Nguyên nhân vì chưa được trả tiền về khối lượng thi công các cửa van cống ngăn triều do thay đổi vật liệu thép từ G7 sang thép Trung Quốc . Thay thép G7 bằng thép Trung QuốcNgay từ tháng 5-2018 , trong hai văn bản gửi Thường trực UBND TP. HCM và Trung tâm điều hành chương trình chống ngập nước TP ( đơn vị được giao nhiệm vụ theo dõi dự án ) , liên danh tư vấn giám sát hợp đồng ( LDTVGSHĐ ) cho rằng trong hồ sơ thiết kế thi công đã được thẩm định và chủ đầu tư dự án phê duyệt quy định rất rõ : yêu cầu vật liệu cấu tạo thép đối với vật tư chính chế tạo cửa van phải là thép S355 có nguồn gốc xuất xứ từ các nước tiên tiến thuộc nhóm G7 sản xuất . Riêng cống ngăn triều Bến Nghé phải được làm bằng thép không gỉ SUS 304 và 323L tiêu chuẩn Nhật Bản . Thế nhưng , cũng tại văn bản trên , ông L.  Fernando Requena , P. E - giám đốc điều hành LDTVGSHĐ ( gồm Công ty TNHH tư vấn xây dựng Meinhardt ( VN ) , Công ty CP tư vấn xây dựng công trình Hàng Hải ( CMB ) , Công ty CP tư vấn xây dựng và chuyển giao công nghệ Thăng Long 12 ) - cho biết thực tế kiểm tra , giám sát thì phần lớn thép sử dụng trong dự án lắp đặt cửa van lại có nguồn gốc xuất xứ từ Trung Quốc và theo tiêu chuẩn Trung Quốc . Như vậy , nhà đầu tư đã không tuân thủ quy định về nguồn gốc xuất xứ hàng hoá vật tư chính chế tạo cửa van đã được quy định trong chỉ dẫn kỹ thuật của dự án . " Do đó , LDTVGSHĐ nhận thấy chưa đủ cơ sở để xác nhận giải ngân cho các gói thầu cơ khí cửa van cống kiểm soát triều Phú Xuân và cống kiểm soát triều Cây Khô ... " - ông L.  Fernando Requena , P. E nhấn mạnh . Theo một cán bộ của LDTVGSHĐ , số lượng thép lắp ở các cửa van của dự án chống ngập 10.000 tỉ đồng là hơn 2.000 tấn . " Nếu sử dụng thép Trung Quốc sẽ dẫn đến chi phí duy tu bảo dưỡng sau này cao hơn so với loại thép của các nước G 7 . Điều đáng nói là thép Trung Quốc đã được nhập về thực hiện dự án ngay từ năm 2017 , do đó Sở NN & PTNT TP. HCM điều chỉnh sử dụng vật liệu thép cho dự án sau này như là cách hợp thức hoá việc đã rồi " - vị này nói thêm . Bỏ rẻ để mua đắt ? Lý giải về dự án tạm ngừng thi công do chậm giải ngân vì một số lý do , trong đó có nguyên nhân " thay đổi vật liệu thép cho hạng mục cơ khí cửa van ( cống ngăn triều ) " như nêu trên , ngày 5-9 Công ty cổ phần đầu tư xây dựng Trung Nam ( gọi tắt là Trung Nam Group , công ty mẹ của Công ty TNHH Trung Nam BT 1547 - chủ đầu tư dự án chống ngập 10.000 tỉ đồng ) đã có công văn gửi các cơ quan chức năng và cho rằng : Ngày 7-2-2018 , Bộ Xây dựng đã khẳng định căn cứ hồ sơ thiết kế bản vẽ thi công và dự toán xây dựng được Sở NN & PTNT TP. HCM ( đơn vị được uỷ quyền thẩm định dự án ) điều chỉnh thay đổi tiêu chuẩn vật liệu thép chế tạo tại cửa van theo đúng quy định , từ đó đơn vị này đã triển khai thi công .
Từ tháng 4-2018 đến nay , dự án " Giải quyết ngập do triều khu vực TP. HCM có xét đến yếu tố biến đổi khí hậu giai đoạn 1 " ( gọi tắt là dự án chống ngập 10.000 tỉ đồng ) đình trệ thi công .