Как оформить права на свой код?
1. Рекомендую сначала написать модуль и продать его. Далее, если удасться продать модуль более чем одному заказчику, то уже задуматься об оформлении интеллектуальной собственности (ИС).
2. ИС рекомендую оформлять на организацию, а не на физлицо. 
3. Оформление ИС на программу ЭВМ занимает 4 часа работы - заявка заполняется онлайн и подписывается ЭЦП при наличии, ну или в бумажном виде. Через 2 мес вам выдадут свидетельство.
4. Чтобы продавать программный продукт вовсе не обязательно иметь свидетельство. Ваше право на программу ЭВМ возникает в момент создания программного продукта, а не в момент регистрации. Не все юристы это знают, поэтому и требуют на каждом шагу свидетельство. 
5. Госпошлина - порядка 4к руб. Срок 2 мес.

Удачи!
боитесь кражи кода, поставьте защиту. Закройте код или ключем. Свидетельство не спасет от кражи
Чтобы в дальнешем иметь возможность продавать этот модуль другим мед. центрам, чтобы они не писали свое на коленке.
Ну, для началоб нашел кому нужно... Сделаете удобный и нужный иструмент, можно задумываться свидетельстве.