Как сослаться в модели на id в новых версиях django?
Добавь в поле project следующее: null=True, blank=True
Или после выполнения migrate выбери 1, а затем укажи тоже 1 :)
class Meta:
        db_table = "....."
Это лишнее в моделях. Конкретно db_table.