Een tweede statistische kwestie, die voor alle scans voor variantverenigingen geldt, is dat elk van de vele GSV's die in zelfs een kleine cohort worden aangetroffen, het onderwerp is van een afzonderlijke, onafhankelijke hypothese, zodat substantiële, meervoudige test correctie van de significantiedrempel of een rigoureuze controle van het FDR-percentage vereist is om een groot foutenpercentage van type I te vermijden.