मान लीजिए, हमारे पास एक और मॉलिक्यूल है जो हमें लगता है कि हम डिजाइन कर सकते हैं जिसके पास एक बेहतर एक्टिविटी हो, हम इसे इस कॉक्स 2 एंजाइम से बांध सकते हैं और हम देख सकते हैं कि कहां बाइंडिंग एनर्जी या इंटरैक्शन एनर्जी जो आती है, मिलेगी।