Hoewel er pogingen zijn ondernomen om rekening te houden met meerdere tests (b.v. uitsluiting van GSV's in de Database of Genomic Variants, met inbegrip van zeldzame GSV's, empirische schatting van FDR), is het onduidelijk in hoeverre deze methoden doeltreffend zijn.  methoden ontwikkeld voor associatieanalyse van zeldzame sequentievarianten zijn niet altijd goed toegestaan, zelfs niet voor grote monstermaten.