Linux: большое количество файлов в папке — это сколько?
По собственному опыту:
10 тысяч — вполне нормальное число.
50 тысяч и больше — стоит подумать о подпапках и иерархичности папок / документов.
Большое число файлов в папке на самом деле замедняет доступ к ним.
Когда у меня бала задача расположить сотни тысяч файлов и потом оперативно их доставать, то я делал иерархию, как написал человек выше. На сколько я помню каждая фс имеет свои ограничения на количество файлов в одной папке, вроде как 65тыс. Так что если у Вас количество файлов все время растет, то лучше сразу подумать над иерархией.