Какой способ обработки js файлов в gulp самый лучший?
m.habrahabr.ru/post/250569
Посмотрите эту статью, будет весьма полезно.
Чтобы не прописывать все файлы ручками можно использовать wildcards.
Для вендоров я обычно делаю отдельную переменную, в которой прописываю все пути к вендорам.
Насчет конката и мимифая вендоров:
Я конкачу в отдельный файл, т.к. он обновляется намного реже чем файл со скриптами и как следствие может грузиться из кеша.