रोग का दूसरा चरण तब होता है जब यह केंद्रीय तंत्रिका तंत्र में फैल जाता है और भूख न लगना, बुखार, सर भारी होना, उल्टी, प्रकाश से अत्यधिक संवेदनशीलता, ऑप्टिकल हस्तक्षेप, मांसपेशियों की कमजोरी, सुन्नता और कोमा का कारण बनता है।