Могу ли я использовать работы в качестве портфолио?
Ну а почему же нет? Допишите просто, что мол "это вот все добро я сделал, когда работал в студии такой-то. Верстал, натягивал и т.д.". Тогда вообще не будет к чему придраться.
А зачем вы спрашиваете у вас это решает ваша студия  а не , наше мнение никак на решение студии влиять не будет