Как можно при компиляции less в css сохранить комментарии?
ставить комментарии правильно, в формате css.
А вообще есть такая чудная штука как sourcemaps и тогда не надо изобретать ничего.
В поддержку оратора выше, тоже позитивно выскажусь в сторону sourcemaps
Разобраться в этом вопросе вам поможет собственно плагин gulp-less-sourcemap, а также небольшая заметочка  на эту тему