Tại hội thảo lấy ý kiến góp ý dự thảo nghị định về hoá đơn bán hàng , cung ứng dịch vụ , do Phòng Thương mại và công nghiệp VN tổ chức ngày 8-9 , nhiều DN đã bày tỏ lo lắng do thời gian áp dụng quá gấp , trong khi có khoảng 600.000 DN sẽ bị ảnh hưởng bởi quy định này Ông Nguyễn Ngọc Tuấn , phó chủ tịch Hiệp hội Xuất nhập khẩu kế toán Đồng Nai , cho rằng việc áp dụng hoá đơn điện tử đại trà cho DN ở mọi lĩnh vực , mọi quy mô là chưa khả thi vì vẫn còn rất nhiều giao dịch mà khách hàng yêu cầu phải có hoá đơn giấy . Hơn nữa , thời gian quá ngắn cho DN chuẩn bị . " Theo tôi , cần lộ trình 1-2 năm để DN chuẩn bị . Trong thời gian đó , DN vẫn sử dụng hoá đơn điện tử vừa sử dụng hoá đơn giấy . Ngoài ra , cụ thể hoá hơn quy định về sử dụng bất hợp pháp hoá đơn để DN hiểu và tuân thủ " - ông Tuấn nêu ý kiến . Bà Nguyễn Thị Cẩm Ninh ( Công ty Nestlé VN ) cho biết dù đã sử dụng hoá đơn điện tử nhưng có hoạt động vận chuyển hàng hoá , DN vẫn phải xuất trình hoá đơn giấy , phiếu xuất kho suốt quá trình vận chuyển . Do đó nếu muốn mở rộng đối tượng áp dụng hoá đơn điện tử , cần có cơ chế công nhận hoá đơn điện tử ở tất cả các cơ quan quản lý liên quan . " Phải đảm bảo dữ liệu điện tử được kết nối đồng bộ từ cơ quan thuế , hải quan ... đến quản lý thị trường , tránh trường hợp mỗi cơ quan yêu cầu một hình thức hoá đơn khác nhau " - bà Ninh đề nghị . Nhiều DN cho rằng chỉ nên khuyến khích chứ không nên quy định cứng nhắc , nên cho phép DN được sử dụng song song hoá đơn điện tử với loại hoá đơn khác . Bởi với một số lĩnh vực , chẳng hạn như bảo hiểm , khách hàng cá nhân thường yêu cầu hoá đơn , chứng từ giấy chứ không ai chấp nhận hoá đơn điện tử .
Từ ngày 1-1-2018 , doanh nghiệp ( DN ) mới thành lập và DN đang mua hoá đơn sẽ phải chuyển sang sử dụng hoá đơn có mã xác thực của cơ quan thuế .