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Basado en lo que he visto en internet, en la prensa, y especialmente en la escritura de Apple y eBay, parece que deberían ser capitalizados como aparecen, incluso cuando al principio de una frase:

 eBay es un gran sitio de subastas. es correcto.
 EBay es un gran sitio de subastas. es incorrecto.
 Ebay es un gran sitio de subastas. también es incorrecto.
 EBAY es un gran sitio de subastas. es super duper incorrecto.

eBay ejemplo: Acerca de eBay, ""eBay es el mercado en línea del mundo®, permitiendo el comercio sobre una base local, nacional e internacional.""
Ejemplo de Apple:, ""iMac viene con iLife ’06, una suite de aplicaciones fáciles de usar que hacen la parte espectacular de su vida cotidiana.""
Ambos accedieron el 6 de junio de 2006.

En cuanto a escribir en ALLCAPS... bueno, eso es mal estilo, de todos modos. No creo que ninguna manera sería "más correcta" en una situación ya incorrecta como esa, así que no diré nada.

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