Như Tuổi Trẻ đã thông tin , Viện KSND cấp cao tại TP. HCM đã có quyết định kháng nghị bản án sơ thẩm của TAND TP. HCM theo hướng hủy toàn bộ bản án để điều tra lại . Trong quyết định , Viện KSND cấp cao đã phân tích về tội danh , kết luận giám định của Bộ Y tế , vấn đề xử lý vật chứng và trách nhiệm của Cục Quản lý dược . VKS cũng cho rằng bản án sơ thẩm có dấu hiệu để lọt người , lọt tội . Có dấu hiệu bỏ lọt người , lọt tội Theo quyết định kháng nghị của Viện KSND cấp cao , trong vụ án này , Nguyễn Minh Hùng - nugyên tổng giám đốc VN Pharma , và Võ Mạnh Cường cùng bàn bạc từ việc xây dựng hồ sơ đến việc nhập và tiêu thụ lô thuốc H - Capita 500 mg Caplet có nhãn mác do Công ty Helix Canada sản xuất . Để có đầy đủ thủ tục nhập khẩu thì Cường cung cấp một loạt giấy tờ chứng nhận giả sản xuất lô thuốc của Canada . Sau đó Nguyễn Minh Hùng đã chỉ đạo cấp dưới làm giả một loạt giấy tờ của phía Việt Nam . Như vậy , các bị cáo biết rõ làm và sử dụng các giấy tờ giả , con dấu giả để nộp cho Cục Quản lý dược để được cấp giấy phép nhập khẩu . Hành vi làm và sử dụng tài liệu , giấy tờ và con dấu giả đã có dấu hiệu của tội " làm giả con dấu , tài liệu của cơ quan , tổ chức " theo điều 267 Bộ luật hình sự . Cấp sơ thẩm không điều tra , xét xử Nguyễn Minh Hùng , Võ Mạnh Cường , Nguyễn Trí Nhật , Phan Cẩm Loan , Ngô Anh Quốc và Lê Thị Vũ Phương về tội này là bỏ lọt tội phạm . Đối với Bùi Ngọc Duy , Phạm Anh Kiệt và Phạm Văn Thông , cấp sơ thẩm xét xử tội làm giả con dấu , tài liệu của cơ quan , tổ chức cũng là bỏ lọt tội phạm .
Kháng nghị của Viện KSND cấp cao cho rằng nguyên tổng giám đốc Nguyễn Minh Hùng cùng một số đồng phạm còn có hành vi làm giả con dấu , tài liệu nhưng cấp sơ thẩm chưa truy tố , xét xử .