Вопрос по тарифам и целесообразности Яндекс-Кассы на сайте?
DISCLAIMER - личный опыт
Категорически не советую Яндекс.Кассу.
1. Какой есть платежный агрегатор для США, Европы и стран СНГ?Яндекс.Касса это боль. Работаем с ней на одном из проектов.
Это "Яндекс" только по дизайну главной страницы, во всем остальном это Сбербанк.
Среднее время ответа на запрос по email - 3-4 суток. SLA обещает ответ в течении суток, но это а) тоже ад б) не исполняется.
Нашими вопросами занимается персональный менеджер (и никто !@# кроме него), который постоянно то отошел, то в отпуске, человек который его замещает тоже отошел, итд итп. Любой вопрос тянется сутками.
Интерфейс личного кабинета - хочется повеситься.
Тестовый доступ к апи - только после подписания договора и всех проверок (примерно 2 недели)
Деньги пересылают исправно, тут ничего сказать не могу... если в ответе на их запросы не было ошибок.
Если ответить не валидно - начинается магия. 
2. После 3х месяцев успешного сотрудничества - СБ отключило нам прием банковских карт без предупреждений  и объяснения причин.Что касается Ваших вопросов:Будет ли целесообразнее для qiwi использовать qiwi (а не яндекс-кассу) ?Зависит от оборотов и себестоимости разработки. На старте imho нет, потом - нужно считать исходя из цифр по каналам.И если я, правильно понимаю, то мне кажется, проценты как-то завышены, или это норма?Понимаете Вы правильно. Процент по рынку гуляет от ~1% до 5% в зависимости от способа оплаты и оборотов. Вообще начиная даже с 1 млн рублей в месяц публичных условий нет, всегда можно торговаться (именно поэтому если есть большая дисперсия по способам оплаты - может быть резон загонять все в один агрегатор).
Добавлю, что тарифы зависят от рода деятельности и оборота компании. На сайте указаны базовые ставки. 
На интеграции QIWI можно сэкономить: во-первых, в Яндекс.Кассе есть способ оплаты «Наличные» (3,5%), который включает более 250 тыс точек пополнения наличными в России и СНГ, включая терминалы QIWI. А пользователи электронного кошелька QIWI всегда могут расплатиться виртуальной картой, прилагающейся к нему — по стоимости (для вас) карточного эквайринга (3,5%).