Как подключать jQuery плагины в Webpack?
Путем экспериментов, всё заработало с таким подключением:window.$ = window.jQuery = require('jquery');
window.isotope = require("isotope-layout/dist/isotope.pkgd");

var $grid = $(".our-design__gallery-items").isotope({
    itemSelector: '.our-design__gallery-item',
    transitionDuration: 500
});webpack.config.jsplugins: [
        new webpack.ProvidePlugin({
            $: "jquery",
            jQuery: "jquery"
        })
    ],
Jquery это динозавр, который вот так как ты хочешь использовать не получится. Нужны плагины.
https://webpack.js.org/plugins/provide-plugin/