Как запретить изменение переменных из консоли?
вынесите формирование этого массива на сервер, а для уменьшения расходов на транспортировку данными, используйте websockets.
Альтернатива - забить.
Например ты можешь использовать замыкания, избегая глобальных переменных. Конечно это полностью не решит проблему безопасности, но из консоли менять значение переменных уже не получится.