Theo ý kiến của doanh nghiệp Nhật Bản mà tổ chức xúc tiến thương mại Nhật Bản ( Jetro ) thăm dò thì rủi ro trong môi trường đầu tư có thể đến từ vấn đề hệ thống pháp luật chưa được hoàn thiện , vận hành thiếu minh bạch . Thiếu nghiên cứu trước khi xây dựng , nội dung văn bản pháp luật rời xa thực tế hoặc nội dung văn bản pháp luật không rõ ràng dẫn đến vận dụng không thống nhất . Thêm vào đó là việc các chính quyền địa phương vận dụng chính sách không rõ ràng . Thống kê các ý kiến của doanh nghiệp Nhật mà Jetro có được , đại đa số họ sợ " chi phí nhạy cảm " tại Việt Nam . Những lĩnh vực dễ phát sinh chi phí này là hải quan , thuế và liên quan đến việc thủ tục giấy tờ ( cấp phép ... ) . Tại buổi thảo luận ở Uỷ ban Thường vụ Quốc hội mới đây về Báo cáo công tác nhiệm kỳ 2011 - 2016 của Chính phủ , ông Nguyễn Văn Giàu - Chủ nhiệm Uỷ ban Kinh tế của Quốc hội cũng sốc trước thông tin thống kê Jetro . “ Chúng ta đang phấn đấu “ Asean 4 ” , luật pháp minh bạch nhưng vẫn mất đầu tư không chính thức như vậy làm mất hình ảnh rất lớn ” - ông Giàu nói . Cũng từ báo cáo của Jetro , một rủi ro đáng chú ý nữa đó là môi trường đầu tư . Có trên 60 % doanh nghiệp Nhật Bản cho rằng hệ thống pháp luật chưa hoàn thiện , vận hành thiếu minh bạch , những doanh nghiệp này cho rằng đây là vấn đề rủi ro cốt lõi . Việt Nam là mảnh đất màu mỡ cho doanh nghiệp Nhật Bản .
Đó là một trong những vấn đề mà các doanh nghiệp Nhật Bản đầu tư tại Việt Nam đang lo lắng .