Как настроить запуск нескольких приложений django на связке nginx + uwsgi + django?
Какие порты? Лучше unix-сокеты и использовать конфиг.
Для каждого приложения создаешь свой конфиг в /etc/uwsgi/apps-enabled/[uwsgi]
plugins=python27
vhost=true
virtualenv=/home/ubuntu/myproject/python
module=project.wsgi
callable=application
pythonpath=/home/ubuntu/myproject
chdir=/home/ubuntu/myproject
processes=1
По умолчнию сокет создается тут/var/run/uwsgi/app/myproject/socket
но можно указать свой путь опцией socket
Ну и конфиг nginx соответственно:server {
    listen 80;
    server_name  example.ru;

    location / {
        uwsgi_pass      unix:/var/run/uwsgi/app/myproject/socket;
        include         uwsgi_params;
    }
Запустить на разных портах.