Những khó khăn về tài chính đã đẩy hơn 100 trường đại học ở Mỹ vào thế bắt tay với Viện Khổng tử của Trung Quốc trong thời gian 2 , 3 năm ngắn ngủi . Trong khi cộng đồng tình báo Mỹ lo ngại đó có thể là những mạng lưới gián điệp của Bắc Kinh , các chính khách Mỹ còn lo xa hơn thế . Nói như báo Washington Post , sự tồn tại của các Viện Khổng Tử trên đất Mỹ đặt ra mối đe doạ tới tương lai của quốc gia này vì " Nó ảnh hưởng tới cách mà thế hệ lãnh đạo tiếp theo của nước Mỹ suy nghĩ về Trung Quốc và nhận thức của họ về chế độ ở Bắc Kinh " . Thượng nghị sĩ Marco Rubio ( bang Florida ) cảnh báo Viện Khổng Tử thực chất là công cụ để thúc đẩy các tư tưởng và suy nghĩ lệch lạc nhưng có lợi cho Trung Quốc trên đất Mỹ . Hồi đầu tháng 2 này , ông Rubio đã kêu gọi tất cả các trường đại học ở Florida có liên hệ với Viện Khổng tử của Trung Quốc cân nhắc lại mối quan hệ trên . Động thái này diễn ra sau khi có nhiều báo cáo nói Bắc Kinh , thông qua các Viện Khổng Tử , đã cố gắng kiềm chế những chỉ trích nhắm vào Trung Quốc trong các trường học Mỹ , can thiệp vào các chủ đề học thuật liên quan tới Trung Quốc , thậm chí kiểm soát tư tưởng và giám sát các du học sinh Trung Quốc tại Mỹ . Những nỗ lực của ông Rubio đã nhận được sự hồi đáp . Đại học West Florida đã quyết định không gia hạn hợp đồng và mối quan hệ với Hanban , cơ quan quản lý các Viện Khổng tử trên toàn thế giới của Trung Quốc . Đại diện của trường nói việc chấm dứt hợp tác với Viện Khổng Tử là bởi sinh viên không còn hứng thú nhưng thừa nhận những nghi ngại ngày càng tăng cũng ảnh hưởng một phần . Giám đốc Cục Điều tra liên bang Mỹ ( FBI ) , ông Christopher A .
Cộng đồng tình báo Mỹ cảnh báo các học viện Khổng tử của Trung Quốc trên đất Mỹ có thể là một phần trong mạng lưới tình báo của Bắc Kinh .