हालांकि बढ़े हुए फसल उत्पादन और घटे हुए कटाई उपरान्त नुकसान के माध्यम के द्वारा ये रसायन खाद्य सुरक्षा में सार्थक योगदान करने वाले कहे जाते हैं, परन्तु एक बढ़ती चिन्ता इन रसायनों के मनुष्यों एवं पशुओं के स्वास्थ्य, पर्यावरण, प्राकृतिक संसाधनों एवं कृषि उत्पादन के टिकाऊपन पर दुष्प्रभाव के बारे में है।