Как собрать портфолио если предыдущие работодатели ругаются за коммерческую тайну?
Работодателя, ругающегося на линки, можете слать нахрен, авторское право неотъемлемо. А вот исходники показывать вы права не имеете. И то, что валяется билдами, наниматели за выполненную работу считать не будут, естественно, всех интересует только опыт в успешных коммерческих проектах.
ругается даже за публичные линки)

А поисковикам и прочим ресурсам он тоже что-то ругается?

Исходники показывать не можешь. А линкт спокойно.