تحتوي المعدة على حمض الهيدروكلوريك HCl والذي يقوم بتنشيط الببسين الذي يقوم بهضم البروتينات، ويقوم حمض الهيدروكلوريك أيضًا بقتل الجراثيم الموجودة في الطعام، وكذلك تلعب المعدة دورًا في هضم الدهون حيث تتحول الدهون إلى مستحلب بواسطة حرارة المعدة.. أهمية حامض الهيدروكلوريك في المعدة يهيئ الوسط الحمضي المناسب لعمل إنزيمات المعدة.