Как перенести сайт с хостинга на Dedicated Server?
Если сами не знаете как - лучше не лезть.
Стоит обратится к тому, кто знает. За небольшую плату вам все перенесут и настроят.
1. Сделать бекап файлов и базы
2. Настроить web server, БД, php или иное, в зависимости от того что требутся сайту на новом сервере
3. Перенести на новый сервер  файлы и базу.
4. Подправить записи в DNS.
Если нужно не прерывать работу сайта, то все немного сложнее.