복구 단계의 조직 역량 및 인력 측면에서 양식보험의 피해원인 규명을 위한 전 담조직 및 인력의 부족으로 인해 특정 기관에 업무가 과중하게 집중되는 문제가 있다. 이를 방지하기 위해 전담기관의 지정 및 인력 확충을 통해 피해원인 규명 이 조속히 이루어질 수 있도록 해야 한다. 또한 양식재해 전문평가사 및 손해사 정인 제도 도입을 통해 조속한 복구기반의 마련이 필요하다. 법제도 측면에서는 피해규모의 체계적인 산정이 미흡한 실정이므로 표준사육기장을 마련하여 피해 규모의 체계적 산정 및 공정한 보상이 이루어질 수 있도록 해야 한다. 양식재난 복구과정에서 보다 근본적인 해결을 위해서는 피해가 빈번하게 발생하는 지역에 대해서 양식장 재배치 등의 구조개선사업을 실시할 필요가 있다. 또한 양식시설 의 내구성 등에 대한 시설 기준 마련 및 점검이 필요하다.