Do khó khăn về vốn nên khi kết thúc giai đoạn 1 vào năm 2015 , giai đoạn 2 của dự án nói trên bị gián đoạn . Từ tháng 10-2016 , Bộ GTVT đã có quyết định phê duyệt báo cáo nghiên cứu khả thi giai đoạn 2 của dự án theo hình thức BOT . Theo quyết định này , tổng mức đầu tư dự án giai đoạn 2 là 1.337 tỉ đồng , nhưng đến nay dự án vẫn " giậm chân tại chỗ " khiến cuộc sống của người dân trong vùng dự án khốn đốn . Theo Sở GTVT Tiền Giang , hiện nay có hơn 150 điểm sạt lở lấn sâu vào bờ kênh Chợ Gạo từ 2-20 m , làm ảnh hưởng nghiêm trọng đến đời sống của hơn 2.000 hộ dân . Đặc biệt , trong thời gian qua đã có 3 người chết và hơn 30 căn nhà bị sập liên quan đến tình trạng sạt lở kênh Chợ Gạo đoạn chưa được đầu tư . Ngoài ra , tình trạng xói mòn , sạt lở mất đường dân sinh và đường huyện 25B đã chia cắt khu dân cư với các tuyến đường giao thông chính của khu vực . Mới đây , ngành chức năng của tỉnh Tiền Giang đã đi khảo sát và tổ chức di dời khẩn cấp gần 20 hộ dân sống trong vùng sạt lở . Tuy nhiên , con số này vẫn chưa dừng lại nếu không đầu tư xây kè . Ông Phan Vĩnh Thanh , phó giám đốc Sở GTVT Tiền Giang , cho biết trước mắt tỉnh sẽ ứng nguồn vốn khắc phục thiên tai để gia cố hoặc tạm di dời một số nhà dân có nguy cơ sạt lở cao . Còn về lâu dài , dự án nâng cấp kênh Chợ Gạo giai đoạn 2 đang trình Thủ tướng phê duyệt vào dự án phát triển hành lang đường thuỷ và logistics khu vực phía Nam thay cho phương án BOT trước đây .
Dự án chống sạt lở kênh Chợ Gạo ( Tiền Giang ) chỉ làm được phần phía tây , còn phía đông vẫn chưa biết khi nào làm bởi Nhà nước đang tìm nguồn vốn .