Системный диск C: с утра стал девственно чистым, как такое возможно?
ответ очень простой: щит хэппенс и бэкапы - рулят.
и если у вас нет регулярных бэкапов как минимум в двух разнесенных локациях, вы рано или поздно окажетесь в сами знаете где.
И ряд стандартных вопросов:
Прошивка у SSD свежая? (глюки контроллера)
SMART гадостей типа роста ошибок UDMA не показывает? (SATA-кабель отваливается)
Есть еще вероятность, что какая-то гадость запустила Secure Erase смеха ради.