सुश्री महाजन ने वर्ष 2007 से 2012 तक भारत के प्रधानमंत्री के संयुक्त सचिव के रूप में कार्य किया और इससे पहले साल 2004-05 के दौरान वित्त मंत्रालय में आर्थिक मामलों के विभाग में निदेशक के पद पर कार्य किया।