Как запретить системе доступ к харддрайву?
Вставляешь один диск - грузится одна система.
Вставляешь вместо него второй диск - грузится вторая система.
Полная изоляция.
Если системы разные, у них разные ОС - и они просто не будут монтировать неизвестные разделы.
Если системы одинаковые - запретить в самих ОС монтировать диски.