Зачем сайт устанавливается на виртуалке?
Proxmox использует qemu. 
Виртуалка нужна для безопасности, разделения ресурсов сети, файловой системы. Её проще бэкапить, клонировать, переносить между серверами (облако).
На одном физическом ресурсе виртуальных систем может быть много.
Это еще и изоляция окружения, а так же безопасность