في البداية تطوعت بلدان لقيادة مهمات ايساف كل ستة شهور، وكانت بريطانيا هي أول من تولى القيادة وتبعتها تركيا، اما المهمة الثالثة فتولى قيادتاه كلا من ألمانيا وهولندا بدعم من حلف شمال الأطلسي الناتو، ومنذ أغسطس 2004 تولى الناتو قيادة ايساف.