Как откатить версию ноды?
Поставь nvm, там легко менять версию туда-сюда
Запускай свои приложения, настроив минимальную версию окружения в контейнерах docker или рули сам с помощью lxc
по уму можно запустить приложение в простейшем chroot, настроив минимальный образ системы с помощью debootstrap, немного поковырять с сетевыми настройками (точнее только dns так как сеть будет та же что и основной системы) и смонтировать с помощью bind копии /dev,/sys/,/proc