Какая панель управлением хостингом умеет mpm_itk (Apache) или другой механизм изолирования сайтов?
ISPmanager 5 - после установки в возможностях можно выбрать mpm для Apache (itk, prefork)VestaCP - умеет prefork, тоже под каждый сайт своего пользователя можно сделать.
Если сайтов несколько, то лучший вариант ISPmanager 5. Apache Prefork, PHP FastCGI.
Неплохой вариант Plesk. Там есть FastCGI и PHP-FPM.
Из беслатных BrainyCP, Fastpanel, Centos Webpanel