ما هي القواعد النيتروجينية؟
القواعد النيتروجينية هي مركبات عضوية ترجع خواصها القاعدية لزوج الإلكترونات الوحيد في ذرة النيتروجين. ومن القواعد النيتروجينية التقليدية الأمونيا (NH3), ثلاثي ايثيل أمين, بيريدين ؛ ومنها أيضا ما يدخل في تركيب الدنا و الرنا: أدينين, جوانين, ثايمين, سايتوسين, و يوراسيل.
نظرية تسلسل الحمض النووي تميز بين "العمليات الفيزيائية" المتعلقة  بإيجاد تسلسل الحمض النووي والنظريات التحليلية  التي تستخدم لتحليل النتائج الناتجة من إيجاد تسلسل القواعد النيتروجينية: مثل تسلسل المحاذاة،حيث يجب أن لا يتم الخلط بينهما. المنشورات . ولكن في المقام الأول النظريات التحليلية لنتائج إيجاد تسلسل القواعد النيتروجينية تعتبر مسألة لوجاريتمية. نظرية التسلسل  تقوم على عناصر من الرياضيات, علم الأحياء, هندسة النظم, لذلك هي متعددة التخصصات للغاية. هذا الموضوع قد يُدرّس في سياق علم الأحياء الحسابي.