Не запускается сервер MySQL?
Битые таблицы или незакрытые логи транзакций InnoDB.
Делать резервные копии всех директорий и пытаться починить или просто удалить базы и восстановить из бекапов.

ЗЫ Непонятна причина публикации логов из bitrix - что вы хотели этим добиться.
Тут посмотрите.