लाइकोपीन स्वाभाविक रूप से सभी ट्रांस फॉर्म में मौजूद होता है और इसकी श्रृंखला में सात डबल बॉन्ड होते हैं, जिन पर उच्च तापमान, प्रकाश, ऑक्सीजन, एसिड, कैटलिस्ट और धातु आयनों के एक्सपोज़र के कारण इसके मोनो सिस या पॉली सिस आइसोमर बनाए जा सकते हैं।