Ngành thuế TP. HCM cho biết tính đến thời điểm 22-9-2016 , Công ty Uber B.V Hà Lan chưa thực hiện kê khai và nộp thuế VAT , thuế thu nhập cá nhân theo tỷ lệ % trên doanh thu của các cá nhân được hưởng như hướng dẫn của Bộ Tài chính tại Công văn 11828 . Cơ quan thuế cho biết , theo giải thích được đưa ra từ đại diện của Uber BV Hà Lan là do Uber BV Hà Lan cần thời gian để tập hợp dữ liệu các cá nhân kinh doanh vận tải hợp tác với Uber BV từ năm 2014 đến tháng 8-2016 , kể cả một số người đã " không còn hợp tác kinh doanh vận tải " với Uber nữa . Sau đó , Cục Thuế TP. HCM đã yêu cầu Uber B.V Hà Lan phải thực hiện ngay việc kê khai và nộp thuế của tất cả các cá nhân kinh doanh vận tải đã ký kết hợp đồng với công ty này kể từ ngày hoạt động tại TP. HCM . Tuy nhiên sau đó Uber B.V cũng chưa thực hiện kê khai và khấu trừ nộp thay các cá nhân có ký hợp tác kinh doanh vận chuyển với doanh nghiệp này trong thời gian từ năm 2014 đến tháng 9-2016 . Đến ngày 2-3-2017 , Cục Thuế tiếp tục có công văn số 1805 ra thời hạn chót cho Uber B.V phải thực hiện kê khai và nộp thay số thuế này của các cá nhân là ngày 10-3-2017 . Dù vậy công ty này vẫn không thực hiện . Ngày 30-6-2107 Cục Thuế TP. HCM tiếp tục ra công văn số 6107 , trong đó , dựa vào số liệu Uber B.V Hà Lan uỷ quyền cho Công ty TNHH Uber Việt Nam thực hiện kê khai từ năm 2014 đến tháng 5 năm 2017 trên các tờ khai thuế nhà thầu nước ngoài để tính ra số tiền mà Uber B.V phải kê khai và nộp thay cho các cá nhân . Theo cách tính trên , số tiền thuế VAT và thu nhập cá nhân mà Uber Hà Lan phải nộp và Uber Việt Nam có trách nhiệm thực hiện kê khai và nộp thay là hơn 39,5 tỉ đồng , trong đó gồm hơn 26,3 tỉ đồng là thuế VAT và hơn 13,1 tỉ đồng thuế thu nhập cá nhân . Nhưng doanh nghiệp này vẫn chưa thực hiện . Đến tháng 9 Cục Thuế TP. HCM ra quyết định xử phạt vi phạm hành chính về thuế và truy thu số tiền hơn 66,68 tỉ đồng đối với Công ty TNHH Uber B.V ( Hà Lan ) .
Cục Thuế TP. HCM vẫn quyết truy thu số tiền 66.68 tỉ đồng từ Uber B.V , khẳng định rằng công ty này không thuộc diện xét miễn thuế theo Hiệp định tránh đánh thuế 2 lần giữa Việt Nam và Hà Lan .