Есть ли менеджер команд командной строки?
Ага.
Папки и ярлыки называется.
Не знаю, может не в тему, но порекомендую Far Manager
Он консольный... слева на панели каталог с батниками, который можно быстро сортировать /делать поиск/редактировать.. Можно горячие клавиши повесить и много чего другого...