9 h ngày 27/5 , ngành đường sắt đã điều động một máy cẩu chuyên dụng từ Quảng Bình đến . Một máy cẩu khác đang từ Nha Trang ra để tách rời và cẩu hai đầu máy , bốn toa xe trật khỏi đường ray , giải phóng hiện trường . Khoảng 150 công nhân đang khắc phục hơn 100 m đường ray hư hỏng . Hàng hoá trên các toa tàu đã được bốc dỡ gần hết . Toa xe hỏng đã được kéo khỏi hiện trường trong đêm . Dự kiến 15 h hôm nay , tuyến đường sắt số 1 sẽ được thông tuyến , các phần còn lại khắc phục sau . Cẩu 60 tấn điều động đến hiện trường . Lỗi tác nghiệp Trả lời báo chí về nguyên nhân tai nạn , ông Vũ Anh Minh , Chủ tịch Hội đồng thành viên Tổng công ty Đường sắt Việt Nam , cho biết do lỗi tác nghiệp trong ga , khi đoàn tàu hàng đang vào thì bên trong ga lại dồn dịch toa của một tàu hàng khác . Đoàn tàu dồn dịch này đã lấn sang khổ giới hạn , gây va chạm hai đầu máy , làm 4 toa xe trật bánh . Ông Minh thừa nhận các quy trình tác nghiệp của đường sắt hiện nay lạc hậu , khả năng ứng dụng khoa học công nghệ thấp .
Khi tàu ASY2 đang vào thì bên trong ga tàu 2469 dồn dịch toa và lấn sang khổ giới hạn nên xảy ra va chạm .