Не работают горячие клавиши вызова ярлыков в полноэкранном режиме?
Потому что весь инпут перехватывается активным окном.
Полноэкранный режим браузера это своего рода "киоск"... так что думаю никак... разве что попытаться забиндить cmd скрипт, который будет стартовать приложение. но это надо проверять