Могут ли вирусы переходить на другой компьютер при подключении по RDP?
RDP не гарантирует защиты от вирусов. к примеру есть предупреждения, когда в парамерах подключения, разрешено мапить локальные дисковые устройства. но если вам нужен обмен файлами - придется разрешить

можно по другому сказать - как мимнимум, есть угроза заражения, при любом способе обмена файлами (флешка, сеть, в тч мапинг по RDP)

какой то особой защиты не требуется - если у вас есть антивирус, вам не чего добавить upd кроме как не делать ляпов

ps экстремальная защита (шутка с долей юмора):- не мапить устройства
- не качать файлы
- уволиться
- отключить интернет и сотовые
- уехать жить в тайгу или в горыpps ну и об экстремальных угрозах:- 0day может быть найден везде. возможно и в RDP*, даже если заходите без доступа к локальным устройствам. доступ же предусмотрен протоколом, просто запрещен. а крутые зловреды создаются именно для обхода запретов
- все кто более менее интересовался темой ИБ, знакомы с одним из самых показательных случаев - Stuxnet. но если вы работаете там, где есть гостайна, за нее есть кому беспокоится
- если вы самый главный по ИТ/ИБ, в своей конторе, и задаете такой вопрос, думаю, что самая большая угроза, для вашей конторы, это обычные зловреды - майнеры, воры банковских данных, паролей, и тд. но защита от них, требует только повышения вашего общего уровня в ИТ/ИБ. говоря коротко - не делать ляпов, хотя бы выполнять рекомендации МС для администраторов. а их довольно легко искать. удачи

* еще пример экстрима - специалисты по ИБ, продемонстрировали выход в хостовую систему, даже из виртуалки. но не сохранил ссылку, или сохранил далеко, истории чуть не пару лет.. а может и более ))
Кто то ставит антивирусы, касперский там или доктора
Но это вам решать