श्री मुखर्जी के पास व्यापक राजनयिक अनुभव है और उन्होंने अंतर्राष्ट्रीय मुद्रा कोष (आईएमएफ) , विश्व बैंक , एशियाई विकास बैंक एवं अफ्रीकी विकास बैंक जैसे बहुपक्षीय संस्थाओं के बोर्ड ऑफ गवर्नर के रूप में कार्य किया है।