройствах по 3.0, а на ноуте не работает и на ноуте рабочий порт 3.0 то наверное надо установить/переустановить/обновить драйвера на хост контроллер usb 3.0