ЧПУ в CodeIgniter?
С чего Вы так решили?
, в CodeIgniter действительно нет нативной поддержки mod_rewrite

Работает без костылей — поэтому отсутствие костылей ввиду необходимости их наличия вряд-ли имеет смысл называть «отсутствием поддержки». 

«Сынок, все работает? Ничего не трогай!...»