Можно ли отключать графический планшет Wacom от работающего компьютера?
Вы уверены, что он "сгорел" именно из-за отсоединений? Откуда такая информация?
Стандарт USB предусматривает горячее отключение/подключение устройств и планшет ничем не отличается от всех других устройств.
Во первых - отключать устройства от USB на горячую полностью безопасно. От этого не сгорит.
Максимум какая неприятность может быть,  так это отложенная запись на диск оборвется, и файловая система может повредится. Т.е оборудование точно не пострадает, но данные потерять реально.
Во вторых - отключать устройства от USB это всегда опасно, часто горят. И совершенно пофиг включены они или безопасно извлечены перед этим. 
Опасен сам факт подключения или отключения, когда компьютер не заземлен, и приличная разность потенциалов на корпусе.