Как работает сайт изнутри (глубокий технический анализ сайта)?
Xhprof вам в помощь.
Если речь о произвольном сайте, то сделать это невозможно без хакинга.
Если речь о собственном сайте, то это делается на этапе разработки и любой разработчик знаком с инструментами дебага и профилирования