Возрастет ли нагрузка, если ссылать несколько доменов на одну директорию?
в целом, навскидку, разницы абсолютно никакой, если они были только не на разных устройствах раньше. А так как гладиолус виртуализация, то и вообще разницы 0, может даже небольшой профит по скорости за счет системного кеширования.
Обычно разделяют по директориям, если содержимое в них отличается. Если на доменных именах "зеркала" - естественно ссылаться надо на единственную директорию.