Theo hồ sơ , ngày 1-9-2017 , cục trưởng Cục Thuế tỉnh Bình Định ban hành quyết định thanh tra thuế đối với Công ty cổ phần xây dựng An Nghĩa ( trụ sở tại TP Quy Nhơn , tỉnh Bình Định ) và phân công ông Khiêm làm trưởng đoàn cùng 3 thành viên là Trần Thị Thu Hà , Phạm Trọng Ân , Nguyễn Hoàng Tú . Do ông Khiêm , hiện 54 tuổi , đi bồi dưỡng nghiệp vụ tại Thừa Thiên - Huế trong thời gian thanh tra , nên việc thanh tra do 3 người còn lại thực hiện trong các ngày từ 19 đến 21-9-2017 . Bắt quả tang nhận 130 triệu đồng Ngày 24-9-2017 là chủ nhật , bị cáo Khiêm vừa từ Thừa Thiên - Huế về Bình Định đã gọi điện thoại cho ông Đỗ Nguyễn Duy Minh - phó giám đốc Công ty An Nghĩa - đề nghị sắp xếp thời gian làm việc . Ông Minh thống nhất làm việc vào đầu giờ chiều cùng ngày . Tiếp đó , Khiêm điện thoại rủ ông Phạm Trọng Ân đi uống cà phê và hỏi kết quả thanh tra thuế tại Công ty An Nghĩa . Ông Ân báo cáo là công ty này không khai thuế tài nguyên và phí bảo vệ môi trường , ngoài ra qua xem sổ sách thì còn phát hiện công ty có doanh thu hàng năm khoảng 16 tỉ đồng nhưng năm 2016 tồn kho đến 6 tỉ đồng là lớn , nghi có rủi ro về thu thuế . Cuộc làm việc tại Công ty An Nghĩa vào chiều chủ nhật 24-9-2017 chỉ có ông Khiêm và ông Tú , do ông Ân cáo bệnh , còn bà Hà không được thông báo . Trong thời gian giải lao giữa cuộc làm việc , mọi người ra ngoài thì ông Khiêm đưa cho ông Minh một bản danh sách lỗi vi phạm của Công ty An Nghĩa và cho biết số tiền phạt và tiền truy thu thuế lên đến gần 1,39 tỉ đồng . Ông Minh nhờ ông Khiêm xem xét thì vị trưởng đoàn thanh tra thuế đề nghị công ty đưa cho ông 120 - 130 triệu đồng và khoảng 20-30 triệu đồng cho ông T. - cục trưởng Cục Thuế Bình Định , thì sẽ giảm tiền phạt còn 70 triệu đồng . Ông Minh yêu cầu kế toán Công ty An Nghĩa làm việc với ông Khiêm thì ông này giảm số tiền của ông còn 110 triệu đồng , của ông T. là 20 triệu đồng .
Chiều 20-4 , hội đồng xét xử sơ thẩm TAND tỉnh Bình Định tuyên trả hồ sơ vụ án Hồ Minh Khiêm , nguyên trưởng phòng thanh tra thuế Cục Thuế tỉnh Bình Định , về tội “ nhận hối lộ ” để điều tra bổ sung một số nội dung .