पीएमएमएसवाई का उद्देश्य मत्स्य पालन क्षेत्र का सतत और जिम्मेदार विकास करना है जिसमें बुनियादी ढांचे , प्रजातियों के विविधीकरण , स्थायी आजीविका , जलीय स्वास्थ्य प्रबंधन , मजबूत डेटाबेस , नवाचारों , सामूहिकता , वैल्यू चेन के आधुनिकीकरण , निर्यात को बढ़ावा , एक मजबूत मत्स्य पालन प्रबंधन ढांचे की स्थापना पर ध्यान देने के साथ ही ऐसी प्रौद्योगिकियों को लागू करना है जो निवास स्थानों और मछलियों की सुरक्षा सुनिश्चित करे।