Использование jQuery и AngularJS вместе. Это плохо?
Это не плохо. Ибо в самом ангуларе столько всего сделано через жопу, что использование jQuery в некоторых местах будет вашей наименьшей проблемой. Но тут очень важно понимать, где и как этот jQuery юзать, ибо простое подключение глобального файлика с jq-кодом особых результатов не даст из-за асинхронности angular'а, по этому вам все равно придется запихивать jq-код во всякие link функции и прочие места, так что код в итоге получится вполне нормальным.
Допускается разумным использовать любой сторонний плагин.
Только создайте для него директиву и в link-функции инициализируйте сам плагин.