На какой cms начать верстать магазин лучше всего?
Можно разобрать на цитаты из интернетов.... Да и опыта у тебя нет - признавайся, в лучшем случае правки делал какие исходя из текста.

Joomla мертва и никому не нужна.

Wordpress это более 60% рынка CMS и 30% от всех сайтов на планете. Выбор очевиден. Про костыли выброси эти фразы в мусорку и никому не говори. У него есть свои минусы но к тому времени когда ты их осознаешь уже будет понимание что с этим делать. И если будешь отталкивать от того как малыми силами сделать сайт на плагинах останешься без работы и без денег. Вордпрес это максимальный профит за короткий срок а если не умеешь готовить то это уже другой вопрос.

Для начала разберись с пониманием что такое "верстать" и что это не связано с CMS. Разделяй процессы. Сначала верстать потом натягивать.
Modx + Minishop2
Причина. По сути ИМ почти сразу становится самописом, как только что то начинаете продавать. Сразу надо вносить правки по заполнению карточек товара, интеграции с внешней учётной системой, поиском. Затем начнутся проблемы с "вредителями" и плагины будут самым меньшим злом.
Поэтому можно (нужно) изначально выбирать ту cms, которая максимально заточена под самопис.