Philippines đang dần ngả về phía Trung Quốc . Sự thân thiện giữa Philippines và Trung Quốc đã gây ra nhiều lo ngại cho Nhật Bản , theo tạp chí Nikkei ngày 21/10 . Bắc Kinh có thể mở rộng các hoạt động quân sự trên Biển Đông và khu vực biển Hoa Đông . Nhật Bản đang hợp tác với Mỹ và nhiều nước khác để gây áp lực buộc Trung Quốc chấp thuận phán quyết của Tòa Trọng tài , trong đó không công nhận tuyên bố chủ quyền của Bắc Kinh trên Biển Đông . Phán quyết được đưa ra khi Philippines kiện Trung Quốc , nhưng Manila , dưới lãnh đạo của tân Tổng thống Duterte , dường như đang xem nhẹ nó . Chánh văn phòng nội các Nhật Bản Yoshihide Suga cho biết Biển Đông đặc biệt quan trọng , có thể ảnh hưởng trực tiếp tới hoà bình và thịnh vượng khu vực . Tokyo muốn hợp tác với các nước khác , bao gồm Philippines , để đưa ra phản ứng mạnh mẽ hơn . Thủ tướng Nhật Bản Shinzo Abe cũng khẳng định Biển Đông là tuyến hàng hải quan trọng với nước này . Tokyo lo ngại việc Trung Quốc quân sự hóa khu vực sẽ ảnh hưởng tới các vùng tranh chấp khác như quần đảo Senkaku / Điếu Ngư tranh chấp giữa Tokyo và Bắc Kinh ở Hoa Đông . Quan hệ đối tác với Philippines là một phần quan trọng trong chiến lược của Nhật Bản tại Đông Nam Á .
Sự gần gũi của Manila có thể khiến Bắc Kinh có động thái hung hăng hơn trong khu vực , đe doạ tới chiến lược và tầm ảnh hưởng của Nhật Bản .