ما هي القواعد النيتروجينية؟
القواعد النيتروجينية هي مركبات عضوية ترجع خواصها القاعدية لزوج الإلكترونات الوحيد في ذرة النيتروجين. ومن القواعد النيتروجينية التقليدية الأمونيا (NH3), ثلاثي ايثيل أمين, بيريدين ؛ ومنها أيضا ما يدخل في تركيب الدنا و الرنا: أدينين, جوانين, ثايمين, سايتوسين, و يوراسيل.
نظرية تسلسل النيوكليوتيدات في الحمض النووي هي من الأعمال  واسعة النطاق التي تحاول وضع الأسس التحليلية لتحديد ترتيب النيوكليوتيدات في سلسلة من الحمض النووي ، المعروف ب تسلسل الحمض النووي. الجوانب العملية لهذا العمل تدور حول تصميم وتحسين المشاريع التي تسعى لإيجاد تسلسل القواعد النيتروجينية في الاحماض النووية (المعروفة باسم "الاستراتيجية الجينومية")، وتوقع أداء هذا المشروع، واستكشاف أخطاء  نتائج هكذا تجارب وإصلاحها، وتمييز مجموعة من العوامل مثل التحيز في ترتيب القواعد النيتروجينية _ والذي يحصل مثلًا حين أخذ قراءات أكثر أو أقل من مناطق لديها محتوًى عالٍ من ال GC_ وإيجاد آثار برامج معالجة الخوارزميات على النتائج، ومقارنة مختلف طرق إيجاد تسلسل القواعد النيتروجينية مع بعضها الآخر. ومن السابق يمكن اعتبارها فرع من فروع هندسة النظم أو بحوث العمليات. الأرشيف الدائم للعمل يكون على شكل رياضي ، على الرغم من أن الحسابات العددية في كثير من الأحيان تؤدي لمشاكل من نوع خاص.  