संपूर्ण एसटीआईपी 2020 नीति-निर्माण प्रक्रिया के समन्वय और क्रियान्वयन के लिए एसटीआईपी 2020 सचिवालय को प्रधान वैज्ञानिक सलाहकार (पीएसए ) और विज्ञान एवं प्रौद्योगिकी विभाग (डीएसटी ) के कार्यालय द्वारा संयुक्त रूप से स्थापित किया गया है।