Как можно найти все компьютеры с слабыми HDD дисками в домене?
PowerShell-скрипт с командлетом Get-PhysicalDisk вернет вам нужную информацию.
Можно обходить скриптом все компьютеры или добавить скрипт в GPO
Есть разные варианты 

Бесплатные - написать скрипт + еверест или еще какая программа которая соберёт все данные с ПК
Условно бесплатные - много программ которые могут тебе дать такие данные даже на триал варианте (А по голове не получит ни кто за это ?)
Платные - почти все антивирусы и тд энтерпрайз сегмента умеют такое