Что лучше для большого проекта со сложными вычислениями: Node js или PHP?
Можете написать на php только часть со "сложными вычислениями", оформить как микросервис и вызывать из ноды.
Но для начала стоило бы понять, насколько сложны ваши вычисления и какое время программа на них затрачивает. Возможно вы просто преувеличиваете масштаб проблемы и нода спокойно их переварит.
Писать надо на том на чем умеете. А производительность решать архитектурой.
 А хаскели ирленги и скалы для мазохистов.