Новый файл в существующий репозиторий GitHub?
git add
git commit
git push

А если серьезно, прочитайте хоть какие-то основы работы с гитом. На том же гитхабе, например
git status - посмотреть, что там у вас происходит,
git add -A - добавить все изменения

После этого можно посмотреть разницу повторив git status.
Если всё как надо - commit, и, если надо на удалённый - push.