Theo Sở Giao thông vận tải , trong quá trình làm việc với Ban quản lý dự án 7 ( Bộ Giao thông vận tải ) , Sở Văn hóa - thể thao TP … , các đơn vị cho rằng trụ cầu sắt Bình Lợi cũ qua thời gian đã hư hỏng , được sửa chữa , gia cố nhiều lần . Tĩnh không của cầu sắt cũ thấp , không đảm bảo an toàn giao thông thủy trên sông Sài Gòn , còn nếu đưa đi chỗ khác cũng thiếu mặt bằng lưu giữ . Do đó , các đơn vị thống nhất với đề xuất của Sở Văn hóa - thể thao TP. HCM : bảo tồn nguyên trạng một phần gồm hai nhịp và một tháp canh đầu cầu bên phía Thủ Đức . Sở Giao thông vận tải đề xuất giao cho Khu quản lý đường thủy nội địa nghiên cứu để phục vụ vận tải hành khách , du lịch đường thủy . Còn theo Ban quản lý dự án 7 , dự kiến tháng 7-2019 cầu Bình Lợi mới sẽ được đưa vào khai thác chạy tàu . Cầu Bình Lợi là cầu đường sắt vượt sông Sài Gòn đầu tiên được xây dựng năm 1902 , chiều dài 276 m , gồm 6 nhịp với độ tĩnh không thông thuyền thấp nên có nhịp quay ở phía bờ quận Thủ Đức cho tàu thuyền qua lại . Cầu có kết cấu vòm thép , các thanh thép liên kết bằng đinh tán rivê . Bên phải đường ray gần chân cầu theo hướng từ quận Thủ Đức sang quận Bình Thạnh có một tháp canh . Trên vách tường hướng ra bờ sông còn rõ ô đắp chữ nổi " Binh Loi Octobre 1948 " ( Bình Lợi , tháng 10-1948 ) . Theo Sở Văn hoá - thể thao TP , cầu đường sắt Bình Lợi có giá trị lịch sử , văn hoá gắn với quá trình hình thành , phát triển Sài Gòn - TP. HCM và của ngành đường sắt Việt Nam .
Sở Giao thông vận tải TP. HCM cho biết việc bảo tồn toàn bộ cầu sắt Bình Lợi khi cầu mới đưa vào sử dụng là không khả thi .