Восстановление данные mysql из файловой системы linux?
Да конечно возможно. Возьмите файлы из /var/lib/mysql и положите их в тот-же каталог на виртуальной машине с идентичной версией mysql (ну и разрядностью ОС естественно), перезапустите mysql и получите рабочую базу данных. Потом сделайте дамп данных и залейте куда вам надо.
Если файлы не покареженные, то взлетит сразу, если часть файлов данных битая, то немного сложнее.
Из дампа.
ФС не имеет к этому отношения.