JQuery. Как улучшить регистрационную форму?
как улучшить данный скрипт, как можно написать его в виде классов в JQuery (знаю классов нет в этой библиотеки, но как тогда их можно имитировать)?

Что Вы имеете в виду под «имитировать»? В jQuery пишут плагины — материалов на эту тему на хабре хватает — смотрите по тегу jquery plugins — авторы выкладывают исходные коды на github

Как вообще нужно писать подобные вещи на jQuery, чтоб они не просто работали, а люди, которые читали код, понимали, что пишет не новичек? подскажите пожалуйста!

Ну, как выше сказали, дело не в jQuery, это общий момент для любых фреймворков и языков:
 — пишите кратко и лаконично,
 — придерживайтесь принципа «разделяй и властвуй» — выносите общий код «за скобки» — в отдельные методы
 — поменьше магии — всё должно быть очевидно и наглядно
 — не старайтесь использовать максимум возможностей вроде анимаций и т.п. — код должен выполнять работу, а не нагружать процессор — у кого-то и батарейка нерезиновая.
Остальное — придёт с опытом
Старайтесь стремится к тому, чтобы код можно было прочитать без комментариев.
Обычно левую фигурну скобку не пишут с новой строки

Ниже улучшенный вариант кода для дальнейшего развития
$(this).blur(function () {
	var removeErrorMessage = function(className) { $(this).next().children("." + className).remove(); };
	var showErrorMessage = function(className, message ){
		if (!($("." + className).length)){
			$(this).parent().children(".error-list").append(["<li class='", className, "'>", message, "</li>"].join());
		}
	};
	var showSuccessView = function() { $(this).parent().parent().attr("class", "control-group success"); };
	var showWrongView = function() { $(this).parent().parent().attr("class", "control-group error"); };
	
	var checkLogin = function(login){
		var loginVerified = new RegExp(/^[a-zA-Z0-9_-]{3,16}$/).test(login);	
		
		if ((loginVerified) && (login.length >= 6)) showSuccessView(); else showWrongView();
		
		if (login.length >= 6) removeErrorMessage("help-login-length");
		else{ 
			showErrorMessage("help-inline help-login-length", "В логине должно быть не менее 6 символов");
		}
		
		if (loginVerified) removeErrorMessage("help-login-reg");
		else{
			showErrorMessage("help-inline help-login-reg", "Только символы латинского алфавита, цифры, дефис и подчеркивание (a–z, 0-9, -, _).");
		}
		
	};
	
	switch($(this).attr("id")){
		case "id_username": checkLogin($(this).val()); break;
	}
});
