Как создать ISO образ удалённой машины?
Учите параллельно Ansible. В будущем поможет сэкономить время. В вашем случае это хорошая альтернатива копии диска.
Есть стандартные утилиты для создания дампов файловых систем, для ext - dump/restore, для xfs - xfsdump/xfsrestore.
Чтобы сделать дамп достаточно иметь возможность соединиться по ssh, чтобы восстановить дамп - иметь возможность загрузиться с вненео носителя и настроить доступ по ssh.