Tổng cục Thuế yêu cầu Cục thuế các tỉnh , thành phố trực thuộc Trung ương làm việc với sở Kế hoạch và Đầu tư , sở Công Thương để rà soát , xác định các thương hiệu bán lẻ trên địa bàn và xác định chủ sở hữu ( doanh nghiệp 100 % vốn Việt Nam hoặc doanh nghiệp đầu tư nước ngoài ) . Trên cơ sở đó , Cục thuế địa phương thực hiện phân tích , đánh giá rủi ro về thuế để lựa chọn doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài thực hiện kê khai , quyết toán thuế TNDN tại địa bàn quản lý và đề xuất bổ sung vào kế hoạch thanh tra năm 2017 của các Cục thuế . Việc rà soát , bổ sung kế hoạch thanh tra phải được báo cáo về Tổng cục Thuế trước ngày 10/5/2017 . Nội dung thực hiện thanh tra thuế sẽ tập trung ở một số nội dung như : Thuế TNDN , thuế GTGT , thuế thu nhập cá nhân , thuế nhà thầu . Thời gian thanh tra trong 5 năm ( 2012 - 2016 ) và sẽ thực hiện thanh tra các năm chưa được thanh , kiểm tra thuế . Các cục thuế địa phương phải lưu ý tới hoạt động nhượng quyền thương hiệu chưa đăng ký , chưa nộp thuế , rà soát chi phí dịch vụ mà các doanh nghiệp này trả cho các công ty mẹ ở nước ngoài , nhưng không chứng minh được dịch vụ tư vấn đã được thực hiện , hoặc dịch vụ không phục vụ cho sản xuất của doanh nghiệp Việt Nam … Trên cơ sở phân tích rủi ro để thực hiện thanh tra , kiểm tra các nội dung được đánh giá có rủi ro về thuế theo từng sắc thuế và đối với cụ thể từng doanh nghiệp , trong quá trình thanh tra , các Cục thuế phải xác định rõ loại thuế , số thuế mà doanh nghiệp phải thực hiện kê khai và nộp theo quy định của pháp luật , qua đó xác định hành vi vi phạm và đưa ra biện pháp xử lý phù hợp . Trước đó , nhiều doanh nghiệp đầu tư kinh doanh bán lẻ của nước ngoài vào Việt Nam đã rơi vào “ tầm ngắm ” của cơ quan thuế . Cụ thể , trong năm 2015 , Tổng cục Thuế đã thanh tra , cung cấp thông tin về kết quả thanh tra tại Công ty TNHH Metro Cash & Carry Việt Nam . Qua thanh tra , sau nhiều năm liên tục báo lỗ , Tổng cục Thuế đã yêu cầu doanh nghiệp này điều chỉnh giảm lỗ , giảm khấu trừ và truy thu thuế tổng số tiền 507 tỷ đồng . Tiếp đó , giữa năm 2016 , Big C Hải Phòng và 2 doanh nghiệp liên quan cũng được cơ quan thuế đưa vào diện thanh tra chống chuyển giá .
Tổng cục Thuế vừa có văn bản yêu cầu Cục thuế các tỉnh , thành phố trực thuộc trung ương rà soát và thanh tra doanh nghiệp đầu tư nước ngoài kinh doanh bán lẻ trong 5 năm trở lại đây .