Tuy nhiên , nhiều ý kiến cho rằng cuộc thi vẫn còn một số hạn chế . Cụ thể , hiệu trưởng một trường THCS cho biết cuộc thi gộp chung hai đối tượng THPT và THCS là chưa hợp lý . Theo ông , học sinh THCS hạn chế hơn học sinh THPT rất nhiều về sự trưởng thành , kiến thức giáo khoa nên việc tìm ý tưởng và vận dụng kiến thức giáo khoa vào thực tế sẽ khó khăn hơn . Do đó , cần tách bạch hai đối tượng này để việc đánh giá chính xác hơn theo lứa tuổi . Bên cạnh đó , cơ sở vật chất , phòng thí nghiệm của các trường THPT mới chỉ ở mức cơ bản phục vụ việc dạy và học , chưa đáp ứng được yêu cầu nghiên cứu khoa học của học sinh . Ông Nguyễn Văn Dũng - hiệu trưởng Trường THPT Lê Hồng Phong ( Di Linh , Lâm Đồng ) - cho biết phòng thí nghiệm của trường , phương tiện và hoá chất chưa thể đáp ứng nhu cầu nghiên cứu của học sinh . " Các mẫu thí nghiệm chuyên sâu chúng tôi phải gửi về Trường ĐH Đà Lạt để phân tích . Trong khi kinh phí phục vụ nghiên cứu rất hạn chế . Ngoài ngân sách của trường , chúng tôi phải vận động thêm từ phụ huynh . Tuy nhiên không phải nơi nào cũng có điều kiện để xã hội hoá như vậy " - ông Dũng nói .
Cuộc thi khoa học kỹ thuật cấp quốc gia dành cho học sinh trung học 2018 đã bước sang năm thứ 6 . Ngày càng nhiều học sinh quan tâm hơn đến hoạt động nghiên cứu khoa học từ cuộc thi này .