Выйдет ли такой сайт в поисковую выдачу или уйдет в бан как дубликат основного?
Для того, чтобы поисковые системы не наложили санкции на созданные сайты на поддоменах, необходимо соблюсти ряд правил и последовательность выполнения, как технических, так SEO задач. Ниже дам общие рекомендации и упомяну про отдельные моменты, но это по памяти. Где-то была полная инструкция по созданию и оптимизации поддоменов, предоставлю по запросу, если интересно.

Общие нюансы:

определитесь с количеством подоменов (например, города-миллионники);
условия подмены контента (мета-теги, заголовки, ALT, текст), чтобы не плодить дубли;
поименование поддоменов на основе анализа конкурентов в выдаче, например, чтобы не использовать в имени поддоменов полное название городов без необходимости.


Далее:

Создаем поддомены и делаем их алиасами основного домена. На данном этапе информация на всех доменах ничем не отличается, сайты являются полными копиями.
Выполнить склейку каждого поддомена с его www-версией с помощью 301 редиректа. Настоятельно рекомендуется использовать для поддоменов версию без www, чтобы избежать проблемы с SSL-сертификатом
Чтобы избежать склейки поддоменов, максимально быстро после выполнения предыдущего пункта необходимо закрыть их от индексации, прописав в robots.txt: User-agent: * Disallow: /
На всех поддоменах в title,  meta-description,  meta-keywords, Н1 необходимо заменить упоминание города на переменную, которая в зависимости от поддомена будет заменяться на название города. Подмену делаем на всех страницах и разделах/подразделах (мета-теги и Н1 карточек товаров не трогать). При необходимости нужно создать несколько переменных с городами в разных падежах. На страницах, где в title и meta-description топоним не используется, рекомендуется сформировать дописку с указанием текущего города в зависимости от поддомена.


Не упустите технические нюансы:

приобрести SSL-сертификат типа Wildcard для домена и поддоменов.


Справка Яндекса

«Региональность»: https://yandex.ru/support/webmaster/site-geography...
«Оформление поддоменов»: https://yandex.ru/support/webmaster/site-geography...
«Индексирование поддоменов»: https://yandex.ru/support/webmaster/yandex-indexin...

Структуру и верстку сайта поисковики не учитывают