हालांकि, यदि इंफ्लेमेशन जारी रहता है तो इंफ्लेमेशन का दूसरा चरण क्रोनिक इन्फ्लैमेशन कहलाता है, जो विभिन्न प्रकार के क्रोनिक डिजीज़ेस को उभार देता है, जिनमें आर्थ्रिटिस, कैंसर, कार्डीओवैस्क्युलर डिजीजेस, डायबिटीज और न्यूरोलॉजिकल डिजीज हैं, जो विभिन्न सिग्नलिंग पाथवेज के डिसरेगुलेशन के चलते होते हैं।