Ondanks de relatief hoge operatieve complicaties kunnen patiënten met NTM longziekte, waarvan de ziekte in één long is gelokaliseerd en die hersenoperatie kunnen verdragen, worden overwogen voor de operatie, als er een slechte reactie op de behandeling is geweest of als de patiënten significante ziekte-gerelateerde complicaties ontwikkelen, zoals hemoptyse.