Почему Yii/Yii2 не подходит для крупных проектов?
У нас в компании 4 энтерпрайзных проекта на Yii2. В том числе CRM. В том числе и связь с телефонией, 1С, баг-трекером. Всё работает отлично, без нареканий. О каких "слабых" местах вы говорите? Прекратите читать - начните делать!
1) Меня отпугивает AR. Он хорош в админке, но очень плох на пользовательской части сайта. Получать данные в виде массива не всегда удобно, т.к. уже нельзя применить какую-то бизнес логику, работать  с моделями через чур накладно (например при кэшировании) и не безопасно (может кто-то во вьюхе сохранить к примеру).
2) Монолитный проект, допустим сложно проект разбить на микросервисы, всегда будет качаться компоненты связанные с базой данных, assets итд