Linux: как реализовать совмещение тайлинга с обычными окнами?
Pytyle, описанной проблемы не имеет, из себя представляет реализацию тайлинга независимо от wm. Каждую новую версию автор переписывал.
pytyle2 фичастая, но тяжелая.
pytyle3 малофункциональная, но легкая как перышко. и к тому же имеет киллер фичу: поддерживает многомониторный форк опенбокса, почему и пользуюсь.
Работает с любым оконным менеджером.
Но лично я собираюсь переходить с KDE+openbox+pytyle на awesome, описанной вами проблемы там нет, настраиваемость абсолютная.
Куда двигают О_о
У вас какой-то неправильный тайловый WM. Посмотрите на ion3, он является типичной реализацией тайлинга, никуда ничего не двигается) 
А вообще во всех тайловых WM есть что-то в духе "болтающихся окон", на всплывающие их и подвешивают. Правда, оно в итоге неудобно, в ion3 проще было всплывающие открывать в том же тайле в бэкграунде.