Văn bản của Bộ Giao thông , do Thứ trưởng Phạm Quý Tiêu ký , nêu tại hội thảo về Cảng hàng không quốc tế Long Thành do Uỷ ban Kinh tế của Quốc hội tổ chức ngày 12/12/2014 tại TP HCM , ông Trần Đình Bá tham dự và xưng danh học vị tiến sĩ hàng không ( Đại học Hàng không Riga ) . Tuy nhiên , ông Lương Hoài Nam , tiến sĩ chuyên ngành hàng không tại Đại học Hàng không Riga ( Liên Xô cũ ) , khẳng định ông Trần Đình Bá không có học vị này và đặt nghi vấn về việc ông Trần Đình Bá mạo danh tiến sĩ . Sân bay Hong Kong được ông Trần Đình Bá đưa vào bài viết về sân bay Long Thành . Ông Mai Trọng Tuấn , một cựu phi công của ngành hàng không , vào ngày 24/8/2014 có gửi thư đến Bộ trưởng Giao thông cũng đã khẳng định ông Trần Đình Bá không phải là tiến sĩ . Vì vậy , Bộ Giao thông đề nghị Bộ Giáo dục xem xét thẩm tra về học vị tiến sỹ hàng không của ông Bá . Trao đổi với báo chí , ông Trần Đình Bá không khẳng định có học vị tiến sĩ và cho rằng , đã hiến kế cho Bộ Giao thông nhiều đề án bằng tư duy và luận án tiến sĩ nên phía Bộ không cần thắc mắc về học vị này . Ông Bá cho biết đã nghiên cứu tại Đại học Bách khoa Riga và Đại học Hàng không Riga ( Liên xô cũ ) , nghiên cứu luận án tiến sĩ giải pháp mở rộng để hiện đại đường sắt tốc độ cao 150 - 200 km / h nhằm khai thông trục giao thông quốc gia , giảm thiểu tai nạn giao thông . Tuy nhiên , Bộ Giao thông đã không áp dụng đề án này . Trong góp ý mới đây liên quan đến Dự án sân bay Long Thành , ông Trần Đình Bá cho rằng thiết kế của sân bay này sao chép từ Cảng hàng không Chek Lap Kok ( Hong Kong ) . Tuy nhiên , Bộ Giao thông khẳng định , hình ảnh minh hoạ về sân bay Long Thành được một số cơ quan báo chí đăng tải không phải là phối cảnh của Cảng hàng không quốc tế Long Thành trong quy hoạch đã được Thủ tướng phê duyệt ; Đồng thời kiến nghị các cơ quan có thẩm quyền xem xét trách nhiệm của ông Trần Đình Bá trong việc phổ biến những thông tin , hình ảnh sai sự thật .
Lãnh đạo Bộ Giao thông Vận tải khẳng định ông Trần Đình Bá không phải là tiến sĩ , chưa bao giờ làm việc trong các cơ quan , doanh nghiệp hàng không như ông này thường tự nhận .