Codon Bias.jpg
doug youvan
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Codon Bias, Simplified diagram showing codon bias in hydropathy - molar volume space.

The strongest components (bias) for the encoding of anino acid ''residues'' are, in order:

C in 2nd position = NCN = C2 -> small size, medium hydropathy

U in 2nd position = NUN = U2 ->  average size, hydrophobic

A in 2nd position = NAN = A2 -> average size, hydrophilic

U in 1st position = UNN = U1 ->  not hydrophilic

where N is any of {A, C, G, U}

The y-axis is accurate (cubic Angstroms), but the x-axis could have some error from estimates of hydropathy.

Redrawn from Figure 4 in 

which attributes the graph to Yang, M. M., W. J. Coleman and D. C. Youvan. 1990. In Reaction Centers of Photosynthetic Bacteria. M.-E. Michel-Beyerle. (Ed.) (Springer-Verlag, Germany) p209-218; listed by Google at [

More complex diagrams illustrating the codon bias can be found on Commons at:
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Codon Bias, Genetics files (fine-grained classification needed)
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コドンバイアス、 ヒドロパチーのコドンバイアスを示す簡略図 - モル体積空間。アミノ酸の「残留」をコードする際の最も強力な成分は次の順序でである: 2位CのCは2位 = NCN = C2 ->小さなサイズ、中水文症Uは2位 = NUN = U2 ->の平均サイズ、疎水性Aは2位 = NAN = A2 ->平均サイズ、1位で、親水性Uは1位 = UNN = U1 ->親水性でない。ここでNは{A、C、G、U}のいずれかである。y軸は正確であるが、X軸は疎水性のグラフをヤン、M.M.、W.J.コールマン、D.C.ユーバンに帰属させる図4からのredrawn。 1990年。光合成細菌の反応センター。ミシェル・ベイヤール。p209-218; コドンのバイアスを示すより複雑な図式をGoogleが挙げたコモンズは以下の通りである。
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ja
コドン・バイアス、遺伝学のファイル(精緻な分類が必要)
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codon hydrophilic bacteria order unbiased angstrom biased triplet code bias prejudice triplet hydrophobic hydrophobicity genetics