현행은 대통령령으로 정하는 농산물에 대하여 이력추적관리 등록을 규정하고 있으나, 개정안은 쌀을 포함한 대통령령으로 정하는 농산물에 대하여 이력추적관리를 하도록 명시하려는 것임.
현행은 대통령령으로 정하는 농수산물(축산물은 제외)을 생산ㆍ유통ㆍ판매하는 자는 농식품부장관 등에게 이력추적관리를 등록하도록 의무화하고 있으나, 
대통령령에서는 이력추적관리 대상 농수산물을 규정하지 않아 실제 이력추적관리가 의무화된 농수산물은 없음.
쌀 이력추적관리제도는 쌀의 생산단계부터 판매단계까지 각 단계별로 정보를 기록ㆍ관리함으로써, 쌀의 위험요소를 방지하고, 유통질서를 확립하여, 소비자의 신뢰를 확보하는데 그 목적이 있음.
현재 이력추적관리제도가 소(소고기), 돼지(돼지고기), 영유아식품, 건강기능식품 등은 의무화되어 있고, 
우수한 쌀의 품질을 보증하기 위한 수단으로 쌀 이력추적관리제를 도입하는 농가의 수가 점점 늘어나, 현재 쌀 이력추적관리 실시하고 있는 농가는 전체 농가의 7.2%(700천호 중 51천호)에 해당함.
국산쌀과 수입쌀의 이력추적관리제도를 도입하면 쌀의 부정유통 유발요인을 감소시키고, 원산지표시 위반 단속의 효율성을 높일 수 있는 등  제도 도입의 장점은 있으나, 다음과 같은 점을 고려하여 신중히 판단하여야 할 것임.
첫째, 농산물에 대한 이력추적을 하려는 근본 목적이 관리대상 농산물의 안전사고가 발생한 경우 신속히 역추적을 함으로써 위해를 방지하는 것이므로, 특별한 위해요소가 없는 쌀에 대하여 이력추적제를 도입하는 것은 그 취지에 맞지 않음.
둘째, 현재(2012년 기준) 유통되는 전체 쌀에 비해 부정유통 되는 수입쌀의 양이 극히 적음(2012년 기준 : 쌀 수요량의 0.07%)에도 불구하고, 다수의 쌀 생산농가(70만호, 전체 농가의 61%)에게 생산자ㆍ재배지 정보 등록, 출하 정보 기록ㆍ관리 등을 의무화하는 것은 현실적으로 어려움이 있을 뿐만 아니라 제도 도입에 따른 편익도 크지 않은 것으로 보임.
셋째, 쌀 이력추적제 도입에 따른 생산ㆍ유통ㆍ판매 단계별 관련된 농가 및 사업자가 1,297천 개소에 해당하고, 이력추적제에 따른 정보의 기록ㆍ관리 등의 비용이 상당히 소요(2조 5,662억원 추정)될 뿐만 아니라, 이에 따른 유통비용 상승 등으로 오히려 국산 쌀의 경쟁력이 약화될 우려가 있음.
따라서 쌀 부정유통 방지를 위해서는 쌀 이력추적제 도입보다는 기존의 「농수산물의 원산지 표시에 관한 법률」에 따른 원산지 표시의 지속적인 단속과 처벌 수위를 강화하고, 「양곡관리법」에 따른 국산쌀과 수입쌀의 혼합금지를 법제화(현재 5건의 법률안이 상임위에 계류되어 있음)하면 개정안에서 제기된 문제점은 상당히 해소될 것으로 판단됨.