Как использовать порты pb6 и pb7 atmega328 на arduino pro mini?
Для этого вам надо перепрошить так называемые фьюзы (fuses), которые определяют конфигурацию кристалла МК.
В частности ими задается выбор тактового генератора. Вам нужно перепрограммировать их с внешнего кварца на внутренний RC-генератор. Тут есть 2 проблемы:
1 - вам нужен дополнительный ISP-программатор. Им может выступить arduino, как вариант. Другого способа прошить фьюзы я не знаю.
2. Точность тактирования на внутреннем RC-генераторе существенно ниже, чем с кварцевым резонатором, это следует учесть, если нужны точные тайминги.
www.engbedded.com/fusecalc - тут можете посчитать фьюзы под свой МК.
А для чего вам именно нужны эти пины? Если у вас не хватает портов, то можно использовать мультиплексоры или перейти на мегу, но из-за двух пинов перешивать контроллер под внутренний кварц как-то перебор.