Какой open source проект на node.js выбрать как эталон для архитектуры и стиля?
До этого поделайте лабы на nodeschool.io и у меня на https://github.com/HowProgrammingWorks
Потом изучайте исходный код ноды для вникания в стиль: https://github.com/nodejs/node/tree/master/lib и уж потом проект.
Лучшие практики бывают только относительно конкретной задачи, у бесплатных проектов задачи не совпадают с вашими и вообще очень мутные, потому что они делаются не "для людей", а "для fun'а", так что нужно думать головой.