सेक्टर सहयोगी मिशन के व्यापक क्षेत्रों में काम करके मिशन/राज्यों को सहायता प्रदान करेंगें , जिसमें कार्यान्वयन सहायता एजेंसियों का चयन , राज्य जल एवं स्वच्छता मिशन के साथ साझेदारी करना , अकादमिक संस्थानों , गैर-सरकारी संगठनों , नागरिक समाज को एक साथ लाना और जल की गुणवत्ता पर विशेष ध्यान देने के साथ-साथ जल स्रोतों की दीर्घकालिक स्थिरता को सुनिश्चित करने के लिए राज्यों को उचित ओएंडएम तंत्र अपनाने में सहायता प्रदान करना शामिल है।