इन उप-योजनाओं को राष्ट्रीय समुद्री प्रौद्योगिकी संस्थान (एनआईओटी) , चेन्नई , भारतीय राष्ट्रीय समुद्री सूचना सेवा केंद्र (आईएनसीओआईएस) , हैदराबाद , राष्ट्रीय ध्रुवीय एवं समुद्री अनुसंधान केंद्र (एनसीपीओआर) , गोवा , समुद्री सजीव संसाधन एवं इकोलॉजी केंद्र (सीएमएलआरई) , कोच्चि , और राष्ट्रीय तटीय अनुसंधान केंद्र (एनसीसीआर) , चेन्नई जैसे मंत्रालय के स्वायत्त/संबद्ध संस्थानों द्वारा कार्यान्वित किया जा रहा है।