Как в Debian переустановить пакет с нуля?
Содержимое пакета подсказывает, что пакет cups и не содержит doc-root: https://packages.debian.org/jessie/all/cups/filelist
Зато есть тут: https://packages.debian.org/jessie/all/cups-server...
/etc тоже по нескольким пакетам раскидан.
В общем, вы удалили только голову, понятно, что эта голова при приращивании обратно не стала лезть не в свои области, а установила только себя.
Сделайте apt-get autoremove --purge
https://wiki.debian.org/ru/SystemPrinting
https://wiki.archlinux.org/index.php/CUPS_(%D0%A0%...
имею под рукой машину Deb8, могу помочь.