Обновление ubuntu на хостинге?
почему полетит то… 
если напрямую на LTS будете — то всё ок будет. 
Только Zendы действительно осыпятся. 
Можете мне написать, если что то поломается после обновления (ну или в ubuntu.ru/irc/webchat меня пните)
Не должно. А там — черт вас знает, что вы используете. Например того же Zend Optimizer под PHP 5.3 не существует. С обновлением версии системы проблем быть не должно.