Как защитить код js — от вредоносного кода?
Разобраться как он попал и закрыть дыру в безопасности.
Проблема не в JS коде, а в том что кто то может писать в ваши файлы.
Это или дырка в движке вашем, или кто то смог залить Shell или что то ещё подоное.
Надо править.
Закрыть бекдор.