Как хранится текущая директория в linux?
/proc/$$/cwd - это симлинк на текущую директорию
как хранится текущая директория в linux? 
Где то в недрах памяти процесса, который знает о текущей директории. Скорее всего bash.как работает команда cd (не результат, а именно процесс)? 
Исходники скорее всего открыты - берите и смотрите.