Как запретить удалять папку, но разрешить изменять в ней файлы?
У тебя на картинке наоборот сделано, Удаление разрешено - запрети(!), а Удаление подпапок и файлов - разреши или запрети, не оставляй на откуп "автоматике". Так же поступи для "объектов и контейнеров внутри этого контейнера". Плюс в верхнем поле есть выбор к чему применять, "к папке", "к папке и подпапкам", если тебя только папки интересуют, но не файлы, то второе. Ну или только к подпапкам, если для "корневой" - другие настройки.
Запреты имеют приоритет.
Отсутствие разрешения это не совсем запрет.
смысла в этом всем 0. Что мне помешает изменить файл удалив из него все. Получится что файл есть, а данных в нем нет.