Как более грамотно сформулировать тему диплома «Интернет-магазин»?
Не в обиду, однако задайте вопрос, а станет ли мир лучше, если будет создан ещё один бесполезный интернет-магазин. Дипломная работа в первую очередь должна быть актуальной, а значит как минимум привносить что-то новое. Подойдите к этому вопросу.
А по делу,  попробуйте что-то вроде "Использование современных инструментов, фреймворков и методов при разработке %my_project_name". Во-первых, внезапно переместился акцент с "новейшая вакцина от британских учёных", на процесс, где воды можно налить намного больше, взять то же экстремальное программирование. Во-вторых, внезапно появляется слово современный, а так как все эти js-библиотеки, php-фреймворки, CMS-движки имеют свойство меняться с незавидной частотой, это слово скорее всего окажется верным. Ну а методы... Экстремальное программирование уже было упомянуто, придумайте уж хоть что-то своё.
Однако, лично я бы не брал такую тему. Она... Как бы сказать, не очень хорошая для диплома. Возьмите тот же apache, протестируйте его вдоль и поперёк, покажите, какие настройки будут оптимальны для того же интернет магазина. По сложности примерно то же, по актуальности в разы лучше. Или сделайте нагрузочное тестирование VPSок и дедиков на сравнимых заявленных характеристиках. Попытайтесь посчитать потери "на виртуализацию". Ещё можно попробовать посчитать всевозможные метрики пользователей, то как среднее время препровождения на интернет странице, однако здесь потребуется что-либо хоть сколько-то раскрученное. В общем, тем тысячи. Да возьмите один компонент той же бесполезной CMS и выкопайте от туда всё что можно и нельзя. В дипломе нужен анализ, а не вода. Намного приятнее диплом, в котором 20 страниц чистого анализа, того диплома, в котором 120 страниц воды. Не надо делать ещё один интернет магазин. Придумайте что-нибудь хоть сколько-нибудь оригинальное.
"Разработка системы онлайн продаж"
"Система онлайн продаж"
"Разработка системы продаж на основе Web-технологий"
...можно по желанию еще влепить "современной"/"современных".