Что делать с человеком, который не комментирует код?
Если код и правда понятен, то зачем заставлять писать лишнее? Если код местами непонятен, аргументированно требуйте комментировать такие места. В качестве аргументов желательно приводить факт непонятности кода другим разработчикам (то есть надо попросить нескольких людей объяснить что делает неизвестный им код за 5-10 минут).

Если я правильно понял, то в вашем случае человек «особенный» в некоторых смыслах. В частности, его нельзя заставить делать так, как Вы хотите. Поэтому тут следует попытаться убедить человека или, как крайний вариант, прийти к компромиссу.

Как разработчик могу сказать, что сам противник комментариев, но с оговоркой: неясные моменты всё-таки надо комментировать, если не удаётся переписать. Другое дело, что когда руководство или коллеги начинают продавливать желание видеть комментарии везде, это вызывает раздражение, так как с комментариями жить тяжелее (не буду «баянить» про то, что их непросто поддерживать и т.п.)
вот сам хук
code.google.com/p/solo-framework-lib/source/browse/#svn%2Ftrunk%2Fgithook%2Flatest

т.к. мы работаем с PHP, то использовали PHPCodeSniffer для проверки стандартов. Думаю, для java и с++ тоже есть подобные инструменты