Какую выбрать схему виртуализации домашнего сервера?
Для подобных вещей вам не нужен KVM. Используйте lxc, если хотите изолировать сервисы.
По первому вопросу у вас явное непонимание. LVM вас никак не избавит от необходимости наличия файловой системы. Он может упростить манипулирование файловыми системами. Но, в условиях домашней файлопомойки единственной востребованной функцией чаще всего становится расширение пространства хранения путем жонглирования (добавления-замены) физическими HDD-SSD носителями.  Если вы не предполагаете в будущем роста количества дисков, то особенной выгоды от использования LVM вы не получите.
На остальные вопросы ответ вы уже получили. Для вашей основной хотелки оптимальнее использовать контейнеры. Но, если есть сильное желание повозиться с виртуализацией, то кто ж вам запретит.