متى قام عقبة بن نافع  ببناء جامع القيروان ؟
مثلما بُنيت مدينة القيروان بعد الفتح الإسلامي لشمال أفريقيا ، بُني جامعها الكبير ويسمونه أيضا جامع عقبة بن نافع نسبة للقائد الأموي الذي اخضع القيروان كليا في حملته الثالثة عليها عام 665 م . ويقال أن المدينة شيدت على أنقاض حصن للروم ودام بناؤها خمس سنوات انتهى عام 670 م ، بعد عام تم بناء الجامع الواقع في الطرف الشمالي من المدينة ، فليس " أقدم من المدينة جامعها " كما هو متداول. والحال أنهما الاثنان ولدا في زمن واحد قبل ثلاثة عشر قرنا .
المتحف يهتم بالفن الإسلامي في القرون الوسطى، ويحتوي على آثار تأتي من القيروان ورقادة والمنصورية، هذه الأخيرة هي مدينة أميرية أسسها الفاطميون سابقا.
خصصت قاعة المدخل إلى جامع عقبة بن نافع بالقيروان ويحتوي على محراب الجامع مماثل له والذي أعيد تشكيله، وكذلك على مجسم للجامع ككل.
الغرفة الثانية تحتوي على مجموعة من الخزف ترجع إلى الفترة التي كانت فيها رقادة تحت حكم خارجي (القرن التاسع والقرن العاشر).
جزء آخر من المتحف يحتوي على مجموعة من العملات لعصور مختلفة تمثل التاريخ الإقتصادي لإفريقية لمدة تفوق الستة قرون.
مجموعة المحتويات الأكثر أهمية وشهرة هي تلك القرآنية المخطوطة بالخط العربي، والتي تمثل مجموعة بارزة من المخطوطات والأوراق التي في الأصل تنتمي لمكتبة جامع عقبة بن نافع بالقيروان. من بين جواهر هذه المجموعة يوجد صفحات المصحف الأزرق الذي يعود تاريخه إلى القرن العاشر.
شهد المتحف أشغال تهيئة بين سبتمبر 2016 ومايو 2018 بدعم من الولايات المتحدة وبقيمة 146 ألف دولار أمريكي.