Как поступить с заказчиком который не платит?
50% - абстрактная цифра. Необходимо показать менеджеру работу. Но не код. Т.е. на доступном серваке разворачиваете код, кидаете ссылку, сверяете по пулу задач/ТЗ, какие пункты сделаны. Если полноценно ни одного - какие требования оплаты вообще могут быть? Если там реально наберётся процентов 40 сделанных тасков, то можно обсудить условия оплаты и предоставления кода. Но с такими прокатами я бы лично не стал работать дальше в этом проекте. Если только ребята согласятся поднять оплату и заплатить сразу 50% от новой суммы, а не аванс от старой. И дело не в том, что это хорошо или плохо. Просто разработчик и заказчик берут на себя обоюдные обязательства.  Искать нового программиста для доделки 60% проекта - это гарантированное увеличение бюджета и трата времени. Если люди реально готовы платить, а не обманывать, они вам предложат такое увеличение при условии адекватной демонстрации с вашей стороны.
Резюмирую:
1. Поднимаете проект на своей стороне.
2. Проводите демонстрацию.
3. Отмечаете закрытые пункты заказа.
4. Ставите заказчика перед фактом: "исходник он получает при условии оплаты обещанного аванса, но при таком отношении, после передачи кода вы уходите из проекта". Основание: вы не получили пока ни копейки. Договора нет. Со стороны заказчика устное соглашение не соблюдалось и нет гарантий, что будет соблюдаться. Если заказчик настаивает на исполнении обязанностей, говорите, что отдадите код после подписания договора. Юридически, если нет договора, факт оплаты подтверждает сделку. Т.е. договор или оплата. Предпочтительно - оплата.
5. Если сошлись на оплате, и заказчик просит пересмотреть ваш уход из проекта, отказываетесь до тех пор, пока заказчик не поднимет ценник. Сами ищите другой проект. Не факт, что заказчик пойдёт на уступки. Если второго проекта не будет, а заказчик согласится поднять цену, пусть доплатит сразу так, чтобы в сумме вышло 50% от общей суммы. Завершаем проект, радуемся.
и говорит что у них что то с сервером, не осталось бэкапа, предыдущий менеджер уехал, надо восстановить сайт, Вот ключевая фраза!
У Вас нет уверенности и доказательств, что там ни кто-то с улицы пришел и просит дубликат кода, а менеджера - "ушли".
Скажите, чтобы связался с Вами тот менеджер, с которым Вы работали и пусть он объяснит ситуацию голосом. Тогда всё станет более-менее понятно.