Ngày 7/9 , Văn phòng Chính phủ truyền đạt chỉ đạo của Thủ tướng Nguyễn Xuân Phúc , yêu cầu Thanh tra Chính phủ tiến hành thanh tra việc cấp phép nhập khẩu và cấp giấy đăng ký lưu hành đối với 7 loại thuốc do Công ty Helix Pharmaceuticals Inc , Canada sản xuất ; việc trúng gói thầu cung cấp thuốc cho các bệnh viện của công ty cổ phần VN Pharma trước khi xảy ra vụ án . Thanh tra Chính phủ phải báo cáo kết quả lên Thủ tướng trước ngày 31/12 . Trước đó ngày 30/8 , tại phiên họp Chính phủ , Phó thủ tướng Vũ Đức Đam cho biết , vụ việc liên quan đến công ty VN Pharma đang được các cơ quan bảo vệ pháp luật thụ lý giải quyết , nhưng dư luận xã hội đặc biệt quan tâm và nhiều ý kiến rất bức xúc ảnh hưởng đến lòng tin của nhân dân đối với cả hệ thống y tế . " Vì vậy , cần được chỉ đạo xử lý nghiêm minh mọi vi phạm theo đúng quy định của pháp luật , làm rõ mọi góc khuất " , ông nói . Phó thủ tướng cho hay đã chỉ đạo Văn phòng Chính phủ có văn bản yêu cầu Bộ Y tế báo cáo về trách nhiệm quản lý nhà nước của Bộ . Công ty VN Pharma bị cơ quan điều tra xác định đã làm giả hồ sơ nhập khẩu 9.300 hộp thuốc H - Capita 500 mg chữa ung thư từ nhà sản xuất Helix Pharmaceuticals Inc . , Canada . Lô thuốc này được Cục Quản lý Dược cấp phép nhập khẩu cuối tháng 12/2013 . Năm 2014 H - Capita trúng đấu thầu tại Sở Y tế TP HCM với giá 31.000 đồng một viên trong khi giá kế hoạch của Sở là 66.000 đồng . Nghi ngờ giá H - Capita sau kết quả đấu thầu , Bộ Y tế đề nghị các cơ quan chức năng phối hợp xác minh .
Lãnh đạo Chính phủ chỉ đạo làm rõ thông tin trên báo chí về việc quản lý cấp phép nhập khẩu , cấp đăng ký thuốc của Bộ Y tế .