Какой форм-фактор десктопа выбрать?
midi обычно удобнее по габаритам и возможности/удобству upgrade
Смотря под какую задачу.
Если у вас там планируется установка мощных видеокарт, разгон процессора - максимальный объем корпуса. В нем проще организовать эффективное охлаждение.
Я например использую исключительно встроенное видео и предпочитаю форм фактор mini-ITX
В офисах там где не требуется высокая производительность используются неттопы  например на платформе Intel NUC.
Выбирайте корпус под задачу и под железо.