एनबीएचएम का मुख्य उद्देश्य कृषि और गैर कृषि परिवारों के लिए आमदनी और रोजगार संवर्धन के उद्देश्य से मधुमक्खी पालन उद्योग के समग्र विकास को प्रोत्साहन देना , कृषि / बागवानी उत्पादन को बढ़ाना , अवसंरचना सुविधाओं के विकास के साथ ही एकीकृत मधुमक्खी विकास केन्द्र ( आईबीडीसी ) / सीओई , शहद परीक्षण प्रयोगशालाओं , मधुमक्खी रोग नैदानिकी प्रयोगशालाएं , परम्परागत भर्ती केन्द्रों , एपि थेरेपी केन्द्रों , न्यूक्लियस स्टॉक , बी ब्रीडर्स आदि की स्थापना और मधुमक्खी पालन के माध्यम से महिलाओं का सशक्तिकरण है।