Как выбрать ключ ssh?
Варианта три:
1. Использовать один ключ, второй не нужен. Ключи - это персональные данные, у каждого свой собственный приватный ключ, а где нужно - прописывается публичная часть.
2. Зарегистрировать ключ в SSH Agent `ssh-add ~/.ssh/testFolder/id_rsa` (на винде могут быть сложности)
3. Указать ключ при подключении: `ssh -i ~/.ssh/testFolder/id_rsa root@123123123`
Когда генеришь ключ (или уже готовый, то просто переименнуй пару) указываешь имя ключа с привязкой к проекту: id_rsa_project1  и id_rsa_project1.pub и при подключении указываешь необходимый ключ: ssh -i ~/.ssh/id_rsa_project1 root@123123123