Rà soát việc chấp hành chính sách , pháp luật về sử dụng vốn , tài sản tại Tập đoàn Xăng dầu Việt Nam và một số đơn vị thành viên trong thời gian từ tháng 1/2010 đến tháng 6/2013 , Thanh tra Chính phủ ghi nhận công ty mẹ và 42 công ty thành viên đã thực hiện nghĩa vụ nộp ngân sách nhà nước hơn 85.000 tỷ đồng . Sản lượng kinh doanh xăng dầu chiếm trên 50 % thị phần tại 63 tỉnh , thành . Tuy nhiên , Tập đoàn Xăng dầu Việt Nam đã đầu tư tài chính ngoài ngành nghề kinh doanh chính ( ngân hàng , bảo hiểm , bất động sản ) với tổng số tiền 2.255 tỷ đồng . Trong số này , tập đoàn đã tăng vốn đầu tư vào PG Bank 400 tỷ đồng ( chiếm 40 % vốn điều lệ của đơn vị nhận góp vốn ) và Công ty cổ phẩn Bảo hiểm Petrolimex hơn 171 tỷ đồng ( chiếm 51 % vốn điều lệ của đơn vị nhận vốn góp ) mà không có sự chấp thuận của Bộ Công thương và Thủ tướng … Một góc trụ sở Tập đoàn Xăng dầu Việt Nam . Việc quản lý hoạt động kinh doanh của Tập đoàn Xăng dầu Việt Nam và các công ty xăng dầu thành viên cũng có nhiều vi phạm , đặc biệt chưa thực hiện đúng quy định trích Quỹ bình ổn xăng dầu . Thanh tra Chính phủ nhận thấy tập đoàn khoán hao hụt tổng hợp và hạch toán hao hụt xăng dầu qua kho tính theo định mức vào giá vốn tại công ty mẹ . Định mức hao hụt của các công đoạn cao hơn hao hụt tổng hợp thực tế từ 35 đến 48 % nhưng chưa kịp thời điều chỉnh , đã làm tăng giá vốn , giảm hiệu quả kinh doanh . Tập đoàn còn hạch toán vào chi phí xăng dầu hao hụt vượt định mức , không đúng quy định của Quy chế kinh doanh xăng dầu . Việc quản lý , điều hành giá bán xăng dầu nội bộ của công ty mẹ đối với các công ty xăng dầu thành viên chưa phù hợp với quy định trong các Quy chế kinh doanh xăng dầu và chưa phù hợp với giá bán do Liên bộ Tài Chính - Công Thương công bố … Nhiều công ty thành viên buông lỏng điều kiện thanh toán khi hợp đồng tái xuất xăng dầu , cho phép bên mua chậm thanh toán nhưng không có điều kiện để đảm bảo thu hồi , làm phát sinh công nợ khó đòi hơn 278.000 USD , nguy cơ mất vốn . Theo Thanh tra Chính phủ , tập đoàn và các công ty thành viên còn có nhiều vi phạm trong công tác quản lý đầu tư xâu dựng , quản lý sử dụng đất ; quản lý , điều hành giá bán xăng dầu trong nước .
Tập đoàn Xăng dầu Việt Nam và nhiều đơn vị thành viên có sai phạm trong trích Quỹ bình ổn xăng dầu ; " vượt mặt " Bộ Công thương khi đầu tư vào ngân hàng , bất động sản , bảo hiểm .